根据2016年12月南京水科院官网显示，水利部·交通运输部·国家能源局·南京水利科学研究院有科研人员1300余人，其中中国工程院院士、英国皇家工程院外籍院士1名，国家有突出贡献中青年专家、“国家特支计划”百千万工程领军人才等国家和部省级人才70余名，具有高级以上职称670多人