কিছু টুইক্স আছে যা পরিবর্তন করলে অন্য প্রোগ্রামের সমস্যা হতে পারে। টুইক্স সক্রিয় করার পর কোন সফটে সমস্যা দেখা দিলে Restore বাটনে ক্লিক করে Restore to Windows Default এ ক্লিক করে সেটিংস আগের মত করতে পারবেন। তবে এ ধরনের সফটওয়্যার জনিত সমস্যা খুবই কম ক্ষেত্রেই হয়ে থাকে।