Los valores de precipitación anual también fluctúan según las zonas, variando desde los 1900 mm en la parte Norte (confluencia del río Isiboro y río Secure) hasta los 3500 mm en las inmediaciones de Puerto Patino (límite Sureste), con un 80 % del área comprendida en un rango de 2000 a 3000 mm de precipitación media anual.