Вообще-то когда высевают патогенную  или условно патогенную флору,то ее тестируют на восприимчивость к лекарствам.и назначают именно это конкретное лекарство.По крайней мере, у меня так было.Кроме антибиотиков есть бактериофаги.вам не назначали?