Debido a las políticas de Nintendo, el videojuego presentó cambios severos y notables, la sangre y los movimientos violentos fueron eliminados de la versión para SNES, mientras que en Sega eran más abiertos y en lugar de censurar introdujeron cambios moderados en los elementos (cambiando la sangre por sudor) solo para ser cambiados verdaderamente con violencia mediante el uso de un código especial; en consecuencia la versión Sega de "Mortal Kombat" fue la más vendida que la versión de Nintendo.