En general podemos señalar que la vegetación japonesa va de la claramente tropical en las Ryukiu, a la propia de los bosques den transición entre la taiga y los templados caducifolios en Hokkaido; pasando por la flora subtropical en el sur de Honshu, Shikoku y Kyushu, con plantas siempre verdes de hojas brillantes y cerosas, una especie de laurisilva (camelias, rododendros, alcanforeros...) o la templada fría del centro Honshu, sur de Hokkaido, y montañas de las dos islas meridionales.