ՀՏ-ի ժամանակ կիրառվում են ռենտգենյան ճառագայթներ, որոնք տարբեր կերպ են կլանվում տարբեր խտություն ունեցող միջավայրերում: Որքան խիտ և պինդ է այս կամ այն օրգանը, այնքան ավելի մեծ քանակով ռենտգենյան ճառագայթներ է այն կլանում և հակառակը՝ օդակիր օրգանները ավելի թափանցելի են: Այս է պատճառը, որ ոսկրերի և թոքերի հետազոտման համար նախընտրելի է համակարգչային տոմոգրաֆիան: