Не очень понимаю, почему мы выбираем между мамой и бубушкой? Врач где в этой схеме? Вы ведь обращаетесь к врачу, ну хотя бы ради справки, дети ведь в школу и детский сад ходят? Ни один нормальный врач без оснований не выпишет антибиотик. Надеюсь, для мамы назначение врача - это аргумент?А в целом мама может делать по-своему, если Вы для неё не авторитет, причём, в таком случае она  будет поступать по-своему во всём. Наверняка у Вас столкновения не только по поводу лечения детей. Раз Вы вместе живёте и прибегаете активно к её помощи, нужно учиться договариваться, объяснять свою позицию. НО не в приказном порядке и не в таком ключе как "я мать и только мне решать". Аргументируйте, в чём-то идите навстречу, настаивайте, но  и обязательно подчёркивайте как она Вас выручает и как Вам пришлось бы трудно, если бы не она.