Сдать анализ на дисбиоз и патогенную флору. Если есть проблемы - лечить. Ну, стафф до определенных цифр имеет право быть, а клебсиелу нужно лечить, например. Причем, настоятельно рекомендую Вам лечить не у педиатра, а у ХОРОШЕГО гастроэнтеролога сразу, а то начнуться "поиски истины", зальете в ребенка кучу дряни, а проку не будет никакого. Мы через это проходили.