Конечно, должна была по-хорошему сказать, что Костя напишет контрольную попозже, когда освоится, или хотя бы поинтересоваться, что он прошёл во время болезни. У нас учителя специально для проболевших или непонявших проводят доп. занятия. В эл. журнале можно не ставить, можно исправлять и т.д. и т.п. по-крайней мере наши правят без проблем. Может, попытаться поговорить с учителем, она могла просто не заметить, что Кости так долго не было, она же у них первый год  ведёт и всего 2 раза в неделю...