Situado cerca del puerto de Santo Tomás de Castilla, hoy el aeropuerto es de especial interés para los operadores de cruceros, que transportan pasajeros a importantes atracciones en todo el país por medio de vuelos chárter la única aerolínea que transporta pasajeros charter es Tansportes Aéreos Guatemaltecos TAG S.A., su página web es https://tag.com.gt/ .Puerto Barrios fue siempre un centro de logística, lo que se destaca en el escudo de la ciudad, que representa un buque, un tren, un avión y un camión.