Las otras cuatro sedes del Museo son el antiguo Museo de Geología (el Museo Martorell, abierto de 1882 a 2010), el antiguo Museo de Zoología (abierto de 1920 a 2010 en el Castillo de los Tres Dragones y desde 2011 transformado en el "Laboratori de Natura", literalmente el «Laboratorio de Naturaleza»), el Jardín Botánico Histórico de Barcelona (fundado en 1930), y el Jardín Botánico de Barcelona (fundado en 1999).