Se forma de las áreas de recarga en las zonas altas del volcán de Santa Ana, la permeabilidad de la formación de San Salvador permiten que las aguas se infiltren y escurran a través de cavidades vesiculares en la formación, fluyendo el agua hacia el norte en dos flujos subterráneos distintos constituyendo por lo tanto dos subacuíferos distintos: uno que fluye hacia el noreste en dirección hacia la cabecera municipal (que es de donde provienen los ríos de la cuenca alta del río Lempa) y otro hacia el noroeste (que alimenta a los ríos del subcuenca del río Pampe); ambos subacuíferos al llegar a la gran depresión central y tras encontrarse con depósitos conformados con materiales pertenecientes a las formaciones de San Salvador (que es muy permeable) y Bálsamo (de baja permeabilidad), se dividen en dos niveles (uno superior y otro inferior) que continúan su recorrido hasta que llegan a terrenos bajo los 700 msnm en la gran depresión central, donde el nivel superior de ambos subacuíferos choca con las rocas no acuíferas de la formación Bálsamo, que por su impermeabilidad provoca que las aguas descarguen y que por lo tanto salgan a la superficie como manantiales que alimentan o dan origen a los ríos que riegan el municipio.