A pesar de lo anterior, los años finales del gobierno de Lagos, correspondientes a su ministerio, vieron un importante impulso a las obras públicas, con la entrada en operaciones de una serie de autopistas concesionadas en Santiago, la expansión de la red de Metro y, especialmente, el inicio de la implementación del Transantiago, proyecto estrella de la administración Lagos que pretendía reformar totalmente el transporte en la capital, en pro de la descongestión y la eficiencia.