Маяки всегда входят в стоимость штукатурных работ и устанавливаются на ту же смесь которой производят штукатурные работы без добавления каких то прокладок(развод)причем маяки после схватывания штукатурки ,удаляются из основания стены.Самовыравнивающие смеси нельзя смешивать с другими смесями тем более если они разные по составу(гипсовые,цементные)Для чернового выравнивания стяжки используется самовыравнивающая смесь крупной фракции (Ветонит 5000)или пескобетон М 300 смешаным с плиточным клеем в пропорции.Все слои грунтуются.Самовыр.смеси в большинстве являются финишными до 10 мм,не пытайтесь ими поднимать стяжки серьёзный  удар по кошельку.В вашем случаи бригадир первоначально должен был проверить кривизну основания пола,а уж потом вынести решения по выравниванию,что бы для Вас это не было открытием \\\ факта проблемы.В любом случаи придётся выравнивать в два этапа(черновой-финишный)Что касается штробления(Если стена тонкая то желательно штробить после штукатурки.Если перепад от первоначальной стены до оштукатуренной свыше 30 мм то коммуникации вполне можно закрепить на стене и нанести штукатурку сверху по маякам.