পাকস্থলীর আলসার হচ্ছে পাকস্থলীর স্তরের ক্ষত। পাকস্থলীর আলসারের ব্যথা উপরিস্থ পেট থেকে বুক পর্যন্ত অনুভব হতে পারে এবং কখনো কখনো বুকজ্বালার অনুরূপ ব্যথা হতে পারে। সঠিক চিকিৎসা করা না হলে আলসার পাকস্থলীর দেওয়ালে রক্তপাত ও ছিদ্রের কারণ হবে এবং পাকস্থলী ও ক্ষুদ্রান্তের মাঝে ব্লকেজ সৃষ্টি করবে। কিছু পাকস্থলীর আলসার নিজে নিজে সেরে ওঠলেও কিছু আলসারের জন্য অ্যান্টিবায়োটিক প্রয়োজন হবে, এমনকি সার্জারিও।