Я конечно не знаю, как это происходит у конкретного работодателя, но если у работника работы достаточно, чтобы заполнить 40-часовую рабочу неделю, то отпросившись пару-тройку раз на 2 часа, он ее (работу то есть) будет доделывать уже во внерабочее время. Сроки и объямы, я так понимаю, никто не отменяет в связи с личными обстоятельствами. Так что как минимум странно вычитать из отпуска часы, которые потом все равно будут отработаны по факту.