Имею в виду те, куда проходной выше. Их как правило и указывают в качестве желаемой, и да, если слишком много человек выбрало какую-то одну кафедру, смотрят именно по баллам. Сегодняшний ответ в чате Бауманки на эту тему: "начиная с абитуриента с самым высоким баллом распределяют по кафедрам, смотря на приоритеты студента"