Han pasado tres años desde que la nave espacial Nadesico escapó de la Batalla Final en Marte frente a la Federación Joviana, llevándose consigo la caja negra de salto orgánico (cuya desaparición traería finalmente la paz entre terrícolas y jovianos) y abandonando a Akito Tenkawa y a Yurika Mitsumaru para que ambos comenzaran una nueva vida.