Fue fundada como una empresa privada bajo la denominación "Business Flyers Baselle" por Moritz Suter, cambiando su nombre a "Crossair" el 18 de noviembre de 1978, como paso previo para iniciar sus servicios regulares el 2 de julio de 1979 con vuelos entre Zúrich y Núremberg, Innsbruck y Klagenfurt.