La primera termina siendo su amiga de la infancia Saria, en el templo del bosque, resguardado por el fantasma maligno Phantom Ganon, un oscuro fantasma creado por el mismo Ganandorf (esto se descubre cuando al final de la pelea se oye la voz de Ganandorf diciendo que era un mero títere), el segundo es el rey de los Goron: Darunia, en el templo del fuego vigilado por el dragón de fuego Volvagia; la tercera es la princesa de los Zora: Ruto, en el templo del agua, para ayudarla a salvar a su raza de quedar congelada para siempre Link deberá vencer al monstruo Morpha, una especie de encéfalo capaz de dominar por completo el agua que lo rodea.