法第二条第一項の政令で定める外来生物に係る主務大臣は、Ｍｙｏｃａｓｔｏｒ　ｃｏｙｐｕｓ（ヌートリア）、Ｐｒｏｃｙｏｎ　ｃａｎｃｒｉｖｏｒｕｓ（カニクイアライグマ）、Ｐｒｏｃｙｏｎ　ｌｏｔｏｒ（アライグマ）、Ｈｅｒｐｅｓｔｅｓ　ａｕｒｏｐｕｎｃｔａｔｕｓ（フイリマングース）、Ｈｅｒｐｅｓｔｅｓ　ｊａｖａｎｉｃｕｓ（ジャワマングース）、Ｍｕｎｇｏｓ　ｍｕｎｇｏ（シママングース）、Ｍｕｎｔｉａｃｕｓ　ｒｅｅｖｅｓｉ（キョン）、Ｌｅｐｏｍｉｓ　ｍａｃｒｏｃｈｉｒｕｓ（ブルーギル）、Ｍｉｃｒｏｐｔｅｒｕｓ　ｄｏｌｏｍｉｅｕ（コクチバス）、Ｍｉｃｒｏｐｔｅｒｕｓ　ｓａｌｍｏｉｄｅｓ（オオクチバス）及びＡｎｏｐｌｏｐｈｏｒａ　ｇｌａｂｒｉｐｅｎｎｉｓ（ツヤハダゴマダラカミキリ）については環境大臣及び農林水産大臣とし、その他の特定外来生物については環境大臣とする。
２
法第二十一条の未判定外来生物に係る主務大臣は、環境大臣及び農林水産大臣とする。
（申請書等の提出）
第三十五条
法の規定に基づき申請書その他の書類（以下この条において「申請書等」という。）を主務大臣に提出する場合において、主務大臣が環境大臣及び農林水産大臣である生物に関する事項にあっては、環境大臣に提出することができる。
２
前項の規定により環境大臣に申請書等を提出する場合は、その写し一通を添付しなければならない。
３
環境大臣は、申請書等及びその写しを受理したときは、遅滞なく、当該写しを農林水産大臣に送付するものとする。
この場合において、当該申請書等は、環境大臣が受理した日において農林水産大臣に提出されたものとみなす。
（権限の委任）
第三十六条
法及びこの省令に規定する主務大臣の権限（農林水産大臣の権限のうち、Ｌｅｐｏｍｉｓ　ｍａｃｒｏｃｈｉｒｕｓ（ブルーギル）、Ｍｉｃｒｏｐｔｅｒｕｓ　ｄｏｌｏｍｉｅｕ（コクチバス）、Ｍｉｃｒｏｐｔｅｒｕｓ　ｓａｌｍｏｉｄｅｓ（オオクチバス）及びＡｎｏｐｌｏｐｈｏｒａ　ｇｌａｂｒｉｐｅｎｎｉｓ（ツヤハダゴマダラカミキリ）に係るものを除く。以下同じ。）のうち、次に掲げるものは、次の表の上欄に掲げる主務大臣の権限ごとに、同表の下欄に掲げる地方支分部局の長に委任する。
ただし、第三号から第六号まで、第十一号、第十二号（法第二十条第四項に規定する権限に限る。）、第十三号から第十八号まで、第二十六号（第二十三条第二項に規定する権限に限る。）、第三十一号から第三十三号までに掲げる権限については、主務大臣が自ら行うことを妨げない。
一
法第五条第一項、第二項及び第四項（法第九条の二第六項において準用する場合を含む。）に規定する権限
二
法第九条の二第一項、第二項及び第四項に規定する権限
三
法第九条の三に規定する権限
四
法第十条第一項及び第二項に規定する権限
五
法第十一条第一項に規定する権限（特定外来生物による生態系等に係る被害の防止に関する法律の一部を改正する法律（令和四年法律第四十二号。以下「令和四年改正法」という。）附則第二条の規定によりなお従前の例によることとされている令和四年改正法の施行前に令和四年改正法第二条の規定による改正前の法第十一条第二項の規定による公示をした同条第一項の規定による防除に係る権限を含む。）
六
法第十三条第一項から第三項までに規定する権限
七
法第十七条の二第二項及び第四項に規定する権限
八
法第十七条の四第一項から第三項までに規定する権限（令和四年改正法附則第二条の規定によりなお従前の例によることとされている令和四年改正法の施行前に令和四年改正法第二条の規定による改正前の法第十八条第一項の規定による確認を受けた防除に係る権限を含む。）
九
法第十七条の六に規定する権限（令和四年改正法附則第二条の規定によりなお従前の例によることとされている令和四年改正法の施行前に令和四年改正法第二条の規定による改正前の法第十八条第一項の規定による確認を受けた防除に係る権限を含む。）
十
法第十八条第一項から第三項までに規定する権限（令和四年改正法附則第二条の規定によりなお従前の例によることとされている令和四年改正法の施行前に令和四年改正法第二条の規定による改正前の法第十八条第二項の規定による認定を受けた防除に係る権限を含む。）
十一
法第十九条に規定する権限（令和四年改正法附則第二条の規定によりなお従前の例によることとされている令和四年改正法の施行前に令和四年改正法第二条の規定による改正前の法第十八条第二項の規定による認定を受けた防除に係る権限を含む。）
十二
法第二十条に規定する権限（令和四年改正法附則第二条の規定によりなお従前の例によることとされている令和四年改正法の施行前に令和四年改正法第二条の規定による改正前の法第十八条第二項の規定による認定を受けた防除に係る権限を含む。）
十三
