El nuevo Museo ocupa una superficie de , en tres alturas, distribuidos en salas de exposición en las tres plantas, biblioteca, almacenes en sótano y entreplanta, oficinas en planta superior y torreón y, finalmente, claustro mudéjar para la realización de exposiciones temporales, recitales poéticos como "Almagro íntimo", teatro escolar y otros actos culturales.