Hijo de Matías de Ceballos-Escalera y Morezón, fallecido en Cádiz el 1 de junio de 1812, y de su esposa Francisca de Ocón y Morillas y hermano más viejo de Manuel José de Ceballos-Escalera y Ocón (Málaga, 29 de enero de 1793 - Soria, 1836), casado con Leonor de Echagüe e Ysunza (Alfaro, 1798 - ?), padre de dos hijas: Manuela de Ceballos-Escalera y Echagüe (Fuentepinilla - Segovia, 11 de enero de 1913), casada primera vez con Martín Bermejo y Escalona, con descendencia masculina, y casada segunda vez con Carlos de Lecea y García (Segovia, 18 de febrero de 1835 - Segovia, 11 de noviembre de 1926), con descendencia femenina; y Engracia de Ceballos-Escalera y Echagüe (Madrid, 2 de mayo de 1827 - Madrid, 8 de febrero de 1901), casada con Manuel Sainz de Robles y Ortiz, con descendencia femenina.