Выше писали, что такое бывает - из-за каких-то сбоев заявление двоится. И одно регистрируется, а на другое приходит отлуп. Звоните в ОСИП, вероятно они видят два заявления. Не переживайте раньше времени, попробуйте дозвониться.  Подать новое заявление с тем же свидетельством вам система все равно не даст.