En enero de 2009, IU-CM presentó una querella por prevaricación contra el presidente de la Comisión de Control de Caja Madrid, Fernando Serrano, próximo a Alberto Ruiz Gallardón, por el expediente que se había abierto a tres representantes del PP en Caja Madrid, considerados más próximos a Esperanza Aguirre, dado que la nueva Ley de Cajas conllevaba una serie de incompatibilidades en los cargos, que cambiaría la correlación de fuerzas entre los dos sectores del PP en pugna.