Ինչպես հայտարարել է ՀՀ բնապահպանության նախարար Արծվիկ Մինասյանը, չնայած այն հանգամանքին, որ ՀԷԿ-երը համարվում են էկոլոգիապես ավելի նախընտրելի էլեկտրաէներգիայի արտադրություն, սակայն, հետազոտություններն այս ոլորտում բնապահպանական նվազագույն պահանջների բավարարման առումով արդեն բացահայտել են որոշ պրոբլեմներ: