Un ejemplo muy conocido de este error es el que hizo que Carl Woese sugiriera en su sistema de los tres dominios que los eucariotas eran uno de los clados más antiguos de la naturaleza junto con otros dos clados bacterianos, lo que se sabe que es posible tanto sobre la base de análisis morfológicos como paleontológicos, pero que debido a los grandes cambios que experimentó evolutivamente este grupo aparece así invariablemente en los análisis moleculares de la mayoría de genes.