En Navarra el EAJ-PNV formó parte de la coalición Nafarroa Bai, que fue la segunda fuerza política de la comunidad foral, con uno de los doce escaños que correspondieron a la coalición y posteriormente, tras las escisiones de algunos de sus miembros también participó en Nafarroa Bai 2011 y en Geroa Bai.