Да просто потому что рыжих в "средней полосе", особенно после монгольского ига и прочих ассимилянтов  не так уж много, а что "не такое" , то считалось "плохим".Например, у русских "дурным глазом" называли черные глаза, а вот у восточных народов, "глазливыми" считались светлые, голубые или серые глаза. Потому что соответственного цвета глаза в соответственном социуме булди редкостью, потому и взгляд такого человека казался необычным, "чужим". С косоглазием еще проще: если один или оба глаза косят, то взгляд кажется странным. Типа человек смотрит вроде на тебя, а вроде и нет, потому такой человек кажется неискренним, обманщиком.  Еще считалось что мол, черт - хромой. Но это просто калька с легенд о Гефесте (он же Вулкан у римлян), плавно перенесенных на легенды о Люцифере. То есть некто что-то совершил неугодное тскать небесной канцелярии, за что был сброшен с небес, ну и естественно, сломал ногу - шутка ли, так хряпнуться. А лечить правильно тогда не умели, вот и...