Buscando la pureza clerical, la iglesia admitió la segregación racial cuando el antisemita nuevo arzobispo primado de Toledo, nombrado en 1546, Juan Martínez Silíceo, que se sentía muy orgulloso de ser un cristiano viejo, se opuso al nombramiento de un converso -cuyo padre había sido condenado por la Inquisición- para una canonjía vacante de la catedral.