No se ha probado que el SV40 sea causa de enfermedad en humanos, pero estudios sugieren un vínculo con el cáncer sobre la base de la presencia de relativamente grandes cantidades de algo parecido a fragmentos de ADN de SV-40 en algunos tejidos tumorales, particularmente mesoteliomas y linfomas no hodgkinianos, sin embargo otros estudios atribuyen esta relación a falsos positivos por contaminación de muestras en laboratorio con el virus.