Las praderas submarinas de "Zostera marina", "Posidonia oceanica", "Cymodocea nodosa" y "Zostera noltii", muy abundantes en un pasado cercano, han sufrido un fuerte retroceso llegando a desaparecer en la mayor parte de la bahía y encontrándose solamente en puntos muy concretos como en las cercanías de punta Carnero.