Есть такой метод, когда патогенную флору выселяют  посредствам антибиотиков (сначала чувствительность делают), а потом заселяют положительную. Пробиотики и даже антибиотики (как в нашем случае) чпсто не могут справится с патогенной флорой и тогда ее принемают за норму, и продолджают борьбу в других направлениях.