Если не можете запретить проживать лично (вы имеете на это право), то придется обращаться в суд с иском о выселении. Заранее запаситесь доказательствами именно проживания в квартире сожителя - вызовите полицию, пусть дадут отказ, свидетели - соседи  и т.п.