Sumido en una crisis económica, y principalmente debido a las sanciones de resta de puntos decretados por la FIFA terminó último en la tabla de posiciones del año 2015, Sociedad Deportivo Quito descendió por sexta ocasión a la Serie B de Ecuador, torneo que disputaba durante el año 2016, y debido a los constantes problemas económicos, dirigenciales, organizacionales y existenciales, sumado a la disposicion de que si un equipo no se presentaba por dos veces a un partido oficial del campeonato este perderia la categoria como sancion y es asi como terminó prematuramente descendiendo a Segunda Categoría.