Durante la invasión Tarkatana a la "Wu Shi Academy" Raiden es derrotando por Shang Tsung y este toma su forma para engañar a Liu Kang y Kung Lao para que entren en un nuevo "Mortal Kombat", el verdadero Raiden volveria aparecer ya al final del juego para intentar derrotar a Shao Kahn donde con su poder petrifica al emperador para que hací Liu Kang y Kung Lao pudieran dar el golpe final y pudieran terminar el torneo de una vez por todas.