Вот такие мини-подкашливания - первые симптомчики, реакция после физнагрузки - второй симптом. так что отнеситесь серьезно. Возможно, на время нужно увеличить дозу фликсотида, возможно, нужно добавить бронхорасширяющее на время и не провоцировать пока физнагрузкой. Станет лучше, если сразу начнете принимать меры. А через недельку, глядишь, снова будете бегать без проблем. Грибки в легких - это тяжелое заболевание и оно от фликсотида не улучшилось бы,  а наоборот сильно ухудшилось. Т.к. грибки процветают на фоне фликсотида. не думаю, что у вас такое есть. Но и как проверить не знаю .