En 1927 se fundó la Asociación General de Estudiantes Universitarios Salvadoreños (AGEUS) -entre cuyos fundadores se encontraba Farabundo Martí- y se estableció por decreto ejecutivo una limitada autonomía universitaria, muy cuestionada por el movimiento estudiantil, que no incluía ni la participación de los estudiantes, ni la elección del rector, limitándose la función del profesorado a presentar una terna al Poder Ejecutivo.