а вы работаете или дома с сыном? у меня у подруги была похожая ситуация, потом она вышла на работу (ребенку 2,5 было), сейчас целый день он маму не видит, вечером ласкается, скучает, зовет маму играть, рассказывает, что было днем. Сидит с няней пока, но хотят в сад отдать. А как ваш малыш с сестрой общается? Мне кажется несмотря на разницу, она лучше всех должна его понимать. Может он ей "намекал" на причину такого поведения? удачи вам! ситуация сложная...