En 1958 la dictadura gobernante aprobó el Decreto Legislativo 136 de 1958, estableciendo como misión de la universidad "la exaltación de los valores en que se basa la civilización cristiana" y modificando la composición del Consejo Directivo (Conciliatura) para permitir que se incorpore un delegado del obispo de Bogotá y otro en representación de los "padres de familia".