En 2003 se programa la creación de la Maestría en Ciencias Ambientales con énfasis en Seguridad Alimentaría, con la colaboración de la Escuela en la Corporación Ambiental; en el mismo año, el grupo de investigación en alimentación y nutrición humana es reconocido por COLCIENCIAS; mismo grupo que en el 2005 es clasificado como grupo de excelencia (categoría A) de COLCIENCIAS.