Desde 2004 la cabecera santabarbarense cuenta con una sede de la Universidad Tecnológica de Honduras (UTH), y otra sede de la Universidad Pedagógica Nacional Francisco Morazán (UPNFM), como el Sistema de Educación Universitario a Distancia (SUED) de la UNAH y el centro asociado de la Universidad Cristiana Evangelica Nuevo Milenio (UCENM).