En cumplimiento de sus tareas como misionero en 1757 es enviado a la América del Sur y entre 1758 y 1767 en su acción evangelizadora funda una población en el territorio del Putumayo denominada "Agustinillo", recorre los territorios del sur la Nueva Granada, particularmente la provincia de Popayán, con algunos viajes a Quito y Santafé de Bogotá.