Inicialmente llamada "San Miguel el Grande", la población fue elevada a la categoría de ciudad, el 8 de marzo de 1826 (durante el primer sistema federalista), por decreto del Consejo Constituyente, con el nombre de San Miguel de Allende; El nombre de "San Miguel de Allende" está formado por los nombres de "Fray Juan de San Miguel", fundador de la población, y de "Ignacio Allende", caudillo de la Independencia Nacional.