Если на паспорт нового образца, то доки подаются только с детьми, тк фото на сам паспорт делается именно в ОВИРе.Анкету на ребенка заполняет один из родителей, неважно, отец или мать. Но при подаче доков должен присутствовать писавший заявление, так что лучше это делать на обоих детей одному родителю.