En 1999 fue candidato del PRI a Gobernador de Baja California Sur, en la elección interna del PRI le ganó la candidatura al entonces Presidente Municipal de La Paz, Leonel Cota Montaño, quien desconoció los resultados, renunció al PRI y fue postulado candidato a Gobernador por el Partido de la Revolución Democrática, se enfrentaron en la Elecciones constitucionales, resultado derrotaro Manríquez.