Además del Gran lago de los Esclavos y del Williston, el Mckenzie drena otros muchos lagos: Athabasca, Gran lago del Oso, Grouard, Hottah, la Martre, Indin, Buffalo, Claire, Cree, Black, Scott, Selwyn, Wollaston, Pequeño lago de los Esclavos, Utikuma, Nonacho, Eileen, Artillery, Clinton-Colden, Aylmer y Mackay.