Una vez aprobada la nueva categoría, la ANFP a comienzo del año 2012 oficializa invitaciones a todos los clubes de Tercera División que deseen participar en la recién creada Segunda División Profesional, ante el compromiso de conformarse como una institución profesional y sociedad anónima, cinco clubes, entre los más prestigiosos, abandonan Tercera A como son Deportes Melipilla, Deportes Temuco, Iberia, Provincial Osorno y Fernández Vial.