И по этим документам отпуск по новой зарплате ну никак не смогут посчитать  Его всегда считали за определенный период - среднюю зарплату. Либо за год, либо сколько отработал. При расчете отпуска в апреле, мартовская зарплата конечно будет учитываться, но повлияет она незначительно.