Salvo en el tramo inicial, cerca de su cabeza, el río Neches, en todo su curso, sirve de frontera natural entre condados: Van Zandt y Smith, Smith y Henderson, Henderson y Cherokee, Cherokee y Anderson, Cherokee y Houston, Houston y Condado de Angelina, Angelina y Trinity, Angelina y Polk, Angelina y Tyler, Tyler y Jasper, Jasper y Hardin, Hardin y Orange, y finalmente, Orange y Jefferson.