EMCALI cuenta con certificados como: ISO 9001 por Icontec (para las plantas), ISO IEC 17025:2005 (en los laboratorios) y premios como: Andesco a la Responsabilidad Social Empresarial y el premio por la contribución en la gestión de la PCB por parte del Ministerio del Medio Ambiente y Desarrollo Sostenible y el programa de las Naciones Unidas para el Desarrollo.