Posteriormente, la incursión de la guerrilla del Frente 22 de las FARC trajo consigo la lucha armada; sin embargo, a mediados de 2001, inició la etapa más cruenta del conflicto, ya que la disputa por el territorio entre el grupo guerrillero y paramilitares dejó miles de víctimas de asesinatos, masacres, secuestros y el desplazamiento forzado de muchos pobladores.