Смотря на какой вокзал и с какого вокзала.Рядом с Московским ТЦ Галерея - кафе начинают работу с 8.00.Круглосуточные кафе https://www.restoclub.ru/spb/search/kafe-peterburga-rabotajushhie-kruglosutochnohttp://www.the-village.ru/village/food/restaurants/117783-na-noch-glyadyaХороший вариант зайти в Буквоед (сами там коротали ночное время на Лиговском).Вот подборочка https://kudago.com/spb/activity/24-hours/