Debido a numerosas lesiones (de rodilla, ligamentos, brazo, hombro y riñón) Wilkinson ha tenido una carrera internacional con muchas interrupciones, y no volvió a actuar para su selección nacional hasta 1169 días después de su última intervención en la Copa del Mundo 2003, cuando apareció en el partido inaugural del Torneo de las Seis Naciones contra Escocia el 3 de febrero de 2007.