Вы с таким вопросом лучше обратитесь к батюшке, чтобы он развеял Ваше сомнение. Меня например с послеоперационным кровотечением батюшка причастил, сказав, что так можно. Тоже самое и по поводу менструации-к святыням прикасаться нельзя, но в Храме находиться можно.  В  Евангелие читаем о том, как  Спаситель простил и исцелил женщину, страдающую кровотечением, которая прикоснулась к нему.  Так, что если у Вас есть потребность идти в Храм я думаю надо идти. но если сомнения велики, обратитесь за советом к священнику.