Если просрочка есть - она будет учтена. По Вашей вине или нет - тут, к сожалению, пленку назад не отматаешь.  Отношение к этому вопросу может быть разным. И это уже зависит от банка. У нас, например, если сотрудник допустит подобную ошибку (пару раз было, к сожалению), он сам возмещает штрафы и проценты, начисленные Клиенту за этот день (больших сроков просто не было), и при рассмотрении последзаявок никоим образом такой "технический" факт не учитываем и ни в какие "черные списки" не заносим.