Se atesora interesante escultura funeraria en madera, caliza y alabastro, destacando el "Sepulcro de Juan de Padilla", de Gil de Siloé, y el "Sepulcro de Don Gómez Manrique y Doña Sancha Rojas", procedentes ambos del hoy arruinado Monasterio de Fresdelval; tablas de las escuelas castellana y flamenca, incluyendo obras de Pedro Berruguete ("Misa de San Gregorio"); y una colección de sargas procedentes del Monasterio de San Salvador de Oña.