А какой смысл дочери иметь там долю? Выручить отца хотите? Тогда надо с ним и решать какую часть  он вам обменяет на квартиру. По поводу оценки сложно сказать, квартира то хоть сколько комнат?  Доля, как правило, стоит не больше 2/3 от ее идеальной стоимости, чаще меньше. То есть не больше 1м в вашем случае. Хотя  если это не москва, то лучше посмотрите сколько стоит в этом городе комната в коммуналке и вычтите  % 30, потому что коммуналка дороже по определению, там комната объект отдельный.