इमाम अली मस्जिद की लाइब्रेरी भी इस मस्जिद का बहुत अहम भाग है। इस मस्जिद में धर्म, इतिहास, संस्कृति, साहित्य और समाज के बारे में 5000 से ज़्यादा किताबे हैं। इस लाइब्रेरी की ज़्यादातर किताबें फ़ारसी, अरबी, जर्मन और अंग्रेज़ी ज़बान में हैं। पाठक इन किताबों को लाइब्रेरी के विशेष कमरे में पढ़ सकते हैं और चाहे तो घर ले जा सकते हैं। इस मस्जिद ने इस्लामी संस्कृति व विचार को पेश करने के लिए अब तक फ़ारसी, अरबी, तुर्क, बोस्नियाई और जर्मन ज़बान में अनेक किताबें प्रकाशित करायी हैं। इन किताबों में योरोपीय समाजों की ज़रूरत के अनुसार सवालों के जवाब दिए गए और इस्लामी संस्कृति के विभिन्न आयामों को पहचनवाया गया है।