Posteriormente, debido a la política antiterrorista emprendida por el gobierno de José Luis Rodríguez Zapatero y por el PSOE, así como por las relaciones de Patxi López y el PSE-EE con el entorno nacionalista vasco y abertzale, mostrado sus reticencias hacia los contactos mantenidos con Batasuna y hacia el llamado proceso de paz abierto tras el alto el fuego permanente decretado por ETA, llamando a "la unidad de los demócratas y a la acción de la justicia contra los terroristas y todos aquellos que los amparan, justifican y respaldan".