Представьте, есть два правила, по которым нужно поставить в данном случае запятую, и которые похожи. Вот какая разница, следует ли ее поставить по первому правилу или по второму?Но если запятые это, в основном, правила - хотя многое зависит от смысла, который автор вкладывал в предложение, и в зависимости от смысла запятая там может быть или не быть.То  с орфографией и врожденной грамотностью это точно  не про правила.  Известный для многих работающий способ проверки слова - написать его двумя способами. Один способ будет зрительно неправильным.   Люди запоминают слова через зрение.Но не все.  Вот с дисграфиками метод не работает.  Но у них и правила не очень работают, потому что правила они вроде знают, но применить правильно не могут.  (это те, кто их знает. Хотя какой смысл их учить, если на выходе все равно текст будет написан на 2?)