Учитываются, но странным образом. К примеру, на мех-мате  принимается ЕГЭ по математике, но вместо ЕГЭ можно прийти и написать там обычный письменный экзамен по сути, приличную оценку на котором засчитывают как 100% по ЕГЭ. И плюс к тому осталась устная математика. То есть ЕГЭ как бы есть, но как бы и не совсем.