El templo seguirá decorándose bajo la dinastía XIII, en el segundo periodo intermedio de Egipto, y en particular, por Sebekhotep III que usurpará varios bajorrelieves de sus predecesores, como el de su famoso antepasado Sesostris III, que se pueden ver en el museo al aire libre de Karnak, donde el rey está representado acogido por el dios Montu, así como en el Louvre, que conserva las jambas y el dintel de la puerta de una de las capillas del templo, donde Sebekhotep III reinscribirá su nombre; el templo será modificado más tarde por los faraones de la dinastía XVIII incluido Thutmose III, que reconstruyó el santuario en piedra y lo adornó con estatuas de su efigie.