Как один из вариантов, есть антимикробные препараты, не относящиеся к классу антибиотиков. Их назначают. Ну и разные варианты непереносимости антибиотиков существуют, иногда только на один вид запрет, чаще всего на пенициллиновый ряд. Тогда другие виды назначают.