Al final del manga, como en el anime, tras la derrota de Naraku y la destrucción de la Perla de Shikon ambas épocas quedan desconectadas por lo que Kagome e Inuyasha quedan separados, sin embargo tras la graduación de la muchacha misteriosamente el pozo vuelve a funcionar lo que permite a Kagome decidir abandonar el presente y vivir con Inuyasha.