Program: 149535
Project: 149535
Buggy source:
private void guessFormat(String firstLine){
  format=FileFormat.UNKNOWN;
  if (header.length() == 0) {
    if (TSFPeakResultsReader.isTSF(filename)) {
      format=FileFormat.TSF_BINARY;
      return;
    }
    if (Utils.isNullOrEmpty(firstLine))     return;
  }
  if (header.contains("String_Node_Str")) {
    format=FileFormat.NSTORM;
  }
 else   if (header.contains("String_Node_Str")) {
    format=FileFormat.SMLM_TABLE;
    readId=header.startsWith("String_Node_Str");
    readEndFrame=header.contains("String_Node_Str");
    deviations=header.contains("String_Node_Str");
    readSource=header.contains("String_Node_Str");
  }
 else   if (header.contains("String_Node_Str")) {
    if (isMALKFormat(firstLine)) {
      format=FileFormat.MALK;
    }
 else {
      format=FileFormat.RAPID_STORM;
    }
  }
 else   if (isMALKFormat(firstLine)) {
    format=FileFormat.MALK;
  }
 else {
    if (version.length() > 0) {
      format=(version.contains("String_Node_Str")) ? FileFormat.SMLM_BINARY : FileFormat.SMLM_TEXT;
      deviations=version.contains("String_Node_Str");
      if (version.contains("String_Node_Str")) {
        readEndFrame=readId=true;
      }
 else {
        readEndFrame=version.contains("String_Node_Str");
        readId=version.contains("String_Node_Str");
      }
      if (version.contains("String_Node_Str")) {
        readAmplitude=false;
      }
    }
 else {
      format=(version.contains("String_Node_Str")) ? FileFormat.SMLM_BINARY : FileFormat.SMLM_TEXT;
      deviations=header.contains((format == FileFormat.SMLM_BINARY) ? "String_Node_Str" : "String_Node_Str");
      readEndFrame=readId=false;
    }
  }
}

Fixed version (ground truth):
private void guessFormat(String firstLine){
  format=FileFormat.UNKNOWN;
  if (header.length() == 0) {
    if (TSFPeakResultsReader.isTSF(filename)) {
      format=FileFormat.TSF_BINARY;
      return;
    }
    if (Utils.isNullOrEmpty(firstLine))     return;
  }
  if (header.contains("String_Node_Str")) {
    format=FileFormat.NSTORM;
  }
 else   if (header.contains(IMAGEJ_TABLE_RESULTS_HEADER)) {
    format=FileFormat.SMLM_TABLE;
    readId=header.startsWith("String_Node_Str");
    readEndFrame=header.contains("String_Node_Str");
    deviations=header.contains("String_Node_Str");
    readSource=header.contains("String_Node_Str");
  }
 else   if (header.contains("String_Node_Str")) {
    if (isMALKFormat(firstLine)) {
      format=FileFormat.MALK;
    }
 else {
      format=FileFormat.RAPID_STORM;
    }
  }
 else   if (isMALKFormat(firstLine)) {
    format=FileFormat.MALK;
  }
 else {
    if (version.length() > 0) {
      format=(version.contains("String_Node_Str")) ? FileFormat.SMLM_BINARY : FileFormat.SMLM_TEXT;
      deviations=version.contains("String_Node_Str");
      if (version.contains("String_Node_Str")) {
        readEndFrame=readId=true;
      }
 else {
        readEndFrame=version.contains("String_Node_Str");
        readId=version.contains("String_Node_Str");
      }
      if (version.contains("String_Node_Str")) {
        readAmplitude=false;
      }
    }
 else {
      format=(version.contains("String_Node_Str")) ? FileFormat.SMLM_BINARY : FileFormat.SMLM_TEXT;
      deviations=header.contains((format == FileFormat.SMLM_BINARY) ? "String_Node_Str" : "String_Node_Str");
      readEndFrame=readId=false;
    }
  }
}