La ciudad de Santiago de Chile había sido designada como "sede sustituta" en caso de que La Paz no pudiera organizar los juegos durante la reunión del 8 de abril de 2003, en Buenos Aires, en la que se designó a la ciudad boliviana como sede de los Juegos, pero Chile renunció a la organización de los Juegos de 2006 por un gesto de hermandad y amistad hacia Bolivia.