Program: 23357
Project: 23357
Buggy source:
@Override public FetchedFile fetch(Type source,FetchedFile src) throws Exception {
  if (source instanceof Reference) {
    String s=((Reference)source).getReference();
    if (!s.contains("String_Node_Str"))     throw new Exception("String_Node_Str" + s + "String_Node_Str");
    String type=s.substring(0,s.indexOf("String_Node_Str"));
    String id=s.substring(s.indexOf("String_Node_Str") + 1);
    try {
      ResourceType rt=ResourceType.fromCode(type);
    }
 catch (    Exception e) {
      throw new Exception("String_Node_Str" + s + "String_Node_Str");
    }
    if (!id.matches(FormatUtilities.ID_REGEX))     throw new Exception("String_Node_Str" + s + "String_Node_Str");
    String fn=pkp.getSourceFor(type + "String_Node_Str" + id);
    List<String> dirs=new ArrayList<>();
    dirs.add(Utilities.getDirectoryForFile(src.getPath()));
    dirs.addAll(resourceDirs);
    if (Utilities.noString(fn)) {
      fn=findFile(dirs,type.toLowerCase() + "String_Node_Str" + id+ "String_Node_Str");
      if (fn == null)       fn=findFile(dirs,type.toLowerCase() + "String_Node_Str" + id+ "String_Node_Str");
      if (fn == null)       fn=findFile(dirs,type.toLowerCase() + "String_Node_Str" + id+ "String_Node_Str");
      if (fn == null)       fn=findFile(dirs,type.toLowerCase() + "String_Node_Str" + id+ "String_Node_Str");
      if (fn == null)       fn=findFile(dirs,id + "String_Node_Str");
      if (fn == null)       fn=findFile(dirs,id + "String_Node_Str");
      if (fn == null)       throw new Exception("String_Node_Str" + type + "String_Node_Str"+ id+ "String_Node_Str"+ type.toLowerCase()+ "String_Node_Str"+ id+ "String_Node_Str"+ type.toLowerCase()+ "String_Node_Str"+ id+ "String_Node_Str"+ type.toLowerCase()+ "String_Node_Str"+ id+ "String_Node_Str"+ type.toLowerCase()+ "String_Node_Str"+ id+ "String_Node_Str"+ id+ "String_Node_Str"+ id+ "String_Node_Str"+ dirs.toString());
    }
 else {
      fn=findFile(dirs,fn);
      if (!exists(fn))       throw new Exception("String_Node_Str" + type + "String_Node_Str"+ id+ "String_Node_Str"+ fn);
    }
    return fetch(fn);
  }
 else   if (source instanceof UriType) {
    UriType s=(UriType)source;
    String fn=Utilities.path(Utilities.getDirectoryForFile(src.getPath()),s.getValueAsString());
    return fetch(fn);
  }
 else {
    throw new Exception("String_Node_Str");
  }
}

Fixed version (ground truth):
@Override public FetchedFile fetch(Type source,FetchedFile src) throws Exception {
  if (source instanceof Reference) {
    String s=((Reference)source).getReference();
    if (!s.contains("String_Node_Str"))     throw new Exception("String_Node_Str" + s + "String_Node_Str");
    String type=s.substring(0,s.indexOf("String_Node_Str"));
    String id=s.substring(s.indexOf("String_Node_Str") + 1);
    if (!pkp.getContext().hasResource(StructureDefinition.class,"String_Node_Str" + type))     throw new Exception("String_Node_Str" + s);
    if (!id.matches(FormatUtilities.ID_REGEX))     throw new Exception("String_Node_Str" + s + "String_Node_Str");
    String fn=pkp.getSourceFor(type + "String_Node_Str" + id);
    List<String> dirs=new ArrayList<>();
    dirs.add(Utilities.getDirectoryForFile(src.getPath()));
    dirs.addAll(resourceDirs);
    if (Utilities.noString(fn)) {
      fn=findFile(dirs,type.toLowerCase() + "String_Node_Str" + id+ "String_Node_Str");
      if (fn == null)       fn=findFile(dirs,type.toLowerCase() + "String_Node_Str" + id+ "String_Node_Str");
      if (fn == null)       fn=findFile(dirs,type.toLowerCase() + "String_Node_Str" + id+ "String_Node_Str");
      if (fn == null)       fn=findFile(dirs,type.toLowerCase() + "String_Node_Str" + id+ "String_Node_Str");
      if (fn == null)       fn=findFile(dirs,id + "String_Node_Str");
      if (fn == null)       fn=findFile(dirs,id + "String_Node_Str");
      if (fn == null)       throw new Exception("String_Node_Str" + type + "String_Node_Str"+ id+ "String_Node_Str"+ type.toLowerCase()+ "String_Node_Str"+ id+ "String_Node_Str"+ type.toLowerCase()+ "String_Node_Str"+ id+ "String_Node_Str"+ type.toLowerCase()+ "String_Node_Str"+ id+ "String_Node_Str"+ type.toLowerCase()+ "String_Node_Str"+ id+ "String_Node_Str"+ id+ "String_Node_Str"+ id+ "String_Node_Str"+ dirs.toString());
    }
 else {
      fn=findFile(dirs,fn);
      if (!exists(fn))       throw new Exception("String_Node_Str" + type + "String_Node_Str"+ id+ "String_Node_Str"+ fn);
    }
    return fetch(fn);
  }
 else   if (source instanceof UriType) {
    UriType s=(UriType)source;
    String fn=Utilities.path(Utilities.getDirectoryForFile(src.getPath()),s.getValueAsString());
    return fetch(fn);
  }
 else {
    throw new Exception("String_Node_Str");
  }
}