ในคลองบางกอกใหญ่มีขยะเยอะมาก ลอยมาตามน้ำตั้งแต่ประตูน้ำคลองบางกอกใหญ่ ทางประตูน้ำไม่มีการเก็บขยะก่อนเปิดประตู ทำให้ขยะลอยเข้ามาด้านในตามคลองเป็นทางยาวหลายกิโลเมตร ซึ่งคลองนี้บริเวณหน้าวัดปากน้ำภาษีเจริญเป็นแหล่งท่องเที่ยวทางน้ำมีนักท่องเที่ยวชาวต่างชาติมากมายมาเที่ยวทำให้เสียภาพลักษณ์และมลพิษทางน้ำเป็นอย่างมาก