Мы использовали материнский капитал давно. В договоре купли-продажи было прописано, что одна сумма – такая-то –за счет собственных средств, а другая – такая-то– за счет средств материнского капитала, которую надо перечислить в такой-то срок после регистрации договора ( месяц вроде указывали). Комиссия никуда не выезжала.