Это делается в том военкомате, который выдавал акт на обследование. Но вы пишете, что у него по учёбе отсрочка. Т.е. акт не давали, медкомисси не было, это при постановке на учёт документы сдавались для приписного? Вас в старом военкомате могут завернуть, т.к. изменилась регистрация. Вам или сыну нужно запросить дело в любом случае, чтобы понять, на чём остановились и что в этом деле есть. Потом оформить передачу в новый военкомат и уже доделывать билет там, когда закончится отсрочка по учёбе. Или как-то зарегистрироваться в зоне ответственности старого военкомата и числиться там до получения билета.