Отпуска - это хоть какой-то луч света в бесправии российских работодателей. Отпуск дается только с согласия работодателя. У меня на фирме считается, что брать отпуск нужно неделями. То есть выходные всегда плюсуются.  Вам именно так посчитали. Если зарплату нормально выдали (то есть за месяц получилась обычная сумма) - то все хорошо. То есть на мой взгляд у вас 3 дня осталось.