Sobre la base de los caracteres mandibulares, se sugirió que "Astrapothericulus" podría ser el ancestro de "Astrapotherium", aunque más tarde se interpretó que "Astrapothericulus" representaría un linaje divergente distinto de los de "Astrapotherium" y "Parastrapotherium", probablemente derivado de "Astraponotus" en el Eoceno.