তাঁর ভোটে দাঁড়ানো নিয়েও দলের মধ্যে বির্তক হয়। সংগঠনের শীর্ষ নেতৃত্বের দাবি, পিটিএম একটি অরাজনৈতিক সংগঠন। এই সংগঠন থেকে ভোটে দাঁড়ানো যায় না। সংগঠনের কোর কমিটি থেকে ওয়াজিরকে বহিষ্কার করা হলেও সংগঠন থেকে তাঁকে বার করা হয়নি।