Հայաստանի ՓՄՁ զարգացման ազգային կենտրոնը համատեղ ծրագրեր է իրականացնում և ակտիվ համագործակցում է մի շարք միջազգային և օտարերկրյա կազմակերպությունների հետ: Համատեղ ծրագրեր են իրականացվել և իրականացվում ՄԱԶԾ, ՄԹ ՄԶՎ, ՃՄՀԳ և ԵԱՀԿ երևանյան գրասենյակի հետ: