Есть федеральный компонет общеобразовательный, есть федеральный для специальности - это одно и то же во всех вузах. На 1-2 курсе этот компонет преобладающий. Есть вариативная часть (вузовская), здесь разницы начинаются. Но все должно быть в рамках стандарта по направлению. То есть принципиальной разницы нет, но в части вузов сидят педагоги, которым по 70 лет, если не больше и никакой практической информатики они не видели. Вот и судите сами, чему они могут научить.