El MGDP (Mexican Genome Database Project) se compone de una serie de estudios hechos primariamente por el INMEGEN (Instituto Mexicano de Ciencias Genómicas) que tiene como fin desarrollar medicina para la población mexicana, sus estudios, que de acuerdo a sus metodologías se enfocan en la población mestiza e indígena por autoadscripción no han estado libres de controversia, ya que han recibido críticas respecto a la representatividad de estos así como su utilidad real, por su parte los investigadores del instituto defienden sus estudios afirmando que ""Los resultados del proyecto fueron malinterpretados por la prensa" y afirman que ""en un futuro (el MGDP) podría ser útil no sólo para los mexicanos sino para el resto de America Latina"" (Schwartz-Marín & Silva-Zolezzi, 2010).