Чего-то у Вас какие-то понятия все путанные... Вы сами через это проходили ? или только теорию знаете?  И сверху ерунду написали про депортацию с шенгенской визой и сейчас тоже. Если она летит через Мюнхен в Париж, то штамп в  паспорте у нее будет Мюнхенский. В Париже она уже не будет проходить паспортный контроль. Бывают ситуации, что иногда прилет и стыковочный рейс из одного терминала , тогда могут вообще штампа не поставить, вообще никакого. Точно также при полете обратно, если есть стыковка, то паспортный контроль будет там , где вылет в Россию, а не из Шенгена в Шенген.