Чтобы знать, каких документов недостает нужно еще и банк ввести. По зарплате документы есть (табели,расчетные и платежные ведомости)? Кроме ввода первички вводятся данные об организации (она одна или несколько?), кадровые документы. Вам нужно просто ввести то что есть, или восстанавливать учет?