Ничего уже не сделать. Только договариваться полюбовно, но даже если они согласятся вам выплатить исходя из реальной з/п, то они вынуждены будут выплатить из своего кармана, т.к. отчислений не было и ФСС ничего им не компенсирует. Как вы понимаете, вряд ли они на это согласятся.