Convencido de que no debe perder el tiempo salvando a los humanos decide marcharse, cuando de repente, un alienígena llamado Black Doom aperece delante de Shadow y le explica que ha llegado el momento de que Shadow le ayude a cumplir su misión devolviéndole las siete Chaos Emerald tal y como le prometió hace años, pues le dice que el Día del Juicio Final se acerca.