Можно перелечить каналы - это будет очень дорого и без гарантии. Если повезет - воспаление уйдет, а если нет - зуб может пойти под удаление через пару месяцев после лечения. Если киста большая, то опасность в том что она может соседние зубы захватить. Еще есть вариант резекции верхушки корня - с передними зубами такое точно делают (потом часто под коронку зуб попадает), насчет жеательных не в курсе. Вам нужна консультация минимум 2-х хороших врачей - стоматолога-терапевта и хирурга. Насчет воспаления - у вас разве нет ирригатора?