Наличие кисты яичника является противопоказанием для начала стимуляции в протоколе ЭКО. В данном случае тактика такова: либо назначать курс лечения кисты (чаще всего - оральные контрацептивы), либо проводить пункцию кисты, после чего возможно назначение препаратов индукции овуляции.Возможен также рост фолликулярных кист во время индукции овуляции совместно с растущими фолликулами. В данном случае подобные кисты пунктируются наряду с фолликулами яичников, однако, в отличие от последних, не содержат ооцитов. Негативного влияния на качество ооцитов не отмечено.