गीता भाष्य में श्री शंकर के अपने कतिपय विचार बिन्दु हैं जो मान्य वेदान्तिक सिद्धांतों से मेल नहीं खाते। इन्हें द्वैत एवं अद्वैत सिद्धांतों को मानने वाले यानि दोनों ही पक्ष अपने-अपने समर्थन में मान सकते हैं। यही बात कुछ हद तक गीता के साथ भी है, जिसमें कई ऐसे श्लोक हैं, जिनमें दोनों ही पक्षों का समर्थन परिलक्षित होता है। जहाँ तक श्रीशंकर का प्रश्न है, वे दृढ़ता के साथ मानते हैं कि बिना विशुद्ध ज्ञान के मोक्ष पाना असंभव है। इस विषय में गीता का यह श्लोक विशेषकर उल्लेखनीय है-