"Оставайтесь спокойной" можно понять двояко.  Один вариант-"не психуйте".  А второй-"не трепите себе зря нервы, оно того не стоит".  Думаю, ваша начальница поняла вами сказанное как второй вариант.  И она уже забыла об этом, кстати.