Ha