অতুলপ্রসাদ সেনের পারিবারিক ভিটা শরীয়তপুরের নড়িয়া উপজেলার মগর গ্রামে। । তিনি ঢাকায় তাঁর মাতুলালয়ে জন্মগ্রহণ করেন। অতি অল্পবয়সেই অতুলপ্রসাদ পিতৃহারা হন। এরপর তাঁর মাতামহ কালীনারায়ণ গুপ্ত তাঁকে প্রতিপালন করেন। মাতামহের নিকটই সঙ্গীত ও ভক্তিমূলক গানে তাঁর হাতেখড়ি।[১]