En materia empresarial destaca el apoyo de Fernández Vara al proyecto de Refinería Balboa, cuyos trámites no finalizaron bajo su mandato, y la negativa a la instalación del ATC para residuos radioactivos en la localidad cacereña de Albalá, anunciando que presentaría su dimisión si finalmente el almacén recalaba en Extremadura.