Կիստի ֆիբրոզով մարդիկ ունեն թոքերի վարակի զարգացման ավելի մեծ ռիսկ, քանի որ կպչուն լորձը կառուցում է, ստեղծում է միջավայր, որով մանրէները կարող են զարգանալ եւ աճել: Թոքերի վարակները հիմնականում բակտերիաներ են առաջանում եւ հակված են շատ լուրջ խնդիր հանդիսանալ: