Համակարգչային տոմոգրաֆիան բացարձակ հակացուցումներ չունի: Այն հնարավոր է իրականացնել ցանկացած վիճակում գտնվող պացիենտի և նույնիսկ այն պացիենտներին, ովքեր գտնվում են կոմատոզ վիճակում կամ միացված են արհեստական շնչառության սարքին: