Если вы "набираете" путь, сначала билет Москва-Магадан, потом билет Магадан-Екатеринбург, потом билет Екатеринбург-Владивосток - да. Если вы просите Москва - Владивосток и выбираете из предложенного системой - вы выбирате предложенное системой и это ОДИН билет и одна поездка. Даже если система предложила Москва-Калининград-Владивосток.