Le sigue la sala II dedicada al Paleolítico Inferior y Medio (con industria lítica y fauna de la cova de Bolomor, Petxina, El Salt y Cova Negra) y la sala III (Paleolítico Superior), con restos de Parpalló, Malladetes, Cova de les Cendres, Cueva del Volcán del Faro y la Ratlla del Bubo.