El capitán Diego Centeno, leal a la Corona, intentando restablecer la normalidad y restituir el mando absoluto del Poder Real, deseaba desbaratar las fuerzas de Gonzalo, pero el 20 de octubre de 1547, en la batalla de Huarina (cerca del lago Titicaca), las fuerzas reales eran derrotadas y Gonzalo Pizarro quedaba como dueño despótico del territorio.