Novosibirsk es el hogar de una de las principales universidades rusas, la Universidad Estatal de Novosibirsk (en ruso Новосибирский Государственный Университет), situada en el famoso complejo científico de Akademgorodok (Centro Científico de Novosibirsk, Sucursal Siberiana de la Academia de Ciencias de Rusia), en el que hay decenas de institutos de investigación como la Escuela de Física y Matemáticas de la Universidad Estatal de Novosibirsk y la Escuela Superior de Informática de la NSU.