A la espalda de estos, en torno a una nueva plaza que miraba hacia San Fernando, transformada en la actual alameda, se situó el Cuartel de Batallones (actual sede del Tercio de la Armada) y detrás de la iglesia el convento de los franciscanos, transformado desde el primer momento en hospital para atender las necesidades de la Guerra de la Independencia (sustituido en otra ubicación por el actual Hospital de San Carlos.