договариваться надо с руководителем напрямую. А если нет, то править после каждой главы, а не шлепать на стол руководителю готовую работу.... Да, вообще, по разному бывает. Я вот видела по одному свою работу, руководитель по другому. Я пыталась было заикнуться, что не о том работа должна быть, но спорить не будешь.... С ее же помощью и написала то, что на защите было не понято комиссией. Они спрашивали, почему я решила писать об этом и так, ведь это вообще из другой оперы.... Пришлось защищаться, нести ересь про такой подход к этой проблеме и поставили четыре только потому, что руководитель  рекомендовала оценку "отлично" поставить. У меня причем была готовая, полусплагиаченная работа по этому же предприятию на эту же тему, но руководитель такую не одобрила.... а была бы пятерка.. Вот и пиши сам.