La palabra Babahoyo viene de la cultura chorrera que significa "gavilan oscuro" refiriéndose al Águila Caracolero ave que habita en los sembríos de arroz y se alimenta de caracoles, esta ciudad fue en principios tierra de los "babahuyus", estos eran guerreros de etnia huancavilca que habitaban en esta región, fue con ellos que el conquistador Sebastián de Benalcázar realizó una alianza para evitar el enfrentamiento armado.