De acuerdo a la cuenta pública dada a conocer por la Fundación Teletón en 2006, el costo total realizado por los Institutos de Rehabilitación Infantil alcanza los 10 503 150 382 pesos chilenos (equivalentes a US$19,99 millones), de los cuales $1724 millones son por atenciones médicas, $4714 millones por atenciones terapéuticas y $3250 millones por servicios complementarios de rehabilitación como cirugías, medicamentos, ortesis y prótesis.