La vegetación presenta un gran contraste debido a la existencia de vegetación de tipo xerófila, predominando como especie las Cactaceae hacia las laderas y valles interiores en el sector oriente del cordón (Sotavento), debido a la aridez propia del clima del Secano Costero de la Región de Coquimbo y en algunos sectores, la existencia de bosque húmedo pluvial valdiviano sobre las cimas y sector poniente del cordón (barlovento), consecuencia del efecto conocido como biombo climático que provoca la captación de la humedad aportada por los vientos del océano y que son depositadas en dicho sector, siendo común encontrar en estos bosques especies como: la enredadera epífita medallita, olivillos y copihues, la flor nacional de Chile.