কিন্তু জাহাঙ্গীরনগর বিশ্ববিদ্যালয়ের উপাচার্য পদ থেকে অধ্যাপক ড. শরীফ এনামুল কবির পদত্যাগ করায় আন্দোলনকারী শিক্ষক শিক্ষার্থীরা ও ক্যাম্পাসবাসী আপাত দৃষ্টিতে বিজয়ী হলেও নতুন উপাচার্য হিসেবে ঢাকা বিশ্ববিদ্যালয়ের শিক্ষক সমিতির সভাপতি অধ্যাপক আনোয়ার হোসেনকে নিয়োগ দেয়ায় জাবির শিক্ষক শিক্ষার্থীরা হতাশ হয়েছেন। জাবির প্রভাবশালী কয়েকজন শিক্ষক উপাচার্য হওয়ার জন্য বিভিন্ন জায়গায় লবিং করার ফলে সবারই ধারণা ছিল নতুন উপাচার্য হওতোবা জাবির কোন শিক্ষক হবেন।