Litvinenko acusó a la Directiva Principal de Inteligencia del Personal General de las Fuerzas Armadas Rusas de haber organizado el tiroteo del parlamento armenio en 1999 que asesinó al Primer Ministro de Armenia Vazguén Sargsyán, y otros siete miembros del parlamento, aparentemente para descarriar el proceso de paz que hubiera resuelto el conflicto de Nagorno-Karabaj, pero no hubo evidencia para soportar la acusación.