El museo se ubica en una construcción del barrio de Sant Francesc, sobre el mismo solar donde se encontraba el Hospital de los Inocentes (el primer centro psiquiátrico de la historia), del cual sólo queda la parte central (hoy Biblioteca Pública), mientras los restos arqueológicos del complejo hospitalario se esparcen por los jardines que se encuentran ante el mismo MuVIM.