Su primera publicación oftalmológica fue en 1942 cuando presentó el primer instrumento creado por él, El Queratotomo Barraquer con fijación neumática , para hacer las incisiones en la cirugía de catarata con mayor precisión; Desde entonces y hasta 1950 publicó 56 artículos entre los cuales debemos mencionar La inyección intraocular de aire en la cirugía de catarata (1946), Histioterapia (1948), Curare en la cirugía ocular (1949), Actual técnica de elección en Queratoplastia Penetrante (1949) en la que describió la técnica que empleamos hoy en día de la sutura “borde a borde” en los trasplantes penetrantes de córnea, para lo cual había diseñado una aguja y la seda virgen de 7 filamentos; y Queratoplastia Refractiva (1949), el primer artículo sobre su teoría para poder corregir la miopía y la hipermetropía modificando el radio de la cara anterior de la córnea y que fue publicado en español, Francés Inglés y alemán.-