Спросите их, на основании чего они требуют с вас флюрографию. Если на основании свежего приказа Минздравсоцразвития, то на его вступление в действие отводится 10 дней, если иное не указано в самом приказе, то есть до начала ноября должно быть все по старому. Как вариант действия - требовать вернуть деньги (смотреть, на основании чего вы заплатили их, может вам просто анализы были нужны, вот вы их и получили) и идти в то место, где пока выдают старую справку по старым правилам.