Los alumnos eran escogidos por un proceso complejo entre jóvenes menores de 20 años en el que las Sociedades Económicas de Amigos del País, la Junta de Comercio de Madrid y el Ministro de Comercio (que actuaba como "patrón" de la Escuela en nombre del Rey) seleccionaban a los que consideraban más aptos, y los pensionaban durante cinco años.