Protein sequence:
MMKKKNIDIEELKRLIEESSMKKRFVKDIKRNCEIKSIRFGIMSKEDIIKYSEVKIMNREMYKNNSGIPYPYGVLDLKLGAHKSNSVCETCNKKLINCSGHFGYIELNYPVFHIGYYKYIIHILYCICKYCSSLLLSKEKIDFYCNLKKKSTDDSFYKKHLFKRILNNCKKVNKCYICGNPQGVIKKIIKPSLDQFMKLKHILKVKENGKMIIKEEDLNSLYVLKLFKNINPYHVKLLNIENPEKLIITALLVPPNTIRPSVIIDEHGTAEDDLTCILSEITQLNNTIYNQCTNGYQTNQFLGNVEFLQLQITRFINSDSPAVSQLLATQNISKPGRGICQRLKGKEGRFRCNLSGKRVDFSSRTVISPDPNISIDEVVIPKIIAMRLTYPETVNKYNIDKLKMLIKNGCNKWPGANYIIKKSKKGTDPYSDISTSYNNNSNNISSIGCSNIFNVVNNYINNNCKNVRYNIKDVNNNVLLKDMCDINNMNNDINNNINNIYKNTSETNLCNVNNHNNNNNIYCNNQTQDNEEERKNSQFNKISLKYANKNHVIQNLNIGDVVERHICDGDIVLFNRQPSLHRMSIMCHKAKIMDFKTFRFNECVCSPYNADFDGDEMNLDVPQTEEARAEALYLMNVKHNLITPKNGEVIIALTQDFLSASYIITNKDTFLDRDTFCLLCSYFSDASLYIELPIPAILKPKELWTGKQLISVLIKPNKKENTIINFEIQEREYSNKFGDLKHLCLNDSYVCFYKSELICGSLGKKVLGSSKYGLFYYLIHHNSSHIALKIMNRLSKLTSRYFSNKGMTIGIDDVRPSQTLTEKKKDLLLKGYEKVNNEIILYNEKKMQIQPGCTLEETLEIKVKSILDDLRNDAGKTCNQYLHYLNKPLIMFNSGAKGALINIAQMIACVGQQNVAGQRIQNGFINRTLPHFHFHCKDSESRGFVQNSFYTGLSPTEFFFHTMSGREGLVDTAVKTAETGYMQRRLMKALEDLSIHYDYSVRSCDKQIVQFIYGDDALNPSYIDNNNTYLDQFDKVFDHIVSISSSHLLLSYKNKIPYLPHVQHQNKTSNMNNIYNNMNNINNNDSNRSIIYNNDSNMNNINNNDSNMNSIHNNNSNMNNIHNNDSNRSIIHNNDSNMNSIHNNDSNMNSIHNNNSNMNNIHNNDSNRSIIHNNDSNMNSIHNNDSNNNNNYKDCTHNPYICNESLIIRNIMNRLIYQNIAQEDLFIPLEHDEFLVNKIMESYTDQECNYEDIIRSLDLNKNVSYIHNDQGKHLSLQMCAEEHITINNTNNDNTYVEQIEMKELSKNKTKEKQSFKGTIRDMHEDSEEQMNKFITKKAKFFIEKKKGKMHECNDDIEYNNTQYDNIQYNNISCNYIKSQNLENTHHQVNNDLSFIKNNVILPPKEYHSIFHFVNDYRNVVEIKNLMDKKKIFLNNSEKNVVQSKYNRMSKNLKKKIEIINNIYRNEKKKLNRWKTKMDNDDNYWSSDDDSIIAKKIIKIKNKEKRKYHPKEEKENFDRNNYKMITDNNNNDNNNNNNDNNNNDNNNNNNNSNNNNYYYNLHDDVNNLGVTNYNTNIYPNDCNGIYEKETNNNELTTNSNMCDKNNDFSDEFFNNINENDLLYDNKYYRQIFKNVIGFVSVFEYVESYKQHYILFPYEIIKWTSFLLEYLTEIIPTNIFLHTKLSKKEKPTHQKNTGKMKIYIEEIKKWLFIKAINIYKYFSFKKSIELIKKKDYFNYIIKNYDISHRYIIHDYSFINLKQLYLFIFFNIYKYFKYISTPGDAVGSISAQSIGEPGTQMTLKTFHFAGVASMNVTLGVPRIKEIINASNSIQTPILNIPLEVNDNYNFALMMKSKLEKTTIRDICMYIKEDYTSRGVFLSVKFNEELIQKLFLNINAYNIKDIILKQSHINKIKINKIHINVINKYKLHISLKNDEFIFFQMESLKKGLLDLLIYGDKDIKRCIIKKEDIEVTDNEDEICDDMDEYYNVSQGTELYERKCNSKEENKNAIRVKKEEIDDNLEKEENIIYVSEKDSVNQLKSEKKKDINDDNNNNDDNNNNNDDDNKINDTIFNDDIDSDRNNLKENGSKLENVGEHIIERLSYKMKEKNVKKEHIKKEPNLINLDTINLDTLNFDEINVHNINNEKIEFYDEHLNICQGNKKHIQKKKKKKTVYSILVEGNSLNYVLGLEGVDFKHIISNHVINVFQVLGIEAARITIINEIKKCVEAYSIDIDIRHIMLLADIMAFTGDILGINRFGIQKARQSTLMLASFEETNEHLFVSSFFKNVDEINNISESIIVGKNIPIGTGAFQLLYDYKLEKETKNLTLLEKAERETAMNY

Annotated regions:
phrase: MSKEDIIKYSEVKIMNREMYKNNSGIPYPYGVLDLKLGAHKSNSVCETCNKKLINCSGHFGYIELNYPVFHIGYYKYIIHILYCICKYCSSLLLSKEKIDFYCNLKKKSTDDSFYKKHLFKRILNNCKKVNKCYICGNPQGVIKKIIKPSLDQFMKLKHILKVKENGKMIIKEEDLNSLYVLKLFKNINPYHVKLLNIENPEKLIITALLVPPNTIRPSVIIDEHGTAEDDLTCILSEITQLNNTIYNQCTNGYQTNQFLGNVEFLQLQITRFINSDSPAVSQLLATQNISKPGRGICQRLKGKEGRFRCNLSGKRVDFSSRTVISPDPNISIDEVVIPKIIAMRLTYPETVNKYNIDKLKMLIKNGCNKWPGANYIIKKSKKGTDPYSDISTSYNNNSNNISSIGCSNIFNVVNNYINNNCKNVRYNIKDVNNNVLLKDMCDINNMNNDINNNINNIYKNTSETNLCNVNNHNNNNNIYCNNQTQDNEEERKNSQFNKISLKYANKNHVIQNLNIGDVVERHICDGDIVLFNRQPSLHRMSIMCHKAKIMDFKTFRFNECVCSPYNADFDGDEMNLDVPQTEEARAEALYLMNVKHNLITPKNGEVIIALTQDFLSASYIITNKDTFLDRDTFCLLCSYFSDASLYIELPIPAILKPKELWTGKQLISVLIKPNKKENTIINFEIQEREYSNKFGDLKHLCLNDSYVCFYKSELICGSLGKKVLGSSKYGLFYYLIHHNSSHIALKIMNRLSKLTSRYFSNKGMTIGIDDVRPSQTLTEKKKDLLLKGYEKVNNEIILYNEKKMQIQPGCTLEETLEIKVKSILDDLRNDAGKTCNQYLHYLNKPLIMFNSGAKGALINIAQMIACVGQQNVAGQRIQNGFINRTLPHFHFHCKDSESRGFVQNSFYTGLSPTEFFFHTMSGREGLVDTAVKTAETGYMQRRLMKALEDLSIHYDYSV
type: DOMAIN
name: RNAP_III_RPC1_N
description: DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC1, N-terminal

phrase: EKLIITALLVPPNTIRPSVIIDEHGTAEDDLTCILSEITQLNNTIYNQCTNGYQTNQFLGNVEFLQLQITRFINSDSPAVSQLLATQNISKPGRGICQRLKGKEGRFRCNLSGKRVDFSSRTVISPDPNISIDEVVIPKIIAMRLTYPETVNKYNIDKLKMLIKNGCNKWPGANYIIKKSKKGTDPYSDISTSYNNNSNNISSIGCSNIFNVVNNYINNNCKNVRYNIKDVNNNVLLKDMCDINNMNNDINNNINNIYKNTSETNLCNVNNHNNNNNIYCNNQTQDNEEERKNSQFNKISLKYANKNHVIQNLNIGDVVERHICDGDIVLFNRQPSLHRMSIMCHKAKIMDFKTFRFNECVCSPYNADFDGDEMNLDVPQTEEARAEALYLMNVKHNLITPKNGEVIIALTQDFLSASYII
type: DOMAIN
name: RNA_pol_N
description: RNA polymerase, N-terminal

phrase: NLITPKNGEVIIALTQDFLSASYIITNKDTFLDRDTFCLLCSYFSDASLYIELPIPAILKPKELWTGKQLISVLIKPNKKENTIINFEIQEREYSNKFGDLKHLCLNDSYVCFYKSELICGSLGKKVLGSSKYGLFYYLIHHNSSHIALKIMNRLSKLTSRYFSNKGMTIGIDD
type: DOMAIN
name: RNA_pol_Rpb1_3
description: RNA polymerase Rpb1, domain 3

