Вполне может быть, что в СОР поставили прочерк, а при получении паспорта человек сам сделал выбор, какое имя (отчество-фамилию) ему туда записывать.Про отчества не знаю, но знаю когда в паспорте меняли имя и фамилию. Один одноклассник после получения паспорта взял фамилию отчима (усыновлен официально не был, просто так выбрал). Достаточно много человек в то время "переходили" на девичью  фамилию матери - ну по еврейской линии. Но и не только, иногда из других соображений. Еще несколько в паспорт занесли другое имя, чем то, под которым были известны до того (напр. в школе) . "Измененные" имена были занесены и в школьный журнал и другие документы.Так что вполне себе может быть и отчество.