Вы немного неправильно интерпретируете. Альфа (доминант) тот, кому все подчиняются. Если в устоявшейся группе из двух котов-друзей добавился бы Альфа, он бы дубасил и гонял обоих. И не подпускал к себе их. Отбирал их еду, ходил в их лотки. Садился вверху, выше других котов.Если же кот прячется, сидит весь день в темных углах, а ночью незаметно писает-метит.... то ой, тут другое!  Это стресс. Это дискомфорт. Это ему другие коты - не дают жить.