De las especies protegidas de la fauna silvestre viven en la Reserva del Mbaracayú, el mboreví, tapir, el aguará guasú ("Chrysoncyon brachyrus"), la nutria ("Lutra longicaudis"), el yaguá yvyguy ("Speothos venaticus"), el tatú carreta ("Priodontes maximus") y cuatro clases más de armadillos; el oso hormiguero y el jaguar; también dos especies de monos y cinco de felinos por mencionar algunos.