Я, конечно, не спец в гинекологии, но на самом деле ПЦР действительно не особо информативный метод, так как он просто показывает наличие возбудителя, а не наличие заболевания, им вызванного. и для многих инфекций он (возбудитель) может присутствовать годами, ничего не вызывая. Для подтверждения именно инфекции в активной стадии делается ИФА на антитела в крови, и оценивается  в динамике. Если есть IgM - это признак острой инфекции. Или же нарастание титра IgG, если раньше они были (по сравнению со старыми показателями).