プレプリント

プレプリントは査読を通過する前の論文のことであり、査読前論文とも呼ばれる。プレプリントを記録・公開するリポジトリをプレプリントリポジトリといい、これをホストするサーバーはプレプリントサーバーという。研究機関によるプレプリントリポジトリは、機関リポジトリと呼ばれることもある。なお、本記事では「プレプリントリポジトリ」と「プレプリントサーバー」を厳密に区別しない。

1. 概要
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1.1. 役割
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査読付き学術雑誌に掲載される論文は、編集者や査読者が論文を評価・批評するのに必要な時間と、著者がそれに対応するのに必要な時間があるため、最初の投稿から数週間、数ヶ月、あるいは数年かかることが多い。また、近年は論文の投稿本数自体が急増しているため、査読を引き受ける専門家が足りないことも問題となっている。そこで、現在の成果を迅速に学術コミュニティ内で流通できるよう、研究者はプレプリントと呼ばれる原稿を公開するようになった。プレプリントが公開されることで、著者は任意の査読者からのフィードバックを素早く受け取ることができ、論文の改訂や正式な投稿に向けた準備の迅速化が期待できる。また、共同研究者やスポンサーなども見つけやすくなっている。

1.2. 歴史
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プレプリントの共有は、アメリカ国立衛生研究所が生物学におけるプレプリントを配布していて、少なくとも1960年代から始まっている。1991年以降、プレプリントは紙ではなく、インターネット上で電子的に配布されるようになった。これにより、arXivのような大規模なプレプリントデータベースや機関リポジトリが誕生した。1997年にこれらの情報交換グループは一時停止したが、その理由の1つとして、一部の査読付き学術雑誌がプレプリントとして共有された論文を受け入れなくなったことが挙げられている。

2010年代では、学術雑誌によってプレプリントサーバーへの投稿を許可しているところもあれば、許可していないところもあり、その許否はケースバイケースで評価されている。

2016年には、CrossRef、Centre for Open Science、ASAPbioによっていくつかの新しいプレプリントサーバーが提案された。

2017年1月、Medical Research Councilは4月からプレプリントを積極的にサポートすることを発表した。また、2017年1月には、Wellcome Trustも助成金を申請する際にプレプリントを受け入れるようになると発表した。2017年2月、アメリカ国立衛生研究所、Medical Research Council、Wellcome Trustを含む、科学者と資金提供団体からなる連合は、生命科学分野のプレプリントに向けたポータルサイトの提案を開始した。2017年2月、SciELOはプレプリントサーバー「SciELO Preprints」を設置する計画を発表した。2017年3月、アメリカ国立衛生研究所はプレプリントの投稿を奨励する新しいポリシーを発表した。2017年4月、Center for Open Scienceは、新たに6つのプレプリントアーカイブを立ち上げることを発表した。

ネイチャー誌は1996年にはプレプリントへの反対する立場をとっていたが、1997年に中立に転じ、2019年にはプレプリントの共有を推奨するようになった。

2020年には、プレプリントを公開する仕組みが生命科学分野でも活発になり、ネイチャー誌やサイエンス誌への影響が増大していると報道された。

2. 分野ごとのプレプリントサーバー
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2.1. 全般
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Authoreaは、研究者が論文の執筆、引用、共同執筆、ホスト、投稿に利用できる共同執筆プラットフォームとして、2012年に立ち上げられた。このサイトは、原稿をHTMLで表示する当時としては唯一のプレプリントサーバーであり、インタラクティブな図やホストされたデータが表示される。

PeerJ PrePrintsは、PeerJが運営する無料のプレプリントサーバーである。投稿された論文は基本的な審査を経て投稿されるが、査読は行われない。コメントは登録ユーザーであれば誰でも可能で、ダウンロードデータとページビューデータの取得も可能である。すべての論文はCC-BYライセンスで公開されており、2016年9月現在、2,439本の論文が公開されている。2019年9月3日、PeerJ PrePrintsは2019年9月30日をもって新規プレプリントの受付を停止することを発表した。

