Т.е. свою личную добрачную квартиру НЖ  при жизни подарила своему внуку ?  Ну, это ее право, хоть втихаря , хоть громко, не важно.Значит , и она сама, и отец уже какое-то время жили в квартире, принадлежавшей внуку. ОК. теперь ситуация  стала понятна.Но отец в любом случае там зарегистрирован, выписать его оттуда будет сложно, и вряд ли внук НЖ захочет это делать по суду.Так что пока  у детей ничего не просят, то можно ничего и не делать.Проблемы надо решать по мере их появления.