Tras los sucesos acaecidos en Nibelheim, Hojo captura a Zack Fair y Cloud Strife tras su batalla con Sephiroth y experimenta con ellos, inyectándoles células de Jenova y exponiéndolos a altas cantidades de energía mako durante cuatro años, lo cual produjo una intoxicación en Cloud, a pesar de esto Zack como Primera CLase de SOLDADO no se ve afectado y logra huir del laboratorio junto con Cloud.