а вы пирог так и будете с костями печь? если нет, то из мороженой все равно кости не вытащить, ее надо  размораживать, тогда положить вишню в дуршлаг, под него тарелку, все лишнее стечет. Чтобы подстраховаться, можно тесто подсыпать крахмалом, он вберет лишний сок.