""It's All Over Now, Baby Blue"" ha sido versionada por una gran variedad de artistas, entre los que se incluyen Joan Baez, Bryan Ferry, The Seldom Scene, Them (con voz de Van Morrison) y también Van Morrison en solitario, The Byrds, The Animals, The Chocolate Watchband, Graham Bonnet, Judy Collins, Joni Mitchell, Marianne Faithfull, Falco, The 13th Floor Elevators, los Grateful Dead, Link Wray, Hugh Masekela, Echo and the Bunnymen, Bad Religion, Barry McGuire, Energy Orchard y, más recientemente, Hole y el dúo formado por Matthew Sweet, Susanna Hoffs y The Lookouts.