Los principales afluentes son, por la derecha, los ríos Chuya (con una longitud de 320 km y una cuenca de 11.200 km²) y Argut (230 km y 9.550 km²); y por la izquierda, los ríos Koksa (150 km y 5.600 km²), Serna y Kámenka (170 km y 1.900 km²).