У нас та же история, только заболели мы в Черногории  и у ребенка кашель непроходит больше месяца. Сдали кровь на антитела к Хламидии пневмонии, Микоплазме пневмонии, Микоплазме hominis, Пневмоцисте (сейчас ждем результат). Все эти бактерии могут вызывать длительный кашель и атипичные вормы болезней дыхательных путей. Еще  имеет смысл сдать анализ на коклюш и паракоклюш.