Atlas en el torneo de Copa (ya con nuevo formato) quedó en el grupo 3 con Rayados de Monterrey, Necaxa y Club León, Atlas quedó líder de grupo empatando con 11 unidades con Rayados, Atlas en calidad de local derrotó a sus 3 rivales por marcador de 2-1 y de visita empatando 2 encuentros solo perdiendo ante los Rayados por 1-0, José Delgado y Fernando Padilla fueron los máximos anotadores en la fase de grupos.