Para explicar el significado simbólico de estos tres poemas, escribió posteriormente cuatro tratados en prosa, a modo de comentario, en los que expone lo esencial de su doctrina mística: "Subida al Monte Carmelo", que comenta las dos primeras estrofas de "Noche Oscura"; "Noche oscura del alma", que comenta esas mismas estrofas y el principio de la tercera, y "Llama de amor viva", que comenta el poema del mismo nombre.