Entre la extensa producción de Onaindia destacan "Grand Placen aurkituko gara" (Grand Place), "Gau ipuinak" (Cuentos nocturnos), "Gilen Garateako Batxilera" (La tau y el caldero), "Carta abierta sobre los prejuicios nacionalistas", "Guía para orientarse en el laberinto vasco", "La construcción de la nación española".