Терминологию чуть поправлю: "пляски" начинаются с определения налоговый базы; налоговая база по НДФЛ - любые деньги (доход) полученные от продажи. А далее налоговую базу можно уменьшить на сумму налогового вычета, вычеты могут быть разными. В том числе ВСЕГДА к вычету из налоговой базы можно предъявить сумму, затраченную на приобретение и обустройство продаваемого объекта недвижимости (+ лимитированные проценты по кредиту, если кредит был).Поэтому, если квартира была приобретена за деньги (уплату которых можно подтвердить документально), то при продаже за те же деньги налоговая база обнуляется. Но обнуляется не сама автоматом, а нужно заполнить декларацию самостоятельно и обосновать сумму к вычету. Само собой это не сделается.