а вот это как раз и не удивительно... Вы въехали в шенгенскую зону по визе, и перемещаетесь по ней же...А вот если бы Вы поехали из Словении в Хорватию, то паспорт бы у Вас спросили и на выезде, и на въезде. И описанная выше ситуация аналогичная - Черногория не в шенгене.