Ya como gobernador, Ramón Rodríguez revirtió muchas políticas de Osornio: detuvo las persecuciones políticas y religiosas, reabrió el Colegio Civil (precursor de la Universidad Autónoma de Querétaro), repartió tierras en los valles de San Juan y Querétaro, restableció los Juzgados civil y penal, y fue desconociendo uno a uno a los diputados y presidentes municipales que seguían obedeciendo a Osornio.