Ya en el segundo semestre, la ronda de semifinales coincidió con la intervención de la FIFA en la federación de fútbol local en medio de acusaciones de malversación de fondos.Una «comisión normalizadora» fue nombrada para tomar las riendas de la administración, y durante ese periodo los cuscatlecos acabaron fuera de la ronda final al ubicarse en el tercer puesto de su respectiva cuadrangular en la que tuvieron sendos resultados adversos contra Honduras de 2-5 como local y 5-0 como visita.