Aparte de unos pocos trabajos para organistas noveles, como "79 Chorales op." 28, la mayor parte de la música para órgano de Dupré va desde una moderada a una extrema dificultad, siendo alguna de ella casi imposible de ejecutar técnicamente por el instrumentista (por ejemplo, "Évocation", "op." 37; "Suite", "op." 39; "Deux Esquisses", "op." 41; "Vision", "op." 44.