El PRI lo postuló como su candidato a Gobernador en las Elecciones de 2000 en las que fue ampliamente derrotado por el candidato del PAN, Sergio Estrada Cajigal, intentó obtener nuevamente la candidatura de su partido en 2006 pero fue ganada por Maricela Sánchez Cortés, sin embargo Salgado Brito denunció falta de equidad en el proceso interno y se alejó de su partido durante la campaña electoral.