Теоретически может, так как накопительная аллергия существует.Если  проявления аллергии сохраняются при полной отмене прикорма, на одной смеси, то вероятность большая. Может быть, конечно, реакция на компоненты смеси определенной марки, тогда можно попробовать просто ее поменять-именно марку, а не вид смеси (ступень, кисломолочная).