En 1439 es investido antipapa seguramente debido a las influencias y conflictos habidos con el papa tras el Concilio de Florencia, en el que parte de la Iglesia griega no aceptaba la unión con Roma, además, la caída de Bizancio poco tiempo después será el detonante para la celebración del Concilio de Basilea, en donde el 15 de julio de 1439 es declarado hereje el hasta entonces papa, Eugenio IV, y es nombrado en su lugar Amadeo de Saboya, que aceptará bajo el nombre de Félix V.