Самим весь этот список точно не объехать, то есть такси - самый оптимальный вариант, хоть и наименее бюджетный. Зато гарантированно увидите максимум. Вариант, если надо побюджетнее: экскурсия по Бока-Которскому заливу, начало в 9 утра-  и до 6 вечера, плюс минус час у разных фирм. Увидите Герцег-Нови, Котор, залив с его островами, остров с бывшей тюрьмой (Мамула), заедете для купания в Голубую Пещеру... ну и прочие радости - все это будет стоить 20 евро с человека (правда, еще по 3 евро с носа - за Голубую Пещеру, но как вариант можно не поехать туда, а час пролежать на пляже). Питание на кораблике - доп. расходы, если проголодаетесь.