Cơ cấu tổ chức
1. Văn phòng.
2. Phòng Kế hoạch - Tài chính.
3. Phòng Quản lý chất thải rắn sinh hoạt.
4. Phòng Quản lý chất thải công nghiệp và nguy hại.
5. Phòng Quản lý chất lượng môi trường.
6. Phòng Quản lý quan trắc môi trường.
7. Chi cục Kiểm soát ô nhiễm môi trường miền Bắc.
8. Chi cục Kiểm soát ô nhiễm môi trường miền Trung và Tây nguyên.
9. Chi cục Kiểm soát ô nhiễm môi trường miền Nam.
10. Trung tâm Quan trắc môi trường miền Bắc.
11. Trung tâm Quan trắc môi trường miền Trung và Tây Nguyên.
12. Tru