А почему не задать учителю вопрос через электронный журнал? Кстати, у учителя может быть и своя версия происходящего, отличная от версии детей. По теме - тройка за четверть считаю перебором, а вот обеим выставить при спорных оценках по нижнему баллу - это нормально в данной ситуации. Устроить контрольную еще раз в самом конце четверти может просто не быть технической возможности.