Tras lograr permanecer en segunda división, continúa la siguiente temporada 2016/17 en el equipo andaluz hasta la jornada 27, en la que fue destituido después de perder 2-3 contra el UCAM Murcia dejando al equipo colista con solo 25 puntos y tras encadenar 9 jornadas consecutivas sin conocer la victoria, le sustituyó en el cargo el ex-madridista Luis Miguel Ramis.