А должны. Вообще то регистрация в общаге должна быть опять де по закону.Вы в случае чего сможете предоставить слова 2 отдела в качестве доказательств? Есть закон. Его исполнение ваша обязанность а не добрая воля военкомата. Они скажут что и знать не знали что ваш сын тут не проживает