Вас сразу зарегят на оба рейса, багаж естественно без вас с рейса на рейс перевезут. Если вы опоздаете не по своей вине, то всеравно улетите без проблем, это уже будут проблемы авиакомпании. По идее, если очень короткая стыковка, вас может сотрудник авиакомпании встретить и за ручку проводить на ваш стыковочный рейс. Не переживайте, на самом деле все проще, чем кажется.