El 31 de enero de 2007, Cole sufrió una seria lesión de rodilla en la victoria por 3-0 sobre el Blackburn Rovers en un juego de Premier League en Stamford Bridge, aunque después de un escaneo se supo que la lesión no era tan grave como se pensó en un principio, con un Chelsea optimista que estaba seguro que Cole regresaría antes del final de la temporada 2006-07.