Действительно, Вам с заведующей повезло Тогда, да, поблагодарить стоит - нечасто в наше время встречаются такие люди) Только вот насчет подарка не подскажу - мне благодарить доводилось заведующую, но все по мелочи - как-то пачек 5 бумаги приволокла, какую-то канцелярку дарила - но там вопросы не шибко критичные были). Единственное, мне кажется, деньги в этой ситуации не стоит дарить - она ведь  изначально бескорыстно Вам помогала.