Las subsecuentes guerras que cimbraron al país y la región durante las siguientes décadas llevaron a más de un militar a la gubernatura del estado, los cuales convertían a Mazatlán en su capital de facto, dado que aquí se encontraba su cuartel y los comerciantes que, aprovechando la situación, les sobornaban para realizar actividades de contrabando y excepción de impuestos.