En julio de 2014 es confirmado como nuevo jugador del Atlético Nacional de Colombia, teniendo actuaciones sobresalientes durante este año en el equipo verde de Medellín logró participar en varios encuentros tanto de liga como de Copa Sudamericana, en esta última su equipo disputó la final contra el River Plate de Argentina y Guerra participó en el partido de ida en el cual su equipo empató a 1 gol.