Vivió más tarde entregado a la enseñanza en Burgos (1569-1572) cuando en este último año la Inquisición apresó en Valladolid al biblista agustino Alonso Gudiel, catedrático de la Universidad de Osuna, designado para sostener unas tesis en latín sobre la Encarnación de Cristo en el capítulo que la provincia agustina de Castilla celebraba allí, a pesar de que Malón declaró que las había compuesto él.