新中国成立后，黄正清历任甘肃省政府委员、省农业厅副厅长，西北军政委员会委员、畜牧部副部长、民族事务委员会副主任，西北行政委员会副主席，甘南藏族自治州州长，甘南藏族自治州军分区司令员，甘肃省人民政府副省长，甘肃省政协副主席等职