Во-первых, не расстраивайтесь, так как все решаемо. Директриса на Вас наехала, так как  с 8:30 они отвечают за ребенка и они хотят, чтобы он был под "Контролем". Потому что, если по дороге в школу ко второму уроку с ребенком что-то случится к ним первым будут вопросы. Я советую Вам к ней спокойно и вежливо подойти и поговорить. Если она упрется и потребует, Вы ей скажите, что она (лично) должна написать расписку, что она игнорирует освобождение от физкультуры, данное врачом. Если ребенок получит травму, то в прокуратуре тут же окажется ее расписка, где она заставила Вашего ребенка идти на занятие. Ей не надо этого счастья. Вы должны найти конценсус с ней. Может быть еще и другой вариант: требуется специальная форма освобождения. Обсудите с ней все лично. Извините, что длинно, и немного сумбурно.