Если вы выплачиваете ему его долю, то становитесь единоличным собственником квартиры. После этого подаете в суд на выписку БМ, как бывшего члена семьи, автоматом выписывается и его новорожденный ребенок, так как дети до 14 лет могут быть зарегистрированы только вместе с одним из родителей. Да, это займет больше времени и нервов, но вы в любом случае в выигрыше.