La obra de restauración estuvo a cargo del arquitecto Fernando Alsina, quien era interventor del Ministerio de Obras Públicas, de la mano del arquitecto bogotano Álvaro Gómez Rincón, y en ella fue necesario demoler algunas propiedades anexas al palacio como la casa de la Expedición Botánica, la administración de correos y la casa de Camilo Torres, entre otras.