Desde el inicio de la recuperación de Avinganya y de la investigación arqueológica en el año 1986 hasta el momento, se ha intervenido en el interior del templo, en el interior del campanario, en las alas norte y oeste del claustro , en la planta semisubterránea y el primer piso del edificio residencial del lado oeste, a la posible torre islámica que se encuentra al este del conjunto monacal, en el edificio del sector meridional de la zona residencial, al sur del recinto claustral y junto NE del monasterio en el exterior del conjunto monástico.