На режимных объектах могут существовать свои особые правила охраны. Я так понимаю у вас просто производство (на любом производстве есть технологи, бухи, кадры и т.п., т.е. некий офис). Распоряжения вашего руководства скорее всего противозаконны, для начала попросите ознакомить вас с правилами охраны вашего предприятия, там должно быть прописано каким образом и чьими силами производится охрана, что входит в их полномочия. Вас с этим вообще-то должны были ознакомить при приеме на работу. Даже если там прописано, что охранник имеет право вас обыскивать, это все-равно противозаконно (обыскаь имеют право только сотрудники милиции в присутствии понятых независимых и под протокол!).