Además, el sitio es hábitat de 81 especies endémicas de invertebrados del golfo de California y de varias especies amenazadas, como los manglares (Avicennia germinans, Laguncularia racemosa y Rhizophora mangle), totoaba (Totoaba macdonaldi), tortugas marinas (Eretmochelys imbricata, Caretta caretta, Dermochelys coriaceai, Lepidochelys olivacea y Chelonia mydas agassizi) y barnacla carinegra (Branta bernicla).