ФПМИ по напр. математика можно сравнивать с мехматом и конечно не в пользу мехмата. Бауманку точно нельзя сравнивать, с МИФИ я незнакома, но почти уверена, что тоже нет.  А так Вы можете сравнивать что угодно с чем угодно, кто мешает. Я Вашу цель не могу понять. Что более престижно, Вам написали. Что там сейчас "так себе" учат и "так себе" набор - тоже. Студенты тем не менее будут не хуже, чем в Баумана и МИФИ. А надо ли вашему ребенку то и как его будут учить на мехмате - нам неведомо. Вас шатает от рассуждений про фундаментальную науку до Бауманки, которая всегда была очень прикладной. Определитесь или подождите каких-то дальнейших вводных. В каком классе ребенок-то сейчас?