Las precipitaciones anuales son escasas en casi la totalidad de la cuenca -alrededor de 400 mm en el Norte, de 500 a 600 mm en la zona de clima siberiano de verano fresco, de 300 a 400 mm más al sur (clima siberiano meridional), y caen, las cuatro quintas partes, durante el período estival limitada a dos meses.