El criterio expositivo, que determinó el asesor científico del museo y miembro del patronato de la Fundación Fernando Checa Cremades, de el de mostrar un recorrido por los diversos géneros dela pintura flamenca: retratos, paisajes, mitología, religión, vida cotidiana, bodegones, etc...Complementaron el museo dos exposiciones temporales una de grabados de Rembrandt cedidos por la Biblioteca Nacional y la Fundación Custodia de París y otra de paisajes flamencos y holandeses del siglo XVII de la colección Deltoro-Vives.