ただし、別表第四中西部太平洋条約海域、東部太平洋条約海域、インド洋協定海域又は大西洋条約海域の項の改正規定は、平成三十一年一月一日から施行する。
２
この省令の施行前にした行為に対する漁業取締り上行う行政庁の処分についての規定の適用及び罰則の適用については、なお従前の例による。
附　則
この省令は、公布の日から施行する。
附　則
（施行期日）
第一条
この省令は、平成三十一年七月一日から施行する。
ただし、附則第二条及び第三条の規定は、公布の日から施行する。
（経過措置）
第二条
この省令の施行の際現に指定漁業の許可及び取締り等に関する省令第八十三条第一項の許可を受けている者は、この省令の施行の日から三月を経過する日までの間に、この省令による改正後の指定漁業の許可及び取締り等に関する省令（以下「新省令」という。）第八十三条第二項各号に掲げる事項を記載した書面及び同条第三項各号に定める書類を農林水産大臣に提出しなければならない。
２
前項に規定する者が同項に規定する期間内に同項に規定する書面及び書類を提出しなかった場合は、当該許可はその効力を失う。
（準備行為）
第三条
この省令の施行の日以降に営もうとする鯨をとる漁業に係る漁業法第五十二条第一項の許可に関し必要な手続その他の行為は、この省令の施行前においても、新省令の規定の例により行うことができる。
（罰則の適用に関する経過措置）
第四条
この省令の施行前にした行為に対する罰則の適用については、なお従前の例による。
附　則
この省令は、令和元年十月二十九日から施行する。
附　則
（施行期日）
第一条
この省令は、漁業法等の一部を改正する等の法律（平成三十年法律第九十五号。以下「改正法」という。）の施行の日（令和二年十二月一日）から施行する。
（漁獲量の制限等に関する経過措置）
第二条
この省令による改正前の第三十四条、第四十二条、第四十六条、第五十七条、第七十一条、第九十一条の三及び第九十一条の四の規定は、これらの規定に係る水産動植物が改正法第一条の規定による改正後の漁業法第十一条第二項第三号に規定する特定水産資源として漁獲可能量による管理が行われる日の前日までの間は、なお効力を有する。
この場合においては、大西洋くろまぐろ及びみなみまぐろが同号に規定する特定水産資源として漁獲可能量による管理が行われる日の前日までの間は、この省令による改正後の第九十六条の規定は、適用しない。
（罰則に関する経過措置）
第三条
この省令の施行の日前にした行為及びこの附則の規定によりなお効力を有することとされる場合におけるこの省令の施行の日以降にした行為に対する罰則の適用については、なお従前の例による。
附　則
（施行期日）
１
この省令は、令和二年十一月一日から施行する。
附　則
１
この省令は、公布の日から施行する。
２
指定漁業の許可及び取締り等に関する省令の一部を改正する省令（令和元年農林水産省令第十七号）は、廃止する。
附　則
この省令は、令和三年一月一日から施行する。
附　則
（施行期日）
第一条
この省令は、公布の日から施行する。
（経過措置）
第二条
この省令の施行の際現にあるこの省令による改正前の様式（次項において「旧様式」という。）により使用されている書類は、この省令による改正後の様式によるものとみなす。
２
この省令の施行の際現にある旧様式による用紙については、当分の間、これを取り繕って使用することができる。
附　則
この省令は、令和三年二月一日から施行する。
附　則
この省令は、中央北極海における規制されていない公海漁業を防止するための協定の効力発生の日から施行する。
附　則
この省令は、令和三年五月一日から施行する。
附　則
（施行期日）
第一条
この省令は、公布の日から施行する。
（操業制限又は禁止に関する経過措置）
第二条
この省令による改正前の別表第四のかつお・まぐろ漁業の項第八号、第十号及び第二十四号から第三十一号までの規定は、これらの規定に係る水産動植物が漁業法第十一条第二項第三号に規定する特定水産資源として漁獲可能量による管理が行われる日の前日までの間は、なお効力を有する。
（罰則に関する経過措置）
第三条
この省令の施行の日前にした行為及び前条の規定によりなお効力を有することとされる場合におけるこの省令の施行の日以降にした行為に対する罰則の適用については、なお従前の例による。
附　則
この省令は、公布の日から起算して十日を経過した日から施行する。
附　則
この省令は、令和四年八月一日から施行する。
附　則
（施行期日）
１
この省令は、公布の日から起算して一月を経過した日から施行する。
（経過措置）
２
この省令の施行前に行われた転載に係る申告書の提出期限については、なお従前の例による。
附　則
この省令は、令和五年八月一日から施行する。
附　則
