в принципе лечение пройдено, а кашель особенно после сна может оставаться от того, что маленький ребёнок мокроту сплюнуть не может и она пока ребёнок неподвижен скапливается и булькает, как вы говорите, потом ребёнок откашливается как может и становится более менее нормально. думаю это остаточные явления, но я не врач , просто по опыту знаю, поэтому на всякий случай покажитесь доктору... Выздоравливайте скорее