Carlos Morales Vázquez es licenciado en Derecho por la Universidad Nacional Autónoma de México, inicialmente miembro del Partido Revolucionario Institucional, en donde dirigió el Movimiento Territorial, fue Secretario de Organización del comité estatal y Secretario General interino de la Confederación Nacional Campesina en el estado, así mismo fue Diputado al Congreso de Chiapas de 1991 a 1995, ese último año renunció al PRI tras la salida de la gubernatura de Eduardo Robledo Rincón y conflictos con el sucesor de éste, Julio César Ruiz Ferro y se afilió al PRD.