En 1861 esta comisión pasó a denominarse Junta General de Estadística, bajo dirección de Alejandro Oliván, la cual contaba con tres secciones claramente diferenciadas: la de «operaciones geográficas», la de «mapas especiales» y la de «operaciones topográfico-catastrales», encomendadas respectivamente a Francisco de Luxán, Agustín Pascual y Francisco Coello; estas tres evolucionarían cinco años después hasta la formación de la sección de Estadística y la de Operaciones Geográficas.