Aun así el equipo cosechó un magnífico debut en la Liga de Campeones de la UEFA y fue superando eliminatorias con Claudio López como máximo goleador del equipo en esta competición con 5 goles, más uno en la fase previa, y alcanzó en su primera participación disputar la final contra el Real Madrid el 24 de mayo de 2000, sin poder alzarse con el título pese a que el Valencia había demostrado un juego de mayor calidad y efectividad durante toda la competición.