En 2001, mediante Acuerdo Superior 200 la Facultad de Medicina Veterinaria y de Zootecnia se transforma en Facultad de Ciencias Agrarias a la cual se adscriben la Escuela de Medicina Veterinaria y la Escuela de Producción Agropecuaria, igualmente el Departamento de Formación Académica de Haciendas.