Знаю случаи, когда долг по физкультуре студенты МФТИ тащили до третьего курса. То есть с этим хвостом их переводили. Не знаю, чтобы отчисляли из-за физкультуры. Но даже если гипотетически так: студент сдал всё к четвертому курсу, но не сдал физкультуру без уважительной причины (болезнь, например и невозможность заниматься вообще), то так ему и надо, если его отчислят. Значит ему плевать на обучение в МФТИ.