植物天然記念物一覧

植物天然記念物一覧は、日本の文部科学大臣が指定した天然記念物のリスト。天然記念物指定基準「植物」に基づき指定された植物の個体・自生地・群落、原始林、並木などを掲載する。なお、本項では文化財保護法に基づき国が指定した天然記念物を対象とし、地方自治体指定の天然記念物は対象外とする。

1. 特別天然記念物
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マリモ
阿寒湖のマリモ
ソテツ
都井岬ソテツ自生地
鹿児島県のソテツ自生地
スギ
羽黒山のスギ並木
日光杉並木街道 附 並木寄進碑
石徹白のスギ
杉の大スギ
屋久島スギ原始林
イチイ
大山のダイセンキャラボク純林 - ダイセンキャラボクはイチイの変種
イブキ
宝生院のシンパク
クスノキ
加茂の大クス
立花山クスノキ原始林
蒲生のクス
サクラソウ
田島ケ原サクラソウ自生地
サクラ
大島のサクラ株
狩宿の下馬ザクラ
ケヤキ
東根の大ケヤキ - 樹齢1500年
フジ
牛島のフジ
アイラトビカズラ
相良のアイラトビカズラ
メヒルギ
喜入のリュウキュウコウガイ産地
ヤッコソウ
内海のヤッコソウ発生地
ツゲ
古処山ツゲ原始林
コウシンソウ
コウシンソウ自生地
植物群落
アポイ岳高山植物群落
野幌原始林
早池峰山及び薬師岳の高山帯・森林植物群落
春日山原始林
青島亜熱帯性植物群落
枇榔島亜熱帯性植物群落
白馬連山高山植物帯

2. 天然記念物
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2.1. 藻類
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テングノムギメシ
テングノムギメシ産地
スイゼンジノリ
スイゼンジノリ発生地
ヒカリモ
竹岡のヒカリモ発生地
シラタマモ
出羽島大池のシラタマモ自生地
クロキズタ
クロキヅタ産地
オキチモズク
オキチモズク発生地
土黒川のオキチモズク発生地
志津川のオキチモズク発生地
チスジノリ
菊池川のチスジノリ発生地
川内川のチスジノリ発生地
シマチスジノリ
識名園のシマチスジノリ発生地

2.2. コケ植物
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ミズスギゴケ
猪苗代湖ミズスギゴケ群落
ヒカリゴケ
吉見百穴ヒカリゴケ発生地 - 関東平野での自生
江戸城跡のヒカリゴケ生育地
岩村田ヒカリゴケ産地
チャツボミゴケ
六合チャツボミゴケ生物群集の鉄鉱生成地

2.3. シダ植物
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カネコシダ
黒髪山カネコシダ自生地
ヘゴ
ヘゴ自生北限地帯
クサマルハチ
八束のクサマルハチ自生地
ユノミネシダ
ユノミネシダ自生地
ナチシダ
ナチシダ自生北限地

