El acuerdo de paz suscrito que 91.000 soldados sudaneses se retirarían de Sudán del Sur en un período de dos años mientras que las guerrillas sureñas retirarán todos sus efectivos en el norte del país, manteniendo tanto norteños como sureños fuerzas armadas separadas y se establecería un período de seis años en los que se formaría una fuerza conjunta de 21.000 hombres que se desplegaría en las zonas más violentas, en 2011 se realizara un referéndum de autodeterminación y si el Sur no se independiza formara un ejército de 39.000 hombres para mantener el control interno.