Дипломы одного уровня примерно, может по отдельным направлениям только чуток есть разница, и то не всегда в пользу МФТИИ нужно понимать, что на физтехе наргузка будет расти от семестра к семестру до конца 3 курса. У них неспешно запрягают, дают адаптироваться. А в МИФИ нагрузка ровнее.  Так что к концу хотя бы третьего семестра сравните загруз у сына и его одноклассника, чтобы о чём-то сожалеть