Что вас смущает?Считают 2 недели от даты последнего контакта.В вашем случае как раз и набираются 14 дней: 3 дня до каникул + 9 дней каникул + 2-3 дня, пока анализ брали/готовили и заболевший ребенок уже не ходил в школу.