En Pueblo Libre se ubica la Universidad Antonio Ruiz de Montoya, la Universidad Inca Garcilaso de la Vega (facultades de Enfermería, Estomatología e Ingeniería de Sistemas), la Universidad Nacional Federico Villarreal (facultad de Odontología), la Universidad Simón Bolívar, una Facultad de la Universidad San Martín de Porres y la Facultad de Medicina Humana y Ciencias de la Salud de la Universidad Alas Peruanas.