phrase: GLSPTEFFFHTMSGREGLVDTAVKTAETGYMQRRLMKALEDLSIHYDYSVRSCDKQIVQFIYGDDALNPSYIDNNNTYLDQFDKVFDHIVSISSSHLLLSYKNKIPYLPHVQHQNKTSNMNNIYNNMNNINNNDSNRSIIYNNDSNMNNINNNDSNMNSIHNNNSNMNNIHNNDSNRSIIHNNDSNMNSIHNNDSNMNSIHNNNSNMNNIHNNDSNRSIIHNNDSNMNSIHNNDSNNNNNYKDCTHNPYICNESLIIRNIMNRLIYQNIAQEDLFIPLEHDEFLVNKIMESYTDQECNYEDIIRSLDLNKNVSYIHNDQGKHLSLQMCAEEHITINNTNNDNTYVEQIEMKELSKNKTKEKQSFKGTIRDMHEDSEEQMNKFITKKAKFFIEKKKGKMHECNDDIEYNNTQYDNIQYNNISCNYIKSQNLENTHHQVNNDLSFIKNNVILPPKEYHSIFHFVNDYRNVVEIKNLMDKKKIFLNNSEKNVVQSKYNRMSKNLKKKIEIINNIYRNEKKKLNRWKTKMDNDDNYWSSDDDSIIAKKIIKIKNKEKRKYHPKEEKENFDRNNYKMITDNNNNDNNNNNNDNNNNDNNNNNNNSNNNNYYYNLHDDVNNLGVTNYNTNIYPNDCNGIYEKETNNNELTTNSNMCDKNNDFSDEFFNNINENDLLYDNKYYRQIFKNVIGFVSVFEYVESYKQHYILFPYEIIKWTSFLLEYLTEIIPTNIFLHTKLSKKEKPTHQKNTGKMKIYIEEIKKWLFIKAINIYKYFSFKKSIELIKKKDYFNYIIKNYDISHRYIIHDYSFINLKQLYLFIFFNIYKYFKYISTPGDAVGSISAQSIGEPGTQMTLKTFHFAGVASMNVTLGVPRIKEIINASNSIQTPILNIPLEVNDNYNFALMMKSKLEKTTIRDICMYIKEDYTSRGVFLSVKFNEELIQKLFLNINAYNIKDIILKQSHINKIKINKIHINVINKYKLHISLKNDEFIFFQMESLKKGLLDLLIYGDKDIKRCIIKKEDIEVTDNEDEICDDMDEYYNVSQGTELYERKCNSKEENKNAIRVKKEEIDDNLEKEENIIYVSEKDSVNQLKSEKKKDINDDNNNNDDNNNNNDDDNKINDTIFNDDIDSDRNNLKENGSKLENVGEHIIERLSYKMKEKNVKKEHIKKEPNLINLDTINLDTLNFDEINVHNINNEKIEFYDEHLNICQGNKKHIQKKKKKKTVYSILVEGNSLNYVLGLEGVDFKHIISNHVINVFQVLGIEAARITIINEIKKCVEAYSIDIDIRHIMLLADIMAFTGDILGINRFGIQKARQS
type: DOMAIN
name: RNA_pol_Rpb1_5
description: RNA polymerase Rpb1, domain 5

phrase: CEIKSIRFGIMSKEDIIKYSEVKIMNREMYKNNSGIPYPYGVLDLKLGAHKSNSVCETCNKKLINCSGHFGYIELNYPVFHIGYYKYIIHILYCICKYCSSLLLSKEKIDFYCNLKKKSTDDSFYKKHLFKRILNNCKKVNKCYICGNPQGVIKKIIKPSLDQFMKLKHILKVKENGKMIIKEEDLNSLYVLKLFKNINPYHVKLLNIENPEKLIITALLVPPNTIRPSVIIDEHGTAEDDLTCILSEITQLNNTIYNQCTNGYQTNQFLGNVEFLQLQITRFINSDSPAVSQLLATQNISKPGRGICQRLKGKEGRFRCN
type: DOMAIN
name: RNA_pol_Rpb1_1
description: RNA polymerase Rpb1, domain 1

phrase: NNHNNNNNIYCNNQTQDNEEERKNSQFNKISLKYANKNHVIQNLNIGDVVERHICDGDIVLFNRQPSLHRMSIMCHKAKIMDFKTFRFNECVCSPYNADFDGDEMNLDVPQTEEARAEALYLMN
type: DOMAIN
name: RNA_pol_asu
description: RNA polymerase, alpha subunit

phrase: GKRVDFSSRTVISPDPNISIDEVVIPKIIAMRLTYPETVNKYNIDKLKMLIKNGCNKWPGANYIIKKSKK
type: DOMAIN
name: RNA_pol_asu
description: RNA polymerase, alpha subunit

phrase: NEKKMQIQPGCTLEETLEIKVKSILDDLRNDAGKTCNQYLHYLNKPLIMFNSGAKGALINIAQMIACVGQQNVAGQRIQNGFINRTLPHFHFHCKDSESRGF
type: DOMAIN
name: RNA_pol_Rpb1_4
description: RNA polymerase Rpb1, domain 4