Se cuenta actualmente con cinco Vocalías: la Vocalía de Atención Primaria, encargad de las relaciones con las sociedades de médicos de familia; la Vocalía de Asociaciones Médicas, encargada de las relaciones con todo tipo de asociaciones del ámbito médico; la Vocalía de Organizaciones Estudiantiles, en permanente contacto con otras asociaciones de Estudiantes; Vocalía de Comunicación, encargada de las relaciones con prensa y la difusión de las actividades del Consejo y la Vocalía de Gestión Tecnológica, que vela por el buen funcionamiento de las plataformas online del Consejo.