সাহসিকতার জন্য বঙ্গবন্ধু শেখ মুজিবুর রহমানের নজরেও পড়েন মহিউদ্দিন। ভীষণ স্নেহ করতের তাকে। মহিউদ্দিন ছাত্রলীগের রাজনীতিতে জড়িয়ে পড়েন স্কুল জীবনেই। চট্টগ্রাম সিটি কলেজে রাজনৈতিক জীবনের বিকাশ। এরপর জিয়াউর রহমানের শাসনামল এবং এরশাদের আমলেও আন্দোলন সংগ্রামে ছিলেন সামনের সাড়িতে। এরশাদকে অবাঞ্ছিত ঘোষণা করে চক্ষুশূল হন সামরিক সরকারের। গ্রেপ্তারও হন তখন। তবে চট্টগ্রামের সর্বস্তরের মানুষের কাছে নয়নমণি হয়ে ওঠেন মহিউদ্দিন চৌধুরী।