У матфака ВШЭ есть одна принципиальная особенность: он создавался людьми, придерживающимися идеи, что математика делится на алгебраическую геометрию и прочую не стоящую внимания фигню. Хотя узкая специализация - это не так уж страшно.На Мехмате МГУ Вас будут пытаться учить еще чему-нибудь, придерживаясь идеи, что образование математика - хотя бы базовое - должно быть хоть сколько-нибудь разносторонним.