Parece que tras la formación de la cadena montañosa en la que se sitúa, el Ebro, al intentar abrirse paso hacia el sur, quedaba estancado tras los Montes Obarenes más unidos que actualmente a la Sierra de Cantabria, ya que sobre el año 1000 el punto de desagüe se encontraría unos dieciséis metros por encima del nivel actual en las Conchas, formando una laguna que Domingo Hergueta dio en nombrar Laguna de Bilibio.