Спокойно подаете заявление о выписке ребенка. Пусть паспортный стол распишется в принятии заявления. Если они не согласны с выпиской - пусть дают официальный обоснованный отказ. Вы их предупреждаете, что в случае отказа будете писать на них жалобу в вышестоящую инстанцию.