Я думаю, надо по рейтингам брать. Как правило, во все рейтинги входят, помимо московских вузов, СПбГУ, ИТМО, ТГУ, ТПГУ, НГУ, УрФУ, КФУ, СФУ.МФТИ и МГУ не надо исключать, но они привнесут про 1/20 от общего числа. Можно взять не  20, а 40 или 50.