Мне кажется, вам система не даст подать на одно направление два заявления. То заявление, которое БВИ, оно в час икс  или сыграет, если аттестат был, или  пометится удаленным, если аттестата не было. Все.   Дальше начинают рассматриваться все остальные заявления. И среди них не будет заявления на то направление, где у вас стояло БВИ. Поэтому если хотите, чтобы направление БВИ было в конкурсе, но не первым приоритетом, значит просто не подаете БВИ и идете по обычному конкурсу.  Понимаю, что это звучит странно, но многие так делали. Поступали по конкурсу, не подавая свой БВИ, если видели что на конкурс шансы приличные. Это будет видно как раз числа 24-25 июля, каковы ваши шансы пройти без БВИ. Если низкие, то зачисляетесь по нему. Если высокие, то  удаляете БВИ из заявления.