Tuvo también un hermano llamado Francisco de Balbuena Estrada, quizás el mismo mencionado por Fray Antonio Tello en su obra "Libro segundo de la crónica miscelánea" (1891, 218).«Francisco de Balbuena Estrada, Rodrigo de Carbajal Ulloa, Francisco de Torquemada, Marcos de Carcoma, Alonso Perez, Martín de Renteria, Diego Lopez Altopiza, Diego de Villegas, Antonio Díaz Benavente de Brizuela, Alonso de Roa, Pedro Arias de Bustos, Alonso de la Puebla.