Может быть реакция на вирус, а может быть и что-то иное.Как вам уже написали,хорошо бы к ревматологу и УЗИ коленей сделать. К ортопеду тоже можно,он суставами занимается. А колени при болях не опухают,подвижность в них  не уменьшатся?