Tras debutar en el año 2001 con la selección portuguesa sub-17, con la que disputó dos partidos del Campeonato Europeo Sub-17 de la UEFA 2002, fue ascendiendo por las distintas categorías hasta que, en el año 2003, Cristiano fue convocado por primera vez con la selección portuguesa sub-21, conjunto con el que logró clasificarse para la Eurocopa Sub-21 de 2004 tras derrotar a Francia en el partido definitivo de "play-off".