Была похожая ситуация по читательской грамотности. Вся базовая часть выделена красным, самая простая, где вопросы элементарные, только крестик поставь в нужный квадратик. Не поставил Именно что перепутал при переносе ответов, т.к. на вопрос№1 ответил как на вопрос №2  и дальше пошло по накатанной. Набрал максимальные баллы на части С, вроде там надо было не крестики ставить, а писать творческие ответы, которые проверяли люди, а не техника. Это и спасло. Результат по процентам - 57, результат по баллам на высокий уровень впритык - впритык. И практически в эти же даты (январь) писал Кириллицу по русскому языку, и там организаторы (сама регистрировала и моя почта была контактная) на меня вышли с сообщением, что работа выполнена на 100 баллов, но в графе "класс" не поставлен крестик напротив цифры класса, в итоге программой работа оценивается в 0 баллов. Прислали скан, попросили крестик поставить и обратно отправить. Я все быстренько сделала, сын получил свое первое место. Но это просто люди-организаторы порадели, заметили как-то, обратили внимание, потратили добровольно время на обратную связь. А могло быть вообще не так. Меня это дело напрягло, выясняла, что и к чему. Да, проверяет аппарат и оформление влияет на распознавание. Более того, палочка-черточка не в том квадрате, исправление и т.п. сразу делает считывание некорректным, автомат выставляет 0. Учились с января оформлять бланки и продолжаем тренироваться. По математике результат 94%, то есть наука работает т-т-т.