মসজিদের পেছনের দিকে গেলেই নজরে আসে এর সত্যিকার স্থাপত্য শৈলীর নির্দশন। বিভিন্ন সময়ে সংস্কার ও সম্প্রসারণের পরও মোগল স্থাপত্যেরসৌন্দর্য বজায় রাখা হয়েছে বলে জানা যায়। উত্তর দক্ষিণে বিস্তৃত শতবর্ষের স্মৃতিবাহী আয়তাকার মসজিদটি পাঁচ গম্বুজের। একটি বড় গম্বুজ আরদুপাশে দুটি ছোট গম্বুজ রয়েছে। যার উত্তর ও দক্ষিণে চারকোনা আরও দুটি গম্বুজ রয়েছে। স্থাপত্যের ক্ষেত্রে মোগলেরা খিলান গম্বুজ ও খিলান ছাদকেপ্রাধান্য দিত। লতাগুল্মের নকশা, আরবি ক্যালিওগ্রাফি, জ্যামিতিক রেখাচিত্র, মোজাইক নকশা বসানো পাথরের সাজে সজ্জিত মসজিদটি।