Más adelante se le dio el mando de la Expedición Challenger (1872-76), pero, debido a su experiencia previa en el Ártico, fue liberado de esa tarea para hacerse cargo en 1875 de otro viaje al Ártico, la Expedición Ártica Británica en busca del Polo Norte, con los buques "HMS Alert" y "HMS Discovery" (capitaneado por Henry Stephenson).