Через мос.ру можно, но результаты ЕГЭ на гос.услуги приходили на полдня раньше.А подача заявлений в вуз, вероятно, будет только через гос.услуги.Да и в чем смысл прятаться от гос.услуг, имея учетку на мос.услугах?  Если вас посчитали один раз, этого уже достаточно для всех потенциальных проблем.  Со временем мос.услуги может быть просто передадут данные на гос.услуги.