মূল প্রবন্ধে বেশ কিছু চ্যালেঞ্জের কথা তুলে ধরা হয়। এগুলো হচ্ছে- সীমান্তবর্তী ও পার্শ্ববর্তী দেশে ম্যালেরিয়ার প্রকোপ এবং আন্তঃসীমান্ত চলাচল/পারাপারকারীর এই রোগে আক্রান্তের প্রবণতা, অতি দুর্গম এলাকাতে রোগটি স্থানান্তর হওয়া, বাহক মশার আচরণ ও স্বভাব বিষয়ে বৈজ্ঞনিক তথ্যের অভাব, কম প্রকোপ এলাকার জনগণের মধ্যে ম্যালেরিয়া সম্পর্কিত ভীতি কমে যাওয়া, এবং প্রয়োজনীয় বাজেট বরাদ্ধ কমিয়ে দেওয়া ইত্যাদি।