Вас интересует в принципе статус резидентности или для целей налогового учета? Если для целей налогового учета, то могут к договору еще справку с места работы предоставить о том, что человек фактически работал все это время и находился на рабочем месте. А когда он въезжал в страну (даже при безвизовом въезде) ему разве штамп в паспорте при пересечении границы не ставили? Или он из Беларуси? Если есть погранконтроль, то в паспорте штамп стоит о въезде в страну и отсутствует о выезде - отсюда и считать можно.