Toda la porción del territorio que comprende la comuna de Ollagüe se ubica dentro de un clima árido frío ("BWk"), según la clasificación del clima de Köppen, con dos estaciones climáticas durante el año, el invierno chileno y las lluvias convectivas estivales denominado también "invierno altiplánico", con una fuerte oscilación térmica caracterizada por temperaturas que se mueven entre -23 °C y 25 °C, y con vientos que alcanzan, en promedio, los 60 km/h.