Program: 61529
Project: 61529
Buggy source:
public boolean processArguments(String[] args) throws Exception {
  log.info("String_Node_Str" + Arrays.toString(args).replace("String_Node_Str","String_Node_Str"));
  ConfigurationProperties.clear();
  CommandLine cmd=null;
  try {
    cmd=parser.parse(options,args);
  }
 catch (  UnrecognizedOptionException e) {
    System.out.println("String_Node_Str" + e.getMessage());
    help();
    return false;
  }
  if (cmd.hasOption("String_Node_Str")) {
    help();
    return false;
  }
  if (cmd.hasOption("String_Node_Str")) {
    ConfigurationProperties.properties.setProperty("String_Node_Str",cmd.getOptionValue("String_Node_Str"));
  }
 else {
    String javahome=System.getProperty("String_Node_Str");
    File location=new File(javahome);
    if (location.getName().equals("String_Node_Str")) {
      javahome=location.getParent() + File.separator + "String_Node_Str";
      File javalocationbin=new File(javahome);
      if (!javalocationbin.exists()) {
        System.err.println("String_Node_Str");
        return false;
      }
    }
    ConfigurationProperties.properties.setProperty("String_Node_Str",javahome);
  }
  if (cmd.hasOption("String_Node_Str")) {
    ConfigurationProperties.properties.setProperty("String_Node_Str",cmd.getOptionValue("String_Node_Str"));
  }
 else {
    ConfigurationProperties.properties.setProperty("String_Node_Str",ConfigurationProperties.properties.getProperty("String_Node_Str"));
  }
  if (!ProjectConfiguration.validJDK()) {
    System.err.println("String_Node_Str");
    return false;
  }
  if (!this.isExample(cmd)) {
    String dependenciespath=cmd.getOptionValue("String_Node_Str");
    String failing=cmd.getOptionValue("String_Node_Str");
    String location=cmd.getOptionValue("String_Node_Str");
    if (failing == null || location == null) {
      help();
      return false;
    }
    ConfigurationProperties.properties.setProperty("String_Node_Str",dependenciespath);
    ConfigurationProperties.properties.setProperty("String_Node_Str",failing);
    ConfigurationProperties.properties.setProperty("String_Node_Str",location);
  }
  if (cmd.hasOption("String_Node_Str"))   ConfigurationProperties.properties.setProperty("String_Node_Str",cmd.getOptionValue("String_Node_Str"));
  if (cmd.hasOption("String_Node_Str"))   ConfigurationProperties.properties.setProperty("String_Node_Str",cmd.getOptionValue("String_Node_Str"));
  if (cmd.hasOption("String_Node_Str"))   ConfigurationProperties.properties.setProperty("String_Node_Str",cmd.getOptionValue("String_Node_Str"));
  String outputPath="String_Node_Str";
  if (cmd.hasOption("String_Node_Str")) {
    outputPath=cmd.getOptionValue("String_Node_Str");
  }
 else {
    outputPath=ConfigurationProperties.properties.getProperty("String_Node_Str");
  }
  ConfigurationProperties.properties.setProperty("String_Node_Str",(new File(outputPath)).getAbsolutePath());
  if (cmd.hasOption("String_Node_Str"))   ConfigurationProperties.properties.setProperty("String_Node_Str",cmd.getOptionValue("String_Node_Str"));
  if (cmd.hasOption("String_Node_Str"))   ConfigurationProperties.properties.setProperty("String_Node_Str",cmd.getOptionValue("String_Node_Str"));
  if (cmd.hasOption("String_Node_Str"))   ConfigurationProperties.properties.setProperty("String_Node_Str",cmd.getOptionValue("String_Node_Str"));
  if (cmd.hasOption("String_Node_Str"))   ConfigurationProperties.properties.setProperty("String_Node_Str",cmd.getOptionValue("String_Node_Str"));
  if (cmd.hasOption("String_Node_Str")) {
    try {
      double thfl=Double.valueOf(cmd.getOptionValue("String_Node_Str"));
      ConfigurationProperties.properties.setProperty("String_Node_Str",cmd.getOptionValue("String_Node_Str"));
    }
 catch (    Exception e) {
