Работника не должны касаться проблемы работодателя с ФСС и другими органами. Он обязан Вам оплатить больничный, а дальше, пусть подает в суд на ФСС на основании письменного отказа ФСС об оплате больничного. Вообще, достаточно в ФСС предоставить письмо О порядке выдачи и оформления листков нетрудоспособности при усыновлении ребенка http://www.socspb.ru/law/soc/mother/doc11503/ , в котором указано все необходимое для оплаты больничного, в частности, п.5 "5. Выданный в установленном порядке листок нетрудоспособности является основанием для выплаты женщине пособия по беременности и родам."