A nivel comunal, el catolicismo es la religión predominante y goza de gran influencia en la sociedad local; de hecho, Ancud es cabecera de la denominada «Diócesis de San Carlos de Ancud» —en latín: "Dioecesis Sancti Caroli Ancudiae"—, que fue creada mediante la Bula «"Ubi Primum"» del Papa Gregorio XVI el 1 de julio de 1840, haciéndose sufragante de la Arquidiócesis de Santiago y disponiendo como Patrono de su iglesia Catedral a San Carlos Borromeo.