В нормальной магистратуре по экономике ваши знания по экономики не особо важны (там как правило много поступивших без экономического образования), куда более важнее  как дела у вас с математикой (скорее даже в плане способностей,  где-то ее дают с высшей математики начиная, а где-то предполагают что вы имеете достаточный математический аппарат)?Если заборостроительный вуз, то вообще не партесь.ИМХО второе высшее по экономике только магистратура, так что выбирайте ту , которая вам по силам.