कार्यक्रम मूल्यांकन संगठन प्रशासनिक चैनलों से स्वतन्य होकर प्रत्यक्ष निरिक्षण सैंपल सर्वेक्षण और सामाजिक विज्ञान के शोध तरीकों से बाहरी मूल्यांकन कर रहा है, इस प्रकार प्रोग्राम आकलन संगठन द्वारा किया जा रहा आकलन अध्ययन प्रगति की रिपोर्ट करने अथवा जाँच और संवीक्षा कार्य जैसा कि प्रशासनिक मंत्रालयों / विभागों में किया जा रहा है, से अलग है, तथापि कार्यक्रम मूल्यांकन संगठन मूल्यांकन के सभी चरणों में योजनाकारों और क्रियान्वयन एजेंसियों को शामिल करने का प्रयास कर्ता है जिससे कार्यक्रम मूल्यांकन संगठन कि रिपोर्ट लाभदायक बन सके।