Desde 2003, con la incorporación de trenes en sentido contrario y la inauguración de la estación de El Casar (donde la correspondencia con Metro atrae a numerosos viajeros), todos los trenes CIVIS adoptaron el mismo esquema de paradas, al que se añaden Nuevos Ministerios y Chamartín desde septiembre de 2008 y Sol a partir de junio de 2009.