Limita al norte y este con la Diócesis de Pasto, al noroeste con la Diócesis de Tumaco, al sureste con la Diócesis de Mocoa-Sibundoy en el departamento del Putumayo, al suroeste con la Provincia Eclesiástica de Quito, la Arquidiócesis de Quito a la cual pertenece la Diócesis de Tulcán, y el sur con el Vicariato Apostólico de Sucumbios de la República de Ecuador.