San Gil cuenta con 3 empresas de transporte urbano, que tienen servicio de transporte urbano colectivo en microbuses (busetas), transporte urbano municipal (taxis), servicio escolar o mixto, y radio-carga: Cootraguanenta, Cootrafonce y Cootrasangil (la cual posee un terminal de integración regional propio, próximo a la plaza de mercado).