Как я понимаю, у вас сейчас в рейтинговых списках стоит так, словно второго заявления не было, и вы пытаетесь понять, почему, и кто это мог сделать?В принципе можно было сделать через ГУ.  Но скорее всего это какой-то глюк в вузе.   Скажите, а вы уже видели результаты второго заявления в списках? То есть уже видели смену приоритета, а потом она пропала, так?  Если нет, возможно что заявление еще просто не подгрузили. В любом случае, я бы начала со звонка в приемную комиссию вуза. Возможно вопрос решится звонком.