Mediante una ley aprobada el 24 de marzo de 1835, durante el gobierno de Manuel Fernández Chacón, se creó un tercer Departamento, con el nombre de Guanacaste, que comprendía no solamente las poblaciones del antiguo Partido de Nicoya (la villa de Guanacaste y los pueblos de Nicoya y Santa Cruz) sino además Bagaces (erigida en villa en noviembre de 1824) y Las Cañas, que siempre habían pertenecido a Costa Rica.