En 1863 Frontera es invadida nuevamente por un gobierno extranjero, en esta ocasión, los franceses, quienes durante la intervención francesa en Tabasco, toman el puerto el 15 de marzo y posteriormente el 18 de junio atacan la capital del estado San Juan Bautista, tomándola y apertrechándose en el edificio llamado "El Principal" de donde son desalojados por las fuerzas tabasqueñas en la batalla del 27 de febrero de 1864.