A pesar de que a partir del año 2006 el equipo había tenido un repunte de nivel, siendo un serio protagonista de los playoffs en el 2006 y 2007, en el 2008 los Pumas CU no estuvieron en la Conferencia de los 12 Grandes que disputa el Campeonato Nacional, debido a cambios en el sistema de competencia promovidos por los directivos de la Universidad.