Primero se distinguió entre cuatro grupos filogenéticos principales (Ostrander, 2008): el grupo que incluye al zorro común (géneros "Vulpes", "Alopex", "Nyctereutes" y "Otocyon"), el que incluye al lobo gris ("Canis", "Cuon" y "Lycaon"), el de las especies sudamericanas ("Atelocynus", "Cerdocyon", "Dusicyon", "Lycalopex", "Chrysocyon" y "Speothos") y, por último, el género "Urocyon", que integra el clado más diferenciado.