2. Հանձնաժողովն իր գործունեության ընթացքում ղեկավարվում է Հայաստանի Հանրապետության կառավարության 1997 թվականի մայիսի 30-ի թիվ 159 որոշմամբ, սույն կանոնադրությամբ և Հայաստանի Հանրապետության օրենսդրական այլ ակտերով: