Рот полоскать хлоргексидином + мазать холисалом +  если есть возможность физиопроцедуры в районной стоматологической поликлинике (они там обеззараживающим светом светят - быстрее проходит). А вообще стоматит - это общее снижение иммунитета. У меня сынок одно время часто мучился пока с иммунологом полное обследование не прошли и лечим причину, а не последствия. Несколько лет уже стоматита  не было.