En 1918, Isidro se dio de baja del Ejército, pero cuando Pedro Zamora fingió amnistiarse en julio de 1920, para luego remontar a la sierra de Quila y desconocer al gobierno de Adolfo de la Huerta, tomar Mascota, Talpa y Cuautla, tomar de rehenes a 12 mineros extranjeros y exigir medio millón de pesos como rescate, el general Rafael Buelna recurrió a Isidro Michel como su guía para rastrear a Zamora.