En 2017, tras una resolución de la Dimayor que obligaba a todos los equipos profesionales del fútbol colombiano a contar con un equipo femenino, se fundó el Junior de Barranquilla Femenino que jugaría su primer torneo en la Liga Femenina 2018, compartiendo el grupo D con Atlético Nacional, Envigado, Real Cartagema y Unión Magdalena.