Осенью и весной как раз все гастриты и обостряются. А стафилококк тут ни при чем. тут реальные проблемы исключать надо. Кстати, именно фарингит чаще вызывает такие боли, а не тонзиллит. так что Вам к ЛОРу, а затем, очень вероятно,  к гастроэнтерологу.