El informe desfavorable de su antiguo maestro, José Viera y Clavijo, anclado en la teoría del flogisto, contra Gutiérrez Bueno y Chavaneau (por haber aceptado la nueva visión elemental de la química y la nueva nomenclatura) propició el cierre de los laboratorios, aunque éstos finalmente se unificarían en 1799 en el Laboratorio Real de Madrid, a cargo de Proust, un químico de visión moderna.