Не знаю, как остальные, я предпочитаю домены на себя как на физ-лицо регистрировать. Правда, расходы на домены на расходы фирмы не учитываем,  но потеря там не большая. всего 500рублей в год. Просто спокойнее, что никто не отнимет домен, а то если зарегистрировано на ООО, можно сделать доверенность с печатью и домен передать. Это мои личные соображения, может это все не так. Регистрировала на www.nic.ru. там же и аукцион проходит.