Да, тогда после рождения ребенка подавать.Перепрописать можете, перепрописка несовершеннолетнего ребенка ухудшением не считается. Если сейчас, как я понимаю, во второй квартире прописано 5 человек, то станет 4, т.е. останется площадь 68/4 = 17. Тогда у вас будет всего 37+17 = 54 м2, и вы сможете подать на субсидию не дожидаясь малыша. Но прежде чем затеваться с перепропиской, уточните на работе, подходите ли вы по всем остальным критериям для получения субсидии.