Cuenta además con cuatro universidades reconocidas oficialmente por la autoridad educativa estatal: una extensión de la UABC, y tres universidades privadas con RVOEs estatales; la Universidad Rosaritense (primera universidad en establecerse en el municipio, desde el 2002), el Centro de Estudios Universitarios de Baja California y el Centro de Estudios Universitarios de Mexicali.