Un año más tarde, en julio de 2015 fue contratado para asumir la dirección técnica de Independiente Santa Fe de Colombia, con el cual llegó a instancias definitivas en 3 campeonatos simultáneos, obteniendo el subtítulo de la Copa Colombia, días después es eliminado de la Liga Colombiana, y días después consagrándose campeón de la Copa Sudamericana 2015.