Неправильно учить читать  - это, например, выучить все буквы как они звучат в алфавите (мэ, ка, эр), потом пытаться их складывать по типу - мэ-а=ма. Это довольно часто бывает. Мне на всю жизнь запомнилось как читала дочка подруги - бэ-у = бу, рэ-а=ра, тэ-и=ти, нэ-о=но, буратино. Но это точно не Ваш случай, если Вы следуете рекомендациям в букваре Жуковой. . Я думаю, Вы ничего неправильного не делаете, Вы делаете то же самое, что делают на подготовке к школе, только в индивиуальном порядке. Поэтому щитаю, подготовка ему и не поможет. ПРосто в Вашем случае стандартная, распространённая методика (Жукова) может ему не поддходить, или логопроблемы у него могут быть, или ещё что. Специалист должен сказать что не так.