Superboy Prime es inmune a la kryptonita de este universo (el Kryptón de este universo corresponde al de Nueva Tierra), debido a que el Krypton de su universo fue destruido sin dejar rastros, nunca hubo restos de kryptonita que le afectasen, sumado a la destrucción de su realidad en la "Crisis en Tierras infinitas", no hay kryptonita en la actualidad que pueda afectarle.