Seis años, vulve a ser elegeido candidato después de resultar ganador en una contienda interna y es postulado por la amplia Alianza Ciudadana conformada por el PRI-PVEM-Partido Fuerza Ciudadana-Partido Liberal Mexicano, con la cual ganó las elecciones del 6 de julio de 2003 con 824,567 votos (58.22%) contra 491,973 votos (34.74%) del panista Mauricio Fernández Garza.