Так и делайте,как описали,разделите и посадите в стакан,добавьте грунт.Ипомею можно заглубить,ничего страшного,а вот петунию очень аккуратно засыпайте до семядолек,уж больно она хрупкая.Если чем-то поможет,то вот:http://content.mail.ru/arch/21784/7276954.html