En abril de 1986 el PCPE tomó parte en la fundación de Izquierda Unida (IU), participando en sus listas electorales en los comicios generales de ese año excepto en Madrid, donde el secretario regional, José Antonio Moral Santín, se desvinculó del Comité Central del PCPE porque se había excluido a la Mesa para la Unidad de los Comunistas comandada por Santiago Carrillo.