У меня было аналогично, в тот год, когда я начала активно кататься. Но потом оно самоликвидировалось. Наверно, моему примеру следовать не стоит, так как я к врачам не обращалась) Рассказываю просто к тому, что это все было один сезон. Потом через 6 лет это частично вернулось, но это уже после марафонов, но в общем оно мне пока не мешает - иногда ноет то одна коленка, то вторая, обычно после болезни. Но у меня никогда они не болят на ходу- как только разогреваюсь, все проходит. Из моего опыта - нельзя пренебрегать разминкой, объемы надо увеличивать постепенно, процентов на 10-15 в неделю. Если болит- перерыв, пока не пройдет.  Еще я глюкозамин-хондроитин пью временами. Классикой надо ходить обязательно, это теперь я точно знаю