У меня примерно ваша ситуация сейчас - либо трешка побольше, но подальше и район похуже (Фили), либо трешка поменьше, но в любимом и хорошем районе (Мосфильм). Выбрали все-таки квартиру побольше - в ней жить, а не в районе. Так что в вашем случае я - за Коньково, несмотря на нежную любовь к Универу.