Durante la Revolución mexicana crearon un conflicto profundo entre ambas naciones, el más profundo fue la Guerra Cristera, pero este conflicto ya existía desde tiempos de Benito Juárez y en la única ocasión antes de 1862 que hubo un nuncio papal fue en el Segundo Imperio Mexicano, pero este se retiró de México tras el regreso de Juárez a México, poco antes de la muerte de Maximiliano.