Verano 1999 el equipo obtuvo el cuarto lugar con 32 puntos calificando de nuevo, enfrentó en cuartos a La Piedad empatando el de ida 0-0, mientras en el juego de vuelta los freseros lo golearón 4-1; En semifinal Unión de Curtidores era el rival, en la ida en León la trinca ganó 1-0, en la vuelta sorpresivamente Curtidores goleó 5-2 al Irapuato que por segunda vez falló en esta instancia, decepcionando a su afición que no creía lo que le sucedía al equipo cuando llegaba a semifinales.