Да, получится, что труба от насоса и до вашей системы водоснабжения в доме будет пустой. Самое проблемное место, это место где труба выходит из земли и заходит в дом, там вода  часто замерзает, даже если дом отапливается. Но вообще-то, если дом зимой не топится, то проблемным местом становится вся система)) - воды не должно быть нигде.