La aldea fue nuevamente incendiada y devastada por piratas holandeses en 1633 y en agosto de 1643 Trujillo contaba con solo 150 españoles y 600 indios, cuando fue atacada por el pirata Guillermo Jackson, que traía 16 navíos y bajo su mando unos 1,500 hombres en su mayoría norteamericanos puritanos, en fecha 20 de julio, Jackson tomo la ciudad que sucumbió sin menor esfuerzo, apoderándose también de las Islas de la Bahía de las cuales realizó planos topográficos.