Las principales universidades con sede en Rostov del Don son la Universidad Federal del Sur (YuFU), el Centro Científico de la Academia de Ciencias de Rusia del Sur (YuNTS RAN), la Universidad Estatal de Medicina de Rostov (RGMU), el Conservatorio Estatal de Rostov Serguéi Rajmáninov (RGK), y la Universidad Estatal Técnica del Don (DGTU).