никакой связи между продажей и покупкой нет.налог платится с разницы между ценой продажи и покупки старой квартиры (если получена безвозмездно с разницы между ценой продажи и 1 млн. рублей), а не продажи старой и покупки новойНО!если вы не использовали право вычета с покупки, то у вас возникает право вернуть часть налогов уплаченных ранее при покупке новой квартиры.и тут  у вас может произойти зачет