Я тоже "бодалась" со своим ЗАГСом. В итоге вместо письменного отказа, который была намерена обжаловать в суде, ровно через 10 дней получила свидетельство о рождении без штампа "Повторное". Но у меня не только претензии по штампу были. Просто пошла с ними уже на принцип. Поэтому пишите заявление с просьбой выдать первичный, а не повторный документ. ЗАГС обязан отреагировать на Ваше заявление в течение 10 дней.