Dentro halla a Wheeler y siguen avanzando juntos ayudándose mutuamente, hasta que Alex se separa de Wheeler, luego halla a su madre crucificada en una especie de trituradora de huesos, Alex puede elegir si matar a su madre o no hacerlo (esto trae consecuencias al final del juego), luego Alex halla a Wheeler, juntos encuentran a la jueza Holloway y la salvan, aparece Nora, la hija de la jueza Holloway convertida en un demonio Asphyxia, quien secuestra a Wheeler, Alex la mata y encuentra a Joshua, lo sigue hasta una especie de iglesia donde por medio de un confesionario Alex haya a su padre, quien lo confunde con un confesor y ahí Alex puede elegir perdonarlo o no (esto trae consecuencias al final del juego), Alex se haya cara a cara con su padre quien le devela que en realidad él fue quien mató a Joshua, por eso huye de él siempre, que estaba loco y lo enviaron a un hospital psiquiátrico lejos para protegerlo luego de que se hubiera roto el trato con la orden, ya que él debía morir en lugar de Josh, por eso pasó lo que pasó con el pueblo, un Piramyd Head mata al padre de Alex y se va.