Sin embargo, cuatro días después, el Presidente de la República, Manuel Ávila Camacho, decidió pedir tanto a este rector como al rector efímero, Manuel Gual Vidal, designado por el Consejo Universitario, que renunciaran, ya que se había nombrado una junta de avenimiento (la Junta de exrectores) que asumiría el gobierno de la institución y restablecería la organización universitaria.