En octubre de 2007, junto a los expresidentes del Gobierno Vasco, Juan José Ibarretxe y Patxi López, le fue abierto juicio oral por el Tribunal Superior de Justicia del País Vasco, en contra de la opinión del Ministerio Fiscal, acusado de un delito de desobediencia en virtud de los establecido en el artículo 556 del Código Penal, al haberse reunido el 6 de julio de 2006, durante la tregua de ETA, con la organización política ilegal Batasuna.