En ambos juegos después de finalizarlos se genera un final alterno en el cual Konume y Kotake que buscan revivir a Ganon capturan a la princesa Zelda para sacrificarla y así que él regresara, Link impide que el ritual continúe, salvando a Zelda haciendo que quede inconcluso, regresando a Ganon, pero como una bestia sin sentido.