Program: 12247
Project: 12247
Buggy source:
private void processArgs(String[] args,PrintPreferencesCommand ppc) throws SoarException {
  ppc.setWmeTraceType(WmeTraceType.NONE);
  ppc.setPrintProduction(false);
  ppc.setObject(false);
  final Decider decider=Adaptables.adapt(agent,Decider.class);
  ppc.setId(decider.bottom_goal);
  final PredefinedSymbols preSyms=Adaptables.adapt(agent,PredefinedSymbols.class);
  ppc.setAttr(preSyms.operator_symbol);
  final List<String> nonOpts=new ArrayList<String>();
  for (int i=1; i < args.length; ++i) {
    final String arg=args[i];
    if ("String_Node_Str".equals(arg) || "String_Node_Str".equals(arg) || "String_Node_Str".equals(arg)) {
      ppc.setWmeTraceType(WmeTraceType.NONE);
    }
 else     if ("String_Node_Str".equals(arg) || "String_Node_Str".equals(arg) || "String_Node_Str".equals(arg)) {
      ppc.setWmeTraceType(WmeTraceType.NONE);
      ppc.setPrintProduction(true);
    }
 else     if ("String_Node_Str".equals(arg) || "String_Node_Str".equals(arg) || "String_Node_Str".equals(arg)) {
      ppc.setWmeTraceType(WmeTraceType.TIMETAG);
      ppc.setPrintProduction(true);
    }
 else     if ("String_Node_Str".equals(arg) || "String_Node_Str".equals(arg) || "String_Node_Str".equals(arg)) {
      ppc.setWmeTraceType(WmeTraceType.FULL);
      ppc.setPrintProduction(true);
    }
 else     if ("String_Node_Str".equals(arg) || "String_Node_Str".equals(arg)) {
      ppc.setObject(true);
    }
 else     if (arg.startsWith("String_Node_Str")) {
      throw new SoarException("String_Node_Str" + arg);
    }
 else {
      nonOpts.add(arg);
    }
  }
  if (nonOpts.size() == 1 || nonOpts.size() == 2) {
    final String idArg=nonOpts.get(0);
    Symbol idSym=agent.readIdentifierOrContextVariable(idArg);
    if (idSym == null) {
      throw new SoarException("String_Node_Str" + idArg + "String_Node_Str");
    }
    final Identifier id=idSym.asIdentifier();
    if (id == null) {
      throw new SoarException("String_Node_Str" + idArg + "String_Node_Str");
    }
    ppc.setId(id);
    if (nonOpts.size() == 2) {
      final String attrArg=nonOpts.get(1);
      final Symbol attr=Symbols.readAttributeFromString(agent,attrArg);
      if (attr != null) {
        throw new SoarException("String_Node_Str" + attrArg + "String_Node_Str");
      }
      ppc.setAttr(attr);
    }
 else     if (!id.isGoal()) {
      ppc.setAttr(null);
    }
  }
 else   if (nonOpts.size() != 0) {
    throw new SoarException("String_Node_Str");
  }
}

Fixed version (ground truth):
private void processArgs(String[] args,PrintPreferencesCommand ppc) throws SoarException {
  ppc.setWmeTraceType(WmeTraceType.NONE);
  ppc.setPrintProduction(false);
  ppc.setObject(false);
  final Decider decider=Adaptables.adapt(agent,Decider.class);
  ppc.setId(decider.bottom_goal);
  final PredefinedSymbols preSyms=Adaptables.adapt(agent,PredefinedSymbols.class);
  ppc.setAttr(preSyms.operator_symbol);
  final List<String> nonOpts=new ArrayList<String>();
  for (int i=1; i < args.length; ++i) {
    final String arg=args[i];
    if ("String_Node_Str".equals(arg) || "String_Node_Str".equals(arg) || "String_Node_Str".equals(arg)) {
      ppc.setWmeTraceType(WmeTraceType.NONE);
    }
 else     if ("String_Node_Str".equals(arg) || "String_Node_Str".equals(arg) || "String_Node_Str".equals(arg)) {
      ppc.setWmeTraceType(WmeTraceType.NONE);
      ppc.setPrintProduction(true);
    }
 else     if ("String_Node_Str".equals(arg) || "String_Node_Str".equals(arg) || "String_Node_Str".equals(arg)) {
      ppc.setWmeTraceType(WmeTraceType.TIMETAG);
      ppc.setPrintProduction(true);
    }
 else     if ("String_Node_Str".equals(arg) || "String_Node_Str".equals(arg) || "String_Node_Str".equals(arg)) {
      ppc.setWmeTraceType(WmeTraceType.FULL);
      ppc.setPrintProduction(true);
    }
 else     if ("String_Node_Str".equals(arg) || "String_Node_Str".equals(arg)) {
      ppc.setObject(true);
    }
 else     if (arg.startsWith("String_Node_Str")) {
      throw new SoarException("String_Node_Str" + arg);
    }
 else {
      nonOpts.add(arg);
    }
  }
  if (nonOpts.size() == 1 || nonOpts.size() == 2) {
    final String idArg=nonOpts.get(0);
    Symbol idSym=agent.readIdentifierOrContextVariable(idArg);
    if (idSym == null) {
      throw new SoarException("String_Node_Str" + idArg + "String_Node_Str");
    }
    final Identifier id=idSym.asIdentifier();
    if (id == null) {
      throw new SoarException("String_Node_Str" + idArg + "String_Node_Str");
    }
    ppc.setId(id);
    if (nonOpts.size() == 2) {
      final String attrArg=nonOpts.get(1);
      final Symbol attr=Symbols.readAttributeFromString(agent,attrArg);
      if (attr == null) {
        throw new SoarException("String_Node_Str" + attrArg + "String_Node_Str");
      }
      ppc.setAttr(attr);
    }
 else     if (!id.isGoal()) {
      ppc.setAttr(null);
    }
  }
 else   if (nonOpts.size() != 0) {
    throw new SoarException("String_Node_Str");
  }
}