Trabajó también en el Studiolo de Francisco I donde sus pinturas hacen sentir sus elecciones formales manifestadas particularmente en una serie de palas de altar en diversas iglesias florentinas: La "Sacra conversazione" en Ognissanti, la "Aparición de Emmaus" (1574 con un estilo protocaravaggiesco); la "Resurrección de Lázaro" en Santa Maria Novella (1576), el "Martirio de San Esteban" en la iglesia de los santos Genaro y Protacio (1579), el "Cristo en el Huerto de los Olivos" (1579) en Santa Maria Maddalena dei Pazzi (1591), la "Visión de santo Tomás de Aquino" en San Marco (1593) y la "Anunciación" en Santa Maria Novella (1603).