2.4. 種子植物
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2.4.1. 裸子植物
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ソテツ
常神のソテツ
新町の大ソテツ
能満寺のソテツ
龍華寺のソテツ
妙国寺のソテツ - 樹齢1000年
日御碕の大ソテツ
誓願寺のソテツ
広沢寺のソテツ
大野下の大ソテツ
松屋寺のソテツ
イチョウ
法量のイチョウ - 樹齢1000年
北金ヶ沢のイチョウ
実相寺のイチョウ
長泉寺の大イチョウ
雨乞のイチョウ
苦竹のイチョウ
千本イチョウ
善福寺のイチョウ
上日寺のイチョウ
飛騨国分寺の大イチョウ
菩提寺のイチョウ
龍蔵寺のイチョウ
乳保神社のイチョウ
平石の乳イチョウ
有田のイチョウ
下の城のイチョウ
下田のイチョウ
下野八幡宮のイチョウ
田原のイチョウ
去川のイチョウ
オハツキイチョウ
早田のオハツキイチョウ
白旗山八幡宮のオハツキイチョウ
杉森神社のオハツキイチョウ
上沢寺のオハツキイチョウ
八木沢のオハツキイチョウ
本国寺のオハツキイチョウ
了徳寺のオハツキイチョウ
マツ
華蔵寺の宝珠マツ
善養寺影向のマツ
御油のマツ並木
遊龍松
リュウキュウマツ
久米の五枝のマツ
伊平屋島の念頭平松
ゴヨウマツ
幌満ゴヨウマツ自生地
鶉川ゴヨウマツ自生北限地帯
ウツクシマツ
平松のウツクシマツ自生地
ナギ
牛久保のナギ
春日神社境内ナギ樹林
熊野速玉神社のナギ
小郡町ナギ自生北限地帯
コウヤマキ
祗劫寺のコウヤマキ
甘泉寺のコウヤマキ
ヒノキアスナロ
ヒノキアスナロおよびアオトドマツ自生地
ヒノキ
大久保の大ヒノキ
サワラ
沢尻の大ヒノキ
イブキ
いぶき山イブキ樹叢
城願寺のビャクシン
古長禅寺のビャクシン - 樹齢600年
大瀬崎のビャクシン樹林
恩徳寺の結びイブキ
法泉寺のシンパク
下柏の大柏
八幡神社のイブキ
北吉井のビャクシン
モミ
垂洞のシダレモミ
追手神社のモミ - 日本最大のモミ、樹齢400年
アオトドマツ
ヒノキアスナロおよびアオトドマツ自生地
トガサワラ
三ノ公川トガサワラ原始林
アカエゾマツ
早池峰山のアカエゾマツ自生南限地
ハリモミ
山中のハリモミ純林
スギ
桃洞・佐渡のスギ原生林
羽黒山の爺スギ
熊野神社の大スギ
山五十川の玉スギ
諏訪神社の翁スギ媼スギ
杉沢の大スギ
木幡の大スギ
安良川の爺スギ
逆スギ
安中原市のスギ並木
榛名神社の矢立スギ - 樹齢1000年
清澄の大スギ
箒スギ - 樹齢2000年
将軍スギ
虫川の大スギ
天神社の大スギ
杉沢の沢スギ
栢野の大スギ
八幡神社の大スギ
御仏供スギ
精進の大スギ
月瀬の大スギ
加子母のスギ
久津八幡神社の夫婦スギ
禅昌寺の大スギ
神ノ御杖スギ
神渕神社の大スギ
千光寺の五本スギ
大山の大スギ
智満寺の十本スギ
杉本の貞観スギ
八ツ房スギ
玉若酢命神社の八百スギ
大玉スギ
平川の大スギ
天神の大スギ
英彦山の鬼スギ
女夫木の大スギ
阿弥陀スギ
金比羅スギ
大杵社の大スギ
狭野のスギ並木
八村スギ
イチイ
治郎兵衛のイチイ
船通山のイチイ
カヤ
東昌寺のマルミガヤ
横室の大カヤ - 樹齢1000年
与野の大カヤ - 樹齢1000年
田上村ツナギガヤ自生地
了玄庵のツナギガヤ
北浜の大カヤノキ
名古屋城のカヤ
果号寺のシブナシガヤ
高倉神社のシブナシガヤ
コツブガヤ
小原のコツブガヤ
庫蔵寺のコツブガヤ
ハダカガヤ
日置のハダカガヤ - 樹齢600年
ヒダリマキガヤ
小原のヒダリマキガヤ
熊野のヒダリマキガヤ
建屋のヒダリマキガヤ - 樹齢800年、日本最大のヒダリマキガヤ

