Обычно квартплату платит хозяин, ресурсы, которые потребляет квартиросъемщик и которые измеряются  счетчиками, оплачивает квартиросъемщик - это вполне логично.Квартиросъемщик  нынче имеет возможность зарегистрироваться самостоятельно в квартире без согласия арендодателя, если вы этого не хотите, можете включить в договор фразу о том, что регистрация ТОЛЬКО по согласованию, и при нарушении этого условия квартиросъемщик либо выплачивает штраф, либо квартплата автоматически увеличивается на определенную сумму. Не знаю, насколько такая фраза будет соответствовать действующему законодательству, но свою роль пугалки выполнит хорошо.