Aunque Ishaq logró reunir más de 40.000 soldados para hacer frente a los marroquíes, su ejército se batió en retirada ante las armas de fuego enemigas en la decisiva batalla de Tondibi en marzo de 1591; Yuder pronto tomó y saqueó la capital songhai, Gao, así como los centros de comercio de Tombuctú y Djenné, garantizando la destrucción del Imperio.