Что значит - когда-то совершенное опоздание? чем руководитель доказывать будет сам факт опоздания? хотя........ теоретически и это возможно - задним числом акт со свидетелями Работодателя тоже понять можно - раз уходите по соглашению, предполагаю - с выплатой договорились уже. Кому ж платить-то хочется  - проще вынудить по собственному желанию уйти. Так что - для Вас проще не давать ни малейшего повода для порицания