Нужно было сходить. Расскажу, как возникла моя "переплата". Я зплатила налог с доходов, полученных от продажи акций, но декларацию не подала. И думать об этом забыла пока не завела ЛК и не увидела, что эта сумма висит как переплата. Т.е налоговики не могут оприходовать деньги, если они (эти деньги, полученные на счет налоговой) не подкреплены декларацией или другой бумагой, мной подписанной. Скорее всего что-то похожее произошло и у вас. Вы завели ЛК и там отразились какие-то деньги, но документов-оснований для этих денег нет.  Вот они и висят в системе как переплата.