বক্সিং ছেড়ে দেওয়ার পর ১৯৮৪ সাল থেকে পারকিনসন রোগে ভুগছিলেন মোহাম্মদ আলী। ২০১৪ সালের ডিসেম্বরে ফুসফুসের সমস্যা নিয়ে হাসপাতালে ভর্তি হয়েছিলেন তিনি। ২০১৫ সালের জানুয়ারিতে মূত্রাশয়জনিত জটিলতায় চিকিৎসা নিতে হয় তাকে।