Да уж, действительно накосячили греки так накосячили. Вообще в паспорте по правилам не может быть двух шенгенских виз. т.е. если уже есть шенгенская виза и по какой-то причине нужна другая, то предыдущую нужно предварительно закрыть. Но уже хорошо, что все поездки по этим визам прошли нормально и на границе не придрались. Тут вина абсолютно не ваша, указывайте все как есть по датам на визах.