Restablecida la democracia a fines de 1983, Vilas fue identificado por la CONADEP en varias casos de violaciones de derechos humanos en Tucumán y Bahía Blanca y fue procesado por la Cámara Federal de Bahía Blanca, como autor de crímenes de lesa humanidad en los centros clandestinos de detención "Escuelita de Bahía Blanca" y Base Naval Puerto Belgrano, que estaban a su cargo.