En ella se encuentran: las "Tablas de Añes"; las tablas de la "Aparición de San Miguel" y el "Apostolado", conjunto de diez óleos del primer cuarto del siglo XVI y de autor desconocido procedentes del antiguo retablo mayor de la parroquia de San Miguel de Labraza; el "Retablo del Dulce Nombre"; el "Retablo de San Nicolás de Bari", obra plateresca de tres cuerpos, tres calles y ático entallado por los burgaleses Ortega de Córdoba y Diego Guillén y policromado hacia 1539 en el taller de Diego de Torres el Viejo, en depósito de la parroquia de San Nicolás de Bari de Fontecha; el "Retablo de San Blas", con mazonería de dos cuerpos, tres calles, ático y guardapolvo ejecutado hacia 1530 aunque de traza aún plenamente gótica, con talla policromada del santo y óleos sobre tabla, procedente de la parroquia de San Vicente de Hueto Abajo; y, los dos relieves realizados por Juan de Ancheta en estilo romanista en 1578, la "Flagelación" y la "Coronación de Espinas", procedentes de la parroquia vitoriana de San Miguel.