Hubo conflictos internos, a principios de 2014, renunció O'Donnell y, posteriormente también algunos de sus principales miembros e historiadores, como Hernán Brienza, Hugo Chumbita y Felipe Pigna.En diciembre de 2014, Pacho O’Donnell propuso cerrar el Instituto Dorrego y afirmó: "No eran Luis Alberto Romero ni Beatriz Sarlo nuestros peores enemigos: estaban adentro."Por su parte Víctor Jorge Ramos criticó a la ministro de Cultura Teresa Parodi por no autorizar partidas para gastos del Institutoy poco después, en una solicitada del 31 de diciembre de 2014, el Instituto ―cuya presidencia estaba ejerciendo Luis Launay― repudió, a su vez, los dichos de Ramos.