Atraviesa dos importantes capitales regionales —Toulouse (), capital de Occitania, y Burdeos (), capital Nueva Aquitania—, además de bañar otras importantes ciudades (en dirección aguas abajo): Montréjeau (), Saint-Gaudens (), Muret (), y Blagnac (), en Alto Garona; Verdun-sur-Garonne (), Castelsarrasin (), en Tarn y Garona; Agen (), Tonneins (), Marmande (), en Lot y Garona; y La Réole () y Langon (), en Gironda.