Ну, при разводе отец детей  не снимет с регистрационного учёта даже через суд, если, конечно,  его родительских прав не лишат и если мать детей будет разумно себя вести. Дети ведь члены его семьи, как ни крути. По-моему, вполне достаточно жене на себя вторую половину квартиры оформить или дарением от мужа, или через брачный контракт + договор дарения денег родителями, подписанный мужем, как здесь советуют, и всё. Не стала бы я детей вообще никакими долями наделять, даже маленькими, дети пока ещё ничего не заработали в своёй жизни, ещё неизвестно, какими они вырастут, что потребуют от родителей, будучи владельцами даже очень крошечных долей в квартире. Возможно они и хорошими вырастут, но гормональные взрывы-срывы в юношеском возрасте никто не отменит, вот здесь-то они легко могут попасть  под влияние чужих людей противоположного пола, которые могут вдруг захотеть воспользоваться их долей в квартире родителей.