Ya en la Lituania independiente, estuvo trabajando como funcionaria pública en diferentes departamentos del gobierno lituano, bajo un perfil tecnócrata sin adscripción política; primero en el ministerio de Relaciones Económicas Exteriores (1991-1993) y luego en el ministerio de Exteriores (1993-1996), donde negociaría con éxito la firma del tratado de libre comercio con la Unión Europea y del Acuerdo Europeo de Asociación.