Дело совсем не в грязи, да и ручки они опознают чаще всего лишь по внешнему виду (это я  как пользователь того же Пилота, который выглядел как обычная ручка, в классе им больше не пользовались, были более дешевые аналоги, поэтому шел на ура, пока с парочкой одноклассников не поделилась секретиком). Запрещают пользоваться в принципе гелевыми ручками, нашла большое обсуждение на эту тему, вот "В современной школе все первоклашки пишут шариковыми ручками. Эти ручки работают практически в любом положении, лишь бы стержень касался бумаги, поэтому учителю нет необходимости ставить руку ученикам. Шариковые ручки обеспечивают ровное письмо без утолщений и клякс , но провоцируют ребенка на излишний нажим.Гелевые и капиллярные ручки пишут легко по бумаге любого качества. Увы! – слишком легкое скольжение стержня по бумаге стимулирует выработку небрежного почерка. Поэтому использовать для обучения письму их не стоит.Вообще же, у специалистов по обучению письму одного мнения по поводу оптимального выбора ручки сегодня нет. Кто-то предпочитает ставить почерк шариковой ручкой, кто-то – исключительно перьевой. Наверное, наилучшее решение – это подбирать ручку индивидуально, в зависимости от темперамента ребенка и степени развития его мелкой моторики.". Про нажим - это чистая правда, сама в школе писала так, что через 15 минут рука отваливалась просто. Вот одна из мам тоже пишет: "У моей дочки писанина шариковой ручкой весь первый класс привела к "туннельному эффекту", иногда известном как "эффект компьютерной мышки". Воспалился лучевой нерв от перенапряжения. Она просто откладывала ручку и жаловалась, что "рука болит". Пошли в начале лета к хирургу. Он сказал, чтобы перестали писать шариковой ручкой, а переходили на капиллярную или (что гораздо лучше) на перьевую.С перьевой роман у нас пока не сложился, но сейчас дочка пишет капиллярной. Резко улучшился почерк, боли ушли и больше (тттт) не появлялись. Истерики в школе - ПОЧЕМУ ОНА НЕ ПИШЕТ ШАРИКОВОЙ???? ЭТО ЗАПРЕЩЕНО!!!!! были пресечены бумажкой от хирурга.Все тихо-мирно заткнулись, дочку не дергают.Глядишь, перейдем попозже на перьевую."