У меня совсем недавно такая же была проблема. Главбух клялась, что уже два раза отправляла реестр. Каким-то чудом я прозвонилась в сфр, мне там сказали что данных по моему больничному работодатель не подавал, порекомендовали бухгалтерии позвонить по горячей линии для юрлиц. Я передала это нашей главбуху, на следующий день пришло подтверждение от сфр.