ধীরে ধীরে কংগ্রেসের সাথে মনোরমা বসুর দূরত্ব বাড়তে থাকে। তিনি যাতে কমিউনিস্টদের সাথে না যেতে পারেন তার জন্য তাঁর পূর্বতন কংগ্রেসের সহকর্মীরা যথাসাধ্য বাধা দেন। কিন্তু মনোরমার পথ আগলে দাঁড়ানোর ক্ষমতা কারও ছিল না। তিনি ১৯৪২ সালে কমিউনিস্ট পার্টির সদস্য পদ লাভ করেন। ১৯৪৩ সালে কলকাতা শহরের মতো বরিশালেও মহিলা আত্মরক্ষা সমিতি গড়ে তোলেন মনোরমা বসু। তিনি এর প্রথম নির্বাচিত সম্পাদক হন। এসময় বাংলায় ব্যাপক দুর্ভিক্ষ দেখা দেয়। মাসিমা নিরন্ন মানুষের মুখে খাবার তুলে দেয়ার জন্য কয়েকটি স্থানে লঙ্গরখানা চালু করেন। এই বছরের ৮ মে কলকাতায় অনুষ্ঠিত হয় মহিলা আত্মরক্ষা সমিতির প্রথম সম্মেলন। সেই সম্মেলনে তিনি বরিশাল জেলার প্রতিনিধিত্ব করেন। এরই ধারাবাহিকতায় মনোরমা বসুর নেতৃত্বে ও আগ্রহে পরবর্তী বছর বরিশালেই অনুষ্ঠিত হয় মহিলা আত্মরক্ষা সমিতির দ্বিতীয় সম্মেলন। ১৯৪৫ সালে কলকাতায় অনুষ্ঠিত সংগঠনটির তৃতীয় সম্মেলনে তিনি এর কেন্দ্রীয় কার্যকরী কমিটির সদস্য নির্বাচিত হন। এসময় নোয়াখালীতে যে দাঙ্গা হয়েছিল সেখানে একনাগাড়ে প্রায় নয় মাস কাজ করেন তিনি। তাঁর সঙ্গে ছিলেন ইলা মিত্র, আবদুল্লাহ রসুল, ডা. রমেশ ব্যানার্জী, বিভা দাসগুপ্ত ও নৃপেন সেন।