En 1948 tras la Segunda Guerra Mundial varios grupos rebeldes instigaron la "rebelión Hukbalahap" en contra del gobierno, los llamados "Huk" alcanzaron a tener 50.000 combatientes y resistieron hasta 1954.La organización fue reformada en 1968 y el Nuevo Ejército Popular (NPA) fue establecido en 1969, está activo en las islas de Luzón, Samar, Leyte y las regiones autónomas musulmanas de Mindanao, Surigao y Agusan.Desde la década de 1960, la Academia de Policía ha luchado en las diferentes provincias en las Filipinas y se ha cobrado cerca de 120.000a 160.000 muertes en el conflicto y más de dos millones de refugiados.