El acuerdo estuvo rodeado de episodios militares en las regiones de Manuripi y Tambopata, que involucraron por primera vez a indígenas amazónicos pertenecientes a uno y otro estado, se produjeron combates como el del 15 de septiembre de 1910 en el que 150 soldados peruanos apoyados con refuerzos de los indígenas Chamas y Campas atacaron el fortín boliviano de Abaroa situado a la orilla derecha del Manuripi, defendida por 20 soldados bolivianos, finalmente las tropas peruanas ocuparon dicho fortín.