En enero de 2009 el Tribunal Superior de Justicia del País Vasco archivó la causa abierta entre otros a Otegi y a los lehendakaris Patxi López (PSE) y Juan José Ibarretxe (PNV), por reunirse en 2006 y 2007; pero en marzo de ese mismo año fue acusado de enaltecimiento del terrorismo por su participación en el acto político de 2004 en el velódromo de Anoeta.