Да, школа может отказать. Выглядит это вполне правомерно. То есть ребенок должен быть аттестован по сдаваемому предмету. В каждой школе свои правила для этой аттестации. Допустим в нашей нужно было написать 5 работ во второй половине 10 класса на положительную оценку. Если ребенок хотя бы за одну работу получал 2, он не допускался школой до сдачи ЕГЭ. То есть школа совершенно не готовит детей, которые сдают в 10м  (и об этом честно предупреждают), но при этом смотрят имеет ли ребенок шансы написать ЕГЭ на более или менее приличные баллы. У нас был один человек, который писал работы не на 2, а на 3. Результаты ЕГЭ получились соответствующие.