Такое обычно происходит с дрожжевым тестом если его не попрокалывать. Я, например, когда пеку пироги то и нижний слой, а особенно верхний "накалываю" вилкой очень "густо" - получается все "в точечку". Наверное нужно было сделать такой "рисунок"  под начинку