Aoiz se encuentra dentro del área hospitalaria de Pamplona, la cual cuenta con 2 hospitales generales con nivel terciario: El Hospital Virgen del Camino y el Hospital de Navarra ambos ubicados en Pamplona, un hospital monográfico de ortopedia y rehabilitación: La Clínica de Ubarmin, ubicada en la localidad de Elcano, cuatro centros de atención especializada (5 de ellos ubicados en Pamplona) y 6 centros de salud mental repartidos en diferentes localidades siendo el más cercano a Aoiz el situado en Burlada.