Если по трудовой,  то либо заводится новая карта банка организации, либо остается своя, если подходит. Налог платится в этом случае работодателем. Но сейчас более популярен формат трудового договора с самозанятым. В этом случае налогина профессиональный доход сотпудник платит сам, сам де может отчислять и в пенсионный фонд.