При самом поступлении в ВУЗ разницы никакой.А вот во время обучения разница большая, т.к. во время эпидемии в образовательное учреждение не допускаются те, кто не привит от заболевания, вызвавшего эпидемию.Соответственно, если есть БЦЖ, то никаких проблем даже при отсутствии Манту быть не должно.