а как можно было обнаружить то, чего не было?вирус вызывает повреждения в легких, туда попадают всякие бактерии, грибки  и прочее (нижние отделы дыхат.путей у человека в норме стерильны. Вирус нарушает барьер).Конечно найдут именно те микрорганизмы, что размножились быстрее всех. Но только не факт, что они и стали причиной пневмонии. Ни на какой вирус не обследовали тогда. И сейчас-то не особо.