Ambrosio Alfinger murió en mayo de 1533 en "Chitacomar" del territorio independiente de los chitareros —actualmente en el municipio de Chinácota, ubicado entre Pamplona y Cúcuta— y tras cuatro días de agonía causada por una flecha que le había atravesado su garganta, siendo el responsable un aborigen de la etnia chimila, apodado "Francisquillo".