Ostuacán fue fundado en el año de 1549 con el nombre de San Pablo Ostuacán, como un pueblo de misión en que los misioneres españoles concentraron a indígenas zoques para su conversión al catolicismo, dependiente de la alcaldía mayor de Ciudad Real de Chiapas, pertenecía por tanto a la Capitanía General de Guatemala, siendo en esta época mencionado como pueblo tributario.