И это прекрасно, что они выглядят разными, а раньше вообще было принято давать несколько имен.  Именно для этого их и уменьшают, что бы именем выразить отношение. Я вас в этом не пойму. Для меня логично уменьшать имена и ласково обращаться к детям. Взрослые как представятся так и называю. Звать все равно будут по разному. В саду и школе, если детей с таким именем будет много вообще по фамилии. И даже вот Яну назовут Яночкой, когда захотят порадовать или выразить нежность, Антона Антошей или Тошенькой, Дениса - Дениской.  Ну вот принято у нас формой имени подчеркивать с чем обращаешься.