квартира по МС у вас будет по договору найму на тот срок,пока вы полностью за неё не расплатитесь, да и в собственность она к вам перейдёт пока непонятно когда, это долгий процесс, это зависит от того, когда квартиры от городов передадутся г.Москве, вы же покупаете у г. Москвы свою квартирку! Про прописку, это вы решаете сами, где вам жить, какие у вас условия, какие отношения с родственниками, мы живём в Москве по прописке и выписываться из Москвы не собираемся. Может ваши родственники переедут в новую квартиру, а вы останетесь в Москве, это всё ваше решание, и есть разные пути решений!)