Если работа маленькая, то маркером хватает размечать, но не исчезающим (он не понравился). А если понимаю, что это надолго (не один месяц), то размечаю мононитью. Она уж точно никуда  не денется. И в схемке закрашиваю отшитое. Не надо беспокоится, что потеряюсь потом в пространстве. Т.что с такой ситуацией просто не приходилось сталкиваться.