मलेरिया का मुख्य कारण संक्रमित ऐनोफ्लीज मच्छर में मौजूद प्लासमोडियम परजीवी है। ऐनोफ्लीज मच्छर के काटने पर यह परजीवी व्यक्ति के शरीर में प्रवेश करके लीवर को संक्रमित कर देता है, जिससे लीवर में मलेरिया को फैलाने वाले सूक्ष्म जीव बनने लगते हैं। यह जीव लीवर से रक्त में पहुँच जाते हैं जिससे लाल रक्त कण टूटने लगते हैं और व्यक्ति को मलेरिया हो जाता है।