Después, llegó a la Segunda Categoría, donde jugó por dos años desde 1993 hasta 1995, año en que quedó campeón del torneo provincial de segunda categoría; luego en el zonal superaron a Universidad Católica de Quito y ADAC de Santo Domingo de los Colorados ambos de Pichincha y al cuadro de Luz de América de Ibarra; siguieron a la siguiente fase en la cual les toco jugar contra Star Club de Chimborazo; y luego el triangular final se enfrentarían a las escuadras de Audaz Octubrino de Machala y Santa Rita de Vinces al final quedó campeón de Segunda Categoría y ascendió por primera vez a la Serie B con apenas tres años de creación al ganar ante el Audaz Octubrino en Ibarra por 3-0, con goles de Nelson Montenegro, Wilson Méndez y Joel Carabalí a falta de una fecha del final del triangular final del torneo de Segunda Categoría el 13 de diciembre de 1995.