Después de la misión que le llevó hasta Mérida, Bartolomé Maldonado se quedaba algún tiempo en aquella ciudad e intervino mayormente en la comarca andina explorando y descubriendo diversos parajes en el Valle de Santo Domingo, donde se le adjudicaba una encomienda en lugar de los Carboneros, cercana al paraje donde se encontraban los pueblos de indios llamados Capas y Galgas, en donde se dieron algunas batallas e hirieron a varios españoles, entre ellos a Francisco de Trejo.