リガーゼ

リガーゼとはEC番号6群に属する酵素であり、ATPなど高エネルギー化合物の加水分解に共役して触媒作用を発現する特徴を持つ。英語の発音に従ってライゲースと表記される場合もある。リガーゼは別名としてシンテターゼと呼ばれる。日本語ではリガーゼを指して合成酵素と呼ぶことがあるが、合成酵素といった場合はEC6群のシンテターゼの他にEC4群のシンターゼを含むので留意が必要である。シンテターゼはATPなどの高エネルギー化合物分解と共役しているのに対して、シンターゼはリアーゼの一種であり高エネルギー化合物分解の共役は不要である。

1. 概要
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リガーゼには生合成経路上で重要な酵素が多く、代表的な酵素としては

各種アミノアシルtRNAシンテターゼ - ペプチド合成系
アシルコエンザイムAシンテターゼ - 脂肪酸合成系
アスパラギンシンテターゼ、グルタミンシンテターゼ - アミノ酸合成系などが挙げられる。

リガーゼの基質となる高エネルギー化合物はATPがほとんどであるが、GTPやNADなどもある。リガーゼはこれらの高エネルギー化合物と他の基質とがアデニル化，リン酸化，またはピロリン酸化された活性中間体を経由するとともに、加水分解により発生する自由エネルギー変化を駆動力にして触媒反応が生成側に進行する。

2. シンテターゼ
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リガーゼの常用命名法によりシンテターゼの語尾を持つ酵素が多い。すなわち、化合物XとYとをATP加水分解に共役して結合させる酵素は系統名ではX:Yリガーゼと命名されるが、常用名ではX-Yシンテターゼと命名される。例えばアシルコエンザイムAシンテターゼは脂肪酸〈アシル基〉とコエンザイムAとをATP分解のエネルギーを利用して合成する酵素である。

3. 一覧
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3.1. 6.1.-}} 
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3.1.1. 6.1.1.-}} 
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6.1.1.1}} チロシンtRNAリガーゼ
6.1.1.2}} トリプトファンtRNAリガーゼ
6.1.1.3}} トレオニンtRNAリガーゼ
6.1.1.4}} ロイシンtRNAリガーゼ
6.1.1.5}} イソロイシンtRNAリガーゼ
6.1.1.6}} リシンtRNAリガーゼ
6.1.1.7}} アラニンtRNAリガーゼ
6.1.1.8}} 欠番 → 削除
6.1.1.9}} バリンtRNAリガーゼ
6.1.1.10}} メチオニンtRNAリガーゼ
6.1.1.11}} セリンtRNAリガーゼ
6.1.1.12}} アスパラギン酸tRNAリガーゼ
6.1.1.13}} D-アラニン-ポリリガーゼ
6.1.1.14}} グリシンtRNAリガーゼ
6.1.1.15}} プロリンtRNAリガーゼ
6.1.1.16}} システインtRNAリガーゼ
6.1.1.17}} グルタミン酸tRNAリガーゼ
6.1.1.18}} グルタミンtRNAリガーゼ
6.1.1.19}} アルギニンtRNAリガーゼ
6.1.1.20}} フェニルアラニンtRNAリガーゼ
6.1.1.21}} ヒスチジンtRNAリガーゼ
6.1.1.22}} アスパラギンtRNAリガーゼ
6.1.1.23}} アスパラギン酸tRNAAsnリガーゼ
6.1.1.24}} グルタミン酸tRNAGlnリガーゼ
6.1.1.25}} リシンtRNAPylリガーゼ

3.1.2. 6.1.2.-}} 
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6.1.2.1}} D-アラニン--乳酸リガーゼ

