El 8 de octubre de 2008 manifestó su interés en ser candidato de su partido a Gobernador de Querétaro en 2009, por lo que posteriormente solicitó licencia como Senador a partir del 17 de marzo de 2009 siendo registrado como precandidato de unidad del PRI el 1 de abril, tras la declinación a su favor del también precandidato Jesús Rodríguez Hernández, y rindiendo protesta el 2 de mayo como candidato a gobernador en coalición con el partido Nueva Alianza.