Program: 41382
Project: 41382
Buggy source:
@Override public boolean execute(CommandSender sender,String commandLabel,String[] args){
  if (commandLabel.equalsIgnoreCase("String_Node_Str")) {
    if (args.length < 1) {
      sender.sendMessage(ChatColor.RED + "String_Node_Str");
      return true;
    }
    Player player=getOnlinePlayer(args[0]);
    if (player == null) {
      sender.sendMessage(ChatColor.RED + args[0] + "String_Node_Str");
      return true;
    }
    if (((CraftPlayer)player).getHandle().playerConnection.networkManager.getVersion() >= 47) {
      if (args[1].equalsIgnoreCase("String_Node_Str")) {
        int fadeIn, stay, fadeOut;
        if (args.length < 5) {
          sender.sendMessage(ChatColor.RED + "String_Node_Str");
          return true;
        }
        if (isInteger(args[2])) {
          fadeIn=Integer.parseInt(args[2]);
        }
 else {
          sender.sendMessage(ChatColor.RED + args[2] + "String_Node_Str");
          return true;
        }
        if (isInteger(args[3])) {
          stay=Integer.parseInt(args[3]);
        }
 else {
          sender.sendMessage(ChatColor.RED + args[3] + "String_Node_Str");
          return true;
        }
        if (isInteger(args[4])) {
          fadeOut=Integer.parseInt(args[4]);
        }
 else {
          sender.sendMessage(ChatColor.RED + args[4] + "String_Node_Str");
          return true;
        }
        sendTimes(fadeIn,stay,fadeOut,player);
        sender.sendMessage(ChatColor.GREEN + "String_Node_Str");
      }
 else       if (args[1].equalsIgnoreCase("String_Node_Str")) {
        if (args.length < 3) {
          sender.sendMessage(ChatColor.RED + "String_Node_Str");
          return true;
        }
        sendTitle(args,2,player);
        sender.sendMessage(ChatColor.GREEN + "String_Node_Str");
      }
 else       if (args[1].equalsIgnoreCase("String_Node_Str")) {
        if (args.length < 3) {
          sender.sendMessage(ChatColor.RED + "String_Node_Str");
          return true;
        }
        sendSubtitle(args,2,player);
        sender.sendMessage(ChatColor.GREEN + "String_Node_Str");
      }
 else       if (args[1].equalsIgnoreCase("String_Node_Str")) {
        sendClear(player);
        sender.sendMessage(ChatColor.GREEN + "String_Node_Str");
      }
 else       if (args[1].equalsIgnoreCase("String_Node_Str")) {
        sendReset(player);
        sender.sendMessage(ChatColor.GREEN + "String_Node_Str");
      }
    }
 else {
      sender.sendMessage(ChatColor.RED + "String_Node_Str");
    }
    return true;
  }
  return false;
}

Fixed version (ground truth):
@Override public boolean execute(CommandSender sender,String commandLabel,String[] args){
  if (commandLabel.equalsIgnoreCase("String_Node_Str")) {
    if (args.length < 1) {
      sender.sendMessage(ChatColor.RED + "String_Node_Str");
      return true;
    }
    ArrayList<Player> targets=new ArrayList<Player>();
    if (args[0].equalsIgnoreCase("String_Node_Str")) {
      targets.addAll(Bukkit.getOnlinePlayers());
    }
    Player player=getOnlinePlayer(args[0]);
    if (player == null) {
      sender.sendMessage(ChatColor.RED + args[0] + "String_Node_Str");
      return true;
    }
    targets.add(player);
    for (    Player target : targets) {
      if (args[1].equalsIgnoreCase("String_Node_Str")) {
        int fadeIn, stay, fadeOut;
        if (args.length < 5) {
          sender.sendMessage(ChatColor.RED + "String_Node_Str");
          return true;
        }
        if (isInteger(args[2])) {
          fadeIn=Integer.parseInt(args[2]);
        }
 else {
          sender.sendMessage(ChatColor.RED + args[2] + "String_Node_Str");
          return true;
        }
        if (isInteger(args[3])) {
          stay=Integer.parseInt(args[3]);
        }
 else {
          sender.sendMessage(ChatColor.RED + args[3] + "String_Node_Str");
          return true;
        }
        if (isInteger(args[4])) {
          fadeOut=Integer.parseInt(args[4]);
        }
 else {
          sender.sendMessage(ChatColor.RED + args[4] + "String_Node_Str");
          return true;
        }
        sendTimes(fadeIn,stay,fadeOut,target);
        sender.sendMessage(ChatColor.GREEN + "String_Node_Str");
      }
 else       if (args[1].equalsIgnoreCase("String_Node_Str")) {
        if (args.length < 3) {
          sender.sendMessage(ChatColor.RED + "String_Node_Str");
          return true;
        }
        sendTitle(args,2,target);
        sender.sendMessage(ChatColor.GREEN + "String_Node_Str");
      }
 else       if (args[1].equalsIgnoreCase("String_Node_Str")) {
        if (args.length < 3) {
          sender.sendMessage(ChatColor.RED + "String_Node_Str");
          return true;
        }
        sendSubtitle(args,2,target);
        sender.sendMessage(ChatColor.GREEN + "String_Node_Str");
      }
 else       if (args[1].equalsIgnoreCase("String_Node_Str")) {
        sendClear(target);
        sender.sendMessage(ChatColor.GREEN + "String_Node_Str");
      }
 else       if (args[1].equalsIgnoreCase("String_Node_Str")) {
        sendReset(target);
        sender.sendMessage(ChatColor.GREEN + "String_Node_Str");
      }
    }
    return true;
  }
  return false;
}