En 1868 se expidió el Estatuto Orgánico, se abrieron las primeras escuelas y fue elegido el primer rector de la universidad, Ezequiel Rojas, quien no aceptó el cargo por motivos de salud, y fue nombrado en su reemplazo Manuel Ancízar, convirtiéndose en uno de los fundadores de la Universidad Nacional de Colombia y en el primer rector del claustro.