Mendiburu fue especialmente activo en la vida académica de la Facultad de Ciencias Agrarias de Balcarce, tanto en docencia de grado y posgrado, mediante el dictado de cursos y la dirección y asesoramiento de tesistas, como en el gobierno de la misma, como integrante del Consejo Académico (1984-1986), la Junta Asesora del Programa de Posgrado (1988-1991) y distintas comisiones asesoras.