Las bacterias "Coxiella burnetti", "Chlamydophila pneumoniae" (CIE-10: J16.0), "Mycoplasma pneumoniae" (CIE-10: J15.7), y "Legionella pneumophila" son agentes causales menos usuales, por lo que una neumonía causada por estos organismos recibe el nombre de neumonía atípica y se ve comúnmente en adolescentes y adultos jóvenes, tiende a ser menos severa y su curso de tratamiento es diferente que el de las neumonías bacterianas tradicionales.