Como gobernador a Oscar Flores Sánchez le correspondió enfrentar al descontento estudiantil que continuaba a pesar de la represión que se había dado en la Ciudad de México que llevó a una toma y huelga de la Universidad Autónoma de Chihuahua en 1973, así como a la insurgencia de la Liga Comunista 23 de Septiembre que llevó a cabo actos de terrorismo urbano como asaltos bancarios y secuestros durante su gobierno, —el más conocido en el cual murió la abogada Avelina Gallegos, miembro del comando asaltante— en ambos casos fue conocido por la mano dura con la que los combatió apoyado por el entonces comandante de la zona militar Fernando Pámanes Escobedo, aunque como parte de su político otorgó la autonomía a la Universidad.