При таком раскладе как жизнь в однушке с родителями или свой дом/квартира, но в МО, я бы выбрала МО. Но, выбирайте как можно ближе (Дмитров, ИМХО, далеко), выбирайте место с хорошо развитой инфраструктурой (с двумя маленькими детьми это очень важно). Ну а к дороге в конечном итоге все привыкают. У меня папа на работу из одного конца М в другой добирается по 1,5-2 часа, и так уже лет 25. Так что вполне сравнимо с дорогой из области.