La Reforma de las Pensiones también introdujo dos cambios clave al sistema de salud: a) privatizó completamente el sistema de seguro por incapacidad laboral, el cual se convirtió en parte integral del sistema de AFP (las AFP son compañías privadas que, por cuenta de los trabajadores chilenos, administran las Cuentas Personales de Jubilación de estos); y, b) permitió a los trabajadores abandonar el sistema gubernamental de seguro de salud y destinar el 7 % de sus remuneraciones a comprar un seguro de salud básico en entidades privadas que se conocen como isapres.