Proveniente de una familia acomodada con vínculos militares, Germán Marín estudió en el Colegio San Ignacio y después un tiempo en la Escuela Militar Bernardo O'Higgins, donde durante un año fue cadete de Augusto Pinochet (este era capitán de compañía y el futuro escritor estaba en la primera sección de su compañía); de ahí pasó al Internado Nacional Barros Arana.