En represalia, la misma noche del 16 de junio simpatizantes peronistas ―en el conocimiento de la estrecha relación entre la cúpula eclesiástica y los sediciosos que provocaron el atentado terrorista― incendiaron la Curia Metropolitana, las basílicas de Santo Domingo y San Francisco, junto con otras ocho iglesias, sin que los policías y bomberos lo impidieran.