Линекс или Бифиформ или другой препарат группы нормализующих флору кишечника принимайте уже сейчас, а также не менее 7 дней после отмены антибиотиков. Иммунитет сейчас после всех этих "приключений" слабый, а после антибиотикотерапии есть риск дисбактериоза, он Вам сейчас не нужен. Скорейшего выздоровления!