Fundado en 1958 con fondos procedentes la sección de Arqueología y Antropología del Museo Municipal de Santa Cruz de Tenerife (hoy dedicado a las Bellas Artes), de la "Comisaría Provincial de Excavaciones Arqueológicas", del "Gabinete Científico de Santa Cruz de Tenerife" y de las adquisiciones de pequeñas colecciones como las del antiguo "Museo Villa Benítez", "Vallabriga", Casa Ossuna y aportaciones de particulares.