Ну, видимо, запрещающий врач опасается ныряний как раз, а не попадания воды в ухо. Но бароотит (вид тубоотита) случается обычно при конкретных нырках с высоты, с аквалангом или с вышки. Вряд ли Ваш так ныряет.но "за или против бассейна" у детей с ЛОР-проблемами - вопрос правда спорный.