У вас фильтр песочный? Не пугайтесь - часто вода наливается коричневая или красная или зеленая и кажется, что ее не отмыть. Фильтруйте сутки-двое подряд, промывайте фильтр, если надо, вода очистится за неделю максимум. Когда пылесосите - ведите щеткой аккуратно, не отрывая от дна - будет меньше баламутиться.