El municipio de Huitzuco de los Figueroa forma parte de la Región hidrológica del Río Balsas y a su vez de dos cuencas del mismo, que son la del Río Grande de Amacuzac, esta se extiende en las zonas centro, oriente y norte del territorio, en los límites con el municipio de Atenango del Río y el estado de Puebla, y la del Río Balsas-Mezcala que proviene del oeste y sur del municipio, en las colindancias con los municipios de Tepecoacuilco de Trujano, Mártir de Cuilapan, Buenavista de Cuéllar y parte de Copalillo.