А во сколько он утром в туалет ходит?Если терпит до утра, заприте его на ночь в переноску, пусть там спит. Переноску можно вообще выставить в другую комнату и дверь закрыть.Но вообще трехмесячный это же малыш еще. Мои в этом возрасте еще маму сосали. У меня коты устраивают в 6 утра концерт - кушать хотят, еду требуют.   Тоже воевала с ними.  Одного приучала в дверь не ломиться, второму еду на ночь стала ставить.