Не парьтесь. Моему сыну тоже на протяжении всей младшей школы снижали оценки за почерк (особенно по русскому языку, несмотря на "врожденную" грамотность, что было очень обидно). Начиная с пятого класса на почерк перестали обращать внимание и по русскому наконец-то вышла "пятерка". Конечно, все равно стараюсь следить, чтоб совсем в мазню не соскакивал (писать не любит вообще), но учителя в старшей школе более адекватные и смотрят на знания.