думаю, что успеете, эти музеи рядом расположены. имхо, советую вам сначала пойти в Васу, потом в юнибакен. Пару часов на васу, имхо, более чем. а юнибакен может и не хватить, я бы закладывала часа 3-3,5. в юнибакене еще бывают, помимо самой экскурсии, какие-либо развлекалки для детей, типа, делаем имбирное печение и тд. тогда к ним выходит пеппи длинныйчулок и развлекает их. советую вам, чтобы впечатление ребенка от музея было "законченным" еще узнать расписание и этих занятий. думаю, что очередей не будет. васа вообще мне показался музеем "двух комнат." Смена караула - посмотрите в путеводителях, 11 или в 12. около королевского дворца, в старом городе. можете сходить погулять в скансен (музей и зоопарк под открытым небом), там тоже есть прикольные мастерские - как выдувают стекло, пекут булочки и тд. на скансен я бы закладывала мин 4 часа.  возможно, вы не успеете, но при желании возможно.удачи!