Фундаментальная и прикладная лингвистика - как и любая наука. Фундаментальная изучает законы, по которым строятся и развиваются языки, что позволяет, в свою очередь, развивать разные прикладные дисциплины, в том числе, в сфере информационных технологий (онлайн-переводчики, анализ текстов, обучение языкам, реконструкция древних языков и многое другое).Просто лингвистикой в наших вузах традиционно называют изучение иностранных языков - там есть элементы науки, изучают отдельные разделы теории, но в первую очередь осваивают языки и готовят переводчиков и преподавателей языка. Филология - опять же, в российской традиции - частично про изучение языков, частично с уклоном в литературоведение, изучение различных текстов. Лингвисты обижаются, когда их называют филологами, лингвистика ближе к точным наукам, а филология - к гуманитарным.Не претендую на абсолютную истинность ответа, на разных факультетах разных вузов может быть по-разному, это мое впечатление.