Если вы сделаете гистеру во второй фазе цикла, то например гиперплазию диагностировать не смогут, если она конечно есть. А с ней протокол будет пролётным. Поэтому на какой день цикла её делать вам должна назначить врач. И это достаточно принципиально. А месячные ваши ни с чем не связаны. Ну сбился цикл. Это не страшно и делать с этим ничего не нужно.