Una vez clasificados derrotaron en Cuartos de final a Necaxa con marcador global de 4-3 y clasificaron a la final derrotando a Santos Laguna en la semifinal; proclamándose una vez más campeones, tras derrotar al Atlas de Guadalajara en la serie de penales el Domingo 6 de junio de 1999 con un global de 5-5 en tiempo reglamentario y 5-4 en la muerte súbita de penales para así ganar 10-9 en un global final.