Más tarde Raiden rescatará a Emma Emmerich, hermana de Otacon, quien introduce un virus en la base de datos del GW, que hace colapsar al Arsenal Gear (una especie de transformador, censurador, almacén de datos media e información creado por los patriots), que contenía veinticinco unidades MG RAY (Copias)o "Gekkos" que se desarrollaron durante los dos años del incidente del petrolero.