Para comienzos del Siglo XX, García-Mansilla se había convertido en uno de los oficiales más experimentados y capaces de la Armada, por lo que no fue de sorprender que el 21 de marzo de 1900 se lo designara "Comandante Director" de la Escuela Naval Militar en reemplazo del Capitán de Navío Edelmiro Correa, puesto que es considerado un gran honor dentro de la fuerza.