अनुपम खेर भी विरोध करने वालों में शामिल थे। छात्रों ने पुणे के अलावा दिल्ली के जंतर-मंतर में भी गजेंद्र चौहान का विरोध किया था। हालांकि बीजेपी सरकार ने अपना फैसला वापस नहीं लिया, 3 साल बाद जब उनका कार्यकाल पूरा हो गया तो अनुपम खेर को FTII का चेयरमैन बनाया गया।