গত কয়েক মাসে বেশ কয়েকবার মাদ্রাসার শিক্ষার্থী শিক্ষক থেকে শুরু করে বেসরকারি বিশ্ববিদ্যালয়ের শিক্ষার্থীরা শিক্ষক পর্যন্ত জঙ্গি সংগঠনে জড়িয়ে পড়ার অভিযোগে গ্রেপ্তার হয়েছে৷ বিশ্ববিদ্যালয়ে জঙ্গিবাদের পক্ষে প্রচারণা চালানোর অভিযোগে প্রকৌশল বিশ্ববিদ্যালয়ের শিক্ষার্থীদেরও বহিষ্কার ও করা হয়েছে৷ বিভিন্ন ভাবে বিভিন্ন নামে বাংলাদেশে শক্ত আস্তান পেয়েছে ইসলামিক জঙ্গিরা ।বর্তমানে বাংলাদেশে আলোচিত জঙ্গি সংগঠন গুলির মধ্যে রয়েছে আনসারুল্লাহ বাংলা টিম , হিযবুত তাহরীর , হরকাতুল জিহাদ, জেএমবি, জেএমজেবি, শাহদাৎ-ই-আল হিকমা, শহীদ হামজা ব্রিগেড , হিজবুত শাহাদাৎ সহ আরো বেশ কিছু সংগঠন । নামের ভিন্নতা থাকলে কাজের দিক থেকে সবার ই আদর্শ প্রায় ই অভিন্ন আর যাদের আদর্শের কেন্দ্রবিন্দু ই হলো জামায়াতে ইসলামীর আদর্শ। ১৯৯৯ সনের ৬ই মার্চ যশোর টাউন হল মাঠে আয়োজিত বাংলাদেশ উদীচী শিল্পী গোষ্ঠীর দ্বাদশ জাতীয় সম্মেলনের সমাপনী দিনে বোমা হামলা করে নিজেদের শক্তির কথা জানান দেয় হরকাতুল জিহাদ। এর একে রমনার বটমূলে বোমা হামলা বানিয়ার চড়ে গির্জায় বোমা হামলার মধ্যদিয়ে নিজেদের শক্তির আরো শক্ত অবস্হানের কথা জানান হরকাতুল জিহাদ ।এর পর অনেক অঘটনের পর বাংলাদেশের ইতিহাসের অন্যতম নারকীয় অধ্যায়ের জন্মদেয় হরকাতুল জিহাদ আর তা হলো ২০০৪ সালের ২১ আগস্ট আওয়ামী লীগের জনসমাবেশে ন্যক্কারজনক গ্রেনেড হামলা যাতে প্রাণ হারান আইভি রহমান সহ ২৪ জন । ২০০৫ সালের ১৭ই আগস্ট বাংলাদেশের ৬৪ জেলার মধ্যে ৬৩ জেলায় একযোগে বোমা হামলা করে আলোচনায় আসে জেমএবি যারা নাকি বাংলাদেশে জেএমবি পাকিস্তানের লস্কর-এ-তৈয়বা এবং আল-কায়েদার সহযোগি সংগঠন । আনসারুল্লাহ বাংলা টিম ২০১৩ সালে থেকে বাংলাদেশ ব্লগার হত্যার মধ্য দিয়ে তদের কার্যক্রম পরিচালনা করছে যাদের করে ভাবা হচ্ছে বাংলাদেশে আইএস এর সহযোগী সংগঠন । আর হিজবুত তাহরীর তো গত সপ্তাহে ঘোষনা দিয়েই ঢাকায় অনলাইন সম্মেলন করেছে এবং প্রতিদিন তারা তাদের প্রচার পত্র বিলি করে আসছে।