ВОТ http://www.fb2epub.net/rus/index.html - встраивается в проводник Виндоуса, далее выделяете кучу файлов fb2, правой кнопкой мышки на контекстное меню, там сточка - конвертировать... Всё, все файлы в epub. Два года пользуюсь, довольна.