En 1955, producido el golpe militar que derrocó al presidente Perón, Próspero Germán Fernández Alvariño, conocido como el Capitán Gandhi, uno de los jefes de los grupos parapoliciales antiperonistas llamados "comandos civiles", exhumó el cuerpo de Juan Duarte, le cortó la cabeza y la mostraba en su oficina a los visitantes para demostrar que había sido asesinado.