Программы обучения устанавливает сам вуз.  И требования к абитуриентам тоже устанавливает вуз. Министерство только соответствие предметов и специальностей. Но конкретные наименования специальностей тоже выбирает вуз.   Министерство только  КЦП вузу дает с указанием "не меньше 60% на инженерные   и не меньше 20 на ИТ", или что-нибудь типа этого.    Так что практически за все отвечает вуз. Жаловаться можно только на себя.