Сходите еще раз к другому. Потому что флора может быть  "убита" именно из-за хеликобактера. Повторяю. еще раз: какой смысл что-то "восстанавливать", чтобы его тут же снова убить, а потом опять восстанавливать - еще раз пить всю эту гадость? ?  Если что - курс антибиотика дней 10, и для приема во время или сразу после выписывают препараты для восстановления микрофлоры.