Program: 86026
Project: 86026
Buggy source:
public void removeWorkspace(Workspace workspace) throws IOException, StorageException {
  String workspaceId=workspace.getId();
  String pathToMatch=workspaceId + "String_Node_Str";
  List<BinaryResource> binaryResourcesInWorkspace=em.createQuery("String_Node_Str",BinaryResource.class).setParameter("String_Node_Str",pathToMatch).getResultList();
  em.createQuery("String_Node_Str").setParameter("String_Node_Str",workspace).executeUpdate();
  em.createQuery("String_Node_Str").setParameter("String_Node_Str",workspace).executeUpdate();
  em.createQuery("String_Node_Str").setParameter("String_Node_Str",workspace).executeUpdate();
  em.createQuery("String_Node_Str").setParameter("String_Node_Str",workspace).executeUpdate();
  em.createQuery("String_Node_Str").setParameter("String_Node_Str",workspace).executeUpdate();
  em.createQuery("String_Node_Str").setParameter("String_Node_Str",workspace).executeUpdate();
  em.createQuery("String_Node_Str").setParameter("String_Node_Str",workspace).executeUpdate();
  em.createQuery("String_Node_Str").setParameter("String_Node_Str",workspace).executeUpdate();
  em.createQuery("String_Node_Str").setParameter("String_Node_Str",workspace).executeUpdate();
  em.createQuery("String_Node_Str").setParameter("String_Node_Str",workspace).executeUpdate();
  em.createQuery("String_Node_Str").setParameter("String_Node_Str",workspace).executeUpdate();
  em.flush();
  List<DocumentIteration> documentsIteration=em.createQuery("String_Node_Str",DocumentIteration.class).setParameter("String_Node_Str",workspace).getResultList();
  List<PartIteration> partsIteration=em.createQuery("String_Node_Str",PartIteration.class).setParameter("String_Node_Str",workspace).getResultList();
  for (  DocumentIteration d : documentsIteration) {
    d.setLinkedDocuments(new HashSet<DocumentLink>());
  }
  for (  PartIteration p : partsIteration) {
    p.setLinkedDocuments(new HashSet<DocumentLink>());
  }
  em.flush();
  List<DocumentMaster> documentsMaster=em.createQuery("String_Node_Str",DocumentMaster.class).setParameter("String_Node_Str",workspace).getResultList();
  for (  DocumentMaster d : documentsMaster) {
    em.remove(d);
  }
  em.flush();
  List<PartMaster> partsMaster=em.createQuery("String_Node_Str",PartMaster.class).setParameter("String_Node_Str",workspace).getResultList();
  for (  PartMaster p : partsMaster) {
    em.remove(p);
  }
  em.flush();
  em.createQuery("String_Node_Str").setParameter("String_Node_Str",workspaceId).setParameter("String_Node_Str",pathToMatch).executeUpdate();
  em.createQuery("String_Node_Str").setParameter("String_Node_Str",workspaceId).setParameter("String_Node_Str",pathToMatch).executeUpdate();
  List<WorkflowModel> workflowModels=em.createQuery("String_Node_Str",WorkflowModel.class).setParameter("String_Node_Str",workspace).getResultList();
  for (  WorkflowModel w : workflowModels) {
    em.remove(w);
  }
  em.flush();
  em.createQuery("String_Node_Str").setParameter("String_Node_Str",workspace).executeUpdate();
  em.createQuery("String_Node_Str").setParameter("String_Node_Str",workspace).executeUpdate();
  em.createQuery("String_Node_Str").setParameter("String_Node_Str",workspace).executeUpdate();
  em.createQuery("String_Node_Str").setParameter("String_Node_Str",workspace).executeUpdate();
  em.createQuery("String_Node_Str").setParameter("String_Node_Str",workspace).executeUpdate();
  List<UserGroup> userGroups=em.createQuery("String_Node_Str",UserGroup.class).setParameter("String_Node_Str",workspace).getResultList();
  for (  UserGroup u : userGroups) {
    u.setUsers(new HashSet<User>());
    em.flush();
    em.remove(u);
  }
  em.createQuery("String_Node_Str").setParameter("String_Node_Str",workspace).executeUpdate();
  em.flush();
  em.remove(workspace);
  dataManager.deleteWorkspaceFolder(workspaceId,binaryResourcesInWorkspace);
