Нет, всегда оплачиваются только рабочие/отработанные  дни.  Если бы вы отработали весь январь, то получили бы свой оклад  как обычно, просто стоимость одного рабочего дня в этом месяце будет высокая. Проверить проще простого: берете свой оклад (если у вас именно такая система) делите на 15 (если обычная пятидневка). В итоге должна получиться та сумма, что вам заплатили за 1 рабочий день 11.01.2016