У нас в прошлом году так было - неделю кашляла ночью непрерывно по нескольку часов. Пошли к лору, взяли мазок из горла и носа, высеялся стафилококк. Прошли курс лечения, и все нормализовалось. Спросите своего врача, может быть, вам стоит провериться. Наш лор говорила, что именно стафилококк дает такой мучительный кашель.