Cronológicamente ocurre siglos antes de los hechos de The Legend of Zelda, Ganondorf tras derrotar al Héroe del tiempo se hace de la trifuerza completa, esta transforma al reino sagrado en el reino oscuro y cambiando la apariencia de Ganondorf a la de una bestia que reflejaba la verdadera esencia de su corazón corrupto, impío y de su codicioso carácter, a la que se le conoció como Ganon.