El juego completo lo jugaremos con Edward Elric y podremos utilizar la alquimia a lo largo del mismo para transmutar el brazo metálico de Ed, el cual se puede convertir en una cuchilla, y usarse para transmutar espada, lanzas y martillos y en otro tipo de objetos alternativos (transmutar un objeto en algo, por ejemplo cuchillos para tirar).