Program: 17803
Project: 17803
Buggy source:
/** 
 * @param previousLayer
 * @param currentLayer
 * @param synapse
 */
public void generateLayer(Layer previousLayer,Layer currentLayer,Synapse synapse){
  this.addNewLine();
  this.appendToLine("String_Node_Str");
  this.appendToLine(nameLayer(currentLayer));
  this.appendToLine("String_Node_Str");
  if (currentLayer instanceof ContextLayer) {
    this.appendToLine("String_Node_Str");
    this.appendToLine(currentLayer.getActivationFunction().getClass().getSimpleName());
    this.appendToLine("String_Node_Str");
    this.appendToLine("String_Node_Str");
    this.appendToLine(currentLayer.hasThreshold() ? "String_Node_Str" : "String_Node_Str");
    this.appendToLine("String_Node_Str");
    this.appendToLine("String_Node_Str" + currentLayer.getNeuronCount());
    this.appendToLine("String_Node_Str");
  }
 else   if (currentLayer instanceof RadialBasisFunctionLayer) {
    this.appendToLine("String_Node_Str");
    this.appendToLine("String_Node_Str" + currentLayer.getNeuronCount());
    this.appendToLine("String_Node_Str");
  }
 else   if (currentLayer instanceof BasicLayer) {
    this.appendToLine("String_Node_Str");
    this.appendToLine(currentLayer.getActivationFunction().getClass().getSimpleName());
    this.appendToLine("String_Node_Str");
    this.appendToLine("String_Node_Str");
    this.appendToLine(currentLayer.hasThreshold() ? "String_Node_Str" : "String_Node_Str");
    this.appendToLine("String_Node_Str");
    this.appendToLine("String_Node_Str" + currentLayer.getNeuronCount());
    this.appendToLine("String_Node_Str");
  }
  this.addLine();
  if (previousLayer == null) {
    this.appendToLine("String_Node_Str");
    this.appendToLine(nameLayer(currentLayer));
    this.appendToLine("String_Node_Str");
  }
 else {
    this.appendToLine(nameLayer(previousLayer));
    this.appendToLine("String_Node_Str");
    this.appendToLine(nameLayer(currentLayer));
    if (synapse != null) {
      if (synapse instanceof DirectSynapse) {
        this.appendToLine("String_Node_Str");
      }
 else       if (synapse instanceof OneToOneSynapse) {
        this.appendToLine("String_Node_Str");
      }
 else       if (synapse instanceof WeightlessSynapse) {
        this.appendToLine("String_Node_Str");
      }
    }
    this.appendToLine("String_Node_Str");
  }
  this.addLine();
  for (  Synapse nextSynapse : currentLayer.getNext()) {
    Layer nextLayer=nextSynapse.getToLayer();
    if (this.getLayerMap().containsKey(nextLayer)) {
      this.appendToLine(nameLayer(currentLayer));
      this.appendToLine("String_Node_Str");
      this.appendToLine(nameLayer(nextLayer));
      this.appendToLine("String_Node_Str");
      this.addLine();
    }
 else {
      generateLayer(currentLayer,nextSynapse.getToLayer(),nextSynapse);
    }
  }
}

Fixed version (ground truth):
/** 
 * @param previousLayer
 * @param currentLayer
 * @param synapse
 */
public void generateLayer(Layer layer){
  this.appendToLine("String_Node_Str");
  this.appendToLine(nameLayer(layer));
  this.appendToLine("String_Node_Str");
  if (layer instanceof ContextLayer) {
    this.appendToLine("String_Node_Str");
    this.appendToLine(layer.getActivationFunction().getClass().getSimpleName());
    this.appendToLine("String_Node_Str");
    this.appendToLine("String_Node_Str");
    this.appendToLine(layer.hasThreshold() ? "String_Node_Str" : "String_Node_Str");
    this.appendToLine("String_Node_Str");
    this.appendToLine("String_Node_Str" + layer.getNeuronCount());
    this.appendToLine("String_Node_Str");
  }
 else   if (layer instanceof RadialBasisFunctionLayer) {
    this.appendToLine("String_Node_Str");
    this.appendToLine("String_Node_Str" + layer.getNeuronCount());
    this.appendToLine("String_Node_Str");
  }
 else   if (layer instanceof BasicLayer) {
    this.appendToLine("String_Node_Str");
    this.appendToLine(layer.getActivationFunction().getClass().getSimpleName());
    this.appendToLine("String_Node_Str");
    this.appendToLine("String_Node_Str");
    this.appendToLine(layer.hasThreshold() ? "String_Node_Str" : "String_Node_Str");
    this.appendToLine("String_Node_Str");
    this.appendToLine("String_Node_Str" + layer.getNeuronCount());
    this.appendToLine("String_Node_Str");
  }
  this.addLine();
}