Зависит от дальнейших намерений. Топовые московские компании отсекают на этапе просмотра резюме региональные и посредственные вузы. Зарубежной магистратуре важны оценки и учебный план, а название вуза им ни о чем не говорит. Знания - почему вы думаете, что будет такая разница в оценках? Потому что в топе надо действительно учиться, а в регионе часто ставят автоматы только за посещение?Если высшее образование вам не для корочки, то знания в приоритете, интересный и практико-ориентированный учебный план и требовательность педагогов. Эти знания обязательно пригодятся в работе. Но если неважно, что за образование, лишь бы корочка и где-то перекладывать бумажки за 50 тыс устроит, то название вуза не играет роли.