Un segundo prototipo Ha 138 V2, con un diseño de casco modificado, a partir de noviembre participó en el programa de pruebas en el centro de Travemünde , pero pronto el avión mostró ser inestable, lo mismo hidrodinámicamente que aerodinámicamente; las modificaciones de las superficies verticales de cola no llegaron a mejorar las prestaciones adecuadamente y se emprendió un radical cambio de diseño.