Скорее всего Вы уже авансом (по закону так можно) использовали отпуск за будущие периоды (во время отпуска по УР отпуск ежегодный не начисляется). Вы вышли из отпуска по УР и Вы "должны" работодателю, т.к. ещё не отработали ТОТ отпуск. Работодатель перестраховывается, т.к. при Вашем увольнении может быть не из чего удерживать Ваш авансом отгуленный отпуск.