Entre los depósitos de particulares figuran la "Piedad", obra maestra de Sebastiano del Piombo, o "La mujer barbuda", de José de Ribera (desde 2004), cedidas ambas por la Casa de Medinaceli; y el óleo "Aníbal vencedor contempla por primera vez Italia desde los Alpes", de Goya, que quedará depositado durante seis años por la Fundación Selgas-Fagalde desde septiembre de 2011.