El NCAZ coopera estrechamente con la Oficina Federal para la Seguridad de la Información ("Bundesamt für Sicherheit in der Informationstechnik", o BSI); la Oficina Federal de Investigación Criminal ("Bundeskriminalamt", BKA); el Servicio Federal de Inteligencia ("Bundesnachrichtendienst", o BND); el Servicio de Inteligencia Militar ("Amt für den Militärischen Abschirmdienst", o MAD) y otras organizaciones nacionales en Alemania.