Цена строительства метра квартир с комнатами маленькой площади обычно выше, чем большой площади и малокомнатных квартир выше, чем многокомнатных (важно сколько санузлов и какая площадь внешних стен грубо говоря). Вообщем, возможно вы неправильно сравниваете. А еще квартира может быть готова, а дом не подключают к комуникациям - то есть ГК не было еще.