2.4.2. 被子植物・双子葉類
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カワゴケソウ科
志布志のカワゴケソウ科植物生育地
ヤクシマカワゴロモ生育地
オオヨドカワゴロモ自生地
オオヤマレンゲ
オオヤマレンゲ自生地
シデコブシ
椛のシデコブシ自生地
田光のシデコブシ及び湿地植物群落
オガタマノキ
小長井のオガタマノキ
永利のオガタマノキ
クスノキ
神崎の大クス
阿豆佐和気神社の大クス
葛見神社の大クス - 樹齢1000年
杉桙別命神社の大クス
清田の大クス
薫蓋クス
川棚のクスの森
新居浜一宮神社のクスノキ群
大山祇神社のクスノキ群
大谷のクス
新舟小屋のクスノキ林
太宰府神社のクス
湯蓋の森衣掛の森
本庄のクス
川古のクス
藤崎台のクスノキ群
柞原八幡宮のクス
瓜生野八幡のクスノキ群
高鍋のクス
妻のクス
上穂北のクス
清武の大クス
東郷のクス
志布志の大クス - 樹齢1000年
塚崎のクス
タブノキ
府馬の大クス - 指定名はクスであるが実際の樹種はタブノキ
ハスノハギリ
平久保安良のハスノハギリ群落
オニバス
十二町潟オニバス発生地
カザグルマ
カザグルマ自生地
ナンテン
川上のユズおよびナンテン自生地
カツラ
シダレカツラ
赤津のカツラ
糸井の大カツラ
海潮のカツラ
竹崎のカツラ
鎮西村のカツラ
下合瀬の大カツラ
イスノキ
八幡神社のイスノキ
エノキ
東内のシダレエノキ
赤羽根大師のエノキ
ムクノキ
椋本の大ムク
二見の大ムク
アコウ
三崎のアコウ
松尾のアコウ自生地
高串アコウ自生北限地帯
奈良尾のアコウ
内海のアコウ
ガジュマル
名護のひんぷんガジュマル
ヤマグワ
薄根の大クワ - 樹齢1500年
羽吉の大クワ
ヤマモモ
蓮着寺のヤマモモ
アカシデ
幸神神社のシダレアカシデ
テングシデ
大朝のテングシデ群落
ブナ
歌才ブナ自生北限地帯
和泉葛城山ブナ林
比婆山のブナ純林
イヌブナ
平糠のイヌブナ自然林
尚仁沢上流部イヌブナ自然林
ウバメガシ
伊平屋島のウバメガシ群落
カシワ
勝源院の逆ガシワ
イチイガシ
大村のイチイガシ天然林
ハナガガシ
堅田郷八幡社のハナガガシ林
オキナワウラジロガシ
大和浜のオキナワウラジロガシ林
ミズナラ
小黒川のミズナラ
アベマキ
口大屋の大アベマキ - 樹齢400年
ツブラジイ
称名寺のシイノキ
スダジイ
シイノキ山のシイノキ群叢
堂形のシイノキ
神明社の大シイ
伯耆の大シイ
クリ
カズグリ自生地
小野のシダレグリ自生地
西内のシダレグリ自生地
竹原のシダレグリ自生地
ツバキ
ツバキ自生北限地帯
サザンカ
千石山サザンカ自生北限地帯
チャノキ
嬉野の大チャノキ
サカキ
松上神社のサカキ樹林
ホルトノキ
竹野のホルトノキ
アオギリ
伊古奈比咩命神社のアオギリ自生地
サキシマスオウノキ
古見のサキシマスオウノキ群落
ンタナーラのサキシマスオウノキ群落
ハマボウ
万之瀬川河口域のハマボウ群落及び干潟生物群集
ムジナモ
宝蔵寺沼ムジナモ自生地
コケモモ
九重山のコケモモ群落
サカイツツジ
落石岬のサカイツツジ自生地
シロヤシオ
京丸のアカヤシオおよびシロヤシオ群生地
アカヤシオ
京丸のアカヤシオおよびシロヤシオ群生地
レンゲツツジ
湯の丸レンゲツツジ群落
躑躅原のレンゲツツジ及びフジザクラ群落
ヤマツツジ
美森の大ヤマツツジ
オンツツジ
船窪のオンツツジ群落
コメツツジ
三嶺・天狗塚のミヤマクマザサ及びコメツツジ群落
ツクシシャクナゲ
多良岳ツクシシャクナゲ群叢
犬ヶ岳ツクシシャクナゲ自生地
ホンシャクナゲ
一之瀬のホンシャクナゲ群落
鎌掛谷ホンシャクナゲ群落
アズマシャクナゲ
花山のアズマシャクナゲ自生北限地帯
草津白根のアズマシャクナゲおよびハクサンシャクナゲ群落
ハクサンシャクナゲ
吾妻山ヤエハクサンシャクナゲ自生地
草津白根のアズマシャクナゲおよびハクサンシャクナゲ群落
キバナシャクナゲ
八ヶ岳キバナシャクナゲ自生地
ミヤマキリシマ
池の原ミヤマキリシマ群落
大船山のミヤマキリシマ群落
シロドウダン
地獄地帯シロドウダン群落
ツガザクラ
銅山峰のツガザクラ群落
ツルマンリョウ
丹生川上中社のツルマンリョウ自生地
出雲神社ツルマンリョウ自生地
ハマナス
ハマナス自生南限地帯
ノカイドウ
ノカイドウ自生地
ヤマナシ
月潟の類産ナシ
アイナシ
西阿倉川アイナシ自生地
イヌナシ
東阿倉川イヌナシ自生地
多度のイヌナシ自生地
シナナシ
安下庄のシナナシ
ウメ
朝鮮ウメ
余田臥龍梅
高岡の月知梅
湯ノ宮の座論梅
藤川天神の臥龍梅
サクラ
盛岡石割ザクラ
龍谷寺のモリオカシダレ
鹽竈神社の鹽竈ザクラ
角館のシダレザクラ
伊佐沢の久保ザクラ
草岡の大明神ザクラ
南谷のカスミザクラ
三春滝ザクラ
馬場ザクラ
桜川のサクラ
大戸のサクラ
金剛ザクラ
三波川
石戸蒲ザクラ
極楽寺の野中ザクラ
小山田ヒガンザクラ樹林
小木の御所ザクラ
橡平サクラ樹林
梅護寺の珠数掛ザクラ
松月寺のサクラ
山高神代ザクラ
躑躅原のレンゲツツジ及びフジザクラ群落
素桜神社の神代ザクラ
霞間ヶ渓
臥龍のサクラ
根尾谷淡墨ザクラ
中将姫誓願ザクラ
揖斐二度ザクラ
木曽川堤
白子不断ザクラ
常照寺の九重ザクラ
樽見の大ザクラ
知足院ナラノヤエザクラ
三隅大平ザクラ
大村神社のオオムラザクラ
ヒガンザクラ自生南限地 - 栗野岳
荒川のカンヒザクラ自生地
バクチノキ
早川のビランジュ
ケヤキ
文下のケヤキ
高瀬の大木
原町の大ケヤキ - 樹齢1000年
御岳の神代ケヤキ
馬場大門のケヤキ並木
練馬白山神社の大ケヤキ
鵜川神社の大ケヤキ
専福寺の大ケヤキ
根古屋神社の大ケヤキ
三恵の大ケヤキ - 樹齢1000年
上野原の大ケヤキ
野間の大ケヤキ
八代の大ケヤキ - 樹齢1600年
竹の熊の大ケヤキ
下野八幡宮のケヤキ
ヤエヤマシタン
平久保のヤエヤマシタン
フジ
藤島のフジ
滝前不動のフジ - 樹齢400年
山ノ神のフジ - 樹齢200年
熊野の長フジ
黒木のフジ
宮崎神社のオオシラフジ
オヒルギ
大池のオヒルギ群落
キイレツチトリモチ
キイレツチトリモチ自生北限地
キイレツチトリモチ産地
ヤッコソウ
鈴が峯のヤッコソウ発生地
ヤッコソウ発生地
イヌツゲ
野岳イヌツゲ群落
ツゲ
黄柳野ツゲ自生地
アカギ
首里金城の大アカギ
ヨコグラノキ
ヨコグラノキ北限地帯
トチノキ
脇谷のトチノキ
太田の大トチノキ
畑上の大トチノキ - 樹齢500年
熊野の大トチ
カエデ
中釜戸のシダレモミジ
ヤマモミジ
万徳寺のヤマモミジ
楓谷のヤマモミジ樹林
ハナノキ
新野のハナノキ自生地
越原ハナノキ自生地
釜戸ハナノキ自生地
坂本のハナノキ自生地
白山神社のハナノキおよびヒトツバタゴ
富田ハナノキ自生地
川宇連ハナノキ自生地
南花沢のハナノキ
北花沢のハナノキ
センダン
野神の大センダン
琴平町の大センダン
ミカン
尾崎小ミカン先祖木
ユズ
川上のユズおよびナンテン自生地
タチバナ
甲原松尾山のタチバナ群落
コウライタチバナ
笠山コウライタチバナ自生地
ナツミカン
大日比ナツミカン原樹
ヒロハチシャノキ
仁井田のヒロハチシャノキ
太宰府神社のヒロハチシャノキ
キンモクセイ
永明寺のキンモクセイ
華蔵寺のキンモクセイ
三島神社のキンモクセイ
往至森寺のキンモクセイ
麻生原のキンモクセイ
古江のキンモクセイ
ヒトツバタゴ
白山神社のハナノキおよびヒトツバタゴ
鰐浦ヒトツバタゴ自生地
ヒトツバタゴ自生地
シシンラン
シシンラン群落
クチナシ
立田山ヤエクチナシ自生地

