En Juntarrios recibe al río Talamillo, pasa por los términos de Santa Cruz del Tozo, La Piedra, Úrbel del Castillo, Quintana del Pino, La Nuez de Arriba, Montorio, Huérmeces, donde recibe el Arroyo Quintanilla y existe un coto de pesca de la trucha, Santibáñez-Zarzaguda, Miñón de Santibáñez, La Nuez de Abajo, Zumel, Lodoso, donde recibe el arroyo de Las Rebolledas, Pedrosa de Río Urbel, Santa María Tajadura, Las Quintanillas, donde pasan la carretera N-120 y la Autovía A-231 y recibe el arroyo del Páramo, Villarmentero, Tardajos, Rabé de las Calzadas donde coincide con el Camino de Santiago, y Frandovínez donde desemboca en el río Arlanzón.