La administración de flumazenilo está contraindicada en aquellos pacientes que simultáneamente hayan ingerido fármacos o compuestos proconvulsivantes (antidepresivos tricíclicos o cocaína), o tengan antecedentes de epilepsia, debido a que se reduce el umbral epileptógeno y la administración del antídoto podría desencadenar un status epiléptico.