Más tarde y como protesta en contra de esta alianza obligada y dominio nacieron y se formaron dos " repúblicas cosacas" en el río Don (cosacos del Don) y en el Bajo Dniéper (cosacos de Zaporozhia), tras lo cual se inicia el renacimiento y fortalecimiento de la independencia cosaca, y se forman centros principales de unificación del pueblo Cosaco, en que los cosacos de Zaporozhia jugaron un rol muy importante, específicamente en la liberación del pueblo ucraniano del poderío polaco-lituano.