В ВУЗАХ есть вступительные испытания,аналог ЕГЭ. Наверное,можно сдавать их. Я видела в МЭИ. МИИТ. Там прямо указывается, что не ЕГЭ,а отдельная графа .Сдаются непосредственно  в ВУЗе в приемную кампанию.