2.4.3. 被子植物・単子葉類
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ビロウ
高島のビロウ自生地
ニッパヤシ
船浦のニッパヤシ群落
ヤエヤマヤシ
米原のヤエヤマヤシ群落
ウブンドルのヤエヤマヤシ群落
マダケ
敷島のキンメイチク
篠原のキンメイチク
龍野のカタシボ竹林
久喜宮のキンメイチク
ハチク
鳥屋野逆ダケの藪
トラフダケ
トラフダケ自生地
本谷のトラフダケ自生地
モウソウチク
高良山のモウソウキンメイチク林
祝子川モウソウキンメイ竹林
ミヤマクマザサ
三嶺・天狗塚のミヤマクマザサ及びコメツツジ群落
スズラン
向淵スズラン群落
吐山スズラン群落
サクライソウ
久々利のサクライソウ自生地
カキツバタ
小堤西池のカキツバタ群落
大田ノ沢のカキツバタ群落
唐川のカキツバタ群落
ノハナショウブ - 指定名称では//ハナショウブ//となっているが、すべて原種の//ノハナショウブ//の自生地である。
花輪堤ハナショウブ群落
斎宮のハナショウブ群落
栗野町ハナショウブ自生南限地帯 - 日本のノハナショウブ自生地の南限といわれている。
エヒメアヤメ
沼田西のエヒメアヤメ自生南限地帯
小串エヒメアヤメ自生南限地帯
エヒメアヤメ自生南限地帯
タヌキノショクダイ
沢谷のタヌキノショクダイ発生地
ムカデラン
不動院ムカデラン群落

