Вы зря так расстроились, не разобравшись, налоги не могут быть больше заработанного, это уж Вам любой человек подтвердит, даже не бухгалтер. Поэтому вывод один, бухгалтер Вам что-то не то насчитала. Разбирайтесь в документах и расчетах, ищите ошибки. Бухгалтеру сообщите, что как-то странно посчитано, пусть она расскажет про цифры, откуда что взялось.