El tercer y último libro cuenta lo acaecido en el año 48 a. C., desde que César se dirige a Brindisi hasta la conquista de la Isla de Faro y el comienzo de la Guerra de Alejandría; en ese libro se incluye, entre otros aspectos importantes, la derrota de César en la Batalla de Dirraquium y su aplastante victoria en la batalla de Farsalia, la muerte de Pompeyo y el encuentro entre César y Cleopatra.