На Аэрофлоте за весь мой опыт полетов в командировки и на отдых по России, борт меняли только один раз, промариновав нас час в салоне.  Но вряд ли это бы повлияло на онлайн регистрацию.Так что лично я про такую ситуацию и правда не слышала. Буду иметь в виду. Но наверное это как-то решается для зарегистрировавшихся, приехавших к началу посадки.   На новом борту не может же быть мест меньше чем прошедших регистрацию?Вероятно с другими авиакомпаниями ситуация иная, и там стоит приезжать раньше.