Из Берлина с центрального железнодорожного вокзала, а до него вам из аэропорта никакое метро не нужно, автобус прям возле вокзала останавливается. У нас поезд из Берлина отправлялся в 10:46 в Праге были в 15:27, поезда хорошие, мы бронировали через интернет еще из дома билеты.А по поводу пересадок это да, но я была с сыном, который все понимал сразу, в отличии от меня и был моим поводырем