Al año siguiente y con la marcha de David Cobeño en verano de 2006 al Sevilla FC, todo parecía indicar que Casilla tendría más oportunidades de jugar en el filial, pero debido a la llegada de Antonio Adán procedente del tercer equipo y tras su gran actuación en el Europeo Sub-19, y a la titularidad de Jordi Codina, Casilla volvía a ocupar el lugar de tercer portero, que ejerció en el primer equipo, siendo convocado en varias ocasiones por Fabio Capello.