Los jesuitas establecieron con los requerimientos de su "ratio studiorum" los cursos de filosofía y de teología, pudiendo los alumnos alcanzar los grados de bachiller, licenciado y maestro en filosofía y de doctor en teología, los que, una vez cursados los estudios y cumplidas las pruebas necesarias, al igual que en la Universidad en Santiago, permitían al obispo otorgárselos.