Большнство побочных действий возникает при приеме внутрь, внутрь при беременности его не назнают, только местно. При приеме любых антибиотиков могут размножиться условно-патогенные бактерии, надо после лечения флору восстанавливать - заселять хорошие бактерии, а про эндометриоз вы где прочитали? дайте, пож, ссылку