Hijo segundo del mariscal de campo Fernando Cotoner y Chacón, I marqués de la Cenia y V de Ariany, grande de España, gobernador de Puerto Rico, ministro de la Guerra, director de la Guardia Civil, caballero de Calatrava y gran cruz de Carlos III, y de Francisca Allendesalazar y Loyzaga, su mujer, de los condes de Montefuerte, dama noble de María Luisa.