Dentro de la colección de arte virreinal sobresale la de pintura, en la que figuran series de cuadros de mestizaje "(pintura de castas)", tres biombos novohispanos, uno de ellos adquirido recientemente (2013), y enconchados, de los que cuenta con ochenta y ocho (parte de ellos depositados por el Museo del Prado), de un total de doscientos setenta y cuatro que existen en todo el mundo.