Desde la fundación en 1943 el certamen fue llamado Segunda División de Lima, en 1988 pasó a llamarse Segunda División Profesional y desde 2006 Segunda División Nacional ya que se decidió descentralizar el torneo (hasta entonces reservado para equipos del departamento de Lima y la provincia constitucional del Callao), el campeonato se empezó a jugar con de diferentes regiones y departamentos del Perú.