शीतजल मात्स्यिकी अनुसंधान निदेशालय का मुख्यालय उत्तराखंड राज्य के नैनीताल जिले में भीमताल/समुद्र तल से 1470 मी0 ऊँचाई पर स्थित है । यह सुप्रसिद्ध पर्यटक स्थल नैनीताल से लगभग 25 कि0 मी0 दूर है । सबसे नजदीक का रेलवे	स्टेशन काठगोदाम जो 18 कि0 मी0 की दूरी	पर है और दिल्ली से लगभग 250 कि0 मी0 दूर है । निकटस्थ/स्थानिये हवाई अड्डा पंतनगर 45 कि0 मी0 की दूरी	पर है और इन्दिरा गांधी अंतराष्ट्रीय हवाई अड्डा दिल्ली है । संस्थान का प्रायोगिक फार्म प्रक्षेत उत्तराखंड राज्य के चंपावत जिले के छिड़ापानी में स्थित है जो भीमताल से 150 कि0 मी0 की दूरी पर है ।