En la actualidad, las poblaciones de esta especie están en franca recesión, como demuestra su calificación de "en peligro de extinción" en el Catálogo Nacional de Especies Amenazadas y en el Catálogo Regional de la Comunidad Valenciana, lo cual es debido principalmente a la excesiva contaminación de algunas aguas, a la construcción de presas y diques, a la extracción de áridos de los lechos de los ríos y, sobre todo, a la introducción de especies alóctonas que, o bien colonizan su hábitat (como sucede en el caso de la boga de río), desplazando a la loina por competencia, o predan sobre la puesta de huevos de ésta, como es el caso del gobio (Gobio lozanoi) o la perca sol ("Lepomis gibbosus"), especies ambas consideradas como invasoras por parte de la Consejería de Agricultura y Desarrollo Rural de la Junta de Comunidades de Castilla-La Mancha a través de su Orden de Vedas anual.