Y después de recorrer casi todo Brasil en misiones científicas, por una feliz coincidencia del destino, a avanzada edad, después de desempeñar las más elevadas fundiones públicas, vuelve a su bello sitio de Mendanha, herencia de sus padres: João Freira Allemão y dona Feliciana Angélica do Espírito Santo, pasando sus últimos años de vida, falleciendo de ese modo en el mismo lugar de su nacimiento, el 11 de noviembre de 1874.