Durante su encarcelamiento entre 1954 y 1964 escribió su primer libro exegético (Tafsir) sobre el Corán "Fī ẓilāl al-Qurʾān" (A la sombra del Corán), en el que desarrolla nuevos conceptos que serán fundamentales en su pensamiento: "Hakimiyya li-llah" (la soberanía de Dios) y el de la nueva "yahiliyya" (ignorancia) que impera en la sociedad.