3.2. 6.2.-}} 
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3.2.1. 6.2.1.-}} 
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6.2.1.1}} アセチルCoAシンテターゼ
6.2.1.2}} 酪酸—CoAリガーゼ
6.2.1.3}} アシルCoAシンテターゼ
6.2.1.4}} スクニシルCoAシンテターゼ
6.2.1.5}} コハク酸CoAリガーゼ 
6.2.1.6}} グルタル酸CoAリガーゼ
6.2.1.7}} コール酸CoAリガーゼ
6.2.1.8}} シュウ酸CoAリガーゼ
6.2.1.9}} マレイン酸CoAリガーゼ
6.2.1.10}} アシル酸CoAリガーゼ 
6.2.1.11}} ビオチンCoAリガーゼ
6.2.1.12}} 4-クマル酸CoAリガーゼ
6.2.1.13}} 酢酸CoAリガーゼ 
6.2.1.14}} 6-カルボキシヘキサン酸CoAリガーゼ
6.2.1.15}} アラキドン酸CoAリガーゼ
6.2.1.16}} アセト酢酸CoAリガーゼ
6.2.1.17}} プロピオン酸CoAリガーゼ
6.2.1.18}} クエン酸CoAリガーゼ
6.2.1.19}} 長鎖脂肪酸—ルシフェリン成分リガーゼ
6.2.1.20}} 長鎖脂肪酸—アシル輸送タンパク質リガーゼ
6.2.1.21}} 欠番 →
6.2.1.22}} クエン酸 -リシンリガーゼ
6.2.1.23}} ジカルボン酸CoAリガーゼ
6.2.1.24}} フィタン酸CoAリガーゼ
6.2.1.25}} 安息香酸CoAリガーゼ
6.2.1.26}} o-スクシニル安息香酸CoAリガーゼ
6.2.1.27}} 4-ヒドロキシ安息香酸CoAリガーゼ
6.2.1.28}} 3α,7α-ジヒドロキシ-5β-コレスタン酸CoAリガーゼ
6.2.1.29}} 欠番 →
6.2.1.30}} フェニル酢酸CoAリガーゼ
6.2.1.31}} 2-フロ酸CoAリガーゼ
6.2.1.32}} アントラニル酸CoAリガーゼ
6.2.1.33}} 4-クロロ安息香酸CoAリガーゼ
6.2.1.34}} trans-フェルロイルCoAシンターゼ

3.3. 6.3.-}} 
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3.3.1. 6.3.1.-}} 
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6.3.1.1}} アスパラギンシンテターゼ
6.3.1.2}} グルタミンシンテターゼ
6.3.1.3}} 欠番 →
6.3.1.4}} アスパラギン酸-アンモニアリガーゼ 
6.3.1.5}} NAD+合成酵素
6.3.1.6}} グルタミン酸—エチルアミンリガーゼ
6.3.1.7}} 4-メチレングルタミン酸—アンモニアリガーゼ
6.3.1.8}} グルタチオニルスペルミジン合成酵素
6.3.1.9}} トリパノチオン合成酵素
6.3.1.10}} アデノシルコバラミンリン酸合成酵素
6.3.1.11}} グルタミン酸—プトレシンリガーゼ
6.3.1.12}} D-アスパラギン酸リガーゼ

3.3.2. 6.3.2.-}} 
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6.3.2.1}} パントテン酸—β-アラニンリガーゼ
6.3.2.2}} グルタミン酸—システインリガーゼ
6.3.2.3}} グルタチオン合成酵素
6.3.2.4}} D-アラニン—D-アラニンリガーゼ
6.3.2.5}} ホスホパントテノイルシステインシンテターゼ
6.3.2.6}} ホスホリボシルアミノイミダゾールコハク酸アミド合成酵素
6.3.2.7}} UDP-N-アセチルムラミン酸-L-アラニン-D-グルタミン酸—L-リジンリガーゼ
6.3.2.8}} UDP-N-アセチルムラミン酸—L-アラニンリガーゼ
6.3.2.9}} UDP-N-アセチルムラミン酸アラニン—D-グルタミン酸リガーゼ
6.3.2.10}} UDP-N-アセチルムラミン酸アラニン-トリペプチド—D-アラニン-D-アラニンリガーゼ
6.3.2.11}} カルノシン合成酵素
6.3.2.12}} ジヒドロ葉酸合成酵素
6.3.2.13}} UDP-N-アセチルムラミン酸アラニン-D-グルタミン酸—2,6-ジアミノピメリン酸リガーゼ
6.3.2.14}} 2,3-ジヒドロキシ安息香酸—セリンリガーゼ
6.3.2.15}} 欠番 →
6.3.2.16}} D-アラニン—アラニン-ポリグリセロリン酸リガーゼ
6.3.2.17}} テトラヒドロ葉酸合成酵素
6.3.2.18}} γ-クルタミンヒスタミン合成酵素
6.3.2.19}} ユビキチンタンパク質リガーゼ
6.3.2.20}} インドール酢酸—リジン合成酵素
6.3.2.21}} ユビキチン—カルモジュリンリガーゼ
6.3.2.22}} ジフチン—アンモニアリガーゼ
6.3.2.23}} ホモグルタチオン合成酵素
6.3.2.24}} チロシンアルギニンリガーゼ
6.3.2.25}} チューブリン—チロシンリガーゼ
6.3.2.26}} N--L-システイン-D-バリン合成酵素
6.3.2.27}} アエロバクチン合成酵素
6.3.2.28}} L-アミノ酸αリガーゼ

