En 1888 el Ferrocarril Oeste de Buenos Aires vendió el segmento Rufino de Elizalde-Magdalena del ramal que vinculaba este último con Tolosa, inaugurado el 15 de mayo de 1887, a la recién formada compañía del Ferrocarril Buenos Aires Ensenada y Costa Sur (BAE&SC), en la que el FCBAPE tenía participación.