Есть отели, есть хостелы , с квартирой сейчас тяжелее-запретили их. Центров в Берлине  все еще два , какой вас больше интересует? "Шарлотенбург"- Зоопарк, Аквариум, Кудамм, Евпропа-центр."Митте"- это Александерплатц, Потсдамер платц, Музеи, Рейхстаг, Бранденбургские ворота (хотя последние скорее посередине находятся).  Транспорт вообще не проблема. От одного центра до другого максимально 20 минут на метро (одна ветка)