Разница в доступности. Выше правильно пишут, Мачу-Пикчу могло выжить, пока туда подвозили припасы, это было сложно, ни лошадей, ни железных дорог там нет. Так что продержаться они могли только пока их кто-то кормил. Когда кормить стало некому (ну или сочли, чот опасность миновала), люди оттуда ушли.