El 12 de noviembre, en el minuto 75' del partido de vuelta de Copa del Rey entre el Recreativo de Huelva y el Athletic en el Estadio Nuevo Colombino, Llorente lanzó el primer penalti en su carrera profesional marcando el 2-1, clasificando al equipo para octavos de final.Su buen inicio de campaña fue premiado por primera vez el 14 de noviembre, con una convocatoria para la Selección española.En la eliminatoria de semifinales ante el Sevilla marcó un gol en cada partido, ayudando al equipo a clasificarse para una final de Copa 24 años después.El 13 de mayo de 2009, disputó la Final de la Copa del Rey con el Athletic Club frente al F.C.