вы можете воспользоваться двумя вычетами - при продаже и при покупке. налог - на разницу между покупной и продажной ценой той квартиры, которую продаете. и  продавать-покупать надо будет в один календарный год. если в разные, то вначале придется заплатить налог, а уже на будущее - воспользоваться вычетом. три года до подачи заявления на вычет применяются, когда  недвижимость была приобретена несколько лет назад, а право не было использовано.