प्रारंभिक अवस्था में अगर खरपतवार न नष्ट किये जाए तो फसल पर प्रतिकूल प्रवाभ पड़ता है. गर्मियों में अच्छी तरह गहरी जुताई करने से मिटटी में पलने वाले कीट, खरपतवार के बीज, फफूंदी व अन्य हानि पहुचने वाले परजीवी नष्ट या कम हो जाते हैं. अगर खरपतवार उग आये हैं तो हाथों, कृषि यंत्रों व खरपतवारनाशी रसायनों से नियंत्रण करते हैं. "बासालिन" नामक खरपतवारनाशी रसायन का घोल का फसल बोने से पहले उचित नमी वाले बिजाई के लिए तैयार खेत में १.० से १.५ लीटर प्रति हैक्टेयर कि दर से छिडकने के बाद डिस्क द्वारा मिटटी में मिश्रित करने से अधिकतम खरपतवार नष्ट हो जाते हैं. रसायनों का उपयोग उचित मात्रा में ही करें.