Прага понравилась немного больше Мюнхена, хотя наверно у меня не слишком равные варианты - в Праге была в мае, погода-солнышко-все в каштанах цветущих, красота! В Мюнхене была в декабре - погода не оч (дождь моросил почти всегда), но один день было солнечно - вот в этот солнечный день Мюнхен был удивительно хорош! Так что смело можно ехать в оба города  а потом еще раз туда же, но весной или ранней осенью