El país está rodeado por diversas cordilleras montañosas, las montañas de Fergana al noroeste, la cordillera del Pamir con las montañas Alai, al sudoeste, y varias ramas del Tien Shan en el centro y el este que alcanzan con facilidad los 5.000 m de altura, siendo el pico Jengish Chokusu, también conocido como Victory Peak o pico Victoria en la frontera con China, el más alto con 7.439 msnm; otras alturas importantes son el pico Lenin, al sur cerca de la frontera con Tayikistán, con 7.134 msnm, y el pico Khan Tengri, con 6.995 m, en la unión entre Kirguistán, Kazajstán y la Región Autónoma Uigur de Sinkiang en China.