Как я понимаю по закону, если человек на СО, то он может в любой момент (хоть посередине года) вернуться в класс, к которому приписан. А вот если человек на экстернате, то он как бы за бортом, то есть хотят примут (если места будут), а не захотят не примут. В остальном имхо не имеет значения никакого.