Ա. Խառատյանն ունի գիտահետազոտական աշխատանքների լայն շառավիղ. նրա ուսումնասիրությունները վերաբերում են գիտական կարևորություն ունեցող այնպիսի հիմնահարցերի, ինչպիսիք են հայ հասարակական մտքի, հատկապես արևմտահայ և գաղութահայ հասարակական մտքի և մամուլի պատմությունը, Օսմանյան Թուրքիայի խոշորագույն հայ գաղթավայրերի՝ Կոստանդնուպոլսի և Զմյուռնիայի պատմությունը: Գրել և հրատարակել է հետևյալ մենագրությունները.