Desde 1874 hasta el final de su vida la actividad de Pringsheim se dirigió esencialmente a cuestiones de fisiología: publicó en una larga serie de trabajos una teoría sobre la asimilación de carbono por las plantas verdes cuyo punto central es la concepción del pigmento de la clorofila como una pantalla, con la función principal de proteger el protoplasma de los rayos solares, que neutralizarían su actividad asimilativa al estimular una respiración demasiado activa.