Tras el triunfo del Frente Popular en 1936, Ortega fue nombrado Fiscal General de la República (sufriendo un atentado, mediante la colocación de un paquete bomba en su casa, el 7 de abril de 1936), cargo del que dimitió en noviembre de 1937, consecuencia de las tensiones surgidas con dirigentes de la CNT, trasladándose a París, luego a Cuba y por último a Venezuela, donde falleció.