Непонятно в чем у Вас вопросы. Можно подать в пять вузов максимум. Вы хотите в два. В одном (в Пироговке) Вы заявите БВИ. Если зачислят БВИ (а это делается раньше -на этапе приоритетного зачисления), то в общем конкурсе не участвуешь. Чтобы участвовать в общем конкурсе МГУ, надо будет отчисляться из Пироговки (куда зачислились БВИ).