মুক্ত সাইটের অফিসিয়াল ব্লগ থেকে জানা গেলো, এই সাইটির কাজ শুরু হয় ২০০৬ সালের দিকে। প্রথমদিকে পিডিএফ ফরম্যাটে ম্যাগাজিন বের করার চিন্তাভাবনা করলেও পরবর্তীতে পাঠক এবং লেখক উভয়ের সুবিধার কথা বিবেচনা করে অনলাইন পত্রিকার বের করার সিদ্ধান্ত নেয়া হয়। বিষয়বস্তুর সাথে সামঞ্জস্য রেখে পত্রিকাটির নাম রাখা হয় ‘মুক্ত’।