Такая проблема у сына с рождения. Инфекционист сказал, что  с этим сталкивается мама каждого третьего ребенка. Неустойчивость температурного центра. После повышения температуры - длительный субфибрилитет. Это неврологическое явление. Вариант нормы. Но что у Вас, конкретно, я не знаю...