Álvarez; durante su mandato se vio frecuentemente enfrentado políticamente al gobernador José Reyes Baeza Terrazas; tras terminar su periodo al frente del ayuntamiento, en 2008, el Congreso de Chihuahua resolvió turnar la cuenta pública de su Administración en 2006 por presuntos hechos delictivos que se pudieran imputar a su persona; habiendo rechazado, tanto él como su partido, cualquier acusación sobre delitos de corrupción y cohecho.