Заниматься дополнительно, помочь. Ведь не просто так троечник. Если понимание есть, материал хорошо усваивает, но тройки из-за поведения, невнимательности, неаккуратности, то я бы не сильно переживала на самом деле. Если это уже старшие классы, то забить и найти, что интересно и узконаправленно прикладывать усилия в этом направлении и разрабатывать, делать ставку на то, что именно это будет ориентиром для поступления в ВУЗ, потом специальностью. Остальные предметы поскольку-постольку.