El 22 de abril fue investido presidente de la Junta de Andalucía por el parlamento autonómico, con 56 votos a favor (PSOE) y 53 votos en contra (PP e IU), prometiendo el cargo el 23 de abril en un acto de toma de posesión en el que asistieron los tres anteriores presidentes andaluces: Rafael Escuredo, José Rodríguez de la Borbolla y Manuel Chaves; junto con el presidente de Castilla-La Mancha, José María Barreda; la secretaria de Estado de Inmigración, Consuelo Rumí; y el presidente del Tribunal Superior de Justicia de Andalucía, Augusto Méndez de Lugo.