ԵՊՀ ռեկտորատը ռեկտորին կից խորհրդակցական մարմին է: ԵՊՀ խորհրդի և գիտական խորհրդի նիuտերի միջև ընկած ժամանակահատվածում ռեկտորատը, սահմանված կանոնակարգով, իրեն տրված լիազորությունների շրջանակներում քննարկում է ԵՊՀ գործունեության բոլոր ոլորտներին վերաբերող հարցերը, ԵՊՀ խորհրդի և գիտական խորհրդի որոշումների կատարման ընթացքը: