К тому моменту, когда он захочет возвращаться, может магистратур уже и не быть. Сейчас идет речь о том, чтобы увеличить первую ступень (которая бакалавр) на год, а то, что  было магистратурой, сделать образованием для тех, кто поработал уже. Пусть лучше переведется в ту же Синергию и числится в ней дистанционно. А учится при этом в другой стране или даже перепоступит в России. Отсрочку будет Синергия держать.Вот только если он уже год на академе потерял, то ему нельзя больше терять.  Если он сейчас пойдет на первый курс другого вуза, то  ему нужно +2 года относительно начальной отсрочки, а  она не может быть больше чем на год.  То есть он закончит  третий курс нового вуза, когда закончится отсрочка по Синергии.  Если я правильно ваш расклад поняла.