Respecto al seminario, seguía formando curas hasta que en 1872, cuando el presidente Antonio Guzmán Blanco decreta su extinción y al mismo tiempo contrata al arquitecto Juan Hurtado Manrique para llevar a cabo la reconstrucción del edificio donde se instalaron: los Tribunales de Justicia, la Gobernación del Distrito Federal, la Comandancia de Policía y taquillas de recaudación de impuestos, mientras que la capilla es destinada a ser Salón de Sesiones del Concejo Municipal del Distrito Federal.