По физиологическому действию на организм хлор относится к группе веществ удушающего действия. В момент контакта он оказывает сильное раздражающее действие на слизистую оболочку дыхательных путей и глаза. Признаки поражения наступают сразу после воздействия, поэтому хлор является быстродействующим АХОВ. Проникая в глубокие дыхательные пути, хлор разрушает лёгочную ткань, вызывая отёк лёгких.Согласно проведенным опытам, хлор и его соединения могут спровоцировать такие опасные заболевания, как рак мочевого пузыря, рак желудка, рак печени, рак прямой и ободочной кишки, а также болезни органов пищеварения. Кроме того, хлор и его соединения, попавшие в организм человека с водой, могут вызвать болезни сердца, атеросклероз, анемию, повышение артериального давления.