Перенести не получится, т.к. годовой шенген выдавался Чехией. Если обрашаться в чешское кoнсульство, то с вновь поставленной визой нужно сначала снова ехать в Чехию. ( правило первого вьезда) Она с этой визой уже ездила в Чехию, а потом в Германию. Сейчас пришлось делать новый паспорт, т.к. старый был действителен менее 3 месяцев с момента теперешней поездки, могли придраться.  Я сама лично ездила 2 раза с новым паспортом( получала в Москве) и аннулированным старым , в котором стояла виза. Но у меня виза рабочая,я в Германии живу. Никаких проблем ни на секунду не возникло, ни в самолете, ни на границах.  Но у мамы виза туристическая. В консульстве говорят, что все ОК, звонила 2 раза уже. А Вас что,лично не пустили в самолет?