Bacoachi cuenta con un clima semi-seco y templado, con una temperatura media máxima mensual de 27.3°C, en los meses de julio a septiembre y una temperatura media mínima mensual de 9.1°C de diciembre a febrero; la temperatura media anual de 17.7°C; el período de lluvias se presenta en el verano en los meses de julio y agosto teniendo una precipitación media anual de 444 milímetros; se presentan heladas de noviembre a marzo.