Пространственные изомеры (в данном случае цис- и транс-) могут быть только при двойной связи. Потому как вращение относительно нее проблематично. При одинарной связи не может быть изомерии, т.к. вращение по С-С свободно. Насыщение двойной связи водородом ведет к исчезновению пространственных изомеров, т.е. исчезновению цис/транс изомеров. Как-то так. Или вы автор этих дурных программ?