Попробуйте варенные овощи давать, а не сырые и фрукты тоже, проварите или подтушите, а потом в пюре сбейте. Это нормально, не может пока ЖКТ ребенка усвоить сырые овощи и фрукты, вот и гонит транзитом, сырые овощи и взрослые то усваивают далеко не полностью, а процентов на 10-30, остальное транзитом проходит, а зернышки помидора в любом возрасте не перевариваются.