А есть у вас полные данные анализа? Количество лактобактерий, бифидо? Если не ошибаюсь, нормальная флора, если она в достаточном количестве, сама постепенно вытеснит патогенную (ваши Е-коли). В любом случае, лечение должно быть такое, которое помогает насаждать "хорошую" флору, т.е. пробиотики - бифидумбактерин, например, аципол и т.д. Энтерофурил, который вы принимали, не решает в данном случае вашу проблему. Его назначили, чтобы не развивались острые кишечные инфекции из-за слишком сильного размножения гемолизирующей кишечной палочки.