En su nueva etapa dentro de la Primera División, tuvo como mayor relevancia el alcanzar la final y obtener el subcampeonato del Apertura 2011, Tras ello el equipo no logro mantener el ritmo en los siguientes campeonatos y retornó de nuevo a la segunda división al acabar en el último lugar de la tabla acumulada de los torneos Apertura 2012 y Clausura 2013, a pesar que había logrado empatar en puntos con la Universidad de El Salvador, que tenía una ventaja de catorce unidades a principios del Clausura.