En 1962, debido a la politización de la Facultad de Medicina de la Universidad Nacional Mayor de San Marcos, Honorio Delgado renunció, junto con Alberto Hurtado y la mayoría de catedráticos, constituyéndose la Unión Médica Cayetano Heredia, que fundó la Universidad Peruana Cayetano Heredia, de la que fue su primer rector por elección, desde 1962 hasta 1966.