Sin embargo, el descubrimiento de la Operación Puerto y el hecho de que la Guardia Civil hubiera identificado a Mancebo como uno de los clientes de la red de dopaje dirigida por el doctor Eufemiano Fuentes motivó que Mancebo fuera apartado del equipo un día antes del inicio de la ronda gala, al igual que otros favoritos como Jan Ullrich ("T-Mobile") e Ivan Basso ("CSC").