Если они покупали квартиру в браке, то супруг являлся сособственником этой квартиры согласно семейному кодексу. И срок владения им своей собственностью можно считать не с даты свидетельства на долю, а с даты получения первого свидетельства на жену (если не было брачного контракта). Т.е. муж может указывать полную цену в договоре, налоги ему не грозят.