No obstante, cabe destacar tres características que fueron "borradas" en relación al primer Empire Earth: Primero, ya no hay profetas y por consiguiente tampoco los poderes "sobrenaturales" que caracterizaban a éstos; segundo ya no incluye héroes históricos (como Julio César o Carlomagno por ejemplo) en el modo de escaramuzas, recordando que cada época del primer Empire Earth a partir de la "Edad del Cobre" contaban con héroes diferentes dependiendo de la época en que fueran creados.