Думаю, в большинстве место куда берут 200-бальников, такими вещами не занимаются,  тем более что 300бальники в эти места (на эти направления) не идут. Максимум что может быть это какие-то допы для желающих. Но если в вузе есть слабые студенты, то выпускника этого вуза не будет априори воспринимать как сильного, даже если он учился на углубленке. А вот если в вузе слабых детей нет, то будут.  И тогда название вуза будет работать на выпускника.