По-моему, ничего страшного. В нашем случае - так же. Предъявим СНИЛС вместе с паспортом, и все дела. Главное, что заявление в системе прошло, и ему присвоен номер и статус "принято". Значит, школа нас видит. А все остальные проблемы, если таковые возникнут, будем решать по мере поступления.