El cadáver de Vélez fue trasladado a Santiago, recibiendo sepultura en la Catedral, cerca de la reja del coro, al lado del Evangelio, pero antes, al proceder al embalsamamiento, se le extrajo el corazón, que, colocado en una redoma de cristal en alcohol, se conserva en una urna abierta en la pared de la capilla interior del Seminario, en el lado de la Epístola.