Pocos años después de la fundación de Urraca, en 1199, la abadía se integró en la congregación que, teniendo como cabeza al monasterio de Las Huelgas de Burgos, compusieron, además de Fuencaliente, también Torquemada, Gradefes, Carrizo, Perales, San Andrés de Arroyo y Cañas.