Durante un viaje de Ohio a Iowa, Cowdery se reunió con Whitmer en el tabernáculo de la ciudad de Council Bluffs, se extendió la invitación de sostener a Brigham Young como el nuevo presidente de La Iglesia de Jesucristo de los Santos de los Últimos Días; Cowdery testificó en favor de Brigham Young, así como de la veracidad de los eventos de la fundación de la iglesia—incluyendo las visitaciones que tuviera Joseph Smith y la aparición divina del Libro de Mormón—.