3.3.3. 6.3.3.-}} 
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6.3.3.1}} ホスホリボシルホルミルグリシンアミジンシクロリガーゼ
6.3.3.2}} 5-ホルミルテトラヒドロ葉酸シクロリガーゼ
6.3.3.3}} デチオビオチン合成酵素
6.3.3.4}} カルボキシエチルアルギニンβ-ラクタム合成酵素

3.3.4. 6.3.4.-}} 
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6.3.4.1}} 欠番 → 6.3.5.2}}に統合
6.3.4.2}} CTP合成酵素
6.3.4.3}} ギ酸—テトラヒドロ葉酸リガーゼ
6.3.4.4}} アデノシンコハク酸合成酵素
6.3.4.5}} アルギノコハク酸シンターゼ
6.3.4.6}} 尿素カルボキシラーゼ
6.3.4.7}} リボース-5-リン酸—アンモニアリガーゼ
6.3.4.8}} イミダゾ酢酸—ホスホリボシル二リン酸リガーゼ
6.3.4.9}} ビオチン—メチルマロン酸CoA-炭酸転位酵素 リガーゼ
6.3.4.10}} ビオチン—プロピオン酸CoA-カルボキシラーゼ リガーゼ 
6.3.4.11}} ビオチン—メチルクロトン酸CoAカルボキシラーゼ リガーゼ
6.3.4.12}} グルタミン酸—メチルアミンリガーゼ
6.3.4.13}} ホスホリボシルアミン—グリシンリガーゼ
6.3.4.14}} ビオチンカルボキシラーゼ
6.3.4.15}} ビオチン—アセチルCoAカルボキシラーゼ リガーゼ
6.3.4.16}} カルバモイルリン酸シンターゼ
6.3.4.17}} ギ酸—ジヒドロ葉酸リガーゼ
6.3.4.18}} 5-イミダゾールリボヌクレオチド合成酵素

3.3.5. 6.3.5.-}} 
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6.3.5.1}} NADシンテターゼ
6.3.5.2}} GMPシンターゼ 
6.3.5.3}} ホスホリボシルホルミルグリシンアミジン合成酵素
6.3.5.4}} アスパラギン合成酵素 
6.3.5.5}} カルバミン酸リン酸合成酵素 
6.3.5.6}} アスパラギン酸tRNA合成酵素 
6.3.5.7}} グルタミン酸tRNA合成酵素 
6.3.5.8}} 欠番 →
6.3.5.9}} ヒドロゲノビリニック酸-a,c-ジアミドシンターゼ
6.3.5.10}} アデノシンコブリック酸合成酵素 

3.4. 6.4.-}} 
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6.4.1.1}} ピルビン酸カルボキシラーゼ
6.4.1.2}} アセチルCoAカルボキシラーゼ
6.4.1.3}} プロピオニルCoAカルボキシラーゼ
6.4.1.4}} メチルクロトン酸CoAカルボキシラーゼ
6.4.1.5}} ゲラノイルCoAカルボキシラーゼ
6.4.1.6}} アセトンカルボキシラーゼ
6.4.1.7}} 2-オキソグルタル酸カルボキシラーゼ

3.5. 6.5.-}} 
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6.5.1.1}} DNAリガーゼ
6.5.1.2}} DNAリガーゼ
6.5.1.3}} RNAリガーゼ
6.5.1.4}} RNA-3'-リン酸シクラーゼ

3.6. 6.6.-}} 
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3.6.1. 6.6.1}} 
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6.6.1.1}} マグネシウムキラターゼ
6.6.1.2}} コバルトキラターゼ

4. 出典
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5. 関連項目
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酵素
EC番号

6. 外部リンク
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