Вообще общий антибиотик назначают по анализу крови. Хорошо бы сдать вам общий крови срочный, и будет понятно, нужен ли антибиотик. Что касается кишечных проблем, стул от антибиотика вряд ли лучше станет. Такое мое личное мнение. Температура при вирусе может держаться не день и не два, это же не показатель (особенно если есть динамика положительная, ну то есть немного ниже становится или жаропонижающего на дольше хватает)...