Когда вы будете настраивать кассу, там заранее будут описаны  все эти вопросы. Система налогообложения и ставка НДС тоже. Больше вам писать ничего не придется. Да, на чеке будет фраза про отсутствие НДС, еще про то, что у вас УСН Доход, ваш адрес, ИНН..