У меня такое бывает, если йогурт перегреется. Но я по-другому делаю. Молоко не кипячу, холодным разливаю по бутылкам 800-граммовым, добавляю в каждую около полстакана активии, может, чуть больше. Закрываю крышкой, укутываю в полотенце, и ставлю в батарею на кухне, она у меня там не очень горячая. Вечером ставлю - утром готово. Раньше в полотенце не укутывала, ставила прямо на батарею, и бывало так, как у тебя получилось, потому что слишком горячая батарея была.