El análisis filogenético llevado a cabo por Carneiro (en prensa, 2017) encuentra que "Varalphadon" no sería un marsupial propiamente dicho, sino un metaterio basal y un miembro basal del grupo Sparassodonta, tradicionalmente restringido al Cenozoico de América del Sur; este autor identifica en particular que la especie "Varalphadon janetae" del Cenomaniense y Coniaciense de Utah (Estados Unidos) es el miembro más antiguo conocido de Sparassodonta.