В каком плане "что делать?"? Решение суда вы предоставляете только в ЗАГС, в паспортный стол идете только со своим паспортом и СоР(новым) ребенка, если спросят, где папа со своим паспортом(что вряд ли), скажите, позже сам со соим паспортом подойдет. Хотя вписывание в паспорт - это не обязательно.Или у Вас с мужем фамилии разные?