Сейчас позвонила в справочную РЖД и задала свой и Ваш вопрос, мой по поводу законно ли было не сажать нас в сидячий вагон с собакой и Ваш по поводу выкупа всего купе, отвечаю: в сидячий вагон с собакой можно при наличии билета на собаку, справки по Ф№1 и переноски для собаки. В купе с собакой можно, если оно не повышенной комфотности и не двухместное СВ, выкупать все купе не надо. Документы все те же.(С вопросами, носящими справочный характер, обращайтесь на "Единую телефонную линию" ОАО "РЖД" по бесплатному телефону  8-800-200-67-67). Вот туда я и звонила.