Tras este período de entrenamiento, a partir de febrero de 1944, la División Handschar, junto con otras dos divisiones de las SS, la 23.ª División de Montaña SS Kama y la 21.ª Waffen División de Montaña SS Skanderbeg, es destinada a la lucha antipartisana, concretamente a diversas operaciones contra los partisanos comunistas yugoslavos liderados por Tito.