法第二十四条の二第一項から第三項までに規定する権限
十四
法第二十四条の五第一項から第三項までに規定する権限
十五
法第二十四条の六に規定する権限
十六
法第二十四条の七第五項から第七項までに規定する権限
十七
法第二十六条第一項に規定する権限
十八
法第二十八条の二に規定する権限
十九
第二条第二十四号及び第二十五号に規定する権限
二十
第四条第三項、第五項及び第七項から第十項までに規定する権限
二十一
第七条第二号に規定する権限（届出の受理に係るものに限る。）
二十二
第八条第二号に規定する権限（届出の受理に係るものに限る。）
二十三
第十条に規定する権限
二十四
第十一条の二第三項及び第五項から第七項までに規定する権限
二十五
第十一条の五に規定する権限
二十六
第二十三条第一項及び第二項に規定する権限
二十七
第二十三条の二に規定する権限
二十八
第二十四条第一項及び第三項に規定する権限
二十九
第二十五条に規定する権限
三十
第二十六条第一項及び第三項に規定する権限
三十一
第二十九条の二に規定する権限
三十二
第二十九条の三第一項（同条第二項において準用する場合を含む。）に規定する権限
三十三
第二十九条の四に規定する権限
主務大臣の権限
地方支分部局の長
農林水産大臣の権限
地方農政局長
環境大臣の権限
地方環境事務所長
附　則
（施行期日）
第一条
この省令は、法の施行の日（平成十七年六月一日）から施行する。
附　則
（施行期日）
第一条
この省令は、平成十八年一月四日から施行する。
（処分、申請等に関する経過措置）
第二条
この省令の施行前に主務大臣が特定外来生物による生態系等に係る被害の防止に関する法律又はこれに基づく命令（以下「法令」という。）の規定によりした許可その他の処分（この省令による改正後の特定外来生物による生態系等に係る被害の防止に関する法律施行規則（以下「新規則」という。）第三十六条の規定により地方支分部局の長に委任された権限に係るものに限る。）は、相当の地方支分部局の長がした許可その他の処分とみなし、この省令の施行前に法令の規定により主務大臣に対してした申請、届出その他の行為は、相当の地方支分部局の長に対してした申請、届出その他の行為とみなす。
２
この省令の施行前に法令の規定により主務大臣に対し報告、届出、提出その他の手続をしなければならない事項（新規則第三十六条の規定により地方支分部局の長に委任された権限に係るものに限る。）で、この省令の施行前にその手続がされていないものについては、これを、当該法令の規定により相当の地方支分部局の長に対して報告、届出、提出その他の手続をしなければならない事項についてその手続がされていないものとみなして、当該法令の規定を適用する。
（罰則に関する経過措置）
第三条
この省令の施行前にした行為に対する罰則の適用については、なお従前の例による。
附　則
この省令は、平成十八年二月一日から施行する。
附　則
この省令は、平成十八年九月一日から施行する。
附　則
（施行期日）
第一条
この省令は、公布の日から施行する。
（経過措置）
第二条
この省令の施行の際現にあるこの省令による改正前の特定外来生物による生態系等に係る被害の防止に関する法律施行規則の様式（次項において「旧様式」という。）により使用されている書類は、この省令による改正後の特定外来生物による生態系等に係る被害の防止に関する法律施行規則の様式によるものとみなす。
２
この省令の施行の際現にある旧様式により調製した用紙は、この省令の施行後においても当分の間、これを取り繕って使用することができる。
附　則
この省令は、平成十九年九月一日から施行する。
附　則
この省令は、平成二十年一月一日から施行する。
附　則
この省令は、平成二十二年二月一日から施行する。
附　則
この省令は、平成二十三年七月一日から施行する。
附　則
この省令は、平成二十五年九月一日から施行する。
附　則
この省令は、平成二十六年六月十一日から施行する。
ただし、第二条の規定は平成二十六年八月一日から施行する。
附　則
この省令は、平成二十七年三月一日から施行する。
附　則
この省令は、鳥獣の保護及び狩猟の適正化に関する法律の一部を改正する法律の施行の日（平成二十七年五月二十九日）から施行する。
附　則
この省令は、平成二十七年十月一日から施行する。
附　則
この省令は、平成二十八年十月一日から施行する。
附　則
この省令は、平成三十年一月十五日から施行する。
ただし、別表第三の第一の五及び別表第四の第一の三の改正規定は、平成三十年四月一日から施行する。
附　則
この省令は、公布の日から施行する。
ただし、「日本工業規格」を「日本産業規格」に改める部分は、不正競争防止法等の一部を改正する法律の施行の日（令和元年七月一日）から施行する。
附　則