Մանուկյանի ոճի հիմքը կազմում են ինչպես հայկական ազգային երգերի տարրերը, այնպես էլ կոմպոզիտորական ժամանակակից տեխնիկայի անմիջական գործածումը: Չնայած կոնկրետ ժողովրդական երգերի խիստ հազվադեպ օգտագործմանը՝ ազգային երաժշտության գովաբանումն ու ժամանակակից ոճերի հետ դրա միախառնումը, նրա բոլոր գործերի բուն էությունն է: Մանուկյանի ստեղծագործությունները հաճախ հնչում են աշխարհի բազմաթիվ բեմերում, որտեղ երբեմն կոմպոզիտորը ելույթ է ունենում բացման խոսքով: