Насколько я знаю (посетив ДОД и пообщавшись там лично с представителями ПК), вы подаетесь на направление подготовки (НП), например на 090301, а внутри направления уже расставляете приоритеты среди факультетов, которые ведут подготовку по этому направлению (ну условно говоря ИУ5-РТ3-МТ4 и т.п.), и после подачи согласия Приемная комиссия уже смотрит, где вы проходите, а где нет, и предлагает тот факультет, куда вы проходите. К тому же, вы можете одновременно подавать на бюджет и на платку.