Martinez Frías en 1988, por los 25 años de la Diócesis (1989), fue nombrado obispo de Ipiales el 29 de enero de 2000, es ordenado el 20 de marzo de 2000, hasta que dimitió, por razones de salud y protocolarias ante el papa Francisco, el 29 de abril de 2016, cargo en el que permaneció en el año 2017, estando más de 18 años hasta su retiro oficial (2018), es nombrado por el papa como "Obispo Emérito de Ipiales".