Заявление-то вы подавали на оба факультета или на один отзывали, а на другой подавали?Если у вас заявления на два факультета, вы должны быть в списках на обоих. Просто приоритеты должны стоять разные, на одном 1, на другом 2. А у вас сейчас как?Подать заявление через ГУ можно только с учетки ребенка, другой взрослый не сможет это сделатьНо под "сбоем на ГУ" могут подразумевать сбой во всей этой системе. Там же связка между ГУ, гос.базой поступления и  базой институтской.  Там несколько разных баз взаимодействуют. Вот на каком-то этапе могла случиться ошибка. Если завтра все не восстановится, попросите в вузе исправить.