Այնուամենայնիվ, ինչպես բոլոր տեխնոլոգիաները, բժշկական սարքերը չեն պաշտպանում տեխնիկական մարտահրավերներին եւ ծրագրային բծերը: Ծրագրային ապահովման աճող ապրելակերպն առաջացնում է բազմաթիվ խնդիրներ, որոնք առաջացնում են այլ տեղ: Բժշկական ծրագրերը ենթարկվում են bugs, crashes եւ թվային հարձակումներին: Պատրասի համալսարանում անցկացված հետազոտության համաձայն, Ground- ը պարզել է, որ 1999-2005թթ. ԱՄՆ-ում վաճառված ծրագրային ապահովման երեք տարբերակները ձախողումներ են եղել: