Предположу что для правильного письма, о котором как раз и заботится логопед, нужно разбирать слово именно так: мягкое с + Э = СЕ..  А если логопед ребенку начнет давать звуки, а не буквы, ребенок и писать сИмья будет...Цели логопеда и  звукового разбора разные, и противоположные.