En la organización de la gestión de administración de la UNNOBA, la misión de la Secretaría de Investigación, Desarrollo y Transferencia es la de asistir al rector y al Consejo Superior en todo lo vinculado con el diseño de la política de investigación científica y tecnológica, y promover los mecanismos necesarios para su fomento y ejecución, así como la coordinación de dicha política con la del conjunto del sistema nacional de investigación científica y tecnológica.