}

Fixed version (ground truth):
public void removeWorkspace(Workspace workspace) throws IOException, StorageException {
  String workspaceId=workspace.getId();
  String pathToMatch=workspaceId + "String_Node_Str";
  List<BinaryResource> binaryResourcesInWorkspace=em.createQuery("String_Node_Str",BinaryResource.class).setParameter("String_Node_Str",pathToMatch).getResultList();
  em.createQuery("String_Node_Str").setParameter("String_Node_Str",workspace).executeUpdate();
  em.createQuery("String_Node_Str").setParameter("String_Node_Str",workspaceId).executeUpdate();
  em.createQuery("String_Node_Str").setParameter("String_Node_Str",workspaceId).executeUpdate();
  em.createQuery("String_Node_Str").setParameter("String_Node_Str",workspace).executeUpdate();
  em.createQuery("String_Node_Str").setParameter("String_Node_Str",workspace).executeUpdate();
  em.createQuery("String_Node_Str").setParameter("String_Node_Str",workspace).executeUpdate();
  em.createQuery("String_Node_Str").setParameter("String_Node_Str",workspace).executeUpdate();
  em.createQuery("String_Node_Str").setParameter("String_Node_Str",workspace).executeUpdate();
  em.createQuery("String_Node_Str").setParameter("String_Node_Str",workspace).executeUpdate();
  em.createQuery("String_Node_Str").setParameter("String_Node_Str",workspace).executeUpdate();
  em.createQuery("String_Node_Str").setParameter("String_Node_Str",workspace).executeUpdate();
  em.flush();
  List<DocumentIteration> documentsIteration=em.createQuery("String_Node_Str",DocumentIteration.class).setParameter("String_Node_Str",workspace).getResultList();
  List<PartIteration> partsIteration=em.createQuery("String_Node_Str",PartIteration.class).setParameter("String_Node_Str",workspace).getResultList();
  for (  DocumentIteration d : documentsIteration) {
    d.setLinkedDocuments(new HashSet<DocumentLink>());
  }
  for (  PartIteration p : partsIteration) {
    p.setLinkedDocuments(new HashSet<DocumentLink>());
  }
  em.flush();
  List<DocumentMaster> documentsMaster=em.createQuery("String_Node_Str",DocumentMaster.class).setParameter("String_Node_Str",workspace).getResultList();
  for (  DocumentMaster d : documentsMaster) {
    em.remove(d);
  }
  em.flush();
  List<PartMaster> partsMaster=em.createQuery("String_Node_Str",PartMaster.class).setParameter("String_Node_Str",workspace).getResultList();
  for (  PartMaster p : partsMaster) {
    em.remove(p);
  }
  em.flush();
  em.createQuery("String_Node_Str").setParameter("String_Node_Str",workspaceId).setParameter("String_Node_Str",pathToMatch).executeUpdate();
  em.createQuery("String_Node_Str").setParameter("String_Node_Str",workspaceId).setParameter("String_Node_Str",pathToMatch).executeUpdate();
  List<WorkflowModel> workflowModels=em.createQuery("String_Node_Str",WorkflowModel.class).setParameter("String_Node_Str",workspace).getResultList();
  for (  WorkflowModel w : workflowModels) {
    em.remove(w);
  }
  em.flush();
  em.createQuery("String_Node_Str").setParameter("String_Node_Str",workspace).executeUpdate();
  em.createQuery("String_Node_Str").setParameter("String_Node_Str",workspace).executeUpdate();
  em.createQuery("String_Node_Str").setParameter("String_Node_Str",workspace).executeUpdate();
  em.createQuery("String_Node_Str").setParameter("String_Node_Str",workspace).executeUpdate();
  em.createQuery("String_Node_Str").setParameter("String_Node_Str",workspace).executeUpdate();
  List<UserGroup> userGroups=em.createQuery("String_Node_Str",UserGroup.class).setParameter("String_Node_Str",workspace).getResultList();
  for (  UserGroup u : userGroups) {
    u.setUsers(new HashSet<User>());
    em.flush();
    em.remove(u);
  }
  em.createQuery("String_Node_Str").setParameter("String_Node_Str",workspace).executeUpdate();
  em.flush();
  em.remove(workspace);
  dataManager.deleteWorkspaceFolder(workspaceId,binaryResourcesInWorkspace);
}