Luego su número aumento y en 1564 el gobernador, capitán general y presidente de la Real Audiencia de Lima (no era virrey) Lope García de Castro dispuso la supresión de los corregimientos de Lima, Huamanga, Huánuco, Chachapoyas, y San Miguel de Piura, pasando su autoridad a los alcaldes ordinarios de los cabildos.