La compañía Konami fue la escogida para transformar la serie animada de 2003 en una licencia para videojuegos como en los años 90, dando por resultado una trilogía de juegos: "Teenage Mutant Ninja Turtles" (2004), "Teenage Mutant Ninja Turtles 2: Battle Nexus" (2005) y "Teenage Mutant Ninja Turtles 3: Mutant Nightmare" (2006), que fueron lanzados para PC, PlayStation 2 de Sony, GameCube de Nintendo, y Xbox de Microsoft.