Деревьям нельзя углублять корневую шейку, т.е. нельзя их закапывать, но мне кажется, что у вас они не сильно закопаны, а вот забор закопан и он там проржавеет. А  геотекстиль для газона вещь очень спорная. Вот осеются у вас чужие одуванчики или еще какие сорняки и их корни на щечек пальцев пробьют геотекстиль и в нем укоренятся, вы попробуете их выдернуть и с ним поедет часть газона, они просто приподнимется с одуваном