Cuando se estableció la masonería en Bogotá en 1821 con la llamada logia masónica Libertad de Colombia Nº 1, rebautizada luego como Fraternidad Bogotana Nº 1, Azuero ingresó a ella, al igual que muchos otros sacerdotes partidarios de la Independencia y el republicanismo contra las jerarquías eclesiásticas que continuaban siendo monárquicas y españolas.