Al desactivar ese circuito para deshabilitar la sonda RAT, también se deshabilitaba la alarma del TOWS, efecto que no estaba documentado en los manuales del personal de mantenimiento por supuesta dejadez del órgano competente en materia de seguridad aérea en España, la por entonces Dirección General de Aviación Civil (DGAC), ya que existía una actualización de ese manual que nunca llegó a manos de los técnicos de Spanair.