Выяснять где и что с сотрудником (может у него больничный на этот день), и увольнять за прогулы если это реально прогулы (пусть пишет объяснительную,. а вы составляете акт с подписями не менее 3-х сотрудников вашей конторы). И да, можете полюбовно с ним разойтись предложив написать "по собственному" (или за его добровольный уход вообще не делать запись в трудовой ни о приеме ни об увольнении), никому в здравом уме не нужна запись в трудовой, что уволили как непрошедшего ИС...