Ａｎａｓ　ｆｏｒｍｏｓａ（トモエガモ）
（三）　ねったいちょう目
ねったいちょう科
Ｐｈａｅｔｈｏｎ　ｒｕｂｒｉｃａｕｄａ　ｒｏｔｈｓｃｈｉｌｄｉ（アカオネッタイチョウ）
（四）　はと目
はと科
Ｃｏｌｕｍｂａ　ｊａｎｔｈｉｎａ　ｎｉｔｅｎｓ（アカガシラカラスバト）
Ｃｏｌｕｍｂａ　ｊａｎｔｈｉｎａ　ｓｔｅｊｎｅｇｅｒｉ（ヨナグニカラスバト）
Ｓｔｒｅｐｔｏｐｅｌｉａ　ｄｅｃａｏｃｔｏ　ｄｅｃａｏｃｔｏ（シラコバト）
Ｃｈａｌｃｏｐｈａｐｓ　ｉｎｄｉｃａ　ｙａｍａｓｈｉｎａｉ（キンバト）
（五）　みずなぎどり目
あほうどり科
Ｐｈｏｅｂａｓｔｒｉａ　ｉｍｍｕｔａｂｉｌｉｓ（コアホウドリ）
Ｐｈｏｅｂａｓｔｒｉａ　ａｌｂａｔｒｕｓ（アホウドリ）
みずなぎどり科
Ｐｕｆｆｉｎｕｓ　ｌｈｅｒｍｉｎｉｅｒｉ　ｂａｎｎｅｒｍａｎｉ（セグロミズナギドリ）
Ｐｕｆｆｉｎｕｓ　ｂｒｙａｎｉ（オガサワラヒメミズナギドリ）
うみつばめ科
Ｏｃｅａｎｏｄｒｏｍａ　ｃａｓｔｒｏ（クロコシジロウミツバメ）
Ｏｃｅａｎｏｄｒｏｍａ　ｍｏｎｏｒｈｉｓ（ヒメクロウミツバメ）
（六）　こうのとり目
こうのとり科
Ｃｉｃｏｎｉａ　ｂｏｙｃｉａｎａ（コウノトリ）
（七）　かつおどり目
かつおどり科
Ｓｕｌａ　ｓｕｌａ　ｒｕｂｒｉｐｅｓ（アカアシカツオドリ）
う科
Ｐｈａｌａｃｒｏｃｏｒａｘ　ｐｅｌａｇｉｃｕｓ　ｐｅｌａｇｉｃｕｓ（ヒメウ）
Ｐｈａｌａｃｒｏｃｏｒａｘ　ｕｒｉｌｅ（チシマウガラス）
（八）　ぺりかん目
さぎ科
Ｂｏｔａｕｒｕｓ　ｓｔｅｌｌａｒｉｓ　ｓｔｅｌｌａｒｉｓ（サンカノゴイ）
Ｉｘｏｂｒｙｃｈｕｓ　ｅｕｒｈｙｔｈｍｕｓ（オオヨシゴイ）
Ｇｏｒｓａｃｈｉｕｓ　ｇｏｉｓａｇｉ（ミゾゴイ）
Ｇｏｒｓａｃｈｉｕｓ　ｍｅｌａｎｏｌｏｐｈｕｓ（ズグロミゾゴイ）
とき科
Ｎｉｐｐｏｎｉａ　ｎｉｐｐｏｎ（トキ）
Ｐｌａｔａｌｅａ　ｍｉｎｏｒ（クロツラヘラサギ）
（九）　つる目
つる科
Ｇｒｕｓ　ｖｉｐｉｏ（マナヅル）
Ｇｒｕｓ　ｊａｐｏｎｅｎｓｉｓ（タンチョウ）
Ｇｒｕｓ　ｍｏｎａｃｈａ（ナベヅル）
くいな科
Ｃｏｔｕｒｎｉｃｏｐｓ　ｅｘｑｕｉｓｉｔｕｓ（シマクイナ）
Ｒａｌｌｉｎａ　ｅｕｒｉｚｏｎｏｉｄｅｓ　ｓｅｐｉａｒｉａ（オオクイナ）
Ｇａｌｌｉｒａｌｌｕｓ　ｏｋｉｎａｗａｅ（ヤンバルクイナ）
（一〇）　ちどり目
ちどり科
