Если речь идет о ПМИ ВШЭ (с ФПМИ МФТИ только это направление можно сравнивать), то:1. В ВШЭ больше упор на  самообразование. 2. Не уверен, что в группах П+М+ будет сильно меньше часов, чем в мфти. В-третьих, на ПМИ ВШЭ 3. В ВШЭ можно самостоятельно добирать курсы, если на П+М+ недодали