Debe notarse que lo términos respiración aerobia, respiración anaerobia y fermentación no se refieren a la clasificación nutricional básica, sino que simplemente reflejan el diferente uso de los posibles receptores de electrones en el metabolismo energético de los organismos quimiotrofos, tales como O (respiración aerobia), NO, SO o fumarato (respiración anaerobia), o los intermediarios metabólicos intrínsecos (fermentación).