आज्ञा-चक्र वह है जहाँ से शरीर की एक सबसे प्रसिद्ध नाड़ी जिसका एकमात्र कार्य जीव को आत्मा से मिलाना, उसी सुषुम्ना नाड़ी की उत्पत्ति और पुनः लौटकर समाप्ति भी इसी चक्र में होती है। इस विषय पर सुषुम्ना नाड़ी और आज्ञा-चक्र की इतनी बड़ी मान्यता है कि साधना-मार्ग अथवा भोग मार्ग का कोई साधक इसको अपना माध्यम बनाए बगैर योग-साधना का अभ्यास और सिद्धि प्राप्त नहीं कर सकता।