Palacio continuó con las negociaciones de Tratados de Libre Comercio que se iniciaron en el gobierno de Gutiérrez, teniendo avances en las negociaciones con EE.UU., siendo considerado esto por políticos de izquierda y de oposición como una traición de su promesa de retomar el modelo de gobierno progresista por el que fue electo como vicepresidente, además de bajar estándares de soberanía económica.