на андроиде в настройках вотсапа  есть резервное копирование на гугл диск. Если оно настроено, то сохраняется в моем аккаунте на гугле. У меня стоит "еженедельно".Думаю, и на ios то же самое есть.Вопрос только в том, настроено ли резервное копирование.Ну и не помню как, но можно загрузить последнюю сохраненную версию, в ней будут все удаленные сообщения (от всех контактов). Они хранятся на сервере вотсапа 3 суток, если не ошибаюсь.