Las tres variedades principales son la Hondarrabi Zuri, que es la principal costera del País Vasco y que diferencia al Txakoli del resto de los vinos del mundo; la Hondarrabi Zuri Zerratia, de racimo más cerrado, que aporta aromas florales y vegetales con ligeras notas de amargor; y la Hondarrabi Beltza, de la que sale el txakoli tinto, un vino original y  exclusivo de la Denominación, aromático, con sensaciones frutales muy intensas.