En las batallas aparece una pseudocápsula con brazos aplanadores y Robotnik aparece 2 veces: primero Sonic y Knuckles deben huir de un rayo láser controlado por Eggman que se mueve por el techo de una recámara, el cual, si se resiste lo suficiente, se detiene al destruirse a sí mismo debido a un aparente "fallo" por parte de Eggman durante su construcción, y luego se enfrentan a la máquina lanza fuego del Dr.