Вы ИП перевели не на самозанятость, а на НПД (налог на профессиональный доход, аналог самозанятости).И теперь, совершенно верно, нужно полученную на р/с сумму провести через "мой налог". Я точно так же перевела ИП (УСН) на ИП (НПД) . ИП закрывать не стала, так как иногда работаю с юр лицами и им удобней переводить деньги на р/с. Все поступления, в т.ч. и на р/с вводятся в приложение "мой налог".