Su denominación honra la memoria de Tomás Falkner, sacerdote jesuita misionero del siglo XVIII de origen inglés, quien si bien nunca visitó la región donde se ubica el lago que lleva nombre, después de realizar una importante tarea de evangelización de los indios del sur de la actual provincia de Buenos Aires, recogió importantes datos geográficos acerca de la misma que plasmó en en su conocida obra ""Descripción de la Patagonia y de las partes contiguas de la América del Sur"".