      System.out.println("String_Node_Str");
      help();
      return false;
    }
  }
  if (cmd.hasOption("String_Node_Str"))   ConfigurationProperties.properties.setProperty("String_Node_Str",cmd.getOptionValue("String_Node_Str"));
  if (cmd.hasOption("String_Node_Str"))   ConfigurationProperties.properties.setProperty("String_Node_Str",cmd.getOptionValue("String_Node_Str"));
  if (cmd.hasOption("String_Node_Str"))   ConfigurationProperties.properties.setProperty("String_Node_Str",cmd.getOptionValue("String_Node_Str"));
  if (cmd.hasOption("String_Node_Str"))   ConfigurationProperties.properties.setProperty("String_Node_Str",cmd.getOptionValue("String_Node_Str"));
  if (cmd.hasOption("String_Node_Str"))   ConfigurationProperties.properties.setProperty("String_Node_Str",cmd.getOptionValue("String_Node_Str"));
  if (cmd.hasOption("String_Node_Str"))   ConfigurationProperties.properties.setProperty("String_Node_Str","String_Node_Str");
  if (cmd.hasOption("String_Node_Str"))   ConfigurationProperties.properties.setProperty("String_Node_Str","String_Node_Str");
  if (cmd.hasOption("String_Node_Str"))   ConfigurationProperties.properties.setProperty("String_Node_Str","String_Node_Str");
  if (cmd.hasOption("String_Node_Str"))   ConfigurationProperties.properties.setProperty("String_Node_Str",cmd.getOptionValue("String_Node_Str"));
  if (cmd.hasOption("String_Node_Str"))   ConfigurationProperties.properties.setProperty("String_Node_Str",cmd.getOptionValue("String_Node_Str"));
  if (cmd.hasOption("String_Node_Str"))   ConfigurationProperties.properties.setProperty("String_Node_Str",cmd.getOptionValue("String_Node_Str"));
  if (cmd.hasOption("String_Node_Str"))   ConfigurationProperties.properties.setProperty("String_Node_Str",cmd.getOptionValue("String_Node_Str"));
  if (cmd.hasOption("String_Node_Str"))   ConfigurationProperties.properties.setProperty("String_Node_Str",cmd.getOptionValue("String_Node_Str"));
  if (cmd.hasOption("String_Node_Str"))   ConfigurationProperties.properties.setProperty("String_Node_Str",cmd.getOptionValue("String_Node_Str"));
  if (cmd.hasOption("String_Node_Str"))   ConfigurationProperties.properties.setProperty("String_Node_Str",cmd.getOptionValue("String_Node_Str"));
  if (cmd.hasOption("String_Node_Str")) {
    String hour=cmd.getOptionValue("String_Node_Str");
    try {
      TimeUtil.tranformHours(hour);
    }
 catch (    Exception e) {
      System.out.println("String_Node_Str");
    }
    ConfigurationProperties.properties.setProperty("String_Node_Str",hour);
  }
  if (cmd.hasOption("String_Node_Str"))   ConfigurationProperties.properties.setProperty("String_Node_Str","String_Node_Str");
  if (cmd.hasOption("String_Node_Str"))   ConfigurationProperties.properties.setProperty("String_Node_Str",cmd.getOptionValue("String_Node_Str"));
  if (cmd.hasOption("String_Node_Str"))   ConfigurationProperties.properties.setProperty("String_Node_Str",cmd.getOptionValue("String_Node_Str"));
  if (cmd.hasOption("String_Node_Str"))   ConfigurationProperties.properties.setProperty("String_Node_Str","String_Node_Str");
  if (cmd.hasOption("String_Node_Str"))   ConfigurationProperties.properties.setProperty("String_Node_Str",cmd.getOptionValue("String_Node_Str"));
  if (cmd.hasOption("String_Node_Str"))   ConfigurationProperties.properties.setProperty("String_Node_Str","String_Node_Str");
  if (cmd.hasOption("String_Node_Str"))   ConfigurationProperties.properties.setProperty("String_Node_Str","String_Node_Str");
  if (cmd.hasOption("String_Node_Str"))   ConfigurationProperties.properties.setProperty("String_Node_Str",cmd.getOptionValue("String_Node_Str"));
  if (cmd.hasOption("String_Node_Str"))   ConfigurationProperties.properties.setProperty("String_Node_Str",cmd.getOptionValue("String_Node_Str"));
