Закройте кота в какой-то одной комнате, пусть там будет для него укромное место - кресло, диван, за которым он может спрятаться. Рядом с этим местом поставьте лоток и чуть поодаль еду и воду. Еду лучше ту, к которой он привык в родном доме, дальше поменяете при желании. Из "родного" лотка было бы хорошо взять немного не свежего наполнителя и добавить в свой, но обычно, если наполнитель тот же, коты и так спокойно идут в лоток. Старайтесь не лезть к нему пока, не тискать. Кот очень сильно стрессует. Дайте ему 5-7 дней на освоение в этой одной комнате, потом откроете двери и дадите уже возможность передвигаться по всей квартире, сможете поставить и лоток и еду в нужное Вам место.