এরপরে মহাজোট সরকার যখন সংবিধানে সংশোধনী এনে তত্ত্বাবধায়ক সরকার ব্যবস্থার বিলুপ্তি আনলো তখন থেকে বেগম সাহেব রাস্তায় নেমে এলেন। অবশ্য এখানেও দুষ্ট লোকেরা বলে তত্ত্বাবধায়ক সরকার ব্যবস্থা বাতিল নয় বরঞ্চ ততোদিনে তাঁর পেয়ারা খাস লোকেরা একে একে জেলখানায় ঢুকে গেছেন এদেশের স্বাধীনতা যুদ্ধের সময় পাকিস্তানী বাহিনীর সাথে কাধে কাঁধ মিলিয়ে এদেশের সাধারন মানুষকে হত্যার অপরাধে। আন্তর্জাতিক যুদ্ধাপরাধ ট্রাইব্যুনাল তাদের ঐতিহাসিক বিচারিক কার্যক্রম শুরু করার পর থেকেই মুলত বেগম খালেদা যিয়ার ঘুম হারাম হয়ে যায়। তাঁর স্বপ্নের রাজনৈতিক কুট কৌশল আস্তে আস্তে সাধারনের কাছে পরিস্কার হয়ে উঠতে শুরু করে।