Исходя из вышеперечисленных материалов могу сделать для себя простой вывод: если буквы  произносятся, как в алфавите,  то пишутся заглавными (РФ эр эф), если буквы аббревиатуры произносятся, как звуки транскрипции, то пишем строчными ( вуз [вуз] )