（施行期日）
１
この省令は、令和六年一月一日から施行する。
（経過措置）
２
操業日誌の備付け及び記録については、この省令による改正後の漁業の許可及び取締り等に関する省令（以下「新省令」という。）第二十六条第五項の規定は、同項に規定する操業日誌の備付け及び記録を施行日以後最初に行うべき日として次の表のとおり大臣許可漁業及び海域ごとに定める日から適用し、同日前における操業日誌の備付け及び記録については、なお従前の例による。
大臣許可漁業の名称
海域
農林水産大臣が定める日
大中型まき網漁業
我が国の排他的経済水域、領海及び内水並びに我が国の排他的経済水域によって囲まれた海域から成る海域（東京都小笠原村南鳥島に係る排他的経済水域及び領海を除く。）以外の海域
令和六年一月一日
かつお・まぐろ漁業（総トン数八十トン以上の動力船により、浮きはえなわ又は釣りを行うものに限る。）
オーストラリアの南海岸線と東経百四十一度の線との交点から南緯五十五度東経百四十一度の点に至る直線、南緯五十五度東経百四十一度の点から南緯五十五度東経百五十度の点に至る直線、南緯五十五度東経百五十度の点から南緯六十度東経百五十度の点に至る直線、南緯六十度東経百五十度の点から南緯六十度西経百三十度の点に至る直線、南緯六十度西経百三十度の点から南緯四度西経百三十度の点に至る直線、南緯四度西経百三十度の点から南緯四度西経百五十度の点に至る直線、南緯四度以北の西経百五十度の線から成る線以西の太平洋の海域
令和六年一月一日
かつお・まぐろ漁業（総トン数八十トン未満の動力船により、浮きはえなわ又は釣りを行うものに限る。）
北緯五十度の線、東経百度の線及び次に掲げる一から九までの各点を順次に直線で結ぶ線により囲まれた海域（日本国とオーストラリア連邦との間の漁業に関する協定第二条１に規定する海域を除く。）
一　北緯五十度西経百五十度の点
二　南緯四度西経百五十度の点
三　南緯四度西経百三十度の点
四　南緯二十五度西経百三十度の点
五　南緯二十五度東経百五十五度の点
六　南緯十一度三十分東経百二十九度の点
七　南緯十一度三十分東経百十三度二十八分の点
八　南緯十度東経百十三度二十八分の点
九　南緯十度東経百度の点
令和八年一月一日
３
操業日誌の提出については、新省令第二十六条第六項の規定は、同項に規定する操業日誌の提出を施行日以後最初に行うべき日として次の表のとおり大臣許可漁業及び海域ごとに定める日から適用し、同日前における操業日誌の提出については、なお従前の例による。
大臣許可漁業の名称
海域
農林水産大臣が定める日
大中型まき網漁業
我が国の排他的経済水域、領海及び内水並びに我が国の排他的経済水域によって囲まれた海域から成る海域（東京都小笠原村南鳥島に係る排他的経済水域及び領海を除く。）以外の海域
令和六年一月一日
かつお・まぐろ漁業（総トン数八十トン以上の動力船により、浮きはえなわ又は釣りを行うものに限る。）
オーストラリアの南海岸線と東経百四十一度の線との交点から南緯五十五度東経百四十一度の点に至る直線、南緯五十五度東経百四十一度の点から南緯五十五度東経百五十度の点に至る直線、南緯五十五度東経百五十度の点から南緯六十度東経百五十度の点に至る直線、南緯六十度東経百五十度の点から南緯六十度西経百三十度の点に至る直線、南緯六十度西経百三十度の点から南緯四度西経百三十度の点に至る直線、南緯四度西経百三十度の点から南緯四度西経百五十度の点に至る直線、南緯四度以北の西経百五十度の線から成る線以西の太平洋の海域
令和六年一月一日
かつお・まぐろ漁業（総トン数八十トン未満の動力船により、浮きはえなわ又は釣りを行うものに限る。）
北緯五十度の線、東経百度の線及び次に掲げる一から九までの各点を順次に直線で結ぶ線により囲まれた海域（日本国とオーストラリア連邦との間の漁業に関する協定第二条１に規定する海域を除く。）
一　北緯五十度西経百五十度の点
二　南緯四度西経百五十度の点
三　南緯四度西経百三十度の点
四　南緯二十五度西経百三十度の点
五　南緯二十五度東経百五十五度の点
六　南緯十一度三十分東経百二十九度の点
七　南緯十一度三十分東経百十三度二十八分の点
八　南緯十度東経百十三度二十八分の点
九　南緯十度東経百度の点
令和八年一月一日
４
大臣許可漁業ごとに農林水産大臣が別に定めて告示する海域において操業する場合には、新省令第二十六条の規定にかかわらず、当分の間、この省令による改正前の漁業の許可及び取締り等に関する省令第二十六条の規定を適用する。
附　則
この省令は、公布の日から施行する。
附　則
この省令は、令和六年七月一日から施行する。
別記
様式第１号
（第３条、第４条関係）
様式第２号
（第４条関係）
様式第３号
（第１６条関係）
様式第４号
（第４０条関係）
様式第５号