El 10 de enero de 1993, la ciudad es por primera vez en su historia asediada de manera feroz por aproximadamente 1000 terroristas del grupo armado "Movimiento Revolucionario Túpac Amaru" (MRTA), con el uso de armas de guerra, incluidas ametralladoras y morteros, cargas de dinamita, y autos bomba, que bloquearon cinco accesos de la ciudad, y se enfrentaron en distintos barrios contra las Fuerzas Armadas Peruanas y elementos de la Policía Nacional; durante el evento fallecieron 9 policías, más de 6 terroristas (algunas fuentes mencionan hasta 30), 2 soldados de la Base Militar de Rioja, 4 soldados del destacamiento de Tarapoto, y 02 soldados de Infantería de Moyobamba, además de indeterminado número de civiles, por el fuego cruzado, incluidos dos varones tras la explosión de una agencia bancaria del Banco de Crédito del Perú, y una mujer que se refugiaba tras un muro en la zona sur de la ciudad.