Se requiere diferenciación de otras fiebres hemorrágicas; así en África, de la fiebre de Lassa, enfermedad de Marburg, fiebre Ebola, fiebre amarilla, infecciones por hantavirus (fiebre hemorrágica con síndrome renal), y, en Europa, de la fiebre hemorrágica de Omsk, la enfermedad de la Selva de Kyasanur e infecciones por hantavirus.