Купите специальный противоклещевое средство и обработайте им ковры несколько раз. Я свой обрабатываю раз в месяц глобально, и раз в неделю немного акарицидного шампуня добавляю в пылесос при мойке ковра.  Ну и работа воздухоочистителя с HEPA-фильтром помогает от аллергии. Аллергенны не сами ковры чаще всего, а клещи, которые в них живут