Luego de que las fuerzas del general Rafael Carrera retomaron el control de Guatemala en 1840, durante el breve exilio de este a México entre 1848 y 1849, García Granados estuvo encargado de perseguir al caudillo conservador cuando éste ingresó de nuevo a Guatemala; las tropas de García Granados persiguieron a Carrera en la región de Los Altos, pero Carrera rehuyó el combate por no tener suficientes efectivos ni pertrechos de guerra.