-и- входит в корень и одновременно является тематическим суффиксом глагола (изначально рядом было две -и-, затем произошла стяжка). В то время подобные глаголы при спряжении выглядели как "бию", "шию", затем в произношении, а впоследствии и в написании упростились до современного вида.