Храню, в плоском виде в коробке из под жк-телевизора, но мне проще - свой дом с большим чердаком. Надеюсь потом разобрать по коробкам и отдавать будущим племянникам, а может, и до внуков доживет.  Инструкции в папках-скоросшивателях, в одной дупло, в двух мелкое лего по сериям. Само мелкое лего в пластиковом ящике на большой фланелевой пеленке - достаем, расстилаем (легко искать, т.к. поле большое), а потом за углы как мешок обратно в ящик.