У меня у сестры такая проблема с зубами, постоянные кисты и она их постоянно лечит. От чего образуются не ясно. Ну соответственно версий много бывает - от сниженного иммунитета до особенности конкретного организма. Какой то отдельный врач, который бы разбирался и искал почему образуются кисты  вряд ли есть.