A finales de 1511, cuando estaba en las proximidades del cabo de Buena Esperanza, el levantamiento de la región de Goa (probablemente instigados por Adil Shah, que quería liberar la península India del gobierno de Albuquerque y los portugueses), llevó a que Mascarenhas tomara la iniciativa de separarse de la flota para encontrar una manera más rápida de llegar a la India.