Самолетом конечно удобнее прямо в Мюнхен долететь, но раз можно только поездом... На какой вокзал приходит ваш московский поезд? если на Центральный, то оттуда и на Мюнхен уехать можно. Вам бы лучше без пересадок найти который. Билеты можете купить на сайте дб.де заранее, так они очень дорогие, около 100 Евро. Нумерация путей крайне понятная и лаконичная, на билете указано, с какого пути поезд пойдет. Автобусы тоже естьhttp://meinfernbus.de/booking/search?route=Berlin+ZOB-M%C3%BCnchen+ZOB&depart=27.10.2013&from=1&to=10&adult=1&children=0&bikes=0 вот например, но идет не от Ц. вокзала, там добираться надо двумя электричками, подходит ли вам?  Где искать помошника- не знаюУдачи вам!