इस सोसायटी में विवाद कोई नया नहीं है। देश के जाने-माने राजनीतिक विश्लेषक प्रताप भानू मेहता ने इस सोसायटी से इस्तीफ़ा दे दिया था। श्री मेहता ने अगस्त 2016 में ही इसके कार्यकारी परिषद से भी इस्तीफ़ा दे दिया था। श्री मेहता नये निदेशक शक्ति सिन्हा की नियुक्ति से असहमत थे।