El 12 de mayo de 2014 el entrenador de la selección uruguaya, Óscar Washington Tabárez, inlcuyó a Eguren en la lista provisional de veinticinco jugadores con los que inició la preparación para la Copa Mundial de Fútbol de 2014, aunque finalmente no formó parte de la lista definitiva de veintitrés futbolistas que viajaron a Brasil.