Manu Busto se formó en las categorías inferiores de diversos equipos de Santander y jugó en el equipo filial del Real Valladolid.Disputó dos temporadas con el Pontevedra Club de Fútbol (2002-03 y 2003-04) y en la última ascendió a Segunda División, en la temporada 2004-05 jugó cedido en el Club Deportivo Castellón y marcó el gol que supuso el ascenso del equipo castellonense a Segunda División.Después volvió al conjunto pontevedrés, jugó dos temporadas en el Real Jaén y en el verano de 2007 se incorporó al Lorca Deportiva, tras el descenso del conjunto murciano a Segunda División B, donde estuvo dos temporadas.El 11 de julio de 2009 fue presentado como jugador del Real Oviedo .