En 2003 fue nombrado Director General del Sector Primario y Recursos Naturales Renovables de la Secretaría de Medio Ambiente y Recursos Naturales (SEMARNAT), y en 2004 se convirtió en Subsecretario de Fomento y Normatividad Ambiental en la misma secretaría, estando al frente de ésta Alberto Cárdenas Jiménez.