Cuando Amenhotep III fue coronado faraón tras el breve reinado de Thutmose IV, Mutemuia asumió la regencia del niño, de apenas doce años, y concertó con su posible hermano Yuya el matrimonio con Tiy, desechando las candidaturas de las hijas nacidas del difunto Thutmose IV con sus dos grandes esposas reales (es probable que Mutemuia les guardase inquina por haberla desplazado).