En el torneo Clausura 2012 el equipo logra terminar la fase de clasificación en el tercer lugar de la tabla clasificando a la ronda final del torneo, derrotando en los cuartos de final al Heredia Jaguares con marcador global de 7 a 4, para luego enfrentarse en semifinales al Deportivo Marquense, al cual derrota en visita recíproca por marcador global de 2-1, llegando así a disputar la final del torneo ante el Municipal tal como en el 2010 a visita recíproca cayendo en el primer duelo 1-0 en el Estadio Mateo Flores y ganando el segundo 2-1 con goles de Israel Silva y Wilber Caal, teniendo que definir al campeón del torneo en penalties venciendo así por 3-1 con una gran actuación del guardameta costarricense Fernando Patterson deteniendo 3 de 4 penales y anotando 1 obteniendo así su "Quinta Luna".