Все правильно вам сказали в ГИТ, у Вас договор на определенную сумму - Вы ее и получаете. Отпускные рассчитывают по среднему за период, сколько получали до - такие и отпускные. Доказать получение черного нала, ну... кому это надо? Зачем? Обидно, конечно, но странно, что Вы сами не понимали, что официально Вам будут платить только окладную часть.