Барахтайся, как хочешь, зависит скорее от востребованности. Физтеховские базы являются базами и для других вузов. Поработал студент в ФИАНе, например. Хоть из МГУ,  хоть с физтеха, написал диплом. Но если нет вакансий, то его там не оставят. Пойдет он на свободный открытый рынок труда. Базовые предприятия физтеха про учебную практику, а не про гарантированное трудоустройство выпускников.