Ամեն առավոտ սրտխառնոցի զգացումը կարող է լյարդի ու մարսողական համակարգի խնդրի հետևանքով առաջանալ, նաև` սիրտ-անոթային ու ներզատիչ համակարգերում առաջացած խանգարման հետևանքով: Առավոտյան սրտխառնոցի պատճառ կարող են լինել նաև հելմիտները (ճիճվային հիվանդություններ): Պատճառները բազում են, ուստի ինքնուրույն ախտորոշել հիվանդությունը խիստ դժվար է, եթե չասենք` անհնար: Ճշգրիտ ախտորոշման համար պետք է հետազոտություններ կատարվեն, արյան ընդհանուր ու կենսաբանական քննություն: Պետք է որովայնի խոռոչի օրգանների գերձայնային հետազոտություն անցնել, գաստրոսկոպիա կատարել: