Pero a la hora de redistribuir el territorio según el principio del "Uti possidetis juris" ("Como poseéis, seguiréis poseyendo"), tuvo mucha importancia el hecho de que, tanto los jesuitas del Orinoco como los capuchinos de la Guajira, procedían de la Nueva Granada: los misioneros fundaron poblaciones (los llamados pueblos de misión) pero el poder civil y territorial, seguía a veces al eclesiástico en los territorios americanos.