А зачем вы трехлетке смесь даете? Он что, больной? Кефир, йогурт, молоко в конце концов. Организм ночью должен отдыхать, а не работать, переваривая пищу. Моей дочери два года. Уже как  мес 4 отучаю от еды ночью. Проснется, даю воды. Хнычет, не хочет, потом попьет и уснет. Иногда вообще не пьет. У Вас может быть и встает потому, что у него режим "поесть" в это время.