Вы же квартиру не у банка, а у продавца покупаете, верно!? - поэтому все деньги, и первоначальный взнос, и кредитную часть вы отдаете продавцу. А вот в каком порядке, зависит от банка, кредитной программы этого банка и ваших договоренностей с продавцом. Лучше с этим разобраться до того, как вы начнете искать квартиру. Разбираться надо не здесь, а у вашего банковского менеджера.