La mayor parte del territorio municipal, un 42%, es cubierto por zona urbana, el 25% del territorio se destina a la agricultura, un 15% esta cubierto por pastizal y un 12% por bosque, el resto se considera como no aplicable a definición; los bosques se encuentran ubicados en las faldas del Volcán Malintzin y continuamente amenazados por un proceso continuo de deforestación principalmente para dedicar las tierras a la agricultura, las principales especies encontradas en esta zona son pino y encino y en la parte más elevada oyamel, además de otras especies menos numerosas como pino harweggi, ocote blanco, palo amarillo, axóchitl, lupinus, escobilla, guapinol y pino chino, en la Sierra de Amozoc también se encuentran zonas de encino, igualmente que en la Sierra del Tentzo donde además se localizan especies más bajas como táscate, jarilla y sabino, al pie de la Sierra del Tentzo se ubica la principal zona de pastizales del municipio en los alrededores de la Presa del Valsequillo que es también una de las zonas mayor erosión del territorio debido a la acción del acarreo de sedimiento por la presa.