Автопроход с 3 (вроде бы регионального) этапа республиканской или областной олимпиады на региональный этап всеросса - это нарушение порядка проведения ВсОШ. Так что все верно, если в прошлом году муницип пропускали, а в этом хотите участвовать за 9 класс с целью выхода на регион, то начинать надо со школьного.