La CNBM ayudó a la fundación de diversas instituciones educativas como el Instituto Madero de Saltillo, Coahuila, el Colegio Anáhuac de Chihuahua, Chihuahua, el Colegio Howard de Puebla, Puebla, el Colegio Occidental de Guaymas, Sonora, el Seminario de Saltillo que se inauguró el 3 de octubre de 1917, la Escuela Teológica de Monterrey, inaugurada el 2 de enero de 1908, entre otros.