Да, если подписали соглашение сторон, то это не сокращение. Нельзя сократить беременную по инициативе работодателя, а соглашение сторон - это не инициатива работодателя. Советую если что письменно подать заявление, что хотите изменить условия соглашения, не факт, что поможет, но есть судебная практика, когда в таких случаях суд на сторону беременных вставал.