A la llegada de los españoles los embera se encontraban en Colombia en las áreas aledañas a los cursos alto y medio de los ríos Atrato y San Juan en lo que es hoy el suroriente del departamento del Chocó, la porción que linda con el río Atrato en el centro occidente del departamento de Antioquia, y el occidente del departamento de Risaralda.