Cienciano perdió ambos partidos en la primera fase donde perdió por goleada de local lo que causó el despido del entrenador de ese entonces, el ecuatoriano Carlos Sevilla Dalgo, y la contratación del uruguayo Carlos Jurado quien repitió lo sucedido en el 2001 ganando absolutamente todos sus partidos de local pese a ello el torneo Clausura no fue tan bueno terminando quintos el clausura, pero aun así lograron clasificarse al "play-off" contra Sporting Cristal.