я обрабатываю каждую отдельно, благо после отсева остается не больше десятка обычно  Открываю NEF в фотошоповском конвертере, все, что можно делать в нем двигаю и меняю, затем перехожу в основной ФШ редактор без сохранения, там уже юзаю плагины и прочие примочки и если вижу, что готово, то сохраняю в jpg  (так как редко переделываю уже сделанную обработку ), если не доделала, сохраняю в psd и потом возвращаюсь доделываю. Тифы не люблю почему-то - их просматривать не удобно. Но если надо сделать какую-то серьезную фотографию, то у меня всегда хранятся NEF и я их заново довожу до ума уже по всем правилам и сохранить в тифе могу, если надо. Но это такая штучная работа, что о ней можно даже не говорить. Я ей не занимаюсь почти ибо меня устраивает и то качество, которое выходит при сохранении в jpg.