У вас должны быть договор на аренду автотранспортных средств (с водителем, без водителя), протоколы цены (если цена не прописана в договоре), акт приема-передачи а/транспортного средства и ежемесячно-ежеквартально (опять же как прописано в договоре) составляется акт выполненных работ-услуг и происходит оплата.  Арендованные ОС приходуются на забалансовые счета. При оказании транспортных услуг вы тоже заключаете договор, оговариваете цены, составляете акт выполненных работ. Договор об оказании транспортных услуг является подвидом договора возмездного оказания услуг