Потому что в современном русском языке много закрепившихся (в частности, в орфографии) пережитков прошлого. Традиционный принцип.Исторически исконно мягкие, в том числе ц, могут писаться как чисто традиционно (жи-ши), так и в соответствии с произношением, а также по-разному (цифра, но огурцы). А так как личные имена  плохо поддаются правилам, а действует принцип "как когда-то записали", то и появилось двоякое написание. Чернышов и Чернышёв из той же оперы.