В смысле откуда ПДР берётся как среднее? Вы уже ответили на свой вопрос - это среднее. Продолжительность беременности при стандартном регулярном цикле - 38-42 недели от первого дня последних месячных. Тупо среднее арифметическое получается 40. Без претензий на роды именно в этот день. Но, скажем, для оформления декрета это нужно, и вообще самой беременной проще ориентироваться, когда есть от чего отталкиваться хотя бы с оговоркой "плюс-минус".