Напишите служебку руководству, что не согласны с тем-то, либо такие-то решения не соответсвуют, прошу внести изменения или что-то типа того, отдайте под роспись на втором экземпляре. Если Вам надо подписывать какой-то проект, подписывайте с оговоркой, например "с тем-то не согласен".