En cuartos de final una entrada dura del defensa central Heriberto Morales de Monarcas Morelia lesionó al chileno Rodrigo Ruiz y lo dejó inhábil el resto de la liguilla, Santos empató en el global con Monarcas y avanzó por mejor posición en la tabla general, en la semifinal derrotó 2-1 a Universidad Nacional y en la final contra Toluca fue derrotado por goleada histórica de 7-1 en el marcador global y así obtuvo el segundo subcampeonato de su historia.