Արմատային ջրանցքի ընթացակարգը կատարվում է այն ժամանակ, երբ ատամը երբեք արմատ չի դառնում վարակված կամ վնասված է: Արմատային ջրանցքի կարգում նյարդն ու պուլպը երկուսն էլ հեռացվում են, եւ ատամի ներսը մաքրվում եւ կնքվում է: