Если документов разное кол-во и они разные по структуре, то как раз логичнее было бы расчитывать нагрузку по часам  Например, сегодня 5 накладных с большим кол-вом товаров, из них половина с уже заведенным товаром, половина с новым товаром, который еще надо завести. Возни на целый день, при чем на часть документов будет затрачено меньше времени, чем на вторую часть. А завтра 50 документов, которые вводятся за полчаса функцией "на основании". Если считать по кол-ву документов, то в первый день можно поработать за 400 руб целый день, а второй день за 4 тыс полчаса.Если бы работу выполнял программист или другой специалист, то он бы взял оплату за фактически затраченное время. И только бухгалтеры перемудрили Мне кажется, что сдельную оплату за каждую операцию целесообразно брать только когда все операции идентичные по трудоемкости.