Под пробковою подложку нужно более тщательное выравнивание полов,нежели под другие виды подложек. Ещё вариант неполадки может быть в том,что соблюдался ли необходимый зазор у порога и вдоль стен,т.к. ламинат в процессе эксплуатации сужается и  расширяется. Ламинат должен был вылежаться недели2. Если эти требования были соблюдены,то тогда проблема в неровности основания. Способ "лечения" описала выше.