Մագիստրոսների համար նախատեսված են հետևյալ դասընթացները. գրավիտացիայի տեսություններ և դրանց աստղաֆիզիկական կիրառությունները, դինամիկական համակարգերի որակական վերլուծություն, թույլ փոխազդեցություններ, ուժեղ փոխազդեցություններ բարձր էներգիաների տիրույթում, ռեակտորների տեսություն, վաղ տիեզերքի կոսմոլոգիա, տրամաչափական դաշտերի տեսություն, փուլային անցումներ, քվանտային էլեկտրադինամիկա, գերխիտ երկնային մարմինների ֆիզիկա, լարերի և բրանների տեսություն, պլազմայի ֆիզիկա, ռադիացիոն ֆիզիկայի տեսական և փորձարարական հիմունքներ, քվանտային ինֆորմացիոն տեխնոլոգիաներ, մասնագիտության արդիական հիմնախնդիրները, տեղեկատվական տեխնոլոգիաները մասնագիտական հետազոտություններում, ինֆորմատիկայի ֆիզիկական հիմունքներ: