Pese a su tecnología, los Forerunners no pudieron hacer frente a la amenaza del Flood, un parásito mortal con el que tuvieron un primer contacto cerca de 100.000 años atrás y con el que empezaron una larga y mortífera guerra que cobró billones de vidas y que se expandió por toda la Vía Láctea, la Guerra Forerunner-Flood.