También cuenta con las clínicas Comfandi y Nueva de Cartago SAS que prestan sus servicios en la ciudad, la sede de la IPS del Municipio de Cartago, una sede de la Liga Colombiana contra el Cáncer (Unicáncer), la Cruz Roja Colombiana Unidad Municipal de Cartago, y además varios centros asistenciales y hospitalarios de menor tamaño.