Otras diferencias notables entre partisanos y chetniks eran su organización (centralizada y muy disciplinada en el caso de los primeros, descentralizada y menos coordinada en el de los segundos) y su mando militar: frente al entrenamiento formal habitual en los mandos chetniks, muchos de ellos oficiales del antiguo Ejército real yugoslavo, muchos comandantes partisanos no contaban con este, pero sí con experiencia de combate en la Guerra Civil Española.