2.5. 植物群落など
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オンネトー湯の滝マンガン酸化物生成地 - 藻類などの集合体も含め指定されている。
円山原始林
藻岩原始林
後方羊蹄山の高山植物帯
女満別湿生植物群落
焼尻の自然林
登別原始林
霧多布泥炭形成植物群落
夕張岳の高山植物群落および蛇紋岩メランジュ帯
礼文島桃岩一帯の高山植物群落
縫道石山・縫道石の特殊植物群落
平糠のイヌブナ自然林
岩手山高山植物帯
青葉山 - 東北大学植物園内のモミ原生林。
椿島暖地性植物群落
八景島暖地性植物群落
芝谷地湿原植物群落
長走風穴高山植物群落
秋田駒ヶ岳高山植物帯
鳥海山獅子ヶ鼻湿原植物群落及び新山溶岩流末端崖と湧水群
三瀬気比神社社叢
駒止湿原
赤井谷地沼野植物群落
中山風穴地特殊植物群落
雄国沼湿原植物群落
尚仁沢上流部イヌブナ自然林
武甲山石灰岩地特殊植物群落
平林寺境内林
笠森寺自然林
成東・東金食虫植物群落
太東海浜植物群落
旧白金御料地
三宝寺池沼沢植物群落
大島海浜植物群落
山神の樹叢
箱根仙石原湿原植物群落
宮川神社社叢
能生白山神社社叢
筥堅八幡宮社叢
宮崎鹿島樹叢
気多神社社叢
鹿島の森
須須神社社叢
蒼島暖地性植物群落
富士山原始林及び青木ヶ原樹海
霧ヶ峰湿原植物群落
一位森八幡神社社叢
八幡野八幡宮・来宮神社社叢
羽豆神社の社叢
宮山原始林
石巻山石灰岩地植物群落
八百富神社社叢
鳳来寺山
葦毛湿原
鬼ヶ城暖地性シダ群落
細谷暖地性シダ群落
金生水沼沢植物群落
九木神社樹叢
須賀利大池及び小池
御池沼沢植物群落
大島暖地性植物群落
田光のシデコブシ及び湿地植物群落
伊吹山頂草原植物群落
深泥池生物群集
生島樹林
室生山暖地性シダ群落
仏経嶽原始林
妹山樹叢
与喜山暖帯林
稲積島暖地性植物群落
江須崎暖地性植物群落
新宮藺沢浮島植物群落
神島
那智原始林
倉田八幡宮社叢
大野見宿禰命神社社叢
白兎神社樹叢
鳥取砂丘
波波伎神社社叢
高尾暖地性濶葉樹林
三瓶山自然林
鯉ヶ窪湿生植物群落
忠海八幡神社社叢
瀰山原始林
峨嵋山樹林
干珠樹林
満珠樹林
指月山
津島暖地性植物群落
弁天島熱帯性植物群落
皇子神社社叢
象頭山
菅生神社社叢
天川神社社叢
伊尾木洞のシダ群落
室戸岬亜熱帯性樹林及び海岸植物群落
隠家森
沖の島原始林
岩戸山樹叢
原生沼沼野植物群落
普賢岳紅葉樹林
御橋観音シダ植物群落
黒子島原始林
平戸礫岩の岩石地植物群落
洲藻白岳原始林
龍良山原始林
辰の島海浜植物群落
奈留島権現山樹叢
諫早市城山暖地性樹叢
阿蘇北向谷原始林
宇佐神宮社叢
虚空蔵島の亜熱帯林
甑岳針葉樹林
石波の海岸樹林
川南湿原植物群落
城山
藺牟田池の泥炭形成植物群落
甑島長目の浜及び潟湖群の植物群落
薩摩黒島の森林植物群落
宝島女神山の森林植物群落
種子島国上湊川・阿嶽川のマングローブ林
喜界島の隆起サンゴ礁上植物群落
徳之島明眼の森
安波のタナガーグムイの植物群落
宮良川のヒルギ林
久高島の海岸植物群落
慶佐次湾のヒルギ林
諸志御嶽の植物群落
長幕崖壁および崖錐の特殊植物群落
田港御願の植物群落
南大東島東海岸植物群落

