En 1563, se nombró como gobernador de Tierra Firme a Juan Bustos de Villegas pero este no llegó a encargarse, pues murió en la ciudad Nombre de Dios a consecuencia de haberse caído de la mula en que iba a hacer el viaje a la ciudad de Panamá, circunstancia que llevó al mando del territorio al licenciado Pineda, con cuya corta administración terminaría un período político de Tierra Firme como entidad secundaria sujeta a la Real Audiencia de Lima.