То что физика на физтехе сильнее чем на физфаке это скорее всего так и есть. Вопрос вот в чем- какую разницу в карьере в среднем  ( в разных ипостасях- в том числе и зарплатной и чисто научной)даст эта разница при условии равенства изначальных условий.