Durante este segundo mandato se produjo el cese definitivo de las acciones tertoristas de la organización armada ETA, como consecuencia de la presión de las acciones policiales y judiciales, que derrotaron a la organización y de la actividad de la Fiscalía para conseguir la ilegalización de todos los partidos políticos que pretendían suceder a Batasuna, actividad que obligó al entorno político de la organización armada a presionar a ETA para que abandonase las armas.