Совершенно верно. Льгота будет действовать только с мая, за предыдущие 4 месяца налог будет начислен в полном объеме. Но льготу вы получите после того, как не будет задолженности по начисленным налогам ранее. Т.е. нужно вместе с подачей заявления на льготу по транспортному налогу запросить справку о наличии/отсутствии у вас задолженностей по иным налогам (скажем, по налогу на имущество), все аккуратно уплатить и уже смело рассчитывать на предоставление льготы.