La campaña 1987-88 marca un hito en la historia del club, al ser el debut en Segunda B, y, hasta ahora, su última temporada en la tercera categoría nacional; la campaña se saldaría con el 19º puesto y el descenso, siendo el equipo con más derrotas en casa (8, como el Bergantiños y la Gimnástica) y el más goleado en casa (27 goles); en Copa elimina al Laredo en primera ronda (cae derrotado en Laredo por 1-0, y vence en Santander 4-0), y es eliminado en segunda ronda por la Gimnástica (pierde 4-1 en Torrelavega y vence 1-0 en Santander).