A lo largo de los últimos años la hinchada de Marathon ha ido aumentado debido a su regularidad y campeonatos logrados, siendo el único equipo grande junto al Club Deportivo Olimpia que no han tenido altibajos, estando entre las primeras posiciones de los últimos campeonatos en la última década, por lo que las nuevas generaciones se identifican con el club y que se hace notar en la gran cantidad de jóvenes que asisten al estadio con los colores verde, rojo del Marathón.