जुनैद खान के पिता जलालुद्दीन ने दायर याचिका में आरोप लगाया कि जांच एजेंसी ने एक आकस्मिक और खराब जांच की है। याचिका में कहा गया कि जांच एजेंसी ने भारतीय दंड संहिता कीधारा 153 ए (धर्म आदि के आधार पर दुश्मनी को बढ़ावा देने), 153 बी (अभिप्राय, राष्ट्रीय एकीकरण के प्रति झूठे आरोपों), 120 बी (आपराधिक साजिश) और 14 9 (गैरकानूनी जमावड़े ) नहीं लगाई।