El INTCF se divide en varios Servicios o Secciones que se ocupan de una rama distinta de la Ciencia Forense: (Biología, Criminalística, Drogas de abuso, Histopatología, Química, Servicio de Información Toxicológica, Unidad de Garantía de Calidad, Valoración Toxicológica y Medio Ambiente.