সংশোধিত প্রস্তাবে প্রকল্পের প্রতিটি ক্ষেত্রেই ব্যয় বেড়েছে। এর মধ্যে সবচেয়ে বেশি বেড়েছে মূল সেতু ও নদী শাসন ব্যয়। এ দুই প্যাকেজে নিয়োজিত ঠিকাদারি দুই চীনা প্রতিষ্ঠান ৬ হাজার ৩০৬ কোটি টাকা বেশি দর প্রস্তাব করে। এর মধ্যে মূল সেতুতে ব্যয় বেড়েছে ২ হাজার ৯৬১ কোটি ও নদীশাসনে ৩ হাজার ৩৪৫ কোটি টাকা।