El sistema hidrográfico está formado por tres grandes cuencas: la Río Amazonas, que mide aproximadamente 724.000 km2 y cubre el 66% del territorio boliviano, la cuenca cerrada (endorreica), que mide 145.081 km2 o el 13% del territorio, y la cuenca del río Plata, que abarca 229.500 km2 o el 21% del territorio del país.