El gobernador César Duarte fue acusado en múltiples ocasiones de nepotismo, ya que varios familiares suyos ostentaron algún cargo o puesto público, entre ellos se encuentran sus hermanos Ricardo Duarte Jáquez, rector de la Universidad Autónoma de Ciudad Juárez; su otro hermano Crecesiano Duarte Jáquez, funcionario alto en la Universidad Autónoma de Chihuahua; Sixto Duarte Jáquez, quien es responsable de la flota aérea del gobierno de Chihuahua; Jesús Alonso Duarte García, que fue director general del Colegio de Bachilleres del Estado de Chihuahua, Ricardo Gómez Carrillo que fue director del plantel 10 del Colegio de Bachilleres y es primo de su esposa Bertha Gómez Fong; Balbina Duarte sobrina del mandatario es fue nombrada jefa del Departamento de Educación Media Superior y Superior en Ciudad Juárez; su sobrino Sixto Duarte Álvarez, fue asesor del director de la Junta Municipal de Agua y Saneamiento en Ciudad Juárez; Sofía Duarte es parte del equipo de trabajo de la esposa del gobernador y sobrina del mismo y Federico Duarte, presidente de la Unión Ganadera de Chihuahua.