"Так написав отказ от зачисления он получается автоматом попадает в конкурс зеленой волны?"Должен бы так, да.  И государство с этим согласно, что написав отказ от зачисления по одному направлению человек остается в конкурсе по другим и может быть зачислен там  (если есть, куда)А ВШЭ  с этим не согласно.