মাঝখানে নির্বাচনে অংশগ্রহণের সুযোগ হারান। কঠিন বিপর্যয়ের মুখেও ২০০১ সালের নির্বাচনে জাতীয় পার্টি ১৪ টি আসন লাভ করে তৃতীয় বৃহত্তম দল হিসাবে নিজেদের অস্তিত্ব জানান দেয়। ৪ দলীয় জোট বিজয়ী হওয়ায় ভোটের পরদিনই এরশাদ দেশের বাইরে চলে যান। পরিবেশ অনুকূলে এলে দেশে ফিরে দল গুছানোর কাছে হাত দেন। সেই নির্বাচনের আগেও জাতীয় পার্টি আরেক দফা ভেঙে ছিল।