Не надо забывать, что в тот момент советское правительство только-только сформировалось. И не везде оно имело достаточное влияние, особенно в отдаленных областях. В стране еще не закончилась первая мировая, и уже началась гражданская война. Большевиков драли на части. В этой ситуации любой из выживших Романовых придавал монархически настроенным группам сил бороться с советами. А тех, кто находился при Романовых - доктор, прислуга, расстреляли уже как свидетелей, я думаю. Не зря же пытались тела уничтожить так, чтоб следов не осталось. Я думаю, что на каком-то этапе произошло то ли непонимание, то ли разногласие между правительством в Питере и тобольским комиссариатом. Может, в менее опасной для советов обстановке решение было бы другим. А тут сработал инстинкт самосохранения.