Зависит от Ваших договоренностей с няней: если няню устроит 3 месяца отпуска за свой счет, и Вы уверены, что она в сентябре выйдет к Вам, то не оплачиваете; если же няня дает понять, что ей проще найти другую работу, то смотрите, что Вам важнее: именно эта няня или 3 месяца без оплаты (но в сентябре ищите новую); Вы обсуждали с няней этот вопрос?