Начислять заработную плату Вы себе очень даже можете за выполнение обязанностей генерального директора. Согласно Трудовому Кодексу в этом случае (когда единственный учредитель и гендиректор одно лицо) не нужно заключать трудовой договор. Заработная плата начисляется на основании решения учредителя