В Книге Доходов и Расходов в соотв. квартале забиваете в строке вручную, это если у вас в С1 - по такому-то договору, такого-то числа, такая-то сумма. Никаких объяснений не нужно, только если налоговая потребует. Сами распечатываете со своей карты платежку на приход денег и делаете выписку на этот день, должно быть понятно от кого пришло и по какому поводу, подкалываете в папку банк, как и обычно. Всё. Если налоговая попросит, приенесете им эти платежку и выписку и договор. Ну, максимум, попросят ещё выписку с карточного счета более развернутую, но они и сами у банков запрашивать могут, без вас.