रुस्तम की कहानी नेवल अफसर रुस्तम पावरी (अक्षय कुमार) की है जो अपनी पत्नी सिंथिया पावरी (इलियाना डी क्रूज) के साथ सुखद जिंदगी व्यतीत कर रहा होता है। लेकिन एक दिन उसकी दुनिया अचानक से बदल जाती है जब उसे पता चलता है कि उसकी पत्नी के अवैध सम्बन्ध उसके ही करीबी दोस्त विक्रम मखीजा (अर्जन बाजवा) के साथ हैं। इसके ठीक बाद 3 गोलियां चलती हैं और सबकुछ बदल जाता है। अब इस कत्ल का जिम्मेदार कौन है। इसमें सरकार का क्या योगदान होता है? और आखिरकार क्या नतीजा आता है, ये आपको नजदीकी थिएटर तक जाकर ही पता चलेगा।