農林水産部の所掌事務に係るバイオマスその他の資源の有効な利用の確保に関すること。
十
食品産業その他の農林水産部の所掌に係る事業における資源の有効な利用の確保に関する事務の総括に関すること。
十一
食品産業その他の農林水産部の所掌に係る事業の発達、改善及び調整に関すること（生産振興課の所掌に属するものを除く。）。
十二
卸売市場の整備及び中央卸売市場の監督に関すること（農政課の所掌に属するものを除く。）。
十三
農林水産部の所掌に係る事業における標準化に関する事務の総括に関すること。
十四
日本農林規格に関すること（消費・安全課の所掌に属するものを除く。）。
（林務水産課の所掌事務）
第四十二条
林務水産課は、次に掲げる事務をつかさどる。
一
山村の総合的な振興計画の実施についての指導及び助成に関すること。
二
森林資源の確保及び総合的な利用に関すること。
三
林野の造林及び治水、林道の開設及び改良その他の森林の整備に関すること。
四
森林の経営の監督及び助成に関すること。
五
保安林に関すること。
六
森林病害虫の駆除及び予防その他の森林の保護に関すること。
七
林野の保全に係る地すべり防止に関する事業に関すること。
八
国土緑化の推進に関すること。
九
木材その他の林産物及び加工炭の生産、流通及び消費の増進、改善及び調整に関すること。
十
林業経営の改善及び安定に関すること。
十一
森林組合その他の林業者の協同組織の発達に関すること。
十二
林業技術の改良及び発達並びに普及交換に関すること並びに林業・木材産業改善資金の貸付けについての助成に関すること。
十三
林業構造の改善に関すること。
十四
漁村の総合的な振興計画の実施についての指導及び助成に関すること。
十五
水産資源の保存及び管理に関すること。
十六
漁業の指導及び監督に関すること。
十七
沿岸漁業に係る漁場の保全及び持続的な養殖生産の確保に関すること。
十八
栽培漁業の促進その他海洋水産資源の開発の促進に関すること。
十九
水産物の生産、流通及び消費の増進、改善及び調整に関すること（消費・安全課の所掌に属するものを除く。）。
二十
水産業専用物品及び氷の生産、流通及び消費の増進、改善及び調整並びに冷凍及び冷蔵に関すること。
二十一
水産業経営の改善及び安定に関すること。
二十二
漁業協同組合その他の水産業者の協同組織の発達に関すること。
二十三
水産に関する技術の改良及び発達並びに普及交換に関すること並びに沿岸漁業改善資金の貸付けについての助成に関すること。
二十四
沿岸漁業の構造改善に関すること。
二十五
漁船の検査に関すること。
二十六
漁港の修築、維持管理及び災害復旧その他漁港に関すること。
二十七
漁港の区域に係る海岸の整備、利用、保全その他の管理に関すること。
（総合農政推進官、主任農政推進専門官、食料安全保障専門官及び検査官）
第四十三条
農政課に、総合農政推進官一人、主任農政推進専門官一人、食料安全保障専門官一人及び検査官二人を置く。
２
総合農政推進官は、命を受けて、農林水産部の所掌事務に関する総合的な政策の企画及び立案に関する事務を行う。
３
主任農政推進専門官は、命を受けて、農林水産部の所掌事務に関する総合的な政策に関する企画、推進、連絡調整及び指導に関する事務を行い、並びにこれらの事務を整理する。
４
食料安全保障専門官は、命を受けて、農畜産物、飲食料品及び油脂についての物価対策に関する事務のうち農林水産部の所掌に係るものの総括に関する事務を行う。
５
検査官は、命を受けて、農業協同組合、農業協同組合連合会、農事組合法人、沖縄県農業協同組合中央会、沖縄県農業信用基金協会、土地改良区、土地改良区連合、土地改良事業団体連合会、中央卸売市場を開設する者及び中央卸売市場において卸売の業務を行う者の業務及び会計の検査の実施に関する事務を行う。
（企画指導官及び人材確保支援企画官）
第四十四条
経営課に、企画指導官四人及び人材確保支援企画官一人を置く。
２
企画指導官は、命を受けて、経営課の所掌事務に関し、沖縄総合事務局長が指定する農林水産業の振興開発に関する事項についての企画及び立案、調整並びに指導に関する事務を行う。
３
人材確保支援企画官は、命を受けて、農林水産業その他の農林水産部の所掌に係る事業に従事する人材の確保に対する支援に関する事項についての企画、連絡調整及び指導に関する事務を行う。
（農村活性化推進室並びに企画指導官、地域資源活用専門官、管理官、農業土木専門官、技術審査官、用地官及び災害査定官）
第四十五条
農村振興課に、農村活性化推進室並びに企画指導官二人、地域資源活用専門官一人、管理官一人、農業土木専門官一人、技術審査官一人、用地官一人及び災害査定官一人を置く。
２
農村活性化推進室は、第三十七条第一号及び第九号から第十七号までに掲げる事務をつかさどる。
