ՀՀ ԱՆ ԱՊՏ Սյունիքի մասնաճյուղն իրականացնում է օրենքով Հայաստանի Հանրապետության առողջապահության նախարարությանը վերապահված վերահսկողական գործառույթներ` աշխատանքի անվտանգության և աշխատանքային օրենսդրության նորմերի կիրառման, բնակչության սանիտարահամաճարակային անվտանգության ապահովման, բժշկական օգնության և սպասարկման, առողջապահության ոլորտի լիցենզավորման ենթակա գործունեության տեսակների իրականացման, ինչպես նաև դեղերի և դեղագործական գործունեության բնագավառները կարգավորող օրենքներով, Հայաստանի Հանրապետության կառավարության որոշումներով և այլ իրավական ակտերով սահմանված պահանջների նկատմամբ, և օրենքով սահմանված կարգով կիրառում պատասխանատվության միջոցներ: