Program: 24908
Project: 24908
Buggy source:
public static void setx(CommandSender sender,String[] args){
  String varX=null;
  if (EZCalc.usePermissions) {
    if (!EZCalc.permissionHandler.has((Player)sender,"String_Node_Str")) {
      Error.error("String_Node_Str",sender);
    }
 else {
      int length=args.length;
      for (int k=0; k < length; k++) {
        boolean concatenate=false;
        if (!concatenate) {
          args[0]=ParseVariables.replaceVariables(sender,args[0]);
          varX=args[0];
          concatenate=true;
        }
 else {
          args[k]=ParseVariables.replaceVariables(sender,args[k]);
          varX+=args[k];
        }
      }
      String answer=X.solve(varX);
      if (answer.equals("String_Node_Str")) {
        Error.error("String_Node_Str",sender);
      }
 else {
        if (answer.equals("String_Node_Str")) {
          Error.error("String_Node_Str",sender);
        }
        sender.sendMessage(ChatColor.GOLD + "String_Node_Str" + ChatColor.DARK_GREEN+ answer);
        EZCalc.x.put((Player)sender,varX);
      }
    }
  }
 else {
    int length=args.length;
    for (int k=0; k < length; k++) {
      boolean concatenate=false;
      if (!concatenate) {
        args[0]=ParseVariables.replaceVariables(sender,args[0]);
        varX=args[0];
        concatenate=true;
      }
 else {
        args[k]=ParseVariables.replaceVariables(sender,args[k]);
        varX+=args[k];
      }
    }
    String answer=X.solve(varX);
    if (answer.equals("String_Node_Str")) {
      Error.error("String_Node_Str",sender);
    }
 else {
      if (answer.equals("String_Node_Str")) {
        Error.error("String_Node_Str",sender);
      }
      sender.sendMessage(ChatColor.GOLD + "String_Node_Str" + ChatColor.DARK_GREEN+ answer);
      EZCalc.x.put((Player)sender,varX);
    }
  }
}

Fixed version (ground truth):
public static void setx(CommandSender sender,String[] args){
  String varX=null;
  if (EZCalc.usePermissions) {
    if (!EZCalc.permissionHandler.has((Player)sender,"String_Node_Str")) {
      Error.error("String_Node_Str",sender);
    }
 else {
      int length=args.length;
      for (int k=0; k < length; k++) {
        boolean concatenate=false;
        if (!concatenate) {
          args[0]=ParseVariables.replaceVariables(sender,args[0]);
          varX=args[0];
          concatenate=true;
        }
 else {
          args[k]=ParseVariables.replaceVariables(sender,args[k]);
          varX+=args[k];
        }
      }
      String answer=X.solve(varX);
      if (answer.equals("String_Node_Str")) {
        Error.error("String_Node_Str",sender);
      }
 else {
        if (answer.equals("String_Node_Str")) {
          Error.error("String_Node_Str",sender);
        }
 else {
          sender.sendMessage(ChatColor.GOLD + "String_Node_Str" + ChatColor.DARK_GREEN+ answer);
          EZCalc.x.put((Player)sender,varX);
        }
      }
    }
  }
 else {
    int length=args.length;
    for (int k=0; k < length; k++) {
      boolean concatenate=false;
      if (!concatenate) {
        args[0]=ParseVariables.replaceVariables(sender,args[0]);
        varX=args[0];
        concatenate=true;
      }
 else {
        args[k]=ParseVariables.replaceVariables(sender,args[k]);
        varX+=args[k];
      }
    }
    String answer=X.solve(varX);
    if (answer.equals("String_Node_Str")) {
      Error.error("String_Node_Str",sender);
    }
 else {
      if (answer.equals("String_Node_Str")) {
        Error.error("String_Node_Str",sender);
      }
 else {
        sender.sendMessage(ChatColor.GOLD + "String_Node_Str" + ChatColor.DARK_GREEN+ answer);
        EZCalc.x.put((Player)sender,varX);
      }
    }
  }
}