El 1 de febrero de 2017 empezaba la travesía de los "albos" en la Conmebol Libertadores 2017 contra Botafogo en el Estadio Olímpico Nilton Santos de Brasil por la Fase 2, a pesar del buen partido del conjunto chileno cayeron por 2-1 con goles de Airton y autogol de Esteban Pavez, Esteban Paredes descontó para la visita, la vuelta el 8 de febrero en el Estadio Monumental, chilenos y brasileños empataron 1-1 lo que marcó una nueva eliminación del cacique en el máximo torneo continental, un autogol de Emerson Silva adelanto a los locales al minuto 3, después Rodrigo Pimpão aprovecho un erro entre Villar y Baeza al minuto 80' para anotar el 1-1 final, en el partido de vuelta Justo tuvo grandes intervenciones, como por ejemplo el disparo que desvió al córner de Walter Montillo al minuto, y el cabezazo de Marcelo al 20' entre otras.