Durante el último tercio de su vida, trabajó junto con su hijo, Gerald Handerson Thayer, en la redacción de "Concealing Coloration in the Animal Kingdom: An Exposition of the Laws of Disguise Through Color and Pattern", un vasto libro sobre la coloración protectiva en la naturaleza, que fue publicado por primera vez en 1909 por Macmillan, y de nuevo en 1918.