El municipio de San Francisco de Conchos se encuentra en el sur del estado de Chihuahua en la región del río Conchos, sus límites son la norte con el municipio de Saucillo, al noreste en el municipio de La Cruz, al este con el municipio de Camargo, al sur con el municipio de Allende y al oeste con el municipio de Valle de Zaragoza; tiene una extensión territorial de 1,169.10 kilómetros cuadrados.