A partir de ese momento el INE tomó la responsabilidad de la administración del parque a través del nombramiento de un director, se elaboró un programa emergente, se iniciaron las gestiones para concertar el manejo y la administración con los sectores involucrados y se estableció un esquema de financiamiento, por lo cual se integró un consejo de planeación del parque marino nacional creándose un fideicomiso de inversión entre “Asociados náuticos de Cancún AC”, “Asociados náuticos y subacuáticos de Isla Mujeres AC” y el “Instituto nacional de ecología”.