Tiene como misión planificar, ejecutar y controlar todas las actividades antárticas de carácter científico, tecnológico, logístico, ambiental y de difusión, además de administrar una serie de bases antárticas en el Territorio Chileno Antártico; estas tareas se asentaron con la aprobación del Reglamento Orgánico del Instituto Antártico Chileno del 28 de febrero de 1964 y sus posteriores modificaciones.