Сразу в стаканчики рекомендуется сеять то, что не любит пересадки (огурцы, например). Все остальное лучше в большие плошки. Во-первых, у семян разная всхожесть, многое может банально не прорасти. Во-вторых, всходы разные, что-то посильнее, что-то послабее. Вот при пикировке это решается легко. Вам же не нужно 100 кустов помидоров?