Вы посмотрите с другой стороны - где дочь хочет провести ближайшие 4 года. В МФТИ все-таки умнейшие ребята, все-таки туда идут лучшие. Атмосферу, наверно, представляется примерно, если туда хотели.МИЭМ - тоже хорошие студенты, но скорее обычный уровень фмш. Программирование там есть. По отзывам, все равно приходится самим доучиваться (для тех, кто хочет в хорошие ИТ компании). Атмосфера другая,  учеба устроена по другому, можно сказать, "на европейский манер". Это же тоже важно. И важно, чтобы вуз нравился. А с точки зрения профессии, дорога у большинства и после МФТИ, и МИЭМ - или преподавание, или область ИТ, как кто-то уже написал. Наука сложно, это надо любить и желательно быть лучшим. А МИФИ почему не рассматриваете? МИФИ чаще рассматривают альтернативой физтеху в области физики.