मात्र तैंतीस वर्ष की आयु में कलकत्ता विश्वविद्यालय में विश्व के सबसे कम उम्र के कुलपति बने , इंडियन इंस्टीटयूट ऑफ़ साइंस’, बंगलौर की परिषद एवं कोर्ट के सदस्य और इंटर-यूनिवर्सिटी ऑफ़ बोर्ड के चेयरमैन , हिन्दू महासभा के अध्यक्ष , बंगाल विधान परिषद के सदस्य , विरोधी दल के नेता , वित्त मंत्री , पंडित जवाहर लाल नेहरू के मंत्री मंडल में उद्योग एवं आपूर्ति मंत्री के पद को सुशोभित करने वाले डॉ मुखर्जी 6 अप्रैल 50 को त्यागपत्र दे कर राष्ट्रीय स्वयंसेवक संघ के संघचालक गुरु गोलवलकर जी से परामर्श करने के बाद 21 अक्तूबर, 1951 को दिल्ली में ‘भारतीय जनसंघ’ की नींव रखी और इसके पहले अध्यक्ष बने।