  if (cmd.hasOption("String_Node_Str"))   ConfigurationProperties.properties.setProperty("String_Node_Str",cmd.getOptionValue("String_Node_Str"));
  if (cmd.hasOption("String_Node_Str"))   ConfigurationProperties.properties.setProperty("String_Node_Str",cmd.getOptionValue("String_Node_Str"));
  if (cmd.hasOption("String_Node_Str"))   ConfigurationProperties.properties.setProperty("String_Node_Str",cmd.getOptionValue("String_Node_Str"));
  if (cmd.hasOption("String_Node_Str"))   ConfigurationProperties.properties.setProperty("String_Node_Str",cmd.getOptionValue("String_Node_Str"));
  if (cmd.hasOption("String_Node_Str"))   ConfigurationProperties.properties.setProperty("String_Node_Str",cmd.getOptionValue("String_Node_Str"));
  if (cmd.hasOption("String_Node_Str"))   ConfigurationProperties.properties.setProperty("String_Node_Str","String_Node_Str");
  if (cmd.hasOption("String_Node_Str"))   ConfigurationProperties.properties.setProperty("String_Node_Str",cmd.getOptionValue("String_Node_Str"));
  if (cmd.hasOption("String_Node_Str"))   ConfigurationProperties.properties.setProperty("String_Node_Str",cmd.getOptionValue("String_Node_Str"));
  ConfigurationProperties.properties.setProperty("String_Node_Str",Boolean.toString(cmd.hasOption("String_Node_Str")));
  ConfigurationProperties.properties.setProperty("String_Node_Str",Boolean.toString(!(cmd.hasOption("String_Node_Str"))));
  if (cmd.hasOption("String_Node_Str"))   ConfigurationProperties.properties.setProperty("String_Node_Str",cmd.getOptionValue("String_Node_Str"));
  if (cmd.hasOption("String_Node_Str"))   ConfigurationProperties.properties.setProperty("String_Node_Str",cmd.getOptionValue("String_Node_Str"));
  if (cmd.hasOption("String_Node_Str"))   ConfigurationProperties.properties.setProperty("String_Node_Str",cmd.getOptionValue("String_Node_Str"));
  RandomManager.initialize();
  return true;
}

Fixed version (ground truth):
public boolean processArguments(String[] args) throws Exception {
  log.info("String_Node_Str" + Arrays.toString(args).replace("String_Node_Str","String_Node_Str"));
  ConfigurationProperties.clear();
  CommandLine cmd=null;
  try {
    cmd=parser.parse(options,args);
  }
 catch (  UnrecognizedOptionException e) {
    System.out.println("String_Node_Str" + e.getMessage());
    help();
    return false;
  }
  if (cmd.hasOption("String_Node_Str")) {
    help();
    return false;
  }
  if (cmd.hasOption("String_Node_Str")) {
    ConfigurationProperties.properties.setProperty("String_Node_Str",cmd.getOptionValue("String_Node_Str"));
  }
 else {
    String javahome=System.getProperty("String_Node_Str");
    File location=new File(javahome);
    if (location.getName().equals("String_Node_Str")) {
      javahome=location.getParent() + File.separator + "String_Node_Str";
      File javalocationbin=new File(javahome);
      if (!javalocationbin.exists()) {
        System.err.println("String_Node_Str");
        return false;
      }
    }
    ConfigurationProperties.properties.setProperty("String_Node_Str",javahome);
  }
  if (cmd.hasOption("String_Node_Str")) {
    ConfigurationProperties.properties.setProperty("String_Node_Str",cmd.getOptionValue("String_Node_Str"));
  }
 else {
    ConfigurationProperties.properties.setProperty("String_Node_Str",ConfigurationProperties.properties.getProperty("String_Node_Str"));
  }
  if (!ProjectConfiguration.validJDK()) {
    System.err.println("String_Node_Str");
    return false;
  }
  if (!this.isExample(cmd)) {
    String dependenciespath=cmd.getOptionValue("String_Node_Str");
    String failing=cmd.getOptionValue("String_Node_Str");
    String location=cmd.getOptionValue("String_Node_Str");
    if (failing == null || location == null) {
      help();
      return false;
    }
    if (dependenciespath != null) {
