Su cercanía al congreso lo acercó tempranamente al disputado poder ejecutivo de la época, perteneciente al bando pelucón al estallido de la guerra civil de 1829-1830 Ovalle logró escalar en el congreso hasta alcanzar la presidencia de una junta de reconciliación que presidía el país, el 24 de diciembre de 1829 iniciándose su primer mandato.