Desde su inicio, la Tok'Ra no ha hecho muchos aliados, debido en parte a su parecido con los Goa'ulds, ya que aunque son bondadosos, también comparten el defecto goa'uld de la arrogancia, creyéndose mejores que otras razas y culturas, aunque saben reconocer sus errores, por esto hasta ahora se conoce su alianza con los Tau'ri (terrestres) con los que comparten información y tecnología, los Jaffa Rebeldes alianza debilitada debido a los resentimientos de pasado de los Tok'ra hacia los Jaffas que tantos de los suyos han matado y de los Jaffas que no pueden evitar ver a los Tok'ra como a cualquier goa'uld; también existía una alianza con los tolanos hasta su destrucción.