Если физ.лицу платит организация, то она обязана по закону выступать в роли налогового агента, т.е платить налоги за физ.лицо.В остальном с вами согласен, сдача квартиры организации - лотерея, так как у непосредственно проживающих нет чувства личной ответственности за жилье, которое они пользуют.