Принять документы они обязаны были при условии, что сам договор, правоустанавливающие и правоподтверждающие документы есть, что Вами оплачены квитанции и подписано заявление на регистрацию (заранее квитанции и заявление скачайте на сайте, оплатите и подпишите),  что документы подаются уполномоченными на это по закону лицами. Если причина отказа только в том, что отсутствует указанный в документах населённый пункт, значит, пусть так и пишут. А Вы потом в суд пойдёте уже с  их официальным письменным отказом,  а не с голословными утверждениями. Вам так проще будет. Жаловаться на регистраторов можно и нужно в вышестоящую инстанцию: в любой рег. палате и в Москве, и в М.О. сейчас обязательно висит объявление о том, что можно и нужно обращаться по телефону доверия, и телефон там указан. Или жалуйтесь на их действия (бездействие) , на то, что письменный отказ не дают, вот сюда: http://www.to50.rosreestr.ru/