En el club vasco jugaba un joven Pablo Orbaiz, flamante fichaje procedente de Osasuna, pero Luis Fernández decidió que Pablo permaneciera un año más en el club navarro y, a cambio, Tiko fuera cedido al club rojiblanco.Debutó en Primera división el 12 de octubre de 1999, en el partido Málaga 3-4 Athletic.El 29 de diciembre de 1999, el Athletic pagó 150 millones de pesetas por su fichaje.El 27 de febrero anotó su primer gol en el empate a dos ante el Málaga.A pesar de ello, en sus dos primeras temporadas fue suplente habitual y rondó los 1.000 minutos por temporada.