El retablo mayor es obra de Luis de Figueroa, de 1629, que contiene seis lienzos de Francisco de Zurbarán (Visión de San Pedro, Conversión de San Pablo, San Pedro, San Pablo, San Hermenegildo y San Fernando) y los dos centrales atribuidos a los hermanos Polanco y que representan el martirio de San Esteban, la Adoración de los pastores y Cristo crucificado.