Я так понимаю, у вас котел и автономная система отопления, поэтому вам можно делать водяные полы?Моя подруга делала водные полы таким способом.Пол у них был пробковый, клееная пробка, не на  доске, и там где трубы проходили тоже. Никаких проблем не было с пробковыми полами, а тепло даже там где труб нет.Вам можно везде пробку положить и сделать единую зону на полу, а возле кухонной мебели только пару рядов плиток, но можно и не делать. А то что потолок будет уже с геометрией, то это ничего не испортить, ведь зонирование может быть только и по потолку. Не обязательно и на полу что-то городить, но конечно на любителя.Ваши сомнения по поводу изменения зоны на полу не беспочвенны.  Действительно, смотреться будет не очень красиво и разрушиться вся задумка.1.Все оставить как есть и не париться в этим кусочком возле входа, не такой он уж и большой чтобы на этом зацикливаться. Стык паркета и плитки заделывается "жидкой пробкой" из тюбика как паста выдавливается и имеет цвет пробки-паркета. Плитку выбрать матовую и шершавую и если любите, то носите домашнюю обувь (я люблю )2. Постелить на полу один материал, пригодный для этого, например пробку.Если все-таки решите менять зонирования, согласно вашим планам, можно постараться подобрать керамическую плитку в цвет паркета, такие бываю, даже с хорошей имитацией дерева и положить там где трубы проходят.На водные полы не рекомендуют класть паркет или паркетную доску, чтобы не испортить последние.