Вы ниже написали, что он стоит напротив окна. Основная причина появления зеленых водорослей (т.н. цветение воды) - слишком много света. Плюс к этому водоросли - это всегда переисбыток органики (в Вашем случае, возможно, перекорм - мальки могут не справляться с количеством корма). Если у Вас условия одинаковые, то, возможно, прямые лучи, попадающие на акву через окно + время включения освещения + органика дают такой результат.Наверняка, у Вас живых растений там нет - попорбуйте оставить совсем без света на недельку акву. Накройте чем-нибудь. Малькам это вреда не нанесет.