Aizpún fue uno de los veintidós juristas que, designados por el Ministerio de Gobernación franquista, elaboraron el “"dictamen sobre la ilegitimidad de los poderes actuantes el 18 de julio de 1936"”, documento publicado el 21 de diciembre de 1938, que pretendía justificar la sublevación militar que provocó la guerra civil española.