Ребенок до периода полового созревания увеличивает длину своего тела в основном за счет роста ног, причем, наиболее интенсивно растут стопы и голени. Именно в таких местах, где происходит быстрый рост и дифференцировка ткани, необходимо обеспечить обильный кровоток. Сосуды, питающие кость, мышцу, — широкие, способные интенсивно снабжать растущие ткани кровью, но в них содержится мало эластичных волокон, количество которых увеличивается только к 7-10 годам. Отсюда следует, что циркуляция крови в них улучшается при двигательной активности ребенка, когда идет работа мышц, способствующая росту и развитию кости(а вы болеете и мало двигаетесь). Ночью в период сна тонус артериальных и венозных сосудов снижается, интенсивность кровотока в столь быстро растущих частях тела уменьшается, отсюда и возникает болевой синдром. Вам нужно погладить, помассировать голени ребенка, массаж ног посмотрите в нете. Боль должна отступать,  происходит это за счет усиления притока крови к мышцам голеней, стоп. Если после массажа станет легче то введите эту процедуру как обязательную ночную время подберите сами, желательно чуть раньше того момента когда начинают болеть ноги. Если помогать не будет есть еще разные причины, но о них пока лучше не думать.Напишите как пройдет следующая ночь. Удачи