Если в договоре не указан порядок разрешения споров, то Вы можете действовать по своему усмотрению - либо предъявить подрядчику претензию, либо обратиться с иском в суд. При предъявлении претензии установите разумный срок для ее рассмотрения подрядчиком и выполнения им предъявленных Вами требований. Если работа Вам еще не сдана, то укажите в претензии, что пени будут Вами доначислены после приема работы по Акту. Размер пени и порядок ее начисления указан в ФЗ РФ О Защите прав потребителей ст. 28. Претензию можно отправить по почте письмом с уведомлением и/или курьером (в этом случае подрядчик  или лицо, которое принимает претензию должен указать на Вашем экз ФИО, дату получения и должность)