En San Ciro de Acosta se registran tres tipos de diferentes de climas, una zona muy pequeña en su extremo oeste tiene un clima "Seco templado", el tercio noreste tiene un clima "semiseco semicálido" y el resto del territorio "semicálido subhúmedo con lluvias en verano"; la temperatura media anual que se registra va de 20 a 22°C, con excepción de una zona en el oeste del territorio que lo atraviesa de sur a norte y donde el promedio es de 18 a 20°C; la precipitación media anual en la zona noreste del municipio es de 600 a 700 mm, y en el resto de su extensión es de 700 a 800 mm.