Tras finalizar el Apertura 2012, el Atlas Fútbol Club y el Club América, buscaban hacerse de los servicios, de Omar Bravo y el Atlas anuncio a Omar Bravo a Préstamo por 1 año con los Rojinegros del Atlas, su paso por el equipo fue un rotundo éxito metiendo un total de 13 goles, entre el Clausura 2013 y Apertura 2013, gracias a sus actuaciones ayudó al Atlas a salvarse de la Situación del Descenso.