Asunción Nochixtlán se encuentra en la zona noroeste del estado de Oaxaca, en la Región Mixteca y en el caso de la mayor parte del municipio, en el Distrito de Nochixtlán, del que también es cabecera su propia cabecera municipal, otro sector del municipio forma parte del Distrito de Etla de la Región Valles Centrales; esta última situación es debida a que el municipio tiene un territorio discontínuo, está formado por tres porciones territoriales separadas, la principal y más extensa donde se encuentra la cabecera y dos pequeños exclaves, uno al sur y otro al este de la porción central respectivamente.