В лицее всегда была сложная химия. И когда я училась, и до меня, и после меня.  То, что бы называете "проблемой с предметом" - это недоученный материал, который надо доучить. Я прекрасно понимаю, что Вы мне пытаетесь сказать. Как это вижу я: классу сложно (но это же профильный класс, чего все ожидали), много времени уходит на подготовку (но это же профильный класс, чего все ожидали), учителя ставят двойки. Так если учителя видят, что дети плохо готовятся и не стараются, что сделать? Поставить 5? Как эти дети будут сдавать ЕГЭ? Или писать олимпиады? Плакаться в жилетку два года и потом написать на 100 не получится.  Надо учить.