Tras Enrique, encabezarían dos nobles más la Casa de Manuel de Villena siguiendo la línea de varón no interrumpida hasta llegar a Juan Manuel de Villena y de Sousa, primer señor de Cheles ya a comienzos del siglo XV, siendo a partir de entonces Cheles en Badajoz el lugar de residencia de los Manuel de Villena hasta la marcha de la familia a Madrid ya en el siglo XIX.