Я бы посоветовала настаивать на лечении, а чтобы избежать излишнего волнения, действительно обратиться к другому врачу. Не сегодня-завтра Вы будете в роддоме. Совершенно верно описанные Вами последствия могут произойти там. К концу беременности все органы и системы плода уже сформированы. Стоматологическое лечение при условии рентгена с визиографом и минимальной экспозицией, безадреналиновых анестетиков  не только допустимо, но и необходимо для уничтожения очагов инфекции.Может быть, у первого врача, к которому Вы обратились, просто не было этих возможностей и поэтому он Вам отказал.