Циклюйте паркет шлифовальной машиной. Аккуратно соберите опилки-стружку в пакетик. Купите паркетную/деревянную шпаклевку под цвет. Смешайте с опилками в кашицу и заделайте щель. Только имейте в виде, что при высыхании шпаклевка проседает. Поэтому лишние опилки не выбрасывайте, а сохраните. Когда полностью реставрированная щель подсохнет, добавьте еще смеси. Потом все вместе зашкурьте и покройте нужным лаком. Ничего вообще видно не будет.