Se desarrolla dos años después de que Akari y Hiroyuki se graduaran de la preparatoria, centrándose en la relación existente entre otra pareja de amigos que apenas está iniciando curso, Konomi Yuzuhara y Takaki Kono e intercalando su historia con la de sus compañeros y amigos de instituto, entre ellas, las gemelas Himeyuri, que ya hicieran aparición en ToHeart ~remember my memories~.