Если расстояние под полом позволяет, то можно снизу к лагам прикрутить осб или фанеру и уже на осб укладывать минвату или пенопласт. У нас так сделано. По поводу фильтров можно сказать только после того как будет получена вода из скважины. Может там будет много железа например. Что даже постирать белье будет проблема. Но такое редко встречается, для технических нужд, постирать и помыться обычно качества воды из скважины хватает, а для питьевой воды ставится компактный фильтр под мойку.