Ese verano de 2016, el Club decidió integrar definitivamente y a todos los efectos al equipo femenino en su estructura, computando a partir de la recién alzada Copa de la Reina de 2016 oficialmente en su palmarés los títulos conseguidos por el primer equipo femenino (excluyendo así el primer campeonato de Liga que su entonces equipo femenino conquistó en 1990), sumándolos en un cómputo global a los del primer equipo masculino.​ Esta decisión coincidió en el tiempo con un hito de gran repercusión mediática: el equipo Alevín del Atlético compuesto íntegramente por chicas se proclamó campeón de Liga ante equipos compuestos íntegramente por chicos.