Esta solución duró poco tiempo, ya que el avión que conducía a Ntaryamira y al Presidente de Ruanda, Juvénal Habyarimana, también Hutu, se estrelló al ser derribado por un misil (Atentado del 6 de abril de 1994) cuando iba a aterrizar en el aeropuerto de Kigali, atentado en la que ambos murieron.