Era hija del último emperador del Sacro Imperio Romano Germánico Francisco II, (que, desde 1804, se convirtió en emperador de Austria con el título de Francisco I, porque Napoleón exigió su renuncia en el año en que fue coronado emperador de los franceses), y su segunda esposa y prima María Teresa de las Dos-Sicilias, princesa de Dos Sicilias, de la Casa de Borbón, hija del rey Fernando I y de su esposa María Teresa de las Dos Sicilias.