Вода, вода. Но ТВЭЛ не в воде, он в реакторе, в котором вода используется в качестве теплоносителя - забирает тепло у ТВЭЛа и передает его наружу. И когда надо остановить процесс, ТВЭЛы не вынимают из воды. А после того, как процесс остановлен, и ТВЭЛы вынули из реактора  (ну и из воды тоже) , их снова помещают в воду на несколько лет, но уже вне реактора.