Оформляют 2 выговора и увольняют с основанием «за неоднократное неисполнение работником без уважительных причин трудовых обязанностей». Или прогул в табеле рисуют, оформляют акт, приказ, акт об отказе дать объяснения с подписью свидетелей и т.п.