Probablemente recibió este nombre en remembranza de la quebrada de Guaya, que pasa por Tenza, donde había nacido Andrés Medina y de la terminación «Tá», que en chibcha significa «tierra de allá»; Existe otra versión sobre el nombre de Guayatá, es: «Guaita» con i latina, según la etimología chibcha significa «sembrado o dominio de la cacica», «Ta» quiere decir labranza en la lengua indígena.