Por su experiencia en el campo agropecuario a través de la empresa familiar Bachoco, Eduardo Bours llegó a presidir el Consejo Nacional Agropecuario y fue nombrado Negociador Representante del Sector Privado en Materia de Agroindustria en las negociaciones del Tratado de Libre Comercio con los Estados Unidos de América y Canadá (COECE).