Так это смотря какой корабль) Одно дело здоровенная посудина, готовая к встрече с штормами и совсем другое - лодочка или катамаранчик) Да и даже такие суда стараются в шторм не выводить или их обходить. Равно как и самолеты. Защита от попадания молний есть, по идее, ничего не должно развалиться и самолет должен спокойно пройти бурю, но рейсы задерживают и в полете стараются облететь, если напарываются.