в договоре четко прописать: к договору приложить рабочий проект фундамента + смету. В договоре четко прописать, что включено в цену договора, что идет как доп работа (оплачивается дополнительно), обязать вести журнал работ. Четко определить сроки исполнения работ, порядок промежуточных сдач-приемок, порядок приемки скрытых работ, порядок пролонгации сроков исполнения работ по вине одной из сторон, третьей стороны (вам кто-то не предоставил вовремя чертежи: например проект ОВК, и строители стоят, курят, ждут), или по погодным условиям (в ливень какие-то работы делать нельзя); кто оплачивает каждый из простев. Мелочей -  миллион: обустройство площадки (времянка, туалет, временные подключения воды-электроэнергии), вызов геодезиста для привязки дома, земляные работы по снятию плодородного слоя и подготовке котлована(вот где фиг проконтролируешь), вязка арматуры (если монолитный), отверстия в фундаменте под коммуникации: вода и тп (включены в смету или нет), коммуникационные приямки, вывоз мусора, вывоз грунта, уборка территории.  На каком этапе (чётко и однозначно) заканчиваются их работы (плита основания с цоколем, пирог утепления пола, каналы под коммуникации (канализация-вода), черновой пол и т.д. Но тут все зависит от контрукции фундамента. Ну и от условий договора (цена твердая на договор, или твердые цены на виды работ и тыды)