Если будете продавать, то платить налог с полной суммы не нужно будет. Прямой ссылки на закон нет, но есть письма Минфина разъясняющие эту ситуацию. Если Вы 1 долей владели более 3-х лет, то и со свей квартиры налог не платите при продажи.