Антитела бывают против белков вируса, а вот за проникновение в клетку и связывание белков отвечает генетический код из 15-20 тыс. звеньев, который постоянно меняется, это и называется "штамм". Вирус все время приспосабливается, но белки в его основе одни и те же, так что антитела в любом случае действуют, но иногда недостаточно.