Во Фьюмичино действительно есть терминал, который стоит отдельно от основного здания аэропорта, оттуда в аэропорт нужно ехать на специальном шатле, но там не автобус а электричка. Перед посадкой на внутренний рейс, конечно же нужно будет пройти паспортный контроль, но вы мимо не пройдете, там просто нет другого выхода, только через паспортный контроль. Единственное, что нужно быть внимательными, после паспортного контроля не выходите в "город", иначе придется заново проходить контроль безопасности и на этом потеряете время.