La Iglesia Presbiteriana San Andrés comparte muchas doctrinas comunes a otras iglesias surgidas de la Reforma, como por ejemplo las conocidas afirmaciones o ""cinco solas"" de la Reforma: "sola scriptura" (la Biblia contiene la palabra Dios), "sola gratia" (únicamente basta la gracia de Dios para ser salvados de la condenación eterna), "sola fide" (solo la fe dada por Dios nos justifica ante Dios mismo), "solus Christus" (Jesucristo es el único mediador entre Dios y el hombre) y "soli Deo gloria" (la gloria es solo para Dios).