Если в суде вы восстановили срок на принятие наследства или установили факт принятия наследства, то сейчас считается, что вы приняли любое наследство. Судя по всему, наследственное дело вы не открывали у нотариуса, и сейчас вам нужно на основании решения суда пробовать его открыть в Москве у нотариуса по последнему месту жителсьтва умершего. Если нотариус вам откажет оформлять долю и открывать дело, то признаете право собственности на долю в квартире в суде Петербурга. Если она так и оформлена на отца, то проблемы быть не должно