Ну так-то университет - это многопрофильное заведение, академия - специализируется на определенной отрасли деятельности (сельское хозяйство, например), институт - узкопрофильное заведение, готовит специалистов в строго определенной сфере, как правило финансируется из средств определенного министерства, например, культуры. По факту, в связи с начавшейся несколько лет назад идиотской системой слияния вузов, сейчас все, что относится к ведению министерства науки и ВО является университетом. а уже  каждое министерство свои профильные вузы  как хочет, так и обзывает. Самое скудное финансирование - у институтов. Особенно у "культурных". А министерства, например, сельского хозяйства и путей сообщения не выпендриваются особо, свои вузы давно не переименовывают, и тихонько весьма неплохо их финансируют.