Вот судя по описанию - как раз была черная ножка. То что изначально прокалили субстрат - вы его стерилизовали но на какое-то короткое время. потом микрогрибы все равно приходят. Сыграли два фактора:1. Очень ранняя посадка без досветки (всегда советую без досветки ничего не сеять раньше февраля).2. Субстрат возможно торфяной с кислой реакцией. При переливе рассады на таком грунте ЧН гарантирована.Попробуйте найти грунт с большим содержанием песка. Или сами добавьте песок в готовый грунт. так же действительно помогает посыпка поверхности песком (или вермикулитом) .