Подать  заявление о замене военной службы на альтернативную гражданскую, объяснить причины плюс автобиографию и характеристику из школы. Подать в воен комиссариат. Потом заседание, где он устно рассказывает почему и как. Можно позвать кого-то (родители, друзья, тренер, учителя) , кто может подтвердить , о том, что ребёнок придерживается определённого мнения  (например). Ответ сразу. Если все делать заранее. Не позднее полугода до призыва, то все ок.  Если вы в Москве/Петербурге, то прохождение как правило в своих городах. Племянник на почте «отрабатывал». Параллельно учился на вечернем (очно-заочно) в вузе