En 1979, fue nombrado comandante de al Brigada de Institutos Militares en Bogotá, cargo en el que se destacó su lucha contra guerrillera y la captura de por lo menos 200 guerrilleros entre los que predominaban miembros del Movimiento 19 de abril (M-19), y desde entonces se le señala por la violación de los derechos humanos y de terrorismo de estado y de guerra sucia como posible máximo responsable de la Alianza Americana Anticomunista.