La vida de Alonso de Padilla permanece documentada por documentos fortuitos y dispersos, se sabe que contrajo matrimonio con Clemencia Maldonado y Viloria, perteneciente a una de las familias más ricas de la provincia de Cartagena y que es tataranieta de Don Alonso de Heredia, fundador de Tolú y Mompós y hermano de Don Pedro de Heredia, fundador de la provincia de Cartagena de Indias.