1) На ранжирование БВИ-шников уровень олимпиады, насколько я помню, не влияет. Победители перечневых стоят выше призеров перечневых, не зависимо от уровня.Т.е.  победитель III-го уровня будет выше призера I-го уровня.Победители перечневых ранжируются между собой по баллам за инд. достижения. Ну и по призерам так же. При равенстве баллов за инд. достижения - там дальше надо читать...Так что если победитель II-го уровня и много баллов за инд. достижения - будет высоко в ранжированных списках БВИ-шников.2) Не всегда так бывает, что БВИ можно заменить на 100-ку. Надо читать правила вуза. Не знаю, как в этом году, но в 2020 точно были вузы, где 100-ка не полагалась тому, кто имел право на БВИ. Как раз у моего сына так было  На одном направлениии БВИ, а на других в этом вузе никаких 100-к  Другие вузы двали 100-ки.3) Незачисление БВИ-шника (любого) означает, что мест в общем конкурсе нет - их все разобрали БВИ-шники, даже кому-то из БВИ-шников не хватило.  Ни одного. Какую парочку по ЕГЭ они должны взять?Исключение из 2)  Правда в этом году, наверное, Вы правы. Спец. квота. В каком-то документе, сказано  что спец.квотников зачисляют на приоритетном и основном этапах. Если спец. квота не выберется, то, как это ни странно, может случится ситуация, когда БВИ-шника не возьмут, а кто-то пройдет по результатам ЕГЭ.