1950-ական թվականների կեսերից, Մ. Քոթանյանը դասախոսել է Երևանի մի շարք բուհերում, վարել է հանրապետական մակարդակի պատասխանատու պաշտոններ: Նրա գիտական ղեկավարությամբ բազմաթիվ ասպիրանտներ պաշտպանել են թեկնածուական թեզեր և ստացել տնտեսագիտության թեկնածուի գիտական աստիճան: