НДС и Прибыль засчитываются, так как эти налоги федеральные.Согласно п. 1 и 5 ст. 13 НК РФ НДС и налог на прибыль организаций являются федеральными налогами. При этом налог на прибыль уплачивается в два бюджета: федеральный и региональный (п. 1 ст. 284 НК РФ). Если раньше переплату по налогу на прибыль можно было зачесть в счет недоимки по НДС только в части переплаты в федеральный бюджет, то с 2008 года всю сумму переплаты по налогу на прибыль можно зачесть в счет погашения недоимки по НДС, поскольку оба налога являются федеральными.Если нужно, то я могу вам прислать заявление, по которому у меня все зачли.