A lo largo de la Edad Media el pueblo se inscribe como un barrio de Huécija, según el documento de donación de la Taha de Marchena a Gutierre de Cárdenas por los Reyes Católicos y será en el siglo XVI cuando a Alicún se le empiece a considerar um pueblo, configurándose como uno de los diez lugares que forman el Señorío de Marchena con capital en Huécija.