У нас с военкоматом косяков  ни разу не было. Как в сиропе система работает, но все было учтено, все отражено, в часы приема можно приехать и уточнить. Причем у них даже какая-то расширенная старая медицинская база есть, мы о паре случаев  и сами не помнили. Но допускаю, что сбой может быть,  везде есть человеческий фактор. Поэтому контроль на любом этапе. И военкомату, и больницам наплевать как там идет процесс. Это нужно призывнику, ему и держать руку на пульсе.