Ambientada en el siglo XXI, "Ghost in the Shell" se presenta en una primera lectura como un "thriller" futurista de espionaje, al narrar las misiones de Motoko Kusanagi, la mayor a cargo de las operaciones encubiertas de la Sección Policial de Seguridad Pública 9, o simplemente Sección 9, especializada en crímenes tecnológicos.