Logra ser reelegido al Consejo Federal el 10 de diciembre de 2003, a pesar de que su partido perdió un escaño en el Consejo Federal, superando a Ruth Metzler-Arnold tras la renovación del gobierno (Ruth tuvo que dejar su escaño en manos de Christoph Blocher, miembro de la Unión Democrática del Centro, además, siendo vicepresidenta, no pudo acceder a la presidencia el año siguiente, situación aprovechada por Deiss).