El Jardín Botánico fue diseñado en un área de bosque parque preexistente, donde se encontraban especies nativas, tales como: ciprés ("Austrocedrus chilensis"), ñire ("Nothofagus antarctica"), coihue ("Nothofagus dombeyi"), radal ("Lomatia hirsuta"), maitén ("Maytenus boaria") y laura ("Schinus patagonica"), entre otras.