En 1804 y 1812 Jarafuel sufrió la enfermedad de la peste causando numerosas muertes en 1834 fue el cólera el que se llevó a la tumba hasta el 5% de su población, igualmente desastrosas fueron las epidemias de viruela de los años 1836,1845 y 1849 en el 1854 se inició aquí la epidemia de cólera asiático que azotó a la provincia de Valencia, entre 1860 y 1885 Jarafuel sufrió hasta 4 veces epidemias de sarampión y viruela y en 1885 y 1887 a estas enfermedades se unió nuevamente el cólera , en 1897 la viruela se llevó el 7,23 % del total de la población y ya en 1919 la gripe atacó con tal virulencia la población que las campanas de la iglesia dejaron de tañir ante la acumulación de fallecimientos.