Подавайте только на академический бакалавриат, т.к. прикладной - это новинка, но типа тоже самое (в смысле образования, только больше практики, но меньше теории).   А на самом деле даже сами ВУЗы не знают, как будет дальше (намекают, что это похоже на техникум) и как потом с магистратурой будет пока непонятно.