Tras la Copa FIFA Confederaciones 2017, el nuevo técnico del Inter; Luciano Spalletti no tendría en cuenta a Medel, por lo que debería partir del club italiano, tras tener ofertas de Boca Juniors, Clubes mexicanos, finalmente el 11 de agosto de 2017 fichó por el Besiktas de la Superliga de Turquía a cambio de 2,5 millones de euros.