En la época precolombina la zona Sur de Honduras fue ocupada por varias etnias indígenas, entre los que se destacan los Chorotegas, con la llegada de los españoles a esta zona, se fundó en 1535 por don Cristóbal de la Cueva, como la Villa de Xerez de la Frontera de Choluteca de acuerdo a las políticas colonizadoras, de que debían fundarse centros urbanos en los cuatro puntos cardinales del territorio nacional, por lo que este poseía una ubicación estratégica para la comunicación con las hermanas Repúblicas de Guatemala y Nicaragua.