Ｃｈａｒａｄｒｉｕｓ　ａｌｅｘａｎｄｒｉｎｕｓ　ａｌｅｘａｎｄｒｉｎｕｓ（ハシボソシロチドリ）
Ｃｈａｒａｄｒｉｕｓ　ａｌｅｘａｎｄｒｉｎｕｓ　ｄｅａｌｂａｔｕｓ（シロチドリ）
せいたかしぎ科
Ｈｉｍａｎｔｏｐｕｓ　ｈｉｍａｎｔｏｐｕｓ　ｈｉｍａｎｔｏｐｕｓ（セイタカシギ）
しぎ科
Ｓｃｏｌｏｐａｘ　ｍｉｒａ（アマミヤマシギ）
Ｌｉｍｏｓａ　ｌａｐｐｏｎｉｃａ　ｍｅｎｚｂｉｅｒｉ（コシジロオオソリハシシギ）
Ｌｉｍｏｓａ　ｌａｐｐｏｎｉｃａ　ｂａｕｅｒｉ（オオソリハシシギ）
Ｎｕｍｅｎｉｕｓ　ｍｉｎｕｔｕｓ（コシャクシギ）
Ｎｕｍｅｎｉｕｓ　ｍａｄａｇａｓｃａｒｉｅｎｓｉｓ（ホウロクシギ）
Ｔｒｉｎｇａ　ｅｒｙｔｈｒｏｐｕｓ（ツルシギ）
Ｔｒｉｎｇａ　ｔｏｔａｎｕｓ　ｕｓｓｕｒｉｅｎｓｉｓ（アカアシシギ）
Ｔｒｉｎｇａ　ｇｕｔｔｉｆｅｒ（カラフトアオアシシギ）
Ｔｒｉｎｇａ　ｇｌａｒｅｏｌａ（タカブシギ）
Ｅｕｒｙｎｏｒｈｙｎｃｈｕｓ　ｐｙｇｍｅｕｓ（ヘラシギ）
たましぎ科
Ｒｏｓｔｒａｔｕｌａ　ｂｅｎｇｈａｌｅｎｓｉｓ　ｂｅｎｇｈａｌｅｎｓｉｓ（タマシギ）
つばめちどり科
Ｇｌａｒｅｏｌａ　ｍａｌｄｉｖａｒｕｍ（ツバメチドリ）
かもめ科
Ｌａｒｕｓ　ｓａｕｎｄｅｒｓｉ（ズグロカモメ）
Ｓｔｅｒｎａ　ｂｅｒｇｉｉ　ｃｒｉｓｔａｔａ（オオアジサシ）
Ｓｔｅｒｎａ　ａｌｂｉｆｒｏｎｓ　ｓｉｎｅｎｓｉｓ（コアジサシ）
Ｓｔｅｒｎａ　ｄｏｕｇａｌｌｉｉ　ｂａｎｇｓｉ（ベニアジサシ）
Ｓｔｅｒｎａ　ｓｕｍａｔｒａｎａ（エリグロアジサシ）
うみすずめ科
Ｕｒｉａ　ａａｌｇｅ　ｉｎｏｒｎａｔａ（ウミガラス）
Ｃｅｐｐｈｕｓ　ｃａｒｂｏ（ケイマフリ）
Ｓｙｎｔｈｌｉｂｏｒａｍｐｈｕｓ　ａｎｔｉｑｕｕｓ（ウミスズメ）
Ｓｙｎｔｈｌｉｂｏｒａｍｐｈｕｓ　ｗｕｍｉｚｕｓｕｍｅ（カンムリウミスズメ）
Ｆｒａｔｅｒｃｕｌａ　ｃｉｒｒｈａｔａ（エトピリカ）
（一一）　たか目
たか科
Ｈａｌｉａｅｅｔｕｓ　ａｌｂｉｃｉｌｌａ　ａｌｂｉｃｉｌｌａ（オジロワシ）
Ｈａｌｉａｅｅｔｕｓ　ｐｅｌａｇｉｃｕｓ（オオワシ）
Ｓｐｉｌｏｒｎｉｓ　ｃｈｅｅｌａ　ｐｅｒｐｌｅｘｕｓ（カンムリワシ）
Ｃｉｒｃｕｓ　ｓｐｉｌｏｎｏｔｕｓ　ｓｐｉｌｏｎｏｔｕｓ（チュウヒ）
Ａｃｃｉｐｉｔｅｒ　ｇｕｌａｒｉｓ　ｉｗａｓａｋｉｉ（リュウキュウツミ）
Ｂｕｔａｓｔｕｒ　ｉｎｄｉｃｕｓ（サシバ）
Ｂｕｔｅｏ　ｂｕｔｅｏ　ｔｏｙｏｓｈｉｍａｉ（オガサワラノスリ）
Ａｑｕｉｌａ　ｃｈｒｙｓａｅｔｏｓ　ｊａｐｏｎｉｃａ（イヌワシ）
Ｎｉｓａｅｔｕｓ　ｎｉｐａｌｅｎｓｉｓ　ｏｒｉｅｎｔａｌｉｓ（クマタカ））
（一二）　ふくろう目
ふくろう科
Ｏｔｕｓ　ｌｅｍｐｉｊｉ　ｐｒｙｅｒｉ（リュウキュウオオコノハズク）
Ｏｔｕｓ　ｅｌｅｇａｎｓ　ｉｎｔｅｒｐｏｓｉｔｕｓ（ダイトウコノハズク）
Ｂｕｂｏ　ｂｕｂｏ　ｂｏｒｉｓｓｏｗｉ（ワシミミズク）
Ｋｅｔｕｐａ　ｂｌａｋｉｓｔｏｎｉ　ｂｌａｋｉｓｔｏｎｉ（シマフクロウ）
Ａｅｇｏｌｉｕｓ　ｆｕｎｅｒｅｕｓ　ｍａｇｎｕｓ（キンメフクロウ）
（一三）　ぶっぽうそう目
ぶっぽうそう科
Ｅｕｒｙｓｔｏｍｕｓ　ｏｒｉｅｎｔａｌｉｓ　ｃａｌｏｎｙｘ（ブッポウソウ）
（一四）　きつつき目
きつつき科
Ｄｅｎｄｒｏｃｏｐｏｓ　ｌｅｕｃｏｔｏｓ　ｏｗｓｔｏｎｉ（オーストンオオアカゲラ）
Ｐｉｃｏｉｄｅｓ　ｔｒｉｄａｃｔｙｌｕｓ　ｉｎｏｕｙｅｉ（ミユビゲラ）
Ｄｒｙｏｃｏｐｕｓ　ｍａｒｔｉｕｓ　ｍａｒｔｉｕｓ（クマゲラ）
Ｓａｐｈｅｏｐｉｐｏ　ｎｏｇｕｃｈｉｉ（ノグチゲラ）
（一五）　はやぶさ目
はやぶさ科
Ｆａｌｃｏ　ｐｅｒｅｇｒｉｎｕｓ　ｊａｐｏｎｅｎｓｉｓ（ハヤブサ）
（一六）　すずめ目
やいろちょう科
Ｐｉｔｔａ　ｎｙｍｐｈａ（ヤイロチョウ）
さんしょうくい科
Ｐｅｒｉｃｒｏｃｏｔｕｓ　ｄｉｖａｒｉｃａｔｕｓ　ｄｉｖａｒｉｃａｔｕｓ（サンショウクイ）
もず科
Ｌａｎｉｕｓ　ｔｉｇｒｉｎｕｓ（チゴモズ）
Ｌａｎｉｕｓ　ｃｒｉｓｔａｔｕｓ　ｓｕｐｅｒｃｉｌｉｏｓｕｓ（アカモズ）
しじゅうから科
Ｐｏｅｃｉｌｅ　ｖａｒｉｕｓ　ｎａｍｉｙｅｉ（ナミエヤマガラ）
Ｐｏｅｃｉｌｅ　ｖａｒｉｕｓ　ｏｗｓｔｏｎｉ（オーストンヤマガラ）
むしくい科
Ｐｈｙｌｌｏｓｃｏｐｕｓ　ｉｊｉｍａｅ（イイジマムシクイ）
めじろ科
Ａｐａｌｏｐｔｅｒｏｎ　ｆａｍｉｌｉａｒｅ　ｈａｈａｓｉｍａ（ハハジマメグロ）
せんにゅう科
Ｌｏｃｕｓｔｅｌｌａ　ｐｌｅｓｋｅｉ（ウチヤマセンニュウ）
Ｌｏｃｕｓｔｅｌｌａ　ｐｒｙｅｒｉ　ｐｒｙｅｒｉ（オオセッカ）
みそさざい科
Ｔｒｏｇｌｏｄｙｔｅｓ　ｔｒｏｇｌｏｄｙｔｅｓ　ｍｏｓｕｋｅｉ（モスケミソサザイ）
ひたき科
