Это вы путаете. Грамотность в Великом Новгороде была прямым следствием того, что она была распространена по всей Руси. Просто с приходом монголо-татар, когда русские земли массово были выжжены, люди повально угонялись в плен - заниматься образованием стало некому. В итоге образование осталось доступным лишь боярам и их детям. Новгород от нашествия не пострадал, поэтому там традиции всеобщей грамотности сохранились.