En 1578 murió su protector y tal vez hermanastro Gonzalo Fernández de Córdoba y Juan Latino le comentaba al nuevo arzobispo, Juan Méndez de Salvatierra, también de humilde cuna, su cariño a su hermano en una sentida elegía: "Tanto pueden las letras -le-, que al faltarnos éstas, ni vos salieredes del campo tras de un arado, ni yo de una caballeriza almohazando caballos".