Милена в православии есть в форме Милица.А по поводу путаницы у сестер - Вы же старшую дочку не будете полным именем звать? Да и младшую скорее всего тоже как-то переиначите. Хотя лично мне лишние Милены не нужны , так что я бы предложила найти третий вариант )))