Cumpliendo con lo esperado, Thorpe falló al conseguir la clasificación, terminando en el lugar 23 en los 400 metros estilo libre y 36 en los 200 estilo dorso.Para el fin de ese año (1996), había crecido alcanzando 1.90 m de altura y 90 kg de peso, y también había conseguido la calificación para los Campeonatos Australianos de Piscina de 25 m.