Además huésped y simbionte han desarrollado una asociación morfológica: El estigma (mancha ocular) del simbionte está siempre en el ápice de la célula de la "Hatena arenicola"; y solamente una célula hija hereda al simbionte durante la división celular, resultando en una célula verde que lleva dentro un simbionte y en una célula incolora que carece de él (ver imágenes).