Tras la derrota de su padre a manos de Tomás Cipriano de Mosquera en la guerra civil de 1861 quien lo condenó a una muerte de la que pudo escapar cuando estaba cautivo en Cartagena, gracias a la ayuda de su esposa, la familia se vio obligada a exiliarse en distintos países de Centroamérica, en los cuales el expresidente fue recibido como un "héroe de la fe cristiana".