Program: 6367
Project: 6367
Buggy source:
public static void main(String[] args){
  WCETAnalyser wca=new WCETAnalyser();
  HashSet clsArgs=new HashSet();
  outFile=null;
  boolean latex=System.getProperty("String_Node_Str","String_Node_Str").equals("String_Node_Str");
  dot=System.getProperty("String_Node_Str","String_Node_Str").equals("String_Node_Str");
  jline=System.getProperty("String_Node_Str","String_Node_Str").equals("String_Node_Str");
  ls=System.getProperty("String_Node_Str","String_Node_Str").equals("String_Node_Str");
  if (latex) {
    las="String_Node_Str";
    lae="String_Node_Str";
  }
 else {
    las="String_Node_Str";
    lae="String_Node_Str";
  }
  String srcPath="String_Node_Str";
  try {
    if (args.length == 0) {
      System.err.println("String_Node_Str");
    }
 else {
      for (int i=0; i < args.length; i++) {
        if (args[i].equals("String_Node_Str")) {
          i++;
          wca.classpath=new org.apache.bcel.util.ClassPath(args[i]);
          continue;
        }
        if (args[i].equals("String_Node_Str")) {
          i++;
          outFile=args[i];
          continue;
        }
        if (args[i].equals("String_Node_Str")) {
          i++;
          srcPath=args[i];
          continue;
        }
        clsArgs.add(args[i]);
        mainClass=args[i].replace('/','.');
      }
      StringTokenizer st=new StringTokenizer(srcPath,"String_Node_Str");
      while (st.hasMoreTokens()) {
        String srcDir=st.nextToken();
        File sDir=new File(srcDir);
        if (sDir.isDirectory()) {
          wca.visitAllFiles(sDir);
        }
      }
      wca.out=new PrintWriter(new FileOutputStream(outFile));
      String ds=new File(WCETAnalyser.outFile).getParentFile().getAbsolutePath() + "String_Node_Str";
      wca.dotout=new PrintWriter(new FileOutputStream(ds));
      wca.dotout.print("String_Node_Str");
      wca.load(clsArgs);
      wca.global=false;
      wca.iterate(new SetWCETAnalysis(wca));
      wca.init=false;
      wca.analyze=true;
      wca.iterate(new SetWCETAnalysis(wca));
      StringBuffer wcasbtemp=new StringBuffer();
      if (wca.analyze) {
        wca.global=true;
        wcasbtemp.append(wca.wcmbapp.toLS(true,true,null));
        wcasbtemp.append(wca.toDot());
        wcasbtemp.insert(0,"String_Node_Str" + wca.wcmbapp.wcetlp + "String_Node_Str");
        wca.out.println(wcasbtemp.toString());
        wca.dotout.print("String_Node_Str" + wca.dotf + "String_Node_Str"+ wca.dotf.substring(0,wca.dotf.length() - 4)+ "String_Node_Str");
      }
      wca.out.println("String_Node_Str");
      wca.out.println(wca.wcasb.toString());
      wca.out.println("String_Node_Str");
      wca.out.println(WCETInstruction.toWCAString());
      wca.out.println("String_Node_Str");
      wca.out.println("String_Node_Str");
      wca.out.close();
      wca.dotout.close();
    }
  }
 catch (  Exception e) {
    e.printStackTrace();
  }
}

Fixed version (ground truth):
public static void main(String[] args){
  WCETAnalyser wca=new WCETAnalyser();
  HashSet clsArgs=new HashSet();
  outFile=null;
  jline=System.getProperty("String_Node_Str","String_Node_Str").equals("String_Node_Str");
  appmethod=System.getProperty("String_Node_Str");
  if (appmethod == null) {
    System.out.println("String_Node_Str");
    System.exit(-1);
  }
  String srcPath="String_Node_Str";
  try {
    if (args.length == 0) {
      System.err.println("String_Node_Str");
    }
 else {
      for (int i=0; i < args.length; i++) {
        if (args[i].equals("String_Node_Str")) {
          i++;
          wca.classpath=new org.apache.bcel.util.ClassPath(args[i]);
          continue;
        }
        if (args[i].equals("String_Node_Str")) {
          i++;
          outFile=args[i];
          continue;
        }
        if (args[i].equals("String_Node_Str")) {
          i++;
          srcPath=args[i];
          continue;
        }
        clsArgs.add(args[i]);
        mainClass=args[i].replace('/','.');
      }
      StringTokenizer st=new StringTokenizer(srcPath,"String_Node_Str");
      while (st.hasMoreTokens()) {
        String srcDir=st.nextToken();
        File sDir=new File(srcDir);
        if (sDir.isDirectory()) {
          wca.visitAllFiles(sDir);
        }
      }
      wca.out=new PrintWriter(new FileOutputStream(outFile));
      String ds=new File(WCETAnalyser.outFile).getParentFile().getAbsolutePath() + "String_Node_Str";
      wca.dotout=new PrintWriter(new FileOutputStream(ds));
      wca.dotout.print("String_Node_Str");
      wca.load(clsArgs);
      wca.global=false;
      wca.iterate(new SetWCETAnalysis(wca));
      wca.init=false;
      wca.analyze=true;
      wca.iterate(new SetWCETAnalysis(wca));
      StringBuffer wcasbtemp=new StringBuffer();
      if (wca.analyze) {
        wca.global=true;
        wcasbtemp.append(wca.wcmbapp.toLS(true,true,null));
        wcasbtemp.append(wca.toDot());
        wcasbtemp.insert(0,"String_Node_Str" + wca.wcmbapp.wcetlp + "String_Node_Str");
        wca.out.println(wcasbtemp.toString());
        wca.dotout.print("String_Node_Str" + wca.dotf + "String_Node_Str"+ wca.dotf.substring(0,wca.dotf.length() - 4)+ "String_Node_Str");
      }
      wca.out.println("String_Node_Str");
      wca.out.println(wca.wcasb.toString());
      wca.out.println("String_Node_Str");
      wca.out.println(WCETInstruction.toWCAString());
      wca.out.println("String_Node_Str");
      wca.out.println("String_Node_Str");
      wca.out.close();
      wca.dotout.close();
    }
  }
 catch (  Exception e) {
    e.printStackTrace();
  }
}