"мотивируя тем, что регистрируется не только ДКП, но и одновременно право перехода собственности на покупателя, а последнее невозможно без АПП"Последнее возможно в любом случае: с обременением или без (зависит от текста ДКП). Свидетельство без обременения и без подписания АПП до регистрации возможно получить, если    ДКП правильно составлен (особенно пункт о передаче денежных средств) + в ДКП также прописываются сроки физического освобождения квартиры и сроки подписания передаточного акта именно после регистрации сделки. С правильным  текстом ДКП Вам не имеют законного права чиновники в рег. палате отказать.