Вы определитесь, с какой целью едете в Рим. Если планируете только по городу гулять, то селитесь в центре, там приятней. А если выезжать еще куда-то думаете, то самое лучшее - около Термини. Конечно, там грязновато (как и на всех вокзалах), но ходить там совсем не опасно.