অণুজীব ব্যবহার করে বিষাক্ত আবর্জনাকে ভেঙ্গে কম বিষাক্ত পদার্থে পরিনত করা হয়। কিছু কিছু ক্ষেত্রে অণুজীব পুরো আবর্জনাই খেয়ে ফেলে। আর পুরো ব্যাপারটি ঘটে অণুজীবের মেটাবলিজমের অংশ হয়ে। আর এ প্রক্রিয়ায় বহুল ব্যবহৃত অণুজীব হল ব্যাকটেরিয়া।