От прошлых периодов вам никуда не деться,придется вносить исправления,доплачивать налоги.Но в этом нет ничего страшного,к процессу желательно подойти творчески,но со знанием законодательства,в частности ПБУ 22/10. Определите для себя,будете ли стараться успеть внести все изменения до 30 марта или исправление займет более долгое время,от этого зависит метод внесения исправлений.Определите критерий существенности ошибок(значение этого термина можно посмотреть в правовых базах) и хорошо было бы если бы ваша организация относилась к малым предприятиям.