У меня есть опыт организации самостоятельных путешествий. Считаю, что самостоятельная поездка на 1 неделю в Прагу оправдывает себя только в случае, если у вас уже есть Виза. Дешевый чартер можно, например, у ТО Нева посмотреть. На booking можно дешевые гостиницы посмотреть. Но мы посчитали, т.к. надо делать Визы - беготня не стоит того, а по деньгам выходит примерно одна цена. Сейчас знакомые едут на 8 дней, 3 взрослых  за 60000р. через агентство. Минус - приходится выбирать гостиницы из тех, что тебе предлагают. Если ехать самим, то на эту сумму гостиницу можно подобрать гораздо интересней и ближе к Центру.