আইপিএলে কাটার মাস্টার মুস্তাফিজকে প্রথম খেলে ২০১৬ সালের হায়দরাবাদের হয়ে। প্রথমবার হায়দরাবাদের হয়ে চোখ ধাঁধাঁনো পারফর্ম ছিল তার। চ্যাম্পিয়নও হয় হায়দরাবাদ। পরে ইংলিশ লিগ সাক্সেসে ইনজুরির শিকার হন তিনি। ওই ইনজুরি কাটিয়ে খেলায় ফিরলেও পপুরনো মুস্তাফিজকে পাওয়া গেলো না। পরেরবার হায়দরাবাদের হয়ে ইনজুরির কারণে বেশি ম্যাচ পাননি। সর্বশেষ আইপিএলে ইনজুরির কারণে মুম্বাই ইন্ডিয়ান্সের হয়ে ঠিক চেনা ছন্দে ছিলেন না তিনি। পরপর তিনটি আইপিএল খেলেছেন তিনি। প্রথম দুই মৌসুম ছিলেন হায়দরাবাদে। আর সর্বশেষ মৌসুমে খেলেছেন মুম্বাই ইন্ডিয়ান্সের হয়ে। কিন্তু এবার তাকে ছেড়ে দিল দলটি।