Не знаю, как сейчас, но три года назад, например, в бауманке, можно было использовать для поступления только один диплом для особых прав. То есть, если есть дипломы РСОШ по математике и физике, то можно было закрыть соткой только один предмет, надо было выбирать какой. Это было прописано в их правилах приема. Тогда же на физтех на ИВТ можно было три предмета олимпиадами закрывать, если имелись соответствующие дипломы, это тоже было в правилах. Так что это надо про конкретный вуз конкретную программу спрашивать, общего правильного ответа нет.