Может быть все что угодно. От рациона - например если много ест овощей и фруктов и до проблем с поджелудочной железой. Думаю, что нужно последить за рационом, ( не знаю как у Вас питается ребенок в три года) попробуйте исключить жирное и жареное и жесткое, что требует интенсивного переваривания и активной работы поджелудочной и постарайтесь при случае показатья гастероэнтерологу на предмет узи органов брюшной полости.