No pudo volver a estudiar sino hasta 1896 cuando, con 35 años, se matriculó en la Universidad de Stanford, donde completó su licenciatura en 1899, en el año 1900 completó los estudios de maestría y redactó su tesis doctoral "Studies on Ciliate Infusoria", que fue su primer trabajo publicado y apareció en los "Proceedings of the California Academy of Science".