12 अप्रैल को उनकी जमानत की अर्जी खारिज कर दी गई और उन्हें न्यायिक हिरासत में भेज दिया गया. इससे वैज्ञानिक समुदाय और गैर-सरकारी संगठन भड़क गए. विद्वानों, वैज्ञानिकों और सामाजिक कार्यकर्ताओं के एक समूह ने मनमोहन सिंह को गुस्से से भरा पत्र लिखा. प्रधानमंत्री के लिए परेशानी की बात यह थी कि इस पत्र पर पहले हस्ताक्षर सोनिया गांधी की पसंदीदा अरुणा रॉय के थे. 18 अप्रैल को आखिरकार प्रोफेसर को जमानत मिल गई.