Esta quinasa fosforila a la enzima PFK-2/FBPasa-2 en el grupo NH de un residuo de serina, transfiriendo el fosfato desde una molécula de ATP, lo que provoca la activación de la FBPasa-2 a la vez que la inhibición de la PFK-2, y de esta forma, una reducción de los niveles de Fru-2,6-"P" en la célula.