Su incesante dedicación a la escritura le llevó a conflictos con el Maestro de su Orden, Tomás de Rocaberti, que ordenó revisar y censurar todas sus obras, si bien un encargo de este mismo, la biografía de la Venerable Hipólita de Jesús, entró en el "Índice de Libros Prohibidos" en 1687 ya fallecido su autor más por la controvertida figura de la biografiada que por el trabajo biográfico de Lorea.