Dos pruebas importantes para los nuevos métodos desarrollados en Rosetta@home son los experimentos "Critical Assessment of Techniques for Protein Structure Prediction" (CASP) y "Critical Assessment of Prediction of Interactions" (CAPRI), que se llevan a cabo cada 6 meses para evaluar el estado del arte de la predicción de estructuras proteicas y la predicción del acoplamiento proteína-proteína.