Сразу хочу сказать что самостоятельное бронирование не всегда дешевле пакета. Если покататься по стране это одно, а если две недели прожить в одном отеле то скорее всего дешевле "пакет". Варианты прямые до Пхукета: Аэрофлот и Трансаэро.Варианты "кривые" с одной пересадкой: Аэрофлот, Трансаэро, Тайские  - до Бангкока. Дальше Бангкок  - Пхукет местным лоукостом Airasia.Варианта кривые с двумя пересадками: Самые бюджетные были Эмирейтс, Катарские. Сейчас слышала что у Аэросвита хорошие предложения. То есть летите Москва - Банкгкок с пересадкой где-нить по дороге и дальше как в предыдущем пункте.Если не удасться купить подешевле Трансаэро или Аэрофлот блочные, то кривой рейс вероятнее всего будет самым дешевым вариантом. Ну или купить пакет сразу у турфирмы.