Не знаю как будет в вашем случае, напишу про себя.  Аутоиммунный тиреодит уже около 30 лет, принимаю Л-тироксин каждое утро.  Дозу корректирует мне врач каждые 4-6 мес. И ничего ужасного в этом нет... так что если таблетки вам не отменят (пока) - не расстраивайтесь.  Главное - устойчивая ремиссия вашего основного заболевания