লিনাক্স ইনস্টল করতে গিয়ে শুরুতে অনেকে বিভিন্ন সমস্যায় পড়েন। কারন লিনাক্স ইনস্টলের পদ্ধতি আর উইন্ডোজ ইনস্টলের পদ্ধতি পুরোপুরি ভিন্ন । এজন্য উইন্ডোজ ইনস্টলে দক্ষ ও অভিজ্ঞ ব্যক্তি ও লিনাক্স ইনস্টলের সময় হার্ডডিস্কের পার্টিশন ফরম্যাট করে ফেলা, পুরো পার্টিশন টেবিল ভেঙ্গে একটি করে ফেলা, উইন্ডোজ পার্টিশন মুছে ফেলা, উইন্ডোজ অপারেটিং সিস্টেম মুছে ফেলা ইত্যাদি নানা ধরনের সমস্যা সৃষ্টি করে ফেলেন। কিন্তু একটু সময় নিয়ে অভিজ্ঞদের সহায়তা ও ম্যানুয়াল পড়ে নিলে এ ধরনের সমস্যা এড়ানো সম্ভব।