En diciembre de ese año, Fats Waller ―muy fatigado y aquejado de una delicada salud―, decidió regresar a Nueva York para pasar las fiestas de fin de año, pero muere en el tren el 15 de diciembre de 1943, víctima de una neumonía, en la estación de Kansas City cuando contaba tan solo con 39 años de edad.