Для вас это доход , а для клиента (юр. лица- расход). Вы должны даже при работе с физ лицами и получением от них денег в конце отчетного года декларировать свой доход и платить налоги. Клиент юр.лицо в отчетный период тоже подаст документы в налоговую , где скорее всего укажет уменьшение своих доходов за счет разработки сайта( хотя это смотря конечно какая у него система налогообложения)