En la Sala 3 (Capilla de Álava) destacan el conjunto de vírgenes sedentes con el Niño, tipología conocida en el País Vasco como "Andra Mari", como lo más representativo de la imaginería gótica provincial, así como el "Cristo Crucificado de Zurbano", talla procedente de la parroquia de San Esteban de Zurbano, y el también policromado "Calvario de Eguileta", conjunto de tres bultos -el Cristo, la Virgen y San Juan- procedente de la parroquia de San Román de Eguileta, ambos del siglo XIV.