Лучше подавать документы, в выбранный ВУЗ, через регистрацию и оформление личного кабинета на сайте самого ВУЗа. Быстрее проходит регистрация и если будут вопросы к документам свяжутся быстрее. Это если дистанционно. Лично можно и ножками сходить, если территориально в одном городе.