Հիմնադրամի կառավարման բարձրագույն մարմինն է հոգաբարձուների խորհուրդը, որի բոլոր անդամները ընդգրկված են նաև “Նոր Հորիզոն”-ի կառավարման բարձրագույն մարմնում` Ընդհանուր Ժողովում: Հիմնադրամի ընթացիկ ղեկավարումն իրականացվում է գործադիր մարմնի կողմից` ի դեմս գործադիր տնօրեն Գոռ Մովսեսյանի, ով հանդիսանում է նաև “Նոր Հորիզոն” ՈՒՎԿ ՍՊԸ-ի խորհրդի նախագահը: