La Generalidad Valenciana creó esta Universidad mediante una ley aprobada el 27 de diciembre de 1996 ("Ley de Creación de la Universidad Miguel Hernández de Elche"), la cual preveía la segregación de varios centros y enseñanzas tanto de la Universidad de Alicante (su Facultad de Medicina, Departamento de Estadística e Instituto de Neurociencias) como de la Universidad Politécnica de Valencia (Ingeniería Agrónoma y tres especialidades de Ingeniería Técnica Agrícola), para su readscripción en la recién fundada Universidad.