Program: 51659
Project: 51659
Buggy source:
public StockItem(String data){
  limit=new LimitSystem(this);
  String[] values=data.split("String_Node_Str");
  for (  String value : values) {
    if (item == null) {
      if (value.contains("String_Node_Str")) {
        String[] itemData=value.split("String_Node_Str");
        item=new ItemStack(Integer.parseInt(itemData[0]),1,(short)0,Byte.parseByte(itemData[1]));
        amouts.add(1);
      }
 else {
        item=new ItemStack(Integer.parseInt(value),1);
        amouts.add(1);
      }
    }
 else {
      if (value.length() > 2) {
        if (value.startsWith("String_Node_Str") && !value.contains("String_Node_Str") && !value.contains("String_Node_Str")) {
          price=Double.parseDouble(value.substring(2));
        }
        if (value.startsWith("String_Node_Str") && !value.contains("String_Node_Str") && !value.contains("String_Node_Str")) {
          slot=Integer.parseInt(value.substring(2));
        }
        if (value.startsWith("String_Node_Str") && !value.contains("String_Node_Str") && !value.contains("String_Node_Str")) {
          item.setDurability(Short.parseShort(value.substring(2)));
        }
        if (value.startsWith("String_Node_Str") && !value.contains("String_Node_Str") && !value.contains("String_Node_Str")) {
          amouts.clear();
          for (          String amout : value.substring(2).split("String_Node_Str"))           amouts.add((Integer.parseInt(amout) == 0 ? 1 : Integer.parseInt(amout)));
          if (amouts.size() > 0)           item.setAmount(amouts.get(0));
        }
        if (value.startsWith("String_Node_Str") && !value.contains("String_Node_Str")) {
          String[] limitData=value.substring(3).split("String_Node_Str");
          limit.setItemGlobalLimit(Integer.parseInt(limitData[0]),Integer.parseInt(limitData[1]),Integer.parseInt(limitData[2]) * 1000);
        }
        if (value.startsWith("String_Node_Str") && !value.contains("String_Node_Str")) {
          String[] limitData=value.substring(3).split("String_Node_Str");
          limit.setItemPlayerLimit(Integer.parseInt(limitData[0]),Integer.parseInt(limitData[1]),Integer.parseInt(limitData[2]) * 1000);
        }
        if (value.startsWith("String_Node_Str") && !value.contains("String_Node_Str")) {
          for (          String ench : value.substring(2).split("String_Node_Str")) {
            String[] enchData=ench.split("String_Node_Str");
            item.addEnchantment(Enchantment.getById(Integer.parseInt(enchData[0])),Integer.parseInt(enchData[1]));
          }
        }
        if (value.equals("String_Node_Str")) {
          stackPrice=true;
        }
      }
    }
  }
}

Fixed version (ground truth):
public StockItem(String data){
  limit=new LimitSystem(this);
  String[] values=data.split("String_Node_Str");
  for (  String value : values) {
    if (item == null) {
      if (value.contains("String_Node_Str")) {
        String[] itemData=value.split("String_Node_Str");
        item=new ItemStack(Integer.parseInt(itemData[0]),1,(short)0,Byte.parseByte(itemData[1]));
        amouts.add(1);
      }
 else {
        item=new ItemStack(Integer.parseInt(value),1);
        amouts.add(1);
      }
    }
 else {
      if (value.length() > 2) {
        if (value.startsWith("String_Node_Str") && !value.contains("String_Node_Str") && !value.contains("String_Node_Str")) {
          price=Double.parseDouble(value.substring(2));
        }
        if (value.startsWith("String_Node_Str") && !value.contains("String_Node_Str") && !value.contains("String_Node_Str")) {
          slot=Integer.parseInt(value.substring(2));
        }
        if (value.startsWith("String_Node_Str") && !value.contains("String_Node_Str") && !value.contains("String_Node_Str")) {
          item.setDurability(Short.parseShort(value.substring(2)));
        }
        if (value.startsWith("String_Node_Str") && !value.contains("String_Node_Str") && !value.contains("String_Node_Str")) {
          amouts.clear();
          for (          String amout : value.substring(2).split("String_Node_Str"))           amouts.add((Integer.parseInt(amout) == 0 ? 1 : Integer.parseInt(amout)));
          if (amouts.size() > 0)           item.setAmount(amouts.get(0));
        }
        if (value.startsWith("String_Node_Str") && !value.contains("String_Node_Str")) {
          String[] limitData=value.substring(3).split("String_Node_Str");
          limit.setItemGlobalLimit(Integer.parseInt(limitData[0]),Integer.parseInt(limitData[1]),Integer.parseInt(limitData[2]) * 1000);
        }
        if (value.startsWith("String_Node_Str") && !value.contains("String_Node_Str")) {
          String[] limitData=value.substring(3).split("String_Node_Str");
          limit.setItemPlayerLimit(Integer.parseInt(limitData[0]),Integer.parseInt(limitData[1]),Integer.parseInt(limitData[2]) * 1000);
        }
        if (value.startsWith("String_Node_Str") && !value.contains("String_Node_Str")) {
          for (          String ench : value.substring(2).split("String_Node_Str")) {
            String[] enchData=ench.split("String_Node_Str");
            item.addEnchantment(Enchantment.getById(Integer.parseInt(enchData[0])),Integer.parseInt(enchData[1]));
          }
        }
      }
 else {
        if (value.equals("String_Node_Str")) {
          stackPrice=true;
          System.out.print(stackPrice);
        }
      }
    }
  }
}