En agosto de 2010, es nombrado Ministro de Defensa del gobierno de Juan Manuel Santos del Partido de la U y es bajo su inmediata dirección que se concibe la "Política Integral de Seguridad y Defensa para la Prosperidad" y se ejecuta la Operación Sodoma (Septiembre 2010) donde es dado de baja el principal lider militar de las FARC, Jorge Briceño alias Mono Jojoy, así como la más grande ofensiva contra las bandas criminales que dio como resultado el abatimiento de su principal cabecilla alias "Cuchillo" (Diciembre de 2010) y la adopción de las Operaciones Troya que redujeron el accionar de estas organizaciones en distintas regiones del país.