Если точно не от пересушивания, то, судя по описанию, либо фузариоз, либо паутинный клещ. При фузариозе (грибное заболевание) перцев  нижние листья желтеют, опадают, вянут, затем стебель истончается, растение гибнет. При паутинном клеще желтеющий лист становится как бы в мельчайшую дырочку, опадает, вянет, а верхушка у растения продолжает расти. Растение не гибнет, но сильно замедляется в развитии. Урожая от такой рассады не ждите(( Сам клещик малюсенький, разглядеть его сложно, но возможно. Посмотрите внимательно на нижнюю часть листьев.Утешить не смогу, если ваши перчики действительно заболели, то лучше их поскорее выкинуть, пока соседние растения не подцепили эту бяку.