Сдать на дисбактериоз в Габричевского и сразу на чувствительность к фагам. Если все чисто - гидролизат ест. У моего ребенка аллергия на белок коровьего молока - со стулом проблем не было, а вот АД цвел бесподобно. У старшего ребенка - были стафилоккок и палочка, вот  у него то понос был, то запор. То стул зеленый, то желтый, то нормальный.