У моего сына так было. Примерно в этом возрасте, постоянно на каких-то бактериях сидели. Неоформленный стул, дисбактериоз как диагноз. После перенесенных ОРВИ ситуация ухудшалась, обязательно на утреннем узи остатки непереваренной пищи видны были. Еще и рефлюкс - как следствие черный налет на зубах. Постоянно на каких-то бактериях сидели, врачи регулярно назначали креон, краткосрочными курсами. После 4х лет у нас все вдруг нормализовалось. И стул, и зубы посветлели. Я так понимаю (была у врачей такая версия), у нас была незрелость ЖКТ.