Protein sequence:
MSKKQYKISHFMTTKISLRISSPEEILKDSYGEIIKPETINYRTNKPERNGLFCEKIFGPIKDYECFCGKYKKKLYKEIIRLRQLNKELKVKGLFCNRCGVEITKNTVRRTRMGHINLVVPIVHIWGFRSTPNKIGSILGLSSQQLDMIIYYERYVVIQPGIANSYNNLSIKKLDLLTEEEYTYILNKIPIGNKYLYDNDPNKFIAKMGAECLEELLIRVDLEVLLSDLKKEIKNEESKQRKIELFKRLNVVECFIEGKKKGNKIESIILKVLPVIPPELRPLVPLDGGGYASSDLNDFYRRILIRNNRLKRLIHISAPEIILRNEKRMLQEAVDSLLDNSKKILAVKSESNRPLKSLSDSLKGKQGRFRQNLLGKRVDYSARSVIVVGPKLKLHECGLPKEIAAEIYKPFLIRKLLERKIVRTVKSAKKLISKKDPIIWDILKYLLKGHPVLLNRAPTLHRLGIQSFQPKLIEGKAILLHPLVCSAFNADFDGDQMAVHLPLSNEAILEAKLLMLASQNILNPANGYPITVPSQDMVLGLYYMTKELKSTYESKIKGEGMCFSSLEEVEIAYNNKVVEIHAIIKVKVKILENIGLISKIIKTTVGRVLFNIVVPPKVGYINKLLTNKSLRKIINYILYNTNIPTTAKFLDKIKDLGYYHAFKGGLSFNLNDISIPKEKKSLVKRAIEKVSLVKDNYNLGLITNNERYNQIIDIWTNTNVSLTEKVINYMRKSKQGFNSVYMMLDSGARSSKEQIRQLSGMRGLMAKPQKTSSLGSEIIENPILSNFLEGLSILEYFISTHGARKGLADTALKTADAGYLTRRLVDSAQDVIIQEDDCKTLLGIKISAVKKKEKIIETLSSRVLGRIALNNIYDPTNNNVLIKSSQMIDEKNINLIEKASIDTIEVRSPLTCKSKTGICRKCYGRNLANGLMIQKGEAIGVIAAQSIGEPGTQLTLRTFHVGGTAGNIYEYSKIKAKYDGIIEYEDIQVVKNLVISRSSEIRLLNNHKDKVILMKKKIPYGAKLYVSNKQLVKKNDIICSWDPYNAVIIAEFTGKIRYSNIERDEQTGFKVISERKTPTLKIVNKKNEILKSYNIPVGAHLVVNDGDIINEGSILIKIPIKDLKSGDITGGLPRLSELFEARNDDDDDDYYDSDYYDYYDYSDDDDDYDDYDDYYYNYDDDENDNDNDYDYDYDYDYDYDSDSHNSYSHNSYSPSSNDNYDYDYDSDSDYDSDYDYGDISLNEILDIKGLRAAQKKLINEIQEVYRSQGVKINDKHFEVIVRQMTQKVEIIKSGDTSFLEGNIEYTDVFLEENKRILNMKFIEESGDSKKFFKGQLVNFHELKKENYLLKLSNKNKILFRDVITAISKPIIQGITKAALQTKSFLSAASFQETTKVLYEAAISNKTDYLNGLKENVILGNKIPAGTGLKKSSYEEIIIGDGNQKLKKKDSEINKKLKIENKILK

Annotated regions:
phrase: KISLRISSPEEILKDSYGEIIKPETINYRTNKPERNGLFCEKIFGPIKDYECFCGKYKKKLYKEIIRLRQLNKELKVKGLFCNRCGVEITKNTVRRTRMGHINLVVPIVHIWGFRSTPNKIGSILGLSSQQLDMIIYYERYVVIQPGIANSYNNLSIKKLDLLTEEEYTYILNKIPIGNKYLYDNDPNKFIAKMGAECLEELLIRVDLEVLLSDLKKEIKNEESKQRKIELFKRLNVVECFIEGKKKGNKIESIILKVLPVIPPELRPLVPLDGGGYASSDLNDFYRRILIRNNRLKRLIHISAPEIILRNEKRMLQEAVDSLLDNSKKILAVKSESNRPLKSLSDSLKGKQGRFRQN
type: DOMAIN
name: RNA_pol_Rpb1_1
description: RNA polymerase Rpb1, domain 1

phrase: ESIILKVLPVIPPELRPLVPLDGGGYASSDLNDFYRRILIRNNRLKRLIHISAPEIILRNEKRMLQEAVDSLLDNSKKILAVKSESNRPLKSLSDSLKGKQGRFRQNLLGKRVDYSARSVIVVGPKLKLHECGLPKEIAAEIYKPFLIRKLLERKIVRTVKSAKKLISKKDPIIWDILKYLLKGHPVLLNRAPTLHRLGIQSFQPKLIEGKAILLHPLVCSAFNADFDGDQMAVHLPLSNEAILEAKLLMLASQNILNPANGYPITVPSQDMVLGLYYM
type: DOMAIN
name: RNA_pol_N
description: RNA polymerase, N-terminal

phrase: NILNPANGYPITVPSQDMVLGLYYMTKELKSTYESKIKGEGMCFSSLEEVEIAYNNKVVEIHAIIKVKVKILENIGLISKIIKTTVGRVLFNIVVPPKVGYINKLLTNKSLRKIINYILYNTNIPTTAKFLDKIKDLGYYHAFKGGLSFNLND
type: DOMAIN
name: RNA_pol_Rpb1_3
description: RNA polymerase Rpb1, domain 3

phrase: DISLNEILDIKGLRAAQKKLINEIQEVYRSQGVKINDKHFEVIVRQMTQKVEIIKSGDTSFLEGNIEYTDV
type: DOMAIN
name: RNA_pol_Rpb1_5
description: RNA polymerase Rpb1, domain 5

phrase: GLSILEYFISTHGARKGLADTALKTADAGYLTRRLVDSAQDVIIQEDDCKTLLGIKISAVKKKEKIIETLSSRVLGRIALNNIYDPTNNNVLIKSSQMIDEKNINLIEKASIDTIEVRSPLTCKSKTGICRKCYGRNLANGLMIQKGEAIGVIAAQSIGEPGTQLTLRTFHVGGTAGNIYEYSKIKAKYDGIIEYEDIQVVKNLVISRSSEIRLLNNHKDKVILMKKKIPYGAKLYVSNKQLVKKNDIICSWDPYNAVIIAEFTGKIRYSNIERDEQTGFKVISERKTPTLKIVNKKNEILKSYNIPVGAHLVVNDGDIINEGSI
type: DOMAIN
name: RNA_pol_Rpb1_5
description: RNA polymerase Rpb1, domain 5

phrase: ITNNERYNQIIDIWTNTNVSLTEKVINYMRKSKQGFNSVYMMLDSGARSSKEQIRQLSGMRGLMAKPQKTSSLGSEIIENPILSN
type: DOMAIN
name: RNA_pol_Rpb1_4
description: RNA polymerase Rpb1, domain 4

phrase: GKRVDYSARSVIVVGPKLKLHECGLPKEIAAEIYKPFLIRKLLERKIVRTVKSAKKLISKKDPIIWDILKYLLKGHPVLLNRAPTLHRLGIQSFQPKLIEGKAILLHPLVCSAFNADFDGDQMAVHLPLSNEAILEAKLLM
type: DOMAIN
name: RNA_pol_asu
description: RNA polymerase, alpha subunit