Մ. Միքայելյանը նաև գիտական ու գեղարվեստական գրքերի խմբագիր է, ինչպես` Վարդգես Միքայելյանի "Ղրիմահայ գաղութը Արևելք-Արևմուտք հարաբերությունների ոլորտում" (13-18-րդ դարեր) աշխատությունը (Ե., 2000), ՀՀ ԳԱԱ պատմության ինստիտուտի Հայ գաղթավայրերի պատմության բաժնի հրատարակած "Հայ գաղթաշխարհի պատմություն" եռահատոր ժողովածուների (գիտական խմբագիր` ՀՀ ԳԱԱ ակադեմիկոս Վարդգես Միքայելյան) I և II հատորները (Ե., 2003), RAA Հայկական ճարտարապետությունն ուսումնասիրող կազմակերպության հրատարակած "Ջավախք" ուսումնասիրությունը (հեղինակ` Սամվել Կարապետյան) (Ե., 2006), դրամատուրգ Ժորա (Գևորգ) Հարությունյանի հիշատակին նվիրված "Եկար, զարմացրիր, գնացիր" (Ե., 2006) հուշերի ժողովածուն (կազմող` բանաստեղծ, թարգմանիչ, խմբագիր Գայանե Հարությունյան):