３
農村活性化推進室に、室長を置く。
４
企画指導官は、命を受けて、農村振興課の所掌事務に関し、沖縄総合事務局長が指定する農林水産業の振興開発に関する事項についての企画及び立案、調整並びに指導に関する事務を行う。
５
地域資源活用専門官は、農村振興課の所掌事務に係る地域資源を活用した農林漁業者等による農林漁業及び関連事業の総合化並びに農林水産物の生産された地域における当該農林水産物の消費の増進、改善及び調整に関する事務の総括に関する専門の事項についての調査、連絡調整及び指導に関する事務を行う。
６
管理官は、土地改良区、土地改良区連合及び土地改良事業団体連合会の業務及び会計に関する事務（農政課の所掌に属するものを除く。）、交換分合その他土地改良事業による農用地の集団化の促進に関する重要事項についての指導及び連絡調整に関する事務並びに国営の土地改良事業に係る換地に関する事務を行う。
７
農業土木専門官は、土地改良事業の工事の設計に関する専門技術上の事項についての調査、連絡調整及び指導に関する事務を行う。
８
技術審査官は、土地改良事業の工事並びに工事のための調査、測量及び設計についての契約に必要な専門技術上の事項についての審査及び連絡調整に関する事務を行う。
９
用地官は、土地改良事業並びに農地の保全に係る海岸保全施設に関する事業、地すべり防止に関する事業及びぼた山の崩壊の防止に関する事業の用に供する土地、工作物その他の物件及び権利の買収及び補償に伴うこれらの物件及び権利の評価に関する事務を行う。
１０
災害査定官は、農用地及び農業用施設並びに農地の保全に係る海岸保全施設、地すべり防止施設及びぼた山崩壊防止施設に関する災害復旧事業に係る事業費の査定に関する事務を行う。
（畜産振興室及び企画指導官）
第四十六条
生産振興課に、畜産振興室及び企画指導官五人を置く。
２
畜産振興室は、第三十八条第一号（畜産物に関することに限る。）、第四号（畜産業専用物品に関することに限る。）、第十号（畜産業に関することに限る。）及び第十一号から第十四号までに掲げる事務をつかさどる。
３
畜産振興室に、室長を置く。
４
企画指導官は、命を受けて、生産振興課の所掌事務に関し、沖縄総合事務局長が指定する農林水産業の振興開発に関する事項についての企画及び立案、調整並びに指導に関する事務を行う。
（統計指導官及び上席統計指導官）
第四十七条
統計調査課に、統計指導官五人及び上席統計指導官一人を置く。
２
統計指導官は、命を受けて、統計調査課の所掌事務のうち、沖縄総合事務局長が指定する事項についての企画及び立案、調整並びに指導に関する事務を行う。
３
上席統計指導官は、命を受けて、統計調査課の所掌事務のうち、沖縄総合事務局長が指定する事項についての企画及び立案、調整並びに指導に関する事務並びに統計指導官が行う事務の整理を行う。
（企画指導官及び安全管理専門官）
第四十八条
消費・安全課に、企画指導官及び安全管理専門官それぞれ一人を置く。
２
企画指導官は、命を受けて、消費・安全課の所掌事務に関し、沖縄総合事務局長が指定する農林水産業の振興開発に関する事項についての企画及び立案、調整並びに指導に関する事務を行う。
３
安全管理専門官は、消費・安全課の所掌事務に関し、肥料、飼料及び飼料添加物並びに動物用の医薬品、医薬部外品、医療機器及び再生医療等製品の生産、流通及び消費の増進、改善及び調整並びに輸出入植物の検疫、牛の生産段階に係る個体識別に関する情報の収集及び提供に係る専門の事項についての調査、連絡調整及び指導に関する事務を行う。
（地理的表示・輸出促進専門官）
第四十九条
食料産業課に、地理的表示・輸出促進専門官一人を置く。
２
地理的表示・輸出促進専門官は、特定農林水産物等の名称の保護及び農林水産部の所掌事務に係る物資についての輸出の促進に関する専門の事項についての調査、企画、連絡調整及び指導に関する事務を行う。
（企画指導官、漁業監督指導官、上席漁業監督指導官及び安全操業調整官）
第五十条
林務水産課に、企画指導官一人、漁業監督指導官十一人、上席漁業監督指導官一人及び安全操業調整官一人を置く。
２
企画指導官は、命を受けて、林務水産課の所掌事務に関し、沖縄総合事務局長が指定する農林水産業の振興開発に関する事項についての企画及び立案、調整並びに指導に関する事務を行う。
３
漁業監督指導官は、命を受けて、漁業の取締りに関する専門技術上の事項についての指導に関する事務を行う。
４
上席漁業監督指導官は、命を受けて、前項の事務を行い、及び同項の事務を総括する。
５
安全操業調整官は、命を受けて、我が国漁業者の安全な操業のために必要な事項についての連絡調整（漁業取締りの業務に使用する船舶により行うものに限る。）に関する事務を行う。