Я бы не стала корректировать сумму,т.к. человек и так уже за январь оплачивает с опозданием. Пени должны в любом случаи пересчитать на момент оплаты. И конечно, нужно дозвониться и все уточнить. И получив счет-фактуру за февраль , а там будет включена сумма за январь с пенями,т.к. оплата была в марте естественно в счет -фактуру она не могла попасть, уже скорректировать. Тогда счет-фактура за март, который пришлют в апреле будет уже только реальная сумма за март,т.е. без всех задолженностей.