Además de la adición de SDS, se puede calentar opcionalmente las proteínas durante un breve tiempo a una temperatura próxima a la de ebullición en presencia de un agente reductor, como el ditiotreitol (DTT) o el 2-mercaptoetanol (o beta-mercaptoetanol), que contribuirá a desnaturalizar las proteínas reduciendo los enlaces disulfuro, desplegando así algunas formas de plegamiento terciario y rompiendo la estructura cuaternaria (subunidades oligoméricas).