Ｚｏｏｔｈｅｒａ　ｄａｕｍａ　ｍａｊｏｒ（オオトラツグミ）
Ｔｕｒｄｕｓ　ｃｅｌａｅｎｏｐｓ（アカコッコ）
Ｌｕｓｃｉｎｉａ　ａｋａｈｉｇｅ　ｔａｎｅｎｓｉｓ（タネコマドリ）
Ｌｕｓｃｉｎｉａ　ｋｏｍａｄｏｒｉ　ｋｏｍａｄｏｒｉ（アカヒゲ）
Ｌｕｓｃｉｎｉａ　ｋｏｍａｄｏｒｉ　ｎａｍｉｙｅｉ（ホントウアカヒゲ）
あとり科
Ｃｈｌｏｒｉｓ　ｓｉｎｉｃａ　ｋｉｔｔｌｉｔｚｉ（オガサワラカワラヒワ）
ほおじろ科
Ｅｍｂｅｒｉｚａ　ａｕｒｅｏｌａ　ｏｒｎａｔａ（シマアオジ）
Ｅｍｂｅｒｉｚａ　ｙｅｓｓｏｅｎｓｉｓ　ｙｅｓｓｏｅｎｓｉｓ（コジュリン）
二　哺乳綱
（一）　もぐら目
とがりねずみ科
Ｓｏｒｅｘ　ｍｉｎｕｔｉｓｓｉｍｕｓ　ｈａｗｋｅｒｉ（トウキョウトガリネズミ）
Ｃｒｏｃｉｄｕｒａ　ｏｒｉｉ（オリイジネズミ）
もぐら科
Ｍｏｇｅｒａ　ｕｃｈｉｄａｉ（センカクモグラ）
Ｍｏｇｅｒａ　ｅｔｉｇｏ（エチゴモグラ）
（二）　こうもり目
おおこうもり科
Ｐｔｅｒｏｐｕｓ　ｄａｓｙｍａｌｌｕｓ　ｄａｉｔｏｅｎｓｉｓ（ダイトウオオコウモリ）
Ｐｔｅｒｏｐｕｓ　ｄａｓｙｍａｌｌｕｓ　ｄａｓｙｍａｌｌｕｓ（エラブオオコウモリ）
Ｐｔｅｒｏｐｕｓ　ｐｓｅｌａｐｈｏｎ（オガサワラオオコウモリ）
きくがしらこうもり科
Ｒｈｉｎｏｌｏｐｈｕｓ　ｃｏｒｎｕｔｕｓ　ｏｒｉｉ（オリイコキクガシラコウモリ）
Ｒｈｉｎｏｌｏｐｈｕｓ　ｐｕｍｉｌｕｓ　ｐｕｍｉｌｕｓ（オキナワコキクガシラコウモリ）
Ｒｈｉｎｏｌｏｐｈｕｓ　ｐｅｒｄｉｔｕｓ（ヤエヤマコキクガシラコウモリ）
ひなこうもり科
Ｍｙｏｔｉｓ　ｇｒａｃｉｌｉｓ（ウスリホオヒゲコウモリ）
Ｍｙｏｔｉｓ　ｆｏｒｍｏｓｕｓ（クロアカコウモリ）
Ｍｙｏｔｉｓ　ｐｒｕｉｎｏｓｕｓ（クロホオヒゲコウモリ）
Ｍｙｏｔｉｓ　ｎａｔｔｅｒｅｒｉ　ｂｏｍｂｉｎｕｓ（ホンドノレンコウモリ）
Ｍｙｏｔｉｓ　ｙａｎｂａｒｅｎｓｉｓ（ヤンバルホオヒゲコウモリ）
Ｐｉｐｉｓｔｒｅｌｌｕｓ　ｅｎｄｏｉ（モリアブラコウモリ）
Ｅｐｔｅｓｉｃｕｓ　ｊａｐｏｎｅｎｓｉｓ（クビワコウモリ）
Ｎｙｃｔａｌｕｓ　ａｖｉａｔｏｒ（ヤマコウモリ）
Ｎｙｃｔａｌｕｓ　ｆｕｒｖｕｓ（コヤマコウモリ）
Ｍｉｎｉｏｐｔｅｒｕｓ　ｆｕｓｃｕｓ（リュウキュウユビナガコウモリ）
Ｍｕｒｉｎａ　ｒｙｕｋｙｕａｎａ（リュウキュウテングコウモリ）
おひきこうもり科