Gran parte del taijutsu básico que se enseña a los principiantes viene de seis de los linajes de la Bujinkan, generalmente "Kotō-ryū", "Gyokko-ryū", "Shinden Fudō-ryū", "Takagi Yōshin-ryū", "Kuki Shinden-ryū", y "Togakure-ryū.".