Потому что менструация, в понимании церкви, это нечистота. И может осквернить святыню. Возникло данное представление во времена, когда о прокладках понятия не имели, да и трусов-то не носили. Церковь очень традиционный институт, она медленно приспосабливается к изменениям, поэтому старое правило пока не отменили.