La FA cuenta con una estructura organizacional en donde la máxima autoridad se llama consejo técnico presidido por el director como presidente del mismo, un representante profesor por cada grado escolar, asimismo un representante alumno por cada grado los dos últimos representante se eligen por elecciones entre la comunidad de alumnos y de profesores, el director de la facultad y presidente del consejo técnico es elegido por el consejo universitario, el cual es la máxima autoridad dentro de la universidad.