Вряд ли у ребенка проблемы со всеми словами.Вы дайте ему диктант по возрасту и посмотрите, в чем проблемы.  Если ошибки в каких-то правилах, то надо правило заучить и отработать на письме на некоторых словах. Письмо это способ усвоения. Для большинства эффективный.Если не поможет, обратитесь к логопеду-дефектологу, чтобы они проверил функционирование центров, связанных с грамотностью.  Может быть ребенку нужно не писать, а петь слова? Дети разные.  Но сначала попробуйте классику, через ручку.  Для запоминания написания слов чтения не достаточно. Тем более если на уроках пишут транскрипцию в строчку, [малако].