Никакого конфликта законов нет. ФЗ в данном случае оговаривает право, но не обязанность пассажиров.Т.е. это означает, что местные транспортные структуры не могут взымать оплату за проезд ребенка до 7 лет без отдельного места.Взымать ли плату за проезд ребенка, которому предоставлено отдельное место - это зависит от правил конкретного поставщика транспортных услуг. В Москве, если не считать маршруток, таким поставщиком является Мосгортранс. Правила Мосгортранса дают право проезда детей до 7 лет, не ограничивая предоставление мест.