Zenodoは研究データのリポジトリであり、文書プレビューや投稿文書のDOIを提供していることから、プレプリントのリポジトリとしても利用されてきた。

MDPIは2016年に追加のプレプリントサーバーを立ち上げた。

Research Squareは、2018年にサービスを開始した無料のプレプリントサーバーである。論文はHTMLでレンダリングされ、登録せずにコメントをすることが可能。Research Squareには、参加ジャーナルで検討中の原稿をプレプリントとして投稿するオプトインサービス「In Review」もある。In Reviewには査読のタイムラインがあり、編集者がいつ指定されたか、いつ査読を受けたかなどの情報が公開されている。Research Squareは、ネイチャーリサーチがスポンサーとなっているプロトコルのオープンリポジトリであるProtocol Exchangeもホストしている。

Cambridge Open Engageは、ケンブリッジ大学出版局が提供するアーリーコンテンツプラットフォームで、研究者がコミュニティと連携し、初期の研究を素早く共有するためのスペースとリソースを提供できるように設計されている。査読は存在しないが、掲載前に編集作業が行われる。コンテンツのアップロードや閲覧は無料。Cambridge Open Engageのコンテンツは、主に分野を超えた研究コミュニティを対象としていて、学会や他大学の学部、研究センターなどの組織とも提携している。2019年8月には、アメリカ政治学会と共同開発したAPSA Preprintsが発表された。

2.2. 図書館情報学
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Eprints in Library and Information Science は2003年に開設された、ボランティアによって運営されている国際的なオープンアクセスリポジトリである。

LIS Scholarship Archive は、オーラル・ヒストリー、コミュニティワーク、コード、データ、原稿など、伝統的な学問の領域外で行われる作業を含む、図書館情報学および関連分野の人々によって作成されたすべての資料のためのオープンアクセスリポジトリとして2017年に開始された。LISSAはコミュニティのメンバーとCenter for Open Scienceによって運営されており、Open Science Frameworkを利用して資料を保管してる。

2.3. 物理学
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arXivは、最もよく知られたプレプリントサーバーの一つである。1991年に、ポール・ギンスパーグによってロスアラモス国立研究所で理論的な高エネルギー物理学のプレプリントを配布する目的で作成された。現在、高エネルギー物理学の分野においてarXivへプレプリントを投稿することは非常に一般的で、多くの査読付き学術雑誌ではarXivの電子出版番号を使って直接投稿できるようになっている。

物理学のいくつかの分野では、arXivが査読プロセスや査読付き学術雑誌に対する多くの批評の焦点となっている。1992年4月のPhysics Todayのコラムで、David MerminはGinspargの創造を「弦理論の科学への最大の貢献」と表現した。2016年現在、月に約8,000件のプレプリントがarXivにアップロードされている。

工学系プレプリントサーバーであるegrangXivは、Center for Open Scienceによって2016年に立ち上げられた。Wisconsin–Stout大学によって管理されていたプレビュー版では、電子メールによる一時的なデポジットシステムを使用していた。

viXraサーバーは、2009年、投稿フィルタリングによってarXivや他のリポジトリから論文が除外された研究者のために設立された。

2.4. 計算機科学
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原稿をプレプリントとして配布できるようになったことは、計算機科学における研究の普及方法に大きな影響を与えてきた。オープンアクセスの動きは主に、分散された研究内容の収集、グローバルな情報収集、OAIsterのような検索エンジンやゲートウェイを介した情報の集約などを推し進めた。こうして電子出版は、雑誌論文、学会発表、研究論文、学位論文など、あらゆる学術的または科学的な出版物に輪を広げるようになった。

2.5. 生物学
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生物学分野では、プレプリントの利用が物理学分野に比べて遅れている。arXivの成功を踏まえ、2013年にはコールド・スプリング・ハーバー研究所が運営するbioRxivが導入された。

2017年にはTherapoid PreprintとASAPbioが立ち上げられた。なお、2007年から2012年の間、Nature Publishing Groupは独自のプレプリントサーバーNature Precedingsを運営しており、原稿、ポスター、未発表の観察結果などが保管されていた。

2.6. 化学
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2016年にアメリカ化学会が主催するChemRxivが発表され、 2017年には、ChemRxivがfigshareによって運営されることになった。論文は、攻撃的および/または非科学的な内容について基本的なスクリーニングを受けるが、査読プロセスは受けない。2019年初頭、Beilstein-Institutは、Beilstein Journalsへの投稿を予定している著者に、ワンクリックでプレプリント版の原稿をBeilstein Archivesに公開するオプションを提供する意向を発表した。ここに掲載されるプレプリントは、Beilstein Journalsがカバーする分野、すなわち有機化学とナノテクノロジーに限定される。

2019年8月、アメリカ化学会は、英国化学会およびドイツ化学会