3. 過去に指定されていた天然記念物
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根岸御行松 - クロマツ。大正15年指定、のち枯死、昭和3年指定解除。
二十世紀梨原木 - 昭和10年指定。昭和22年枯死。
悲恋駒止桜 - 昭和19年指定。昭和20年台風被害で倒壊、昭和23年指定解除。
馬宮村桜草自生地 - 昭和9年5月指定。戦後の食糧難に伴う開墾により消滅。昭和27年10月指定解除。
開成山の桜 - 彼岸桜、山桜、染井吉野など。昭和9年5月1日指定。スポーツ施設建設のため昭和35年9月17日指定解除。
緩木神社の松 - クロマツ。昭和12年指定、のち枯死。昭和51年3月12日指定解除。
銀杏岡のイチョウ - 昭和6年指定。台風による大きな被害を受けたため昭和48年4月6日指定解除。
関の五本マツ - クロマツ。昭和18年指定。度重なる倒木で残り1本となったため昭和46年10月8日指定解除。
佐賀の夫婦松 - アカマツとクロマツの連理。昭和5年11月指定。昭和49年マツ材線虫病により枯死。昭和51年指定解除。
千手のマツ - 大正15年指定。昭和52年枯死、指定解除。
塩山の大ブドウ - 　昭和28年11月14日指定。枯死により昭和52年7月28日指定解除。
北般若の毘沙門スギ - 大正13年指定。昭和54年9月台風により倒壊し、同月内に指定解除。
上人マツ - クロマツ。昭和35年指定。枯死、昭和52年3月15日指定解除。
宇谷の連理根上りマツおよび根上りマツ - クロマツ。昭和18年指定。枯死、昭和55年4月3日指定解除。
小原のサイカチ - 昭和17年7月21日指定。枯死により昭和56年5月11日指定解除。
神明宮の大スギ - 昭和19年6月26日指定。枯死により昭和56年7月8日指定解除。
与力マツ - クロマツ。昭和22年2月23日指定。マツ材線虫病により昭和56年7月8日指定解除。
下野の女夫マツ - アカマツの連理木。昭和6年7月31日指定。枯死により昭和63年指定解除。
天蓋松 - 樹齢630年。平成4年頃マツ材線虫病により枯死した。
松之山の大ケヤキ - 樹齢1900-2000年。枯死のため平成8年に伐採。
利賀のトチノキ - 平成10年に枯死により伐採。
高津連理の松 - マツ材線虫病により枯死。平成10年1月指定解除。
手野のスギ - 平成3年9月、台風により折損。平成12年5月19日指定解除。
鳴門の根上りマツ - 平成11年、最後の一本が枯死。平成12年5月19日指定解除。
小浜神社の九本ダモ - 平成15年枯死。平成16年5月21日指定解除。
甲西の大カシワ - 昭和58年12月15日指定。台風により倒壊し平成18年指定解除。
万休院の舞鶴マツ - 平成19年9月にマツ材線虫病により枯死。平成20年7月28日指定解除。
タチバナ - 枯死、消滅により平成20年7月28日指定解除。
共和のカシの森 - 平成20年2月主幹折損。平成21年7月23日指定解除。
淡路国道マツ並木 - 1980年代に滅失。平成22年8月5日指定解除。

