Հովհաննես Չեքիջյանը իր ստեղծագործական գործունեության ընթացքում ղեկավարել է 5 տասնյակից ավելի նշանավոր սիմֆոնիկ նվագախմբեր ողջ աշխարհում, հեղինակել է բազմաթիվ վոկալ, սիմֆոնիկ, ստեղծագործություններ, երգչախմբային մշակումներ, արժանացել է ամենաբարձր կոչումների ու պարգևների: