Да, сначала выделить долю и получить отдельное свидетельство. Это рядовая процедура (хотя можно ее усложнить, но итог тот же).Вообще, на вашем месте, я бы попробовала выйти на контакт с отцом и предложила бы решить вопрос с недвигой сейчас, при его жизни. Т.е. попросту выкупить у него эту долю. Дабы избежать геморроя, который не нужен ни вам, ни наследникам.