En el año 1988, seis Hermanas Franciscanas Misioneras de María Auxiliadora llegan a la Institución para recibir la administración, asumiendo como Rectora la Hermana Cecilia Muñoz Ibarra, quien continua con los principios religiosos y humanos que caracterizan la Institución, como uno de los mejores colegios de la localidad y la región.