Потому что изначально Стрелка - это высокая часть берега при слиянии рек, на ней и начали строить город, храмы. А внизу - это коса, сейчас именно ее и называют Стрелкой. Нижний ярус набережной оформили во второй половине прошлого века. Вроде ничего там не разливается и не затапливается.