Del Museo Arqueológico a su vez se separarían las de origen americano (hasta entonces en la "Sección IV o de Etnografía") por el Decreto de creación del Museo de América, de 19 de abril de 1941, que establecía que «El fondo inicial lo constituirán las colecciones de Etnografía y Arqueología americanas existentes en el Museo Arqueológico Nacional, con sus libros, vitrinas y mobiliario».