En el agua, la ecohidrología busca entender la regulación dual - cómo los procesos hidrológicos regulan a los ecológicos (por ejemplo, la liberación del régimen de los ríos regula a las especies y sus poblaciones que viven en ellos) y a la inversa, como un proceso ecológico puede subsecuentemente regular a uno hidrológico (por ejemplo, como presas de contención en las cabeceras y tierras húmedas localizadas más abajo, regulan los tiempos de liberación) - a escala de la base de un río.