El 21 de octubre de 1558 fue enviado para el gobierno de Nápoles, aunque no se sabe exactamente si con el cargo de virrey o simplemente como lugarteniente general, pues los historiadores no se ponen de acuerdo, y aunque aparece citado en las listas de virreyes como tal, en la documentación oficial aparece con el título de lugarteniente, y nunca con el de virrey, como aparece en una carta enviada por Felipe II para comunicarle el Tratado de Chateau-Cambresi el 4 de abril de 1559, en la que se dirige a él como «nuestro muy caro y muy amado amigo y lugarteniente general».