Fue lugarteniente del gobernador Garay en 1583, quien a su vez había remplazado en la gobernación al adelantado Juan Torres de Vera y Aragón pero al morir asesinado Juan de Garay en el mismo tiempo por el cacique Manúa —los guaraníes se sublevaron bajo el mando de Guayuzalo— que con sus aborígenes guerreros atacaron la ciudad de Buenos Aires, esta fue defendida por Ortiz de Zárate con éxito.