রাতভর মানিকগঞ্জে পুলিশের সঙ্গে বন্দুক যুদ্ধ করেন কিন্তু পুলিশ তাকে ধরতে পারেনি। এরপর ঢাকায় পৌঁছে যখন নরসিংদীর উদ্দেশে রওনা হন, তখন পুলিশের সঙ্গে আবারও সংঘর্ষ হয়। এ সময় গ্রেফতার হন শাহজাহান। তাকে সেখানেই থামতে হয়। এরপর থেকেই তার বন্দী জীবন।