अब यह वायरस केरल के चार जिलों -कोझिकोड, मल्लपुरम, कन्नूर और वायनाड- में पाया गया है। निपाह वायरस को लेकर ये बात सामने आई कि इसे चमगादड़ फैला रहे है लेकिन जांच में कुछ और ही बात सामने आई है। मेडिकल रिपोर्ट में खुलासा हुआ है कि यह वायरस चमगादड़ों से नहीं फ़ैल रहा है।