जिस दिन घटना हुई थी उस दिन बिलकीस की मेडिकल जांच नहीं करवाई गई। यद्यपि बिलकीस साफ-साफ कह रही थी कि उसके साथ बलात्कार किया गया है और उसके शरीर पर अनेक चोटें हैं। उसे रात भर पुलिस स्टेशन पर रोककर रखा गया जो स्वयं एक अत्यधिक जघन्य अपराध था। फिर दूसरे दिन उसकी मेडिकल जांच कराई गई।