Есть закон. Если всплывет что вы закон  нарушаете, то никому не будет дела кто вам что наплел. Незнание законов не освобождает от ответственности. Ваш военкомат не обязан знать что ваш ребенок не проживает дома. Встать на учет по месту жительства это обязанность вашего сына а не военкомата.