Он пишет заявление, оно рассматривается и если по нему принимают положительное решение, вносится в специальную базу, реестр лиц с ограничением на выезд.Узнать о том есть ли запрет отца можно написав запрос в ПС ФСБ или ФМС, я бы и туда и туда написал.Попробуйте позвонить на горячую линию ФМС, может у них справка есть онлайн