Con posterioridad el MIR-EGP se vería fuertemente debilitado por el accionar policial, culminando con gran parte de sus militantes encarcelados o desertando su pertenencia al grupo, quedando para mediados de los años 90 relegados a remanentes sin una dirigencia política concreta culminando por fragmentarse en múltiples grupos ya a finales de la década, destacándose entre estos a los Grupos de Acción Popular.