Tomochi fue fundado en 1688 como un pueblo de misión con el nombre de Purísima Concepción de Tomochi, por padres de la Compañía de Jesús, durante la época de la colonia tuvo lugar una insurrección de indígenas tarahumaras, liderados por el caudillo Teporaca o Gabriel Teporame, que arrasaron el pueblo, posteriormente a su derrota por el ejército español, Teporaca fue ahorcado en las cercanías de Tomochi para que sirviera de escarmiento a los demás indígenas.