El Estudio del Plan Maestro de Transporte (EPTM) del Ministerio de Transporte, de julio de 1994, en su diagnóstico describe un deterioro continuo de las condiciones de navegación, la irracional deforestación de las cabeceras de los ríos, los aportes de sólidos en suspensión, el dragado insuficiente, la inexistencia general de mantenimiento, señalización y balizaje, de los cuidados necesarios para la navegación y de la inadecuada infraestructura portuaria, que han contribuido en la pérdida de incidencia de los ríos en la movilización de cargas y pasajeros.