Para temporada 2012/13, se consiguió renovar a Joaquín Caparrós para que liderara la nave bermellona una temporada más, además de fichar a jugadores como Giovanni Dos Santos, Javi Márquez o Antonio López, empezando la campaña muy fuerte con victorias en casa ante Espanyol, Real Sociedad y Valencia CF y empatando fuera ante el Málaga CF y Osasuna.