Los médicos de cabecera pueden evaluar y diagnosticar ciertos factores ambientales, pero la posible presencia de una enfermedad sistémica causante de las aftas, como la enfermedad celíaca, la enfermedad de Behçet o el sida, debe ser estudiada por los especialistas adecuados, ya que su reconocimiento, diagnóstico y tratamiento es muy difícil para los médicos de cabecera.