Dentro de otras actividades a su cargo, CITEDEF participa en el Sistema Federal de Emergencias (SIFEM) prestando asesoramiento técnico, funciona como órgano adjunto de control de plagas para el Ministerio de Salud (Argentina), asimismo como centro de referencia de la Organización Panamericana de la Salud —donde oficia de asesor en problemas toxicológicos y ambientales—; en este aspecto, el Instituto posee un relevante papel en el entorno privado, aconsejando a diversos organismos sobre actualización tecnológica y prestación de numerosos servicios especializados.