      ConfigurationProperties.properties.setProperty("String_Node_Str",dependenciespath);
    }
    ConfigurationProperties.properties.setProperty("String_Node_Str",failing);
    ConfigurationProperties.properties.setProperty("String_Node_Str",location);
  }
  if (cmd.hasOption("String_Node_Str"))   ConfigurationProperties.properties.setProperty("String_Node_Str",cmd.getOptionValue("String_Node_Str"));
  if (cmd.hasOption("String_Node_Str"))   ConfigurationProperties.properties.setProperty("String_Node_Str",cmd.getOptionValue("String_Node_Str"));
  if (cmd.hasOption("String_Node_Str"))   ConfigurationProperties.properties.setProperty("String_Node_Str",cmd.getOptionValue("String_Node_Str"));
  String outputPath="String_Node_Str";
  if (cmd.hasOption("String_Node_Str")) {
    outputPath=cmd.getOptionValue("String_Node_Str");
  }
 else {
    outputPath=ConfigurationProperties.properties.getProperty("String_Node_Str");
  }
  ConfigurationProperties.properties.setProperty("String_Node_Str",(new File(outputPath)).getAbsolutePath());
  if (cmd.hasOption("String_Node_Str"))   ConfigurationProperties.properties.setProperty("String_Node_Str",cmd.getOptionValue("String_Node_Str"));
  if (cmd.hasOption("String_Node_Str"))   ConfigurationProperties.properties.setProperty("String_Node_Str",cmd.getOptionValue("String_Node_Str"));
  if (cmd.hasOption("String_Node_Str"))   ConfigurationProperties.properties.setProperty("String_Node_Str",cmd.getOptionValue("String_Node_Str"));
  if (cmd.hasOption("String_Node_Str"))   ConfigurationProperties.properties.setProperty("String_Node_Str",cmd.getOptionValue("String_Node_Str"));
  if (cmd.hasOption("String_Node_Str")) {
    try {
      double thfl=Double.valueOf(cmd.getOptionValue("String_Node_Str"));
      ConfigurationProperties.properties.setProperty("String_Node_Str",cmd.getOptionValue("String_Node_Str"));
    }
 catch (    Exception e) {
      System.out.println("String_Node_Str");
      help();
      return false;
    }
  }
  if (cmd.hasOption("String_Node_Str"))   ConfigurationProperties.properties.setProperty("String_Node_Str",cmd.getOptionValue("String_Node_Str"));
  if (cmd.hasOption("String_Node_Str"))   ConfigurationProperties.properties.setProperty("String_Node_Str",cmd.getOptionValue("String_Node_Str"));
  if (cmd.hasOption("String_Node_Str"))   ConfigurationProperties.properties.setProperty("String_Node_Str",cmd.getOptionValue("String_Node_Str"));
  if (cmd.hasOption("String_Node_Str"))   ConfigurationProperties.properties.setProperty("String_Node_Str",cmd.getOptionValue("String_Node_Str"));
  if (cmd.hasOption("String_Node_Str"))   ConfigurationProperties.properties.setProperty("String_Node_Str",cmd.getOptionValue("String_Node_Str"));
  if (cmd.hasOption("String_Node_Str"))   ConfigurationProperties.properties.setProperty("String_Node_Str","String_Node_Str");
  if (cmd.hasOption("String_Node_Str"))   ConfigurationProperties.properties.setProperty("String_Node_Str","String_Node_Str");
  if (cmd.hasOption("String_Node_Str"))   ConfigurationProperties.properties.setProperty("String_Node_Str","String_Node_Str");
  if (cmd.hasOption("String_Node_Str"))   ConfigurationProperties.properties.setProperty("String_Node_Str",cmd.getOptionValue("String_Node_Str"));
  if (cmd.hasOption("String_Node_Str"))   ConfigurationProperties.properties.setProperty("String_Node_Str",cmd.getOptionValue("String_Node_Str"));
  if (cmd.hasOption("String_Node_Str"))   ConfigurationProperties.properties.setProperty("String_Node_Str",cmd.getOptionValue("String_Node_Str"));
  if (cmd.hasOption("String_Node_Str"))   ConfigurationProperties.properties.setProperty("String_Node_Str",cmd.getOptionValue("String_Node_Str"));
  if (cmd.hasOption("String_Node_Str"))   ConfigurationProperties.properties.setProperty("String_Node_Str",cmd.getOptionValue("String_Node_Str"));
