Con posterioridad a la crisis de 2001 que llevó a la renuncia del Presidente Fernando de la Rúa, y a una profunda crisis del radicalismo, la Junta Coordinadora Nacional, al igual que el Movimiento de Renovación y Cambio entraron también en una etapa crítica, que se profundizó con la muerte de Raúl Alfonsín en el año 2009