ямки заполните, если они больше 5 см в диаметре, на меньшие и внимание не обращайте. Наплывы снимите, всё же проще чем заново стяжку делать, 3 мм и соскоблить можно шпателем. Там где видны маяки приложите уровень, если не хватает стяжки по высоте маяка, то в тех местах подлейте наливного пола, или молоточком посплющивайте ребро маяка. Если на кухне будет плитка, а не ламинат, то вообще не критичны огрехи более 5мм, клеем плиточным заполнятся. А под ламинат еще пленка ляжет и подложка, что тоже смягчит поверхность для ламината.