Разница конечно есть. Новые колодки могут, банально, хуже тормозить. Могут геометрически отличаться от штатных (как колодки от Кашкая подходят на СХ-5, но при этом имеют мЕньшую площадь соприкосновения с тормозным диском, т.е. они узкие). Могут  сильно истирать тормозной диск. Могут начать выкрашиваться через какое-то время (после нагрева). Могут жутко скрипеть при торможении. Ну и т.д.  Поэтому  неплохо было бы на клубном форуме поизучать отзывы.Ну или покупайте известных производителей (Ремса, Брембо, Лукас, Локхид, АТЕ и т.д.), но и с ними нюансы могут быть.В Экзисте покупать удобно, но цены не самые низкие. Посмотрите в АвтоДоке.