Coria y Currie (2006; 75) diagnostican "Mapusaurus" como un terópodo carcarodontosáurido cuyo cráneo difiere de "Giganotosaurus" en que tiene huesos nasales gruesos y rugosos, más angostos en la porción anterior a la unión nasal/maxilar/lagrimal, posee una mayor extensión de la fosa anteorbital hacia el maxilar y menores fenestras maxilares, una barra interfenestral de mayor grosor entre las fenestras anteorbital y maxilar y un lacrimal más bajo y aplanado con un pequeño cuerno.