El tetrámero formado por unidades idénticas adopta 2 diferentes conformaciones: en el estado "cerrado", la unión de un ion magnesio puentea los grupos fosfato del producto enzimático (ADP y fructosa-1,6-bisfosfato), y en el estado "abierto", el ion magnesio se enlaza únicamente al ADP, mientras que los dos productos se encuentran ahora separados.