Субсидия, про которую здесь идет речь выделяется ввиде документа - Свидетельство оно называется. В нем прописана сумма субсидии (денежных средств), напирмер 100 рублей.Если Вы  найдете квартиру за 100 руб, у вас эта сумму будет прописана в договоре купли/продажи. и будет равна сумме, указанной в свидетельстве.Если вы найдете квартиру дороже (скажем 150 руб), то в ДКП будет прописано, что  50 рублей Покупатель (то есть вы) оплачиваете путем перевода на р/сч Продавца (или наличными через ячейку), а 100 руб - путем перечисления безвозмездной субсиидии и т.д.Сумбурно. но надеюсь понятно написала