Если в хвост и в гриву, то лучше переустановить винду с форматированием диска. Файлы скинуть на флешку, Диск разбить на C и D, винду ставить на С, файлы хранить на D. Проги придется переустановить. Сделать образ диска с виндой после установки винды, драйверов и всех прог. В дальнейшем это сэкономит кучу времени и сил при переустановке винды.