Sin embargo, el juez de Sucumbíos, Daniel Méndez, llamó a varios altos mandos de las Fuerzas Armadas Colombianas a juicio entre los que se incluyen al general Jorge Ballesteros, al director de la Policía, Oscar Naranjo; el ex comandante de las Fuerzas Militares de Colombia Freddy Padilla, el ex comandante de la Armada Guillermo Barrera, al teniente coronel Camilo Álvarez y al ex comandante del Ejército Mario Montoya.