En la campaña siguiente 2006/07, en la conocida "temporada de los récords" de la mano de José Luis Mendilibar donde el equipo acabó con 88 puntos, Jacobo, comenzó cuajando grandes actuaciones como portero titular, pero una lesión en su rodilla hizo que una vez recuperado, el entrenador contara con Alberto, gran portero veterano ex de la Real Sociedad de Fútbol y subcampeón de la Liga de la Primera División de España en la temporada 2002/03.