Luego de la llegada de Jorge Sampaoli como técnico a la selección en diciembre de 2012, Rojas se afianza como titular en la defensa chilena, participando como capitán en las victorias frente a Senegal el 15 de enero del 2013 por 2-1 y el 3-0 frente a Haiti el 19 de enero por 3-0.