La fauna en el municipio de Dzidzantún es diversa, (tanto en áreas retiradas o montes y en algunas zonas urbanas) se pueden encontrar los siguientes animales: ardilla yucateca, tlacuache sureño (erroreanmente conocido como "zorro"), iguana espinosa del golfo ("iguano común") tamandúa norteño (oso hormiguero), tigrillo, coatí de nariz blanca ("pizot"), venado cola blanca, murciélago, entre otros.