Причин запаха из рта может быть несколько - заболевание зубов, ЛОР- органов и органов пищеварения. Вы востанавливали микрофлору. а какие анализы сдавали. Минимальные обследование - УЗИ брюшной полости, анализ мочи на диастазу, капрограмма. Кроме того, ребенок нуждается в контроле питания.