अकोलकर और पाटिल दोनों लिमकर और जयप्रकाश के साथ अक्टूबर 2009 मडारोगो बम विस्फोट में प्रमुख भूमिका निभाने की वजह से संदेह के घेरे में हैं, जब इलाके में दीवाली कार्यक्रम में लगाए जाने वाले आईईडी (विस्फोटक पदार्थ) को ले जाने के दौरान सनातन संस्थान के दो सदस्यों की मौत हो गई थी.