A raíz de lo anterior el sindicato Manos Limpias elevó al Ministerio Público una querella criminal contra los responsables políticos de diversos Ayuntamientos de la CAM por medio de la cual se les acusaba de prevaricación, malversación, falsificación documental, revelación y uso indebido de secretos, utilización de información confidencial, fraude, negociaciones indebidas, cohecho, tráfico de influencias, organización criminal y blanqueo de capitales, en connivencia con algunos grupos empresariales.