Así, se abrieron en el año 2000 las estaciones de San Mamés, Autonomía, Amézola y Zabalburu, se modificó la "estación de Olabeaga", y la estación terminal de los trenes de Cercanías pasó a ser la remodelada estación de Bilbao-Abando, donde también llegan los trenes de largo recorrido, así como los Cercanías de la línea C-3 (Bilbao-Abando-Orduña).