вместо бега переходите на элипс, колено лучше ничем таким не заматывать, если только это не экстренным случай (соревнование), и надо срочно "на ковер" выйти и отработать программу.Как уже выше посоветовали - укрепляйте околоколенные мышцы, исключите ударные нагрузки, и не будет никаких болей.