Debido a que los plugins no forman parte del mecanismo de GPG y no están especificados en los estándares OpenPGP, ni sus respectivos desarrolladores están vinculados con los proyectos de plugins, se podría pensar que las ventajas de seguridad de GPG puedan estar comprometidas o incluso perdiendo su efectividad como resultado de esta falta de coordinación y apoyo, pero al ser las herramientas de código abierto o scripts interpretados (como en el caso de los plugins en Thunderbird), se garantiza un funcionamiento fiable con la herramienta GPG.