ՀԲԸՄ-ի գործունեության կարևոր առանցքներից է համագործակցությունը Մայր Աթոռ Սուրբ Էջմիածնի հետ: Բարերարների աջակցությամբ և Մայր Աթոռ Սուրբ Էջմիածնի ջանքերով բազմաթիվ եկեղեցիներ են վերականգնվել, հոգևոր դպրոցներ ստեղծվել և հայորդյաց տներ կազմավորվել: