У нас была такая же ситуация: прописаны в одном районе Москвы, а живем в другом, в купленной квартире, на которую еще не было собственности. Мы обращались в опеку по фактическому месту проживания, проблем не возникло. По квартире принесли договор купли-продажи и гарантийное письмо от застройщика, что на нас будет оформлена собственность, а с места прописки только выписку с лицевого счета.