Al suscitarse la toma del poder por parte de William Walker en Nicaragua en octubre de 1855, el jefe supremo en funciones de El Salvador Francisco Dueñas le encargó el mando de una guardia de honor de 150 hombres, que llegó a ser de ochocientos, para combatir en la Guerra contra los Filibusteros en defensa de la soberanía del vecino país y resto de Centroamérica que partió el 18 de junio de 1856.