Durante el combate naval de Iquique del 21 de mayo de 1879, la "Independencia" recibió la orden de perseguir a la goleta "Covadonga" a la vista del litoral, pero desafortunadamente encalló en Punta Gruesa, lo que aprovechó el buque chileno para dar media vuelta y descargar todo su poder de fuego sobre la fragata peruana que se hundía, este hecho, ocurrido durante el combate naval de Iquique, es conocido por la historia chilena como el combate de Punta Gruesa.