И так и так. При именно фонетическом разборе, полном - в столбик. Но в некоторых заданиях бывает и в строчку, сокращенный вариант. В строчку частенько встречается в разных тестах, олимпиадах, либо на уроке, когда по-быстрому разбирают сразу много слов. В началке была программа 2100, тогда оба варианта были, но полный разбор чаще. С 5 класса второй вариант чаще встречается.