А где написано, что входят? Если хотят написать, что 50% входят в 90%, то так и пишут: 90% населения проживает в 20 городах, из которых 50% приходится на 3 самых крупных города. А у вас выходит по-другому. половина в 3-х городах, а вторая половина (которая 90%) в 20-ти.