Siendo nuevamente un niño, se reúne con Zelda y se describe un futuro alternativo en el cual Ganondorf ha sido capturado por sabios que lo encierran en el Reino Crepuscular; estos datos permitieron deducir que el argumento de "Twilight Princess" (2006) ocurre un siglo después de los acontecimientos relatados en "Ocarina of Time", etapa en que Link todavía es un niño.