Como hecho destacado, Fernández Vara se presentó como candidato a presidir la Junta en una moción de censura contra el gobierno de José Antonio Monago el 14 de mayo de 2014, si bien la misma no prosperó al contar sólo con los votos favorables de PSOE y PREX-CREX (30 diputados), frente a la negativa del PP (32 diputados) y la abstención de IU (3 diputados).