García Moreno en seguida organizó tropas para expulsar a los invasores, dando inicio a una etapa de beligerancia entre Colombia y Ecuador que culminó con la derrota ecuatoriana y el resultante Tratado de Pinsaquí, con el cual se aleja, definitivamente, la esperanza de que los territorios de Nariño y el Cauca sean vueltos al Ecuador, según había ofrecido al general Flores el entonces triunfante Jefe de las fuerzas colombianas, Cipriano de Mosquera, años atrás, al tiempo de las guerras de emancipación.