En la temporada 2002/2003 el club pierde la categoría y regresa a División de honor, pero ese paso fue efímero ya que a la temporada siguiente el equipo regresaría a 3ªDivision, logrando el ascenso en un emocionante play-off ante el Berío Guipuzcoano(hoy en día Real Sociedad C) y el Ariznavarra Alavès.