Agirretxe volvió a formar parte de la plantilla de la Real Sociedad de cara a la temporada 2018-19 y fue inscrito como tal en la Liga, pero finalmente acabó por tirar la toalla y al poco de iniciarse la temporada, el 29 de agosto de 2018, decidió poner punto final a su carrera como futbolista profesional, después de haber sufrido una nueva lesión muscular de gravedad, pocos días antes en el cuádriceps de su pierna derecha.