Может, кто-то лучше знает и меня исправит, на смысл недопуска мамы в церковь не в 40 днях не прошедших после родов, а в самом таинстве. Ребенок во время его проведения переходит как бы на новый уровень своего духовного развития, приобретает новых духовных родителей и его мама при этом присутствовать не должна, т.к. это - тайна. Могу позанудствовать на правах историка и сказать, что корни идут из глубокой древности от обрядов инициации, которые проводились в строжайшей тайне и инициируемым строго-настрого запрещалось расказывать непосвященным о том, чтто там с ними делали (поэтому они зачастую придумывали всякие страшилки про то, что их съедал, а потом выплевывал дракон и т.д.). Вторая причина - гонения на ранних христиан, чем меньше народу знает о том, что ты был крещен - тем больше шансов, что тебя не повесят. Сейчас, конечно, все это забылось и осталась только правило, что мама на крещении не присутствует, а после обряда над ней читают родоразрешительную молитву.