Ну вообще, логично идти к тому, кто в данный момент твои права нарушает. Если компании-посредники берут свои 3%, то ставку курьера, очевидно, сокращает сам Яндекс, то логично идти к Яндексу, а не к посреднику. И ставка сокращается для всех одинаково - и для Мамеда без мед. книжки, и для Васи с мед. книжкой.