На море удобнее(размер пляжей,заход в воду) ,чище вода.В Боко-Котор.заливе интенсивно работает паромная переправа и заходят в Котор пас.лайнеры.Рядом с береговой линией идет автодорога летом с очень оживленным движением и заход в воду,как правило,с бетон.пандусов.Но в заливе больше сдаваемого фонда прямо у моря и очень красивые старинные города Котор и, мой любимый,Пераст.До удобных пляжей можно добраться на лодочках.Но с маленькими детьми все же советую открытое море.