En 1983 la misión en El Salvador se separa de la de Guatemala por desacuerdos en cuanto a sus posturas doctrinales, aunque dicha separación no implicó un cambio de nombre debido a la dificultad de iniciar ese tipo de trámite en el país por la guerra civil, por lo que la iglesia en El Salvador continua llamándose "Misión Cristiana Elim de El Salvador" hasta el día de hoy (la de Guatemala si cambio su nombre por ""Área de Ministerios Asociados Elim"" y más tarde por ""Ministerios Elim"" (MI-EL) actualmente Iglesia de Cristo Ministerios Ebenezer, Iglesia de Jesucristo Palabra Miel, Área de Ministerios Asociados Elim en Rep.