Program: 187528
Project: 187528
Buggy source:
public void upgrade(ISkillInfo upgrade,boolean quiet){
  if (upgrade instanceof LightningInfo) {
    boolean valuesEdit=false;
    if (upgrade.getProperties().getValue().containsKey("String_Node_Str")) {
      if (!upgrade.getProperties().getValue().containsKey("String_Node_Str") || ((StringTag)upgrade.getProperties().getValue().get("String_Node_Str")).getValue().equals("String_Node_Str")) {
        chance+=((IntTag)upgrade.getProperties().getValue().get("String_Node_Str")).getValue();
      }
 else {
        chance=((IntTag)upgrade.getProperties().getValue().get("String_Node_Str")).getValue();
      }
      valuesEdit=true;
    }
    if (getProperties().getValue().containsKey("String_Node_Str")) {
      int damage=((IntTag)getProperties().getValue().get("String_Node_Str")).getValue();
      getProperties().getValue().remove("String_Node_Str");
      DoubleTag doubleTag=new DoubleTag("String_Node_Str",damage);
      getProperties().getValue().put("String_Node_Str",doubleTag);
    }
    if (upgrade.getProperties().getValue().containsKey("String_Node_Str")) {
      if (!upgrade.getProperties().getValue().containsKey("String_Node_Str") || ((StringTag)upgrade.getProperties().getValue().get("String_Node_Str")).getValue().equals("String_Node_Str")) {
        damage+=((DoubleTag)upgrade.getProperties().getValue().get("String_Node_Str")).getValue();
      }
 else {
        damage=((DoubleTag)upgrade.getProperties().getValue().get("String_Node_Str")).getValue();
      }
      valuesEdit=true;
    }
    chance=Math.min(chance,100);
    if (!quiet && valuesEdit) {
      myPet.sendMessageToOwner(MyPetBukkitUtil.setColors(MyPetLocales.getString("String_Node_Str",myPet.getOwner().getLanguage())).replace("String_Node_Str",myPet.getPetName()).replace("String_Node_Str","String_Node_Str" + chance).replace("String_Node_Str","String_Node_Str" + damage));
    }
  }
}

Fixed version (ground truth):
public void upgrade(ISkillInfo upgrade,boolean quiet){
  if (upgrade instanceof LightningInfo) {
    boolean valuesEdit=false;
    if (upgrade.getProperties().getValue().containsKey("String_Node_Str")) {
      if (!upgrade.getProperties().getValue().containsKey("String_Node_Str") || ((StringTag)upgrade.getProperties().getValue().get("String_Node_Str")).getValue().equals("String_Node_Str")) {
        chance+=((IntTag)upgrade.getProperties().getValue().get("String_Node_Str")).getValue();
      }
 else {
        chance=((IntTag)upgrade.getProperties().getValue().get("String_Node_Str")).getValue();
      }
      valuesEdit=true;
    }
    if (upgrade.getProperties().getValue().containsKey("String_Node_Str")) {
      int damage=((IntTag)upgrade.getProperties().getValue().get("String_Node_Str")).getValue();
      upgrade.getProperties().getValue().remove("String_Node_Str");
      DoubleTag doubleTag=new DoubleTag("String_Node_Str",damage);
      upgrade.getProperties().getValue().put("String_Node_Str",doubleTag);
    }
    if (upgrade.getProperties().getValue().containsKey("String_Node_Str")) {
      if (!upgrade.getProperties().getValue().containsKey("String_Node_Str") || ((StringTag)upgrade.getProperties().getValue().get("String_Node_Str")).getValue().equals("String_Node_Str")) {
        damage+=((DoubleTag)upgrade.getProperties().getValue().get("String_Node_Str")).getValue();
      }
 else {
        damage=((DoubleTag)upgrade.getProperties().getValue().get("String_Node_Str")).getValue();
      }
      valuesEdit=true;
    }
    chance=Math.min(chance,100);
    if (!quiet && valuesEdit) {
      myPet.sendMessageToOwner(MyPetBukkitUtil.setColors(MyPetLocales.getString("String_Node_Str",myPet.getOwner().getLanguage())).replace("String_Node_Str",myPet.getPetName()).replace("String_Node_Str","String_Node_Str" + chance).replace("String_Node_Str","String_Node_Str" + damage));
    }
  }
}