Если она работала не как самозанятая (опять же, специальный договорчик и на этот счёт должен быть), а как наёмный работник, которого по вине работодателя не оформили надлежащим образом, то она имеет полное право считать, что все налоги за неё платились. Она может контролировать ежемесячно, а может вот так вот спохватиться, запросив бумажку из ПФ и обнаружив, что упс.