Не нарушит,  врачу нужно было сообщить обязательно вы рискуете себе подорвать всю флору. Кисломолочку пейте обязательно ,  месяц точно после отмены. В период приема антибиотиков любые "полезные" линексы, бионы и тд практически бесполезны.