Если лично у вас есть глубокое понимание предмета, и с вашей точки зрения у ребенка всё ОК, то забейте на отметки и ребенку объясните, что бы не парился. Балл аттестата важен, только если вы идете в колледж. Если в ВУЗ, то у вас может вообще не быть в аттестате химии и биологии, но вас возьмут в мед, если химия и биология сданы на ЕГЭ.