Después de su sorpresiva salida de los Tigres, Lobos fue fichado en el draft de la Liga MX por el Deportivo Toluca, a petición del entrenador y goleador histórico José Saturnino Cardozo, en un movimiento de $5 millones de dólares, convirtiéndose en el "fichaje bomba" del torneo Apertura 2014.