Al final del curso, batió su mejor registro goleador en la categoría, superando al Castilla de la «Quinta del Buitre» alcanzando un total de setenta y un goles, dos más que los logrados en la citada campaña 1983-84 donde se proclamó campeón de la categoría.Al año siguiente, la salida de muchos de los citados futbolistas de la plantilla propició que se hubiese de reestructurar el equipo por completo lo que unido a una gran escasez goleadora —en contraposición con el curso anterior— acarreó un mal arranque liguero, que a su vez desencadenó la destitución al frente del equipo de Alberto Toril, entrenador del mismo desde enero de 2011.Su sucesor en el cargo, José Manuel Díaz —hasta la fecha entrenador del segundo filial, el Real Madrid Club de Fútbol "C"—, trajo nuevos aires que dieron con una mejoría en el conjunto que le permitió abandonar el último lugar de la clasificación merced a cuatro victorias consecutivas encadenadas, algo que no lograba el filial en la categoría de plata desde la temporada 1988-89.