Por otro lado las subunidades pequeñas tienen más variedad que las grandes en cuanto a secuencia y plegamiento en cada grupo (algas, plantas superiores, bacterias fotosinteticas y cianobacterias), como se observa en la figura 5, mientras que las subunidades grandes son más homogéneas.  La parte central de la subunidad pequeña se pliega en una hoja β-antiparalela de 4 tramos, cubierta por dos α-hélice.