Не надо идти ни на какой конфликт. Просто пишите бумагу и отдаете ее через секретариат, который обязан все бумаги регистрировать. Просто проследите что бы это было сделано и ждите ответа, если его не будет в течение недели, вот тогда можно уже обращаться в вышестоящую организацию, но в таком случае у вас будет доказательство, что вы эту бумагу писали и приносили. А пока у вас все устно, ваш начальник может просто сказать "а она не приходила".