много чем отличаться могут.лицей, гимназия, прогимназия - это статус выше, чем обычная школа.Программа может быть более углубленная, какие-то дополнительные занятия, которых нет в обычных школах.Контингент учащихся несколько другой.Режим отличается (у нас вот школа полного дня - в 8 утра привел в 18.00 забрал, и это не продленка, это такой режим работы школы, если надо забрать раньше, то чуть ли не заявление писать надо с указанием причины)и.т.п.