В Прагу летают ЧСА (чешские авиалинии), Аэрофлот. Если более бюджетно, то чартером Атлант-Союз до Брно, оттуда до Праги. Такой вариант предлагает Амиго-С (туроператор). На май правда цен пока нет, но на апрель вполне бюджетно. Планирую в апреле со старшей дочерью, младшую (ей как раз исполнится 5) оставлю дома.