Tras años sin fútbol competitivo y tras haber participado varios clubes en la ciudad (como Las Animas y Real Valdivia entre otros), y tras la desaparición de Deportes Valdivia, una organización tuvo la iniciativa y fundó el Club Deportivo Deportes Valdivia el 19 de diciembre de 2003, reviviendo los símbolos del desaparecido Deportes Valdivia recibiendo apoyo monetario de la Universidad Austral de Chile y principalmente de la Ilustre Municipalidad de Valdivia.