4. 第二類として指定されていたもの
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戦前の史蹟名勝天然紀念物保存法においては、「第一類」と「第二類」とに分けて指定することとなっていた。しかし第二類として指定されていた天然記念物のほとんどが、1956年1月23日に一斉に指定を解除された。

4.1. 1956年に指定を解除されたもの
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下記の天然記念物は、1956年1月23日に一斉に指定を解除された。★マークは現在都道府県から指定を受けているもの、△マークは現在市町村から指定を受けているもの。

山岸のカキツバタ群落昭和11年指定。★
大善寺の藤昭和9年指定。★
向ヶ岡公園の桜昭和11年指定。★
大木原の桜昭和11年指定。
南郷の太郎杉昭和13年指定。
富田のケヤキ昭和16年指定。
高崎公園のハクモクレン昭和11年指定。★
万蔵寺の御葉附イチョウ昭和23年指定。★
鬼子母神のイチョウ昭和5年指定。★
芝東照宮のイチョウ昭和5年指定。★
安藤稲荷跡のイチョウ昭和9年指定。
旧海軍大学正門前のシイ昭和10年指定。
東京美術学校門内のシイ昭和10年指定。
上野恩賜公園二本杉原のシイ昭和10年指定。
旧蓬莱園のイチョウ昭和14年指定。★
浅草公園のイチョウ昭和23年指定。
中村の大杉昭和4年指定。★
貝屋の御葉附イチョウ昭和5年指定。★
坊金の大杉昭和11年指定。★
村雨の松昭和18年指定。★
神明のケヤキ昭和18年指定。
岩村田の相生松昭和10年指定。
湯福神社のケヤキ昭和23年指定。△
八柱神社の大樟昭和13年指定。★
新熊野神社の樟昭和7年指定。△
才ノ神ノ藤昭和9年指定。★
芦屋の松昭和9年指定。
八郷の藤昭和9年指定。
松江藩道津田松並木昭和12年指定。
竹崎の石割ケヤキ昭和18年指定。
大本神社跡の樟昭和18年指定。★
サンバカタの松昭和18年指定。
花岡のシンパク昭和13年指定。△
正福寺のカイヅカ昭和15年指定。★
佐川の大樟昭和18年指定。★
小城の樟昭和3年指定。
妙見の樟昭和15年指定。△
川辺の大樟昭和16年指定。★

4.2. 1956年以前に指定を解除されたもの
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浅草公園の公孫樹昭和15年指定。昭和25年指定解除。
戸塚ノ一本松昭和12年指定。昭和23年指定解除。
祇園の枝垂桜昭和12年指定。昭和25年指定解除。
国泰寺ノ樟昭和3年指定。昭和23年指定解除。

4.3. 1956年以降に指定を解除されたもの
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山口のセンダン昭和16年指定。昭和40年指定解除。

5. 脚注
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6. 参考文献
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加藤陸奥雄ら監修 『日本の天然記念物』 講談社、1995年、ISBN 4-06-180589-4
沼田眞編集 『日本の天然記念物5 植物III』講談社、1984年。ISBN 4-06-180585-1
文化庁文化財保護部監修『天然記念物事典』 第一法規出版、1981年。
文化庁編集 『史跡 名勝 天然記念物指定目録』 第一法規出版、1984年。

7. 関連項目
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天然記念物
レッドリスト

8. 外部リンク
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