De una ilustre familia vascongada, descendiente de Aizarna (Cestona), en donde se halla la casa solar de que esa estirpe procede, era hijo de Casimiro de Egaña y Cortázar, nacido en Tolosa, doctor en Derecho y catedrático de Filosofía de la Universidad de Oñate, y de su prima Higinia Díaz del Carpio y Cortázar, nacida en Vitoria.