Храню в икеевских коробках, детали разобраны - простые прямоугольные блоки, человечки-лопаты-тележки-животные и т.п., нестандартные блоки (краны, транспортёры, поворотные платформы и т.п.). Не самый идеальный вариант, но пока это самое удобное, так как ничего не валяется и всё можно легко найти.