Я бы посоветовала вам написать письма в налоговую. Если вы в москве - то 2 письма, одно в канцелярию 46, другое в территориальную инспецию. Обязательно лично сдать, с отметкой о получении. В этом письме изложить всю ситуацию, что вы больше не являетесь директором, с приложением заявления об увольнении и всех остальных документов. Тогда вы можете избежать всех претензий со стороны налоговой. Из ЕГРЮЛ вы не исчезнете, пока не будет нового директора, 14 форму бесполезно подавать - она все равно не пройдет.