Otros documentos de máxima importancia son el último testamento del rey Fernando el Católico, las capitulaciones matrimoniales de Juana la Loca y Felipe el Hermoso, una carta remitida por Tiziano al Gran Duque de Alba, el testamento autógrafo del rey Felipe II, un manuscrito del filósofo Rousseau, un ejemplar de la primera edición de "El Quijote", múltiples bulas y documentos expedidos por la Santa Sede, y la "Biblia de Alba", rarísima traducción del siglo que se salvó de la Inquisición.