Silíceo logró que el papa revocara el nombramiento —en una carta le dijo que si se le admitía convertiría la sede toledana en una "nueva sinagoga"— y generalizó los estatutos de limpieza de sangre que marginaban las posibilidades laborales de cualquier converso de origen judío o morisco no solo en la jerarquía religiosa, sino en la administración del reino; solo los jesuitas no tuvieron demasiado en cuenta esta limitación.