Наверное, потому что воспитателям одевать труднее будет. Но если ребенок сам надевает комбез, то и проблем точно быть не должно. А вообще, если вам хочется, то отправляйте ребенка в слитном, разрешать или не разрешать в саду не имеют права, они могут только порекомендовать.