La masacre fue planificada escrupulosamente por el rey, quien estaba en Éfeso, escribiendo a los sátrapas y magistrados para comenzar el mismo día en varias ciudades de la región, como Éfeso, Pérgamo, Adramittio, Cauno, Aydin, Nisa y la isla de Quíos, donde los perseguidos intentaron refugiarse en los templos, pero fueron ejecutados a flechazos mientras se agarraban de las estatuas pidiendo misericordia, sus manos les eran cortadas, a los que intentaron huir a nado por mar los ahogaron y muchas veces se forzó a los esposos ver morir a sus mujeres, quienes antes tuvieron que presenciar la ejecución de sus hijos.