A pesar de los múltiples problemas y de su descenso de popularidad en los sondeos de opinión, en las elecciones presidenciales del 20 de marzo de 2004, Chen Shui-bian y Annette Lu consiguieron la reelección para un segundo mandato, con una ventaja de menos de 30.000 sufragios sobre un total de 12,9 millones de votos emitidos.