Отличается принципиально. Если вы про бывший второй мед, ныне РНИМУ - то там с шестидесятых годов существует медико-биологический факультет, целью которого всегда была подготовка научных кадров для медицины и биологии, а не врачей. Там отделения биохимии, биофизики и медкибернетики. В программе много математики, физики, химии, и это в комплексе с анатомией, зоологией, гистологией, эмбриологией, генетикой, и т.п. и с медициной. Работать можно в научно-исследовательских институтах. Вместо ординатуры - аспирантура. Если нужно право лечения, то лучше на другие факультеты.  А если интересуют больше медицинские приборы - то можно еще в сторону МФТИ посмотреть, там тоже есть один из факультетов с биологией-химией и физикой.