Немного не так автор пишет. Вы путаете последовательность. Сначала пропали 2 доп. ЕГЭ (точнее автор пропустила, что на них не прошла регистрация), а ПОТОМ. .. Когда после окончания всех сроков регистрации в системе осталось только 2 ЕГЭ  (а автор то думала их 4), система посчитала , что данный формат (сдача 2х ЕГЭ) ошибочен, т.к. в таком комплекте сдаются ГВЭ.