En lo que respecta a las capitales regionales, el balance arroja que la Alianza conserva sólo 5 de 9 alcaldías (Valparaíso, Rancagua, Talca, Temuco y Valdivia), y la Concertación pasó de 2 a 6 (La Serena, Santiago, Concepción, Puerto Montt, Coihaique y Punta Arenas).