Фирмы не потеряют, а сэкономят на Вашей зарплате. Т.к. оформление по трудовой и выплата Вам з/п предполагают еще дополнительно уплату за Вас 34% страховых взносов. Если Вы будете с ними работать по договору как ИП, то соответственно зарплаты Вам нет, нет и страховых взносов. Вы для них будете обычным контрагентом.