Otro propósito de la Agrupación de Comandos I.M Nº51 es entrenar sus unidades para ser empleadas tras las líneas enemigas, lo que permite capacitarlas en técnicas tales como: empleo de botes de asalto, paracaidismo, buceo, demoliciones, montañismo, combate cuerpo a cuerpo y la utilización de diversas armas y medios para ser insertados en territorio hostil y cumplir las misiones que le son asignadas en cualquier condición de clima y terreno.