A partir de 1935, el gobierno del general Ubico restructuró la división política de la República en un afán de simplificar la administración del mismo; para este efecto suprimió varios departamentos y municipios, los cuales fueron integrados a sus vecinos; Canillá fue suprimido por acuerdo gubernativo del 26 de agosto de 1936 durante el gobierno del general Jorge Ubico y anexado como aldea al de San Andrés Sajcabajá.