Просто погуглите, как работает ПВО ближнего радиуса действия. Противоракета взрывается рядом с объектом поражения, выпуская облако поражающих элементов, которые вызывают детонацию вражеского заряда в воздухе и он не долетает до цели. Гражданский самолет заряда не несет, следовательно детонировать нечему. Поэтому, если поражающие элементы не повредили критически важные детали самолета, лететь он может. Или вы реально думали, что ПВО ракетой в ракету попадают с ювелирной точностью?  Такое тоже бывает, но за пределами атмосферы и это другой класс оружия, не для ближних целей.