Los observadores tenían la esperanza de que los impactos dejaran ver algo más allá de las cimas de las nubes al ser atravesadas, ya que los fragmentos del cometa perforarían la atmósfera; las observaciones espectroscópicas revelaron la presencia de azufre diatómico (S) y sulfuro de carbono (CS), la primera detección en Júpiter y tan sólo la segunda detección de S en cualquier objeto astronómico, así como de amoníaco (NH) y ácido sulfhídrico (HS).