НАсчет визы. Визу можно сделать самостоятельно. Но, 1 - если в вашем городе есть японское консульство, 2 - если у вас есть гарант. Гарант, это человек, живущий в Японии (не обязательно японец, но человек имеющий там долгосрочную визу), который может за вас поручиться, составить вам программу пребывания в стране и выслать ОРИГИНАЛЫ документов. Очень желательно представить в консульство документы, доказывающие ваше родство либо тесные дружеские отношения с гарантом (совместные фото, письма). В таком случае виза будет бесплатна. Найти приличную ТФ, которая будет со всей отдачей выполнять ваши запросы дело не легкое. Обычно ТФ работают по шаблону, и это касается и перелета и отеля и экскурсий. Как вариант, могу дать контакты гида в Японии. И вам будет обеспечен индивидуальный подход  У меня родители осенью были первый раз в Японии именно по такой схеме. САми брали билеты по акции (ни одна ТФ вам это не предложит), сами бронировали отель, а уже в Японии встречались с гидом. В итоге это вышло намного дешевле, чем поездка с туроператором. Ну а про разницу самостоятельного путешествия и путешествия с группой я, пожалуй, ничего говорить не стану. Для меня лично групповые экскурсии вообще не допустимы Кстати, в Японии вероятность непредвиденных ситуаций сведена к нулю  Ну медстраховку, я думаю, вы сделаете.