Были в похожей ситуации.По суду можно определить право польззования, выделить в натуре нельзя. Квартира в долевой собственности, поэтому все собственники могут пользоваться всей квартирой,а вот сдать какую-нибудь комнату(даже выделенную в пользование)можно только с согласия всех сособственников. Самое умное в такой ситуации продавать квартиру целиком и делить деньги. Жена законно остаться в квартире не сможет-место жительства детей будет определено либо с ней и у нее, либо в этой квартире и с отцом. Запретить любовнице вселиться в квартиру теоретически возможно через суд (песня долгая), и , как выше сказали, обходится дарением 1/100 доли.