বিআরডিবি’র সাংগঠনিক কাঠামোতে ৫টি বিভাগ রয়েছে যথাঃ (১) প্রশাসন, (২) অর্থ ও হিসাব, (৩) সরেজমিন, (৪) পরিকল্পনা,মূল্যায়ন ও পরিবীক্ষণ এবং (৫) প্রশিক্ষণ বিভাগ। প্রতিটি বিভাগ ১ জন পরিচালকের তত্ত্বাবধানে পরিচালিত হয়। বিআরডিবি’র আধুনিক ওআন্তর্জাতিক মানসম্পন্ন প্রশিক্ষণ ইনস্টিটিউট বাংলাদেশ পল্লী উন্নয়ন প্রশিক্ষণ ইনস্টিটিউট (বিআরডিটিআই) সিলেট জেলারখাদিমনগরে অবস্থিত ।