El 29 de octubre de 1961, durante la presidencia de Arturo Frondizi y con todos los ferrocarriles ya bajo la administración de la empresa estatal Ferrocarriles Argentinos, se decidió la clausura del tramo Borges-Delta bajo el rótulo de ramal "antieconómico" por pasar a escasa distancia del ramal Retiro-Tigre, tradicionalmente mucho más utilizado.