De hecho Pole siempre había mantenido la esperanza de un arreglo pacífico de las disensienes en el seno de la Iglesia, a diferencia del octogenario Papa, que evolucionó a favor de una defensa armada de la Iglesia católica; actitud que, junto a la conversión de algunos de sus amigos de Viterbo al protestantismo (Pedro Mártir y Bernardino Ochino), hicieron sospechoso a su círculo ante la Inquisición romana.