El fracaso de las sucesivas expediciones y la sublevación indígena de 1655, motivaron que los vecinos de Concepción declararan la deposición de Acuña al son de los gritos "¡Viva el rey! ¡Muera el mal gobernador!," actuación que no fue aceptada por el Cabildo de Santiago, la Real Audiencia y la Junta de Guerra, que restableció a Acuña en el mando.