Я конечно не юрист и не финансист, но насколько я помню, налог платиться с дохода. А у вас разве доход был? Вы же еще и ипотеку брали. Попробуйте на сайте налоговой заполнить 3-НДФЛ по всем параметрам на проданную и купленную квартиру. Там же и налог к уплате или к возврату посчитается