此后二十年间，王锡爵先后担任过翰林院侍讲学士、国子监祭酒、詹事府詹事兼翰林院掌院学士、礼部右侍郎和《世宗实录》、《穆宗实录》副总裁等要职，在明代嘉靖后期、隆庆和万历初年的政治舞台上初露头角