Суд учитывает мнение органа опеки и попечительства, но  может вынести решение  и вопреки мнению опеки. Вы же пишите, что выиграли суд. Какие у вас сейчас проблемы? Оспорить данное заключение  вы вряд ли сможете. Опека скажет, что давали заключение в соответствии со своим мнением. Ну было у них такое мнение. В порядке обжалования действия госорганов - срок 3 месяца. Смысла особого не вижу. Но может у вас суд еще идет? Тогда лучше в Управление образования написать о том, что меняется заключение на противоположное, в сговоре с матерью детей , которая бросила детей и т.п. Пишут заключение не в интересах детей