Con su carrera algo inactiva dentro de los 90, dentro del nuevo milenio Honda regresa con nuevos trabajos, trasladándose desde la música Pop a melodías de música clásica, con lo que estuvo trabajando hasta el año 2005, donde le fue diagnosticada una leucemia mieloide aguda, enfermedad de la cual finalmente murió en un hospital de Tokio el 6 de diciembre del mismo año.