Una de las prestaciones de Proteus, integrada con ISIS, es VSM, el Virtual System Modeling ("Sistema Virtual de Modelado"), una extensión integrada con ISIS, con la cual se puede simular, en tiempo real, con posibilidad de más rapidez; todas las características de varias familias de microcontroladores, introduciendo nosotros mismos el programa que controlará el microcontrolador y cada una de sus salidas, y a la vez, simulando las tareas que queramos que lleve a cabo con el programa.