La mayor parte de las especies autóctonas, barbo, anguila de río, trucha, callandico, albur, tenca, barbo comizo, barbo cabecicorto, colmilleja, cacho, pardilla o la escasa boga del Guadiana se ven obligadas a competir en sus ecosistemas con especies invasoras muy agresivas tales como el black-bass, la perca sol, el lucio o la carpa.