Branca tenía vínculos económicos con Massera, y quienes lo relacionan a éste con su desaparición plantean tanto la hipótesis de que su socio quiso defraudarlo -al desaparecer era propietario de dos departamentos en Estados Unidos y al menos uno de ellos pasó a su primera mujer- como la de su relación amorosa con la esposa de Branca, aunque lo realmente importante era la parte económica.