  if (cmd.hasOption("String_Node_Str"))   ConfigurationProperties.properties.setProperty("String_Node_Str",cmd.getOptionValue("String_Node_Str"));
  if (cmd.hasOption("String_Node_Str"))   ConfigurationProperties.properties.setProperty("String_Node_Str",cmd.getOptionValue("String_Node_Str"));
  if (cmd.hasOption("String_Node_Str")) {
    String hour=cmd.getOptionValue("String_Node_Str");
    try {
      TimeUtil.tranformHours(hour);
    }
 catch (    Exception e) {
      System.out.println("String_Node_Str");
    }
    ConfigurationProperties.properties.setProperty("String_Node_Str",hour);
  }
  if (cmd.hasOption("String_Node_Str"))   ConfigurationProperties.properties.setProperty("String_Node_Str","String_Node_Str");
  if (cmd.hasOption("String_Node_Str"))   ConfigurationProperties.properties.setProperty("String_Node_Str",cmd.getOptionValue("String_Node_Str"));
  if (cmd.hasOption("String_Node_Str"))   ConfigurationProperties.properties.setProperty("String_Node_Str",cmd.getOptionValue("String_Node_Str"));
  if (cmd.hasOption("String_Node_Str"))   ConfigurationProperties.properties.setProperty("String_Node_Str","String_Node_Str");
  if (cmd.hasOption("String_Node_Str"))   ConfigurationProperties.properties.setProperty("String_Node_Str",cmd.getOptionValue("String_Node_Str"));
  if (cmd.hasOption("String_Node_Str"))   ConfigurationProperties.properties.setProperty("String_Node_Str","String_Node_Str");
  if (cmd.hasOption("String_Node_Str"))   ConfigurationProperties.properties.setProperty("String_Node_Str","String_Node_Str");
  if (cmd.hasOption("String_Node_Str"))   ConfigurationProperties.properties.setProperty("String_Node_Str",cmd.getOptionValue("String_Node_Str"));
  if (cmd.hasOption("String_Node_Str"))   ConfigurationProperties.properties.setProperty("String_Node_Str",cmd.getOptionValue("String_Node_Str"));
  if (cmd.hasOption("String_Node_Str"))   ConfigurationProperties.properties.setProperty("String_Node_Str",cmd.getOptionValue("String_Node_Str"));
  if (cmd.hasOption("String_Node_Str"))   ConfigurationProperties.properties.setProperty("String_Node_Str",cmd.getOptionValue("String_Node_Str"));
  if (cmd.hasOption("String_Node_Str"))   ConfigurationProperties.properties.setProperty("String_Node_Str",cmd.getOptionValue("String_Node_Str"));
  if (cmd.hasOption("String_Node_Str"))   ConfigurationProperties.properties.setProperty("String_Node_Str",cmd.getOptionValue("String_Node_Str"));
  if (cmd.hasOption("String_Node_Str"))   ConfigurationProperties.properties.setProperty("String_Node_Str",cmd.getOptionValue("String_Node_Str"));
  if (cmd.hasOption("String_Node_Str"))   ConfigurationProperties.properties.setProperty("String_Node_Str","String_Node_Str");
  if (cmd.hasOption("String_Node_Str"))   ConfigurationProperties.properties.setProperty("String_Node_Str",cmd.getOptionValue("String_Node_Str"));
  if (cmd.hasOption("String_Node_Str"))   ConfigurationProperties.properties.setProperty("String_Node_Str",cmd.getOptionValue("String_Node_Str"));
  ConfigurationProperties.properties.setProperty("String_Node_Str",Boolean.toString(cmd.hasOption("String_Node_Str")));
  ConfigurationProperties.properties.setProperty("String_Node_Str",Boolean.toString(!(cmd.hasOption("String_Node_Str"))));
  if (cmd.hasOption("String_Node_Str"))   ConfigurationProperties.properties.setProperty("String_Node_Str",cmd.getOptionValue("String_Node_Str"));
  if (cmd.hasOption("String_Node_Str"))   ConfigurationProperties.properties.setProperty("String_Node_Str",cmd.getOptionValue("String_Node_Str"));
  if (cmd.hasOption("String_Node_Str"))   ConfigurationProperties.properties.setProperty("String_Node_Str",cmd.getOptionValue("String_Node_Str"));
  RandomManager.initialize();
  return true;
}