А почему инспектор просит пересдать? У Вас все документы в порядке? Тогда имеете полное право предъявить к вычету, независимо от того, что входящий НДС больше начисленного.Если не хотите с ними спорить, можно часть НДС к возмещению предъявить в следующем квартале, мотивируя это тем, что входящие счета-фактуры получены именно тогда (правда, это надо подтвердить, например, конвертом со штемпелем и т.п.).