Es también acusado de haber tenido, o haber confesado tener, un rol en muchos de los complots terroristas más significativos de los últimos veinte años, incluyendo las bombas de 1993 en el World Trade Center, la Operación Bojinka, un ataque abortado de 2002 sobre la US Bank Tower en Los Ángeles, los atentados en Bali, los ataques fallidos del vuelo 63 de American Airlines, el complot del Milenio y el asesinato de Daniel Pearl en Pakistán.