Вот честно - если щели по 5-6 см - то это просто караул. Есть два варианта косяка - вам собрали дом на гвозди или металлические штыри без их зарубания и бревна при усыхании зависли на металлических штырях. Второй вариант - окна и двери вставлены без скользящей окосячки. Скорее всего и то и то. По хорошему - если хотите нормальный дом - то все это безобразие надо перебирать и складывать дом заново. Ловите бригаду и отбирайте у них свои деньги обратно. Даже если вы косметически все это безобразие зашпаклюете, закроете, замажете, то велика вероятность того что со временем вам заклинит двери и раздавит стекла в окнах.