Alejandro Encinas ha sido miembro en dos ocasiones de la Cámara de Diputados, en los periodos de la LIII Legislatura (1985-1988) como suplente de Demetrio Vallejo, a cuya muerte asumió la titularidad de la diputación, y elegido diputado en la LV Legislatura (1991-1994); en esta última fue presidente de la Comisión de Asentamientos Humanos y Obras Públicas, que elaboró la nueva "Ley General de Asentamientos Humanos" que fue aprobada por unanimidad en 1993, ese mismo año fue candidato del PRD a Gobernador del Estado de México.