संतरे में मौजूद विटामिन सी किडनी के लिए भी काफी फायदेमंद होता है। यह यूरिन में citrate के स्तर को बढ़ा देता है। Citrate यूरिन में मौजूद एसिड्स को neutralize कर देता है और यूरिक एसिड और कैल्शियम ऑक्सालेट के crystallization को रोककर किडनी स्टोन में परिवर्तित होने से रोक देता है। इसलिए संतरे के नियमित सेवन से किडनी में कैल्शियम ऑक्सालेट किडनी स्टोन बनने की सम्भावना बहुत ही कम हो जाती है।