Если субъективно оценивать, то мне на Корфу показалось теплее,хотя мы там и были-то неделей раньше.Но по большому счету море теплое и там и там,но есть нюансы.Разные части острова, разные пляжи и тп. На Крите море показалось более "волнующимся",а там, где волны, там уже проблема температуры на второй план отходит.Еще в районе Палеокастрицы традиционно море считается холоднее из-за течений, хотя лично я особой разницы не почувствовала.Но на южном побережье Крита(там, где мало отелей предлагается) возможны мерзкие ветра. И это не просто ветер на море, а атака острых песчинок на человека.Возможно тоже сезонное, но на том побережье мало кто базируется массово, из россиян по крайней мере.Смотря какой период еще Вы рассматриваете.И смотря какие цели. Если ребенка вывезти, то надо возраст учитывать. С более мелким лично я бы Корфу предпочла,а когда постарше станет, то уже Крит. Если к ребенку привязки нет, то оба острова в плане тепла и воды нормальны,если конечно брать лето и бархатный сезон.