La Cuchilla Grande forma la divisoria principal del departamento, separando las cuencas del río Negro, de la del Santa Lucía; a este último corre el río San José, que nace en el departamento; hacia el río Negro se dirigen el río Yí y el arroyo Grande; la Cuchilla de Marincho separa los tributarios del arroyo Grande (cuyo principal afluente es el arroyo de la Guardia Vieja) de los del río Yí, corriendo hacia este último el arroyo del Tala, el arroyo Sarandí, el arroyo Maciel (cuyo principal afluente es el arroyo del Tala) el arroyo Chamangá y el arroyo Porongos, que pasa a poca distancia de Trinidad, capital del departamento.