Las nanobacterias se encuentran con las mismas dificultades que los nanobios para explicar su existencia como seres vivos, ya que su tamaño no parece ser lo suficientemente grande para contar con la "maquinaria" necesaria para los procesos bioquímicos requeridos para estar vivas, por lo que oficialmente en la comunidad científica no es aceptada su existencia como ese tipo de ser vivo.