WHO की रिपोर्ट के अनुसार अप्रैल से जून महीने में निपाह वायरस के फैलने का खतरा ज्यादा होता है. सबसे ज्यादा संक्रमण मई महीने में होता है. हालांकि सर्दी के मौसम में साल 2001 में भारत में और साल 2004 में बांग्लादेश में निपाह वायरस का संक्रमण देखा गया था. भारत में इसके पहले पश्चिम बंगाल के सिलीगुड़ी में निपाह वायरस का संक्रमण देखा गया था. तब 45 लोगों की मौत हो गई थी.