Terminada la guerra luego del triunfo del ejército restaurador mandado por el general Bulnes en la batalla de Yungay, Lynch permaneció en la escuadra de Chile solo hasta el 11 de febrero de 1840, puesto que el contraalmirante británico Charles Bayne Hodgson Ross, jefe de la estación naval del Pacífico, había visto con buenos ojos a Lynch después de que este lo salvase de una agresión en el puerto del Callao durante la guerra y quería incorporarlo a la Royal Navy para que pudiera ampliar sus conocimientos.