помню, когда у меня был стоматит вызванный герпесом, была ровно такая же картина. Правда тогда помог курс антибиотика.  У него иммунитет похоже вообще не справляется ни с чем. То, что вирусов в больнице не обнаружили, такое... неизвестно делали и нет вообще. У иммунолога проконсультируйтесь. это явно вирусное