До аэропорта Вас те же самые электрички и от ж/д вокзала довезут  Перейдёте на S-Bahn и прямым ходом в аэропорт.В Мюнхене всё находится относительно близко, очень много можно без проблем пешком обойти, если кондиция спортивная позволит Но, конечно, если при этом тащить сумки, то удовольствие это относительное. На ж/д вокзале есть, кстати, ящики хранения. Просто, как вариант, чтобы со всем добром не таскаться. Даже если от Мариенплатц будете ехать в аэропорт, то возьмёте любую электричку до вокзала, возьмёте вещи и поедете дальше на S1 в аэропорт. В Мюнхене, если меняешь направление движения, например, проехал остановку и обратно едешь, то нужно платить отдельно. Поэтому и советую такой маршрут, чтобы в одном направлении двигаться.