Tras obtener la Copa, el Luis Cruz hizo su debut oficial en la segunda categoría, con una gran campaña: el quinto lugar de la tabla con 25 puntos (su mejor temporada histórica) y se mantuvo allí hasta 1966, torneo en el que terminó penúltimo y descendió a su Asociación de Origen junto a San Bernardo Central que quedó un puesto más abajo, concluyendo así su paso por el profesionalismo para siempre.