La provincia de Varese se encuentra bajo los Alpes, de forma que las montañas y las colinas constituyen un 32% y un 46% de su territorio respectivamente; otros rasgos característicos son los ríos (incluyendo el Tesino y Olona) y los lagos glaciares Maggiore, Lugano, Varese y otros lagos más pequeños (los "siete lagos varesinos").