Los estatutos de la UES publicados el 19 de octubre de 1880 organizaron el gobierno de la alma máter en un Consejo Superior de Instrucción Pública integrado por el rector, vicerrector, secretario general, prosecretario, fiscal y un consejero por cada facultad, todos ellos nombrados por el gobierno, con excepción de los consejeros, quienes eran elegidos por la totalidad de académicos del país.