Во-первых ГИ не является архитектором или специалистом и не может давать заключение, была ли сделана перепланировка или нет. Во-вторых МЖК обязана согласовать с Вами время проведения комиссии, а Вы вправе ее не пускать. Но конечно, лучше перепланировку согласовать.