Деревянные-то, конеш, экологичнее. Но с пластиковыми проблем меньше. И потом - Вы где живете? Рассматривать окна с т.з. экологии имеет смысл в чистом дальнем загороде, при наличии деревянного дома Жидкости и запаха за 9 лет не наблюдали