En el año de 1996, el Instituto fue afiliado como socio fundador de la Institución Guanajuato para la Calidad y, en 1997, fue designado ganador del Premio Guanajuato a la Calidad, en el Nivel Superior del Sector Educación, posteriormente en el mes de noviembre de 2003, el Instituto recibe el Premio a la Calidad INTRAGOB 2003; en el año 2006 obtuvo el Premio Guanajuato 2000 y el Reconocimiento a la Calidad SEP 2006; así como el Distintivo Guanajuato Crece; y en el año 2007 obtuvo la Constancia de Inscripción por parte de CONACYT como Centro de Investigación.