En los años 90 el Centro contaba con unos 13 investigadores apoyados por unos 20 técnicos que trabajaban en la biología de organismos marinos y de agua dulce, ecología de comunidades marinas, dinámica poblacional, ecología de manglares, ecofisiología vegetal, dinámica de carbono y nutrientes, micorrizas, comunidades vegetales en los llanos, ciclos biogeoquímicos, fisicoquímica, geología y paleoecología.