El territorio municipal de Puebla es muy variado en su relieve y se encuentra dominado tanto por elevaciones importantes como por el Valle de Puebla-Tlaxcala en donde se asienta en su mayor parte la cabecera municipal, la altitud del territorio va desde 1 980 metros sobre el nivel del mar en el sector más bajo del valle hasta alcanza los 4 420 metros sobre el nivel en la cima del Volcán Malintzin, también conocido como Matlacuéyetl o La Malinche y que es la quinta mayor elevación del estado de Puebla.