Otras dependencias de la universidad son la Clínica de Eppendorf, el nuevo Jardín Botánico y el Instituto de Botánica General en Flottbeck, el Instituto de Construcción Naval en Barmbeck, el Instituto de Hidrobiología y Ciencias Pesqueras en Altona, el Observatorio Astronómico en Bergedorf y algunos Institutos de Física en Bahrenfeld, entre ellos el mundialmente conocido "Deutsche Elektronensynchrotron" (DESY).