En Mocorito se pueden identificar perfectamente las tres regiones climáticas que se encuentran en el estado de Sinaloa: sabana tropical al occidente; montañoso al oriente y una zona de transición en su zona central, por lo que se distinguen tres pisos de vegetación: la de coníferas, robles, encinos y pinos en las altas montañas; amapas, ébanos, cedros y sabinos en sus estribaciones, al igual que hierbas y matorrales en la zona costera, donde proliferan manglares, guamuchilero, mezquites e higueras silvestres.