En 1927, durante el gobierno del presidente Pío Romero Bosque, fue creada la Asociación General de Estudiantes Universitarios Salvadoreños (AGEUS).Entre sus fundadores se encontraban Alfonso Luna, Mario Zapata y Agustín Farabundo Martí,quienes fueron fusilados por el gobierno del presidente Maximiliano Hernández Martínez el 1 de febrero de 1932, por considerar que eran los líderes del levantamiento campesino que había ocurrido a mediados del mes pasado en la zona occidental del país.De conformidad con el artículo 82-C del Reglamento General de la UES de 2001, agregado a su texto original mediante una reforma aprobada el 6 de junio de 2003, a nivel general de la alma máter se reconoce la existencia de una sola asociación general representativa de los intereses de los estudiantes de la UES, la cual se denominará Asociación General de Estudiantes de la Universidad de El Salvador, que se abreviará "AGEUS", y que se constituirá de carácter federativo por las asociaciones generales de cada una de sus doce facultades.