वर्ष 2002 में इनके ऊपर इन्हीं की संस्था की साध्वी के द्वारा यौन उत्पीडन का आरोप लगाया गया. स्त्री ने उस समय देश के तात्कालिक प्रधानमन्त्री श्री अटल बिहारी वाजपेयी तक यह घटना की खबर एक गुमनामी चिठ्ठी द्वारा पहुंचाई थी.