El área bajo control de la APN ascendía en 2005 a 3 584 414 hectáreas, repartidas en 33 áreas, así como cuatro especies declaradas "monumentos naturales": el huemul andino o taruca ("Hippocamelus antisensis"), el yaguareté ("Panthera onca"), el huemul ("Hippocamelus bisulcus") y la ballena franca austral ("Eubalaena australis").