A finales de la guerra Gunray dio la orden de disminuir la producción de armamentos cuando Darth Sidious mandó a Darth Vader a asesinar al virrey y a los otros líderes separatistas, Vader envió un mensaje para desactivar los ejércitos de droides, esto afectó enormemente a los neimoidianos sin los beneficios del virrey y la Confederación los neimoidianos no tardaron mucho en caer bajo órdenes del Imperio.