Según el Ranking Universitario de Rendimiento Académico 2018-2019, la Universidad Nacional del Sur se encuentra en la posición 1443 en una clasificación de 2500 universidades de todo el mundo, con categoría B+, y en el séptimo lugar en la Argentina, tras la Universidad de Buenos Aires, la Universidad Nacional de Córdoba, la Universidad Nacional de La Plata, la Universidad Nacional de Rosario, la Universidad Nacional de Mar del Plata y la Universidad del Litoral.