Program: 23329
Project: 23329
Buggy source:
public String processMarkdown(String location,String text) throws Exception {
  try {
    if (text == null)     return "String_Node_Str";
    text=text.replace("String_Node_Str","String_Node_Str");
    while (text.contains("String_Node_Str")) {
      String left=text.substring(0,text.indexOf("String_Node_Str"));
      String linkText=text.substring(text.indexOf("String_Node_Str") + 3,text.indexOf("String_Node_Str"));
      String right=text.substring(text.indexOf("String_Node_Str") + 3);
      String url=getBySpecMap(linkText);
      String[] parts=linkText.split("String_Node_Str");
      if (url == null && parts[0].contains("String_Node_Str")) {
        StructureDefinition ed=context.fetchResource(StructureDefinition.class,parts[0]);
        if (ed == null)         throw new Error("String_Node_Str" + parts[0]);
        url=ed.getUserData("String_Node_Str") + "String_Node_Str";
      }
      if (Utilities.noString(url)) {
        String[] paths=parts[0].split("String_Node_Str");
        StructureDefinition p=new ProfileUtilities(context,null,null).getProfile(null,paths[0]);
        if (p != null) {
          String suffix=(paths.length > 1) ? "String_Node_Str" + parts[0] : "String_Node_Str";
          if (p.getUserData("String_Node_Str") == null)           url=paths[0].toLowerCase() + suffix;
 else           url=p.getUserData("String_Node_Str") + suffix;
        }
 else {
          throw new Exception("String_Node_Str" + linkText + "String_Node_Str");
        }
      }
      text=left + "String_Node_Str" + linkText+ "String_Node_Str"+ url+ "String_Node_Str"+ right;
    }
    if (!Utilities.noString(prefix)) {
      int i=text.length() - 3;
      while (i > 0) {
        if (text.substring(i,i + 2).equals("String_Node_Str")) {
          if (!text.substring(i,i + 7).equals("String_Node_Str") && !text.substring(i,i + 7).equals("String_Node_Str")) {
            text=text.substring(0,i) + "String_Node_Str" + prefix+ text.substring(i + 2);
          }
        }
        i--;
      }
    }
    String s=Processor.process(checkEscape(text));
    return s;
  }
 catch (  Throwable e) {
    throw new Exception("String_Node_Str" + text,e);
  }
}

Fixed version (ground truth):
public String processMarkdown(String location,String text) throws Exception {
  try {
    if (text == null)     return "String_Node_Str";
    text=text.replace("String_Node_Str","String_Node_Str");
    while (text.contains("String_Node_Str")) {
      String left=text.substring(0,text.indexOf("String_Node_Str"));
      String linkText=text.substring(text.indexOf("String_Node_Str") + 3,text.indexOf("String_Node_Str"));
      String right=text.substring(text.indexOf("String_Node_Str") + 3);
      String url=getBySpecMap(linkText);
      String[] parts=linkText.split("String_Node_Str");
      if (url == null && parts[0].contains("String_Node_Str")) {
        StructureDefinition ed=context.fetchResource(StructureDefinition.class,parts[0]);
        if (ed == null)         throw new Error("String_Node_Str" + parts[0]);
        url=ed.getUserData("String_Node_Str") + "String_Node_Str";
      }
      if (Utilities.noString(url)) {
        String[] paths=parts[0].split("String_Node_Str");
        StructureDefinition p=new ProfileUtilities(context,null,null).getProfile(null,paths[0]);
        if (p != null) {
          String suffix=(paths.length > 1) ? "String_Node_Str" + parts[0] : "String_Node_Str";
          if (p.getUserData("String_Node_Str") == null)           url=paths[0].toLowerCase() + suffix;
 else           url=p.getUserData("String_Node_Str") + suffix;
        }
 else {
          throw new Exception("String_Node_Str" + linkText + "String_Node_Str");
        }
      }
      text=left + "String_Node_Str" + linkText+ "String_Node_Str"+ url+ "String_Node_Str"+ right;
    }
    if (!Utilities.noString(prefix)) {
      int i=text.length() - 3;
      while (i > 0) {
        if (text.substring(i,i + 2).equals("String_Node_Str") && i + 7 <= text.length()) {
          if (!text.substring(i,i + 7).equals("String_Node_Str") && !text.substring(i,i + 7).equals("String_Node_Str")) {
            text=text.substring(0,i) + "String_Node_Str" + prefix+ text.substring(i + 2);
          }
        }
        i--;
      }
    }
    String s=Processor.process(checkEscape(text));
    return s;
  }
 catch (  Throwable e) {
    throw new Exception("String_Node_Str" + text,e);
  }
}