La Dictadura de Alfredo Stroessner se instaura en 1954 con la famosa tríada de "Fuerza Armadas, Gobierno y Partido Colorado", por lo que no pasó mucho tiempo para que la enfrente férreamente, siendo entonces muchos de sus militantes perseguidos, encarcelados, confinados, exiliados, recluidos en Campos de Concentración, brutalmente torturados e inclusive asesinados.