Dentro de la reserva de la biosfera Sierra Gorda, existen definidas 11 zonas núcleo que abarcan una superficie total de 24,803-35-87.5 ha, de la que el Sótano del Barro es la zona núcleo más pequeña de la reserva; abarca un total de 1-45-12.5 ha y está ubicada en el municipio de Arroyo Seco.