Javier Solana es hijo de Luis Solana San Martín, fallecido en 1962, doctor en Ciencias y profesor de Química, a su vez hijo del pedagogo y publicista Ezequiel Solana Ramírez, mientras que su madre, Obdulia Madariaga Pérez, fallecida en 2005, era hija del economista Rogelio de Madariaga y Castro, y prima carnal del pensador, diplomático y político, Salvador de Madariaga y Rojo (1886-1978), tío en segundo grado de Javier.