En cuanto a la sección masculina, el Añorga tiene actualmente un equipo senior, y cuenta con numerosos equipos de fútbol base, siendo uno de los equipos principales de la cantera guipuzcoana, aportando a lo largo de su historia numerosos jugadores que alcanzaron la máxima categoría, como por ejemplo Igor Gabilondo exjugador de la Real Sociedad y del Athletic Club.