Единственное, чем лучше, что на ПМИ вообще нет физики. А на программной инженерии есть какая-то. Когда мой поступал, выбирал из этих соображений. Поступил на ПМИ в результате. Теперь вешается от математики, там ее по 6 разновидностей в семестре, и по каждой надо сдавать экзамен или зачет.