Ну никакому учителю не понравится, что его предмет ставят ниже, чем какую-то секцию. Я бы сразу договорилась с учителем (или через класрука), что такие ситуации будут возможны. Ну а сыну (он же большой уже мальчик?)  объяснила, что хочешь получить преференции - не лезь в бутылку. Какой предмет-то кстати?