La institución sufrió una serie de avatares político-institucionales, una sucesiva pérdida de apoyo universitario y además las siguientes direcciones no acertaron a retomar el rumbo que le había impuesto Mazza desde el inicio, y produjeron una lenta agonía hasta que finalmente en mayo de 1959 se produjo su disolución, bajo el argumento que en la institución no se realizaban trabajos de investigación que justificaran los motivos para los cuales había sido creada.