имхо, если рассматривать затопление квартиры ассоциативно (а все сны о нас и наших чувствах, какие бы картинки мы не видели во сне), плюс Ваша ремарка про "подобное про квартиру в разных вариациях", то предположу, что речь идёт о каком-то ограничении, несвободе, отягощающем Вашу душу/Ваше внутренее. Квартира, как жильё - это символ дома души, то есть Вас. Дождь во сне и омовение водой жилища - это желание (или уже происходящий процесс) омовения/очищения себя  и достижения душевного равновесия.