Protein sequence:
MEAKERKETVRFDAIRLSLASPEIIRSWSHGEVKKPETLNYRTLKPEKDGLFDARIFGPIKDYECLCGKYKKRKYEGTICDRCGVEVTRSDVRRERFGHIELASPVVHIWYLKSTPSKIGSLLDLTSRDIERVVYFESYLVIEHPTEEEEEAFEKDPKSLPLMEGGLTKYVKLHVVSEDEFREREYEYSNAEKYEYGMGAEKVKDVLARIDLEILAKRLKKDLHGYAGTFDDLNLSYKMNYPRLYNKAIIEIARKFSEVGLRFGDIEPTEKEIDVIISQGYYIVIDPASSDLKFGQIINPENVDSLPEGVIALTGVEALEKLYKAYREKVKEIPIFEVIKESVRNVILKEGTDARLKKIIRRLRLVEGFIESENKPEWMILEVLPVIPPDLRPLIALDGGRFASSDLNDLYRRVINRNNRLKRLIDLDAPEIIIRNEKRMLQEAVDALIDNGRRGRMVTQNNRPLKSLSDSLRGKEGRFRQNLLGKRVDYSGRSVIVVGPELQMHECGLPKQMALELFKPFIYRRLEEKGYATSIKSAKKLVEEKVPEVYECLEEVVKQHPVLLNRAPTLHRMSVQAFEPKLVEGKAIKLHPLVCPPFNADFDGDQMAVHVPLSVEAQLESYILMLSTQNILSPAHGKPVTMPSQDIILGVHYMTQELPNAKGEGKIFGSPEEAVTAYELGTIDLLAKIKVRINGKIVETTAGRIIFNQILPEGYKFVNEVLDKKKISKLISDIYEKYGNEIAAQTLDKIKEIGFRFATKAAVSISVADLVVPKKKAKILEKAIKEAETVWKQYVDGIITKGERHNKIIDIWSQATNEVAKEMFNEIEKSERVENGKKYPGYFNPVYMMASSGARGSRDQIRQLAGMRGLMAKHSGEFIETPIMSNFREGLSVVEYFISTYGARKGLADTALKTAVAGYLTRRLADVAQDVIITGEDCGTLKGITVSSIIESGEIVVPFKDRIIGRYTAEDVYDPYTGELLISANEEITEEVVDKFEKAGIEKVKIRSVLTCEMPHGVCAKCYGRDLAQRKLVDIGEAVGIIAAQSIGEPGTQLTMRTFHIGGAATAKEVQTQHKATHDGTVKLQNVKFVVDKKGRKLIINREGSIKILDKEGKTIERFPAPYGAVLYVEDGQEVKEGTILAEWEPFSDPIIAEKGGEVELRDVILDVTLKEERDNITGKTIYTITFLRPKDAQLHTPRLVIKGEDGNEYVYDLPVNTILLIPKENLEEVWDKCFACSEAEKTDIHHKYLQVKKGFKVSEGDVVAKIPKEKAKVRDIVGGLPRVEELLEAREPKNKAIITEIDGIVKIYEDAKEITLINPKEGKTETYKVPDTTFVIVKNGSFVKAGQSLVDDGSIVAEFDGMVRLKSEGSRIVVFNKETGQQKDYKVPKGKFIIVKDNSVVKAGDPLTDGTPNPHDILRVMGIEELAAFLVKEAQIVYRLQGVEINDKHFEVIIRQILRKVKIVDPGDSRFLLNEIVDKLDLEEEINKVISEGGRPPKAEPVLVGITKAALTTRSWISAASFQETTRVLADAAVEGKVDPLKGLKENVIIGGIIPAGTGIKEYSEVEVVLKEEEKEEV

Annotated regions:
phrase: GKRVDYSGRSVIVVGPELQMHECGLPKQMALELFKPF
type: DOMAIN
name: RNA_pol_asu
description: RNA polymerase, alpha subunit

phrase: EKGYATSIKSAKKLVEEKVPEVYECLEEVVKQHPVLLNRAPTLHRMSVQAFEPKLVEGKAIKLHPLVCPPFNADFDGDQMAVHVPLSVEAQLESYILM
type: DOMAIN
name: RNA_pol_asu
description: RNA polymerase, alpha subunit

phrase: NILSPAHGKPVTMPSQDIILGVHYMTQELPNAKGEGKIFGSPEEAVTAYELGTIDLLAKIKVRINGKIVETTAGRIIFNQILPEGYKFVNEVLDKKKISKLISDIYEKYGNEIAAQTLDKIKEIGFRFATKAAVSISVAD
type: DOMAIN
name: RNA_pol_Rpb1_3
description: RNA polymerase Rpb1, domain 3

phrase: GLSVVEYFISTYGARKGLADTALKTAVAGYLTRRLADVAQDVIITGEDCGTLKGITVSSIIESGEIVVPFKDRIIGRYTAEDVYDPYTGELLISANEEITEEVVDKFEKAGIEKVKIRSVLTCEMPHGVCAKCYGRDLAQRKLVDIGEAVGIIAAQSIGEPGTQLTMRTFHIGGAATAKEVQTQHKATHDGTVKLQNVKFVVDKKGRKLIINREGSIKILDKEGKTIERFPAPYGAVLYVEDGQEVKEGTILAEWEPFSDPIIAEKGGEVELRDVILDVTLKEERDNITGKTIYTITFLRPKDAQLHTPRLVIKGEDGNEYVYDLPVNTILLIPKENLEEVWDKCFACSEAEKTDIHHKYLQVKKGFKVSEGDVVAKIPKEKAKVRDIVGGLPRVEELLEAREPKNKAIITEIDGIVKIYEDAKEITLINPKEGKTETYKVPDTTFVIVKNGSFVKAGQSLVDDGSIVAEFDGMVRLKSEGSRIVVFNKETGQQKDYKVPKGKFIIVKDNSVVKAGDPLTDGTPNPHDILRVMGIEELAAFLVKEAQIVYRLQGVEINDKHFEVIIRQILRKVKIVDPGDSRFLLNEIVDKLDLEEEINKVISEGGRPPKAEPVLVGITKA
type: DOMAIN
name: RNA_pol_Rpb1_5
description: RNA polymerase Rpb1, domain 5

phrase: EWMILEVLPVIPPDLRPLIALDGGRFASSDLNDLYRRVINRNNRLKRLIDLDAPEIIIRNEKRMLQEAVDALIDNGRRGRMVTQNNRPLKSLSDSLRGKEGRFRQNLLGKRVDYSGRSVIVVGPELQMHECGLPKQMALELFKPFIYRRLEEKGYATSIKSAKKLVEEKVPEVYECLEEVVKQHPVLLNRAPTLHRMSVQAFEPKLVEGKAIKLHPLVCPPFNADFDGDQMAVHVPLSVEAQLESYILMLSTQNILSPAHGKPVTMPSQDIILGVHYM
type: DOMAIN
name: RNA_pol_N
description: RNA polymerase, N-terminal

phrase: ITKGERHNKIIDIWSQATNEVAKEMFNEIEKSERVENGKKYPGYFNPVYMMASSGARGSRDQIRQLAGMRGLMAKHSGEFIETPIMSNF
type: DOMAIN
name: RNA_pol_Rpb1_4
description: RNA polymerase Rpb1, domain 4

phrase: RFDAIRLSLASPEIIRSWSHGEVKKPETLNYRTLKPEKDGLFDARIFGPIKDYECLCGKYKKRKYEGTICDRCGVEVTRSDVRRERFGHIELASPVVHIWYLKSTPSKIGSLLDLTSRDIERVVYFESYLVIEHPTEEEEEAFEKDPKSLPLMEGGLTKYVKLHVVSEDEFREREYEYSNAEKYEYGMGAEKVKDVLARIDLEILAKRLKKDLHGYAGTFDDLNLSYKMNYPRLYNKAIIEIARKFSEVGLRFGDIEPTEKEIDVIISQGYYIVIDPASSDLKFGQIINPENVDSLPEGVIALTGVEALEKLYKAYREKVKEIPIFEVIKESVRNVILKEGTDARLKKIIRRLRLVEGFIESENKPEWMILEVLPVIPPDLRPLIALDGGRFASSDLNDLYRRVINRNNRLKRLIDLDAPEIIIRNEKRMLQEAVDALIDNGRRGRMVTQNNRPLKSLSDSLRGKEGRFRQN
type: DOMAIN
name: RNA_pol_Rpb1_1
description: RNA polymerase Rpb1, domain 1