Не о том беспокоитесь. Нет там ничего такого "инвазивного". Колоноскоп существенно тоньше кишки. С этой точки зрения точно беспокоиться не о чем. Если делаете все время под общим наркозом -  то вот это да, не здОрово. По показаниям делают хоть каждый месяц.