Respecto a las críticas que ha recibido por llevar a cabo la construcción en su mayor parte dentro de Cisjordania, el Gobierno de Israel sostiene que el único propósito de la Barrera es la seguridad, por lo que se erige «"donde se hace necesario para impedir que terroristas se infiltren en centros de población"», por lo que haberla construido a lo largo de la Línea Verde «"habría servido solamente como una declaración política, sin tener nada que ver con las necesidades de seguridad de los ciudadanos de Israel"».