КТ обычно не делают с наркозом, ну, может, только если ребенок с особенностями и это вопрос жизни и смерти. Это же не послойно МРТ снимать. Неужели Ваш не в состоянии 5 минут был посидеть-полежать? У стоматолога тоже под общим наркозом? В три, тем более, пять лет дети обычно в состоянии понять необходимость не активничать всего-то пять минут.