Las aguas costeras de Jan Mayen son ricas en peces y atraen a numerosos cetáceos (ballena boreal, ballena jorobada, ballena de Minke, rorcual común, ballena azul, rorcual boreal, Hyperoodon ártico, orca, delfín de hocico blanco) y morsas, así como numerosas aves marinas que, con cerca de 500 000 parejas reproductoras, son los animales más abundantes en la isla.