Aunque hay quienes defienden que la etimología del término proviene la palabra árabe «xotah» (saltar rítmicamente), y podría estar relacionado con el verbo sotar que aparece en el siglo XIV en el "Libro de buen amor", el nombre de «jota» no se documenta fehacientemente hasta finales del siglo XVII, en un códice titulado "Cifras para arpa" hallado en Ávila, donde aparece como título en el encabezado del folio 25.