De las siete estaciones con las que cuenta, seis se sitúan en Bilbao: Matiko, que permite continuar por la línea E3 hacia Lezama; Uribarri, que sustituyó a la estación de la antigua "Línea 4" de Euskotren denominada "Zumalakarregi"; Zazpikaleak/Casco Viejo, que sirve de interconexión entre las líneas L1 y L2 de Metro Bilbao, y que fue remodelada para hacer confluir a las tres líneas del sistema; Zurbaranbarri; Txurdinaga; Otxarkoaga y Kukullaga, esta última ya en Etxebarri y que conecta con las líneas E1 (hacia San Sebastián) y E4 (hacia Bermeo).