Ունենալով բավականին մեծ միջհյուսվածքային տարբերակման հնարավորություն՝ ՄՌՏ հետազոտությունը հնարավորություն է ընձեռում հստակ տարանջատել օրգանները, հայտնաբերել առկա խնդրի սկզբնաղբյուրը և հարաբերակցությունը հարակից օրգանների հետ: