Cuzcatlán es la variante del idioma mexica, mientras que Cuzcatán (con el sufijo Tán) es el topónimo nahuat procedente del idioma pipil (la forma pipil original sin traducción al español sería Kuskatan); la forma Cuzcatlán (con el sufijo Tlán) fue adoptado alrededor de 1800, este cambio que se nota para varios topónimos nahuat del país probablemente se deba al prestigio que gozaba el idioma azteca.