Это называется определением порядка пользования квартирой, а не выделением доли в натуре. Выделение доли в натуре - совершенно другое. Для выделения доли в натуре должна иметься техническая возможность оборудовать два санузла, две кухни, два отдельных входа, в обычной квартире это невозможно.