La estación se encuentra en superficie entre el Puente Morland y la vía Georges Pompidou, al noroeste del Quai de la Rapée, muelle que le da nombre, sobre el Canal de San Martín en el que forma una de sus esclusas al dirigirse la vía del tren hacia el río Sena por un viaducto metálico (Viaducto de Austerlitz).