La bandera del protectorado fue el pabellón azul británico, de 1907 a 1914 con el emblema de la antigua África Central y desde entonces hasta 1964 con el escudo concedido al territorio el 11 de mayo de 1914 —estando hasta el 28 de abril de 1919 dentro de un disco blanco, y desde entonces sin él—, con la excepción del periodo comprendido entre 1953 y 1963, que la bandera fue la Federación de Rodesia y Nyasalandia.