Мои дети с такой ситуацией не сталкивались, а документ я давно читала, детали не помню. На сайте нашей школы он не выложен. Но это правило и в обратную сторону работает - если в одной четверти 5, а в остальных 4, то при получении 5 за экзамен итоговую ставят 5.