Cuenta con dos pistas, la principal es la 05R/23L y otra secundaria 05L/23R de menor longitud, abierta en 2011 y destinada en exclusiva a material E-26 Tamiz de la escuela elemental de San Javier, con lo que la principal era utilizada por material E-25 Mirlo (CASA C-101) combinado con vuelos civiles durante todo el día.