Hacia 1850, con el Reglamento de Educación Pública de dicho año, dos facultades efímeras fueron añadidas a las entonces diez con las que la universidad contaba: Facultad de Ciencias Naturales y Facultad de Matemáticas, las cuales fueron luego unificadas en la Facultad de Ciencias Naturales y Matemáticas en el año de 1862, renombrada en 1876 como Facultad de Ciencias.