Entre otras distinciones y reconocimientos, Renan fue miembro de la Academia Francesa, Academia de Inscripciones y Lenguas Antiguas (desde 1856), Academia de Ciencias de San Petersburgo (actual Academia de Ciencias de Rusia), la Société Asiatique (de la que fue presidente desde 1884 hasta su fallecimiento en 1892), gran oficial de la Legión de Honor y «administrador» del Collège de France.