La Coalición Por el Bien de Todos y su candidato César Raúl Ojeda se inconformaron de los resultados de la elección ante el Tribunal Electoral del Poder Judicial de la Federación, que el 27 de diciembre de 2006 emitió su resolución, declarando nulas 7 casillas, pero ratificando el triunfo de Andrés Granier Melo, al declarar que la Coalición Por el Bien de Todos no logró demostrar las irregularidades que había denunciado.