Diego Borja es autor del libro "Optar por el Presente: Nueva Economía para un Nuevo País", publicado en el 2005; así como varios estudios publicados sobre como mejorar la competitividad y productividad en el Ecuador, entre ellos el libro "El Contexto Económico de los Negocios en el Ecuador", CAF, noviembre de 1999; y co-autor, "Estado Actual de la Competitividad en el Ecuador", Federación Nacional de Cámaras de Industrias - CAF - MICIP, Quito, 1998.