En la noche del 28 de abril ingresaron al territorio salvadoreño los revolucionarios exiliados en Guatemala, en el camino se les unen otros más, pero debido a que estaba lloviendo fuertemente esa noche solamente llegaron a Santa Ana 44 revolucionarios, los cuales se agruparon en la barranca Santa Lucía; en la mañana del 29 de abril de 1894 Doroteo Caballero disparó el cohete con el cual se abrió el ataque contra el cuartel, al acercarse el centinela dispara a los revolucionarios sin herir a nadie, luego el revolucionario y general Lizandro Arévalo le dispara; posteriormente Arévalo toca la puerta del cuartel y al ser abierto un soldado le pega con la culata del arma, luego Arévalo se levanta y hiere de un sablazo al soldado; tras ello los revolucionarios entran al cuartel y lo toman rápidamente sin resistencia, y el coronel Rosalío Herrera manda a abrir el almacén con lo cual los revolucionarios recargan sus armas.