Никакой разницы. По заключению они правы. Вы можете получать его по месту фактического проживания, предоставив просто справки о постоянной регистрации с её места, но вы обязаны предоставить согласие всех совместно проживающих, либо спокойно оформляйте заключение по месту вашей квартиры.