En la 2000-01 (donde llegó con los Raptors hasta Semifinales de Conferencia, siendo eliminados en el séptimo partido por Philadelphia 76ers) y 2001-02, Williams jugó los 82 partidos con el equipo, siendo en esta última titular en todos ellos y firmando 11.8 puntos y 5.7 asistencias en 35.7 minutos de juego.