Cuando salieron los persas, estaba tan malograda que se fundó una nueva ciudad ("Theupolis", 'Ciudad de Dios') por orden de Justiniano I, más pequeña que la anterior, y a la cual se acabó imponiendo el nombre de "Antioquía." A comienzos del siglo VII, fue saqueada por los sasánidas (602 y 611) hasta que fueron expulsados por Heraclio.