Не знаю, о каком заболевании вы ведете речь, поэтому теоретически могу допустить, что его лечение финансируется исключительно из федерального бюджета, хотя и сомневаюсь в том, что конкретно для этого заболевания делается исключение. Что же касается перечисленных вами ниже заболеваний, то источники финансирования их лечения различны - одни больные финансируются из местного, другие из федерального бюджета, хотя по этим заболеваниям действительно имеются всероссийские программы, предполагающие, что затраты местных властей будут компенсироваться. Но, видимо, их то ли не компенсируют в полном объеме, то ли просто разворовывают. Кстати, когда вводилась система квотирования, то едросы пытались все эти программы зарубить.