খুব বেশি ছোটগল্প লিখেননি শওকত আলী। তাঁর উপন্যাসের সংখ্যার তুলনায় তা অল্পই। তাঁর ছোটগল্পের বইয়ের সংখ্যা চারটি – উন্মুল বাসনা (১৯৬৮), লেলিহান সাধ (১৯৭৭), শুন হে লখিন্দর (১৯৮৬) এবং বাবা আপনে যান (১৯৯৪)। এ-চারটি গল্পগ্রন্থের মাধ্যমেই তিনি নিজের কণ্ঠস্বরকে ভিড়ের ভেতরও উচ্চকিত রাখতে পেরেছেন।