Para evitar ser capturado, el Presidente Morales estuvo casi veinte días moviéndose de escondite en escondite, con la pierna fracturada, hasta lograr la intermediación del Ministro Residente norteamericano para que se le permitiera salir al exilio luego de presentar su renuncia, lo que ocurrió el 12 de enero de 1906, siendo aceptada por el Congreso Nacional en esa misma fecha, cuando salió exiliado hacia Puerto Rico en el patrullero norteamericano Dubuque donde le fue atendida la pierna fracturada que estuvo a punto de perder.