Subsecuentemente, el 28 de junio, el Congreso Nacional de Honduras, en una sesión extraordinaria, votó para remover a Zelaya de su cargo y colocar a su susesor constitucional, el presidente del Congreso Nacional, quien era entonces Roberto Micheletti, y que estuvo en ese cargo hasta el 27 de enero de 2010, fecha en que le correspondería a Zelaya entregar el poder.