Согласен, что на качество не влияет. Согласен, что большие флешки от лукавого.Но ИМХО NTFS больше вызывает доверия при копировании файлов большого размера, особенно больше 4 Гб. Была ситуация у меня когда копировал на флешку с FAT, ошибки при записи никакой не было, но файл оказался "не рабочим" с подобными симптомами. Но как вариант,есть еще exFAT.