Y en la final, el 11 de mayo, el club enfrentó en un único partido a Santiago Morning en el Estadio Nacional, con una asistencia de 13 529 espectadores y arbitraje de Carlos Robles: los noventa minutos reglamentarios terminaron con empate a un gol (Clarence Acuña a los 25' y Fernando Martel a los 54'), no obstante, en la prórroga, la «U» se impuso con un gol de oro de Acuña al minuto 118 y se adjudicó el título del Torneo de Apertura de 2000 en calidad de invicto.