"Notohypsilophodon" está basado en el holotipo UNPSJB — PV 942, que consiste en un esqueleto parcial con cuatro vértebras del cuello, siete de la espalda, 4 del sacro, y seis de la cola, fragmentos de costillas, una escápula parcial, coracoides también parcial, un húmero, ambas ulnas y la mayor parte de la pata izquierda, menos el pie, y la fíbula derecha con el astrágalo.