Desde la publicación preliminar de los resultados de la prueba ACTG 5412 en 2006 —que tenía como propósito la comparación de los resultados y efectos colaterales de la terapia con efavirenz y lopinavir—, el efavirenz se suele emplear como una de las primeras opciones para el tratamiento con antirretrovirales, con preferencia sobre los inhibidores de proteasa.