El 20 de diciembre de 1990, se procedió a constituir la Fundación Museo de Ciencias, que se encargaría de la guarda y custodia de los bienes del patrimonio cultural del vetusto inmueble y de las diez colecciones: antropología física, arqueología, etnografía (con la subcolección africana y afroamericana), herpetología, ictiología, invertebrados (artrópodos y moluscos), ornitología, teriología, paleontología y mineralogía.