El interior tiene una única una nave con una bóveda de cañón y es dominado por una escalera que llega al altar principal totalmente adornada por estatuas de Tullio Lombardo, Alessandro Vittoria y Nicolò di Pietro, mientras que la bóveda se divide en cincuenta artesonados decorados con las caras de los profetas, hechos por el hermano Gerolamo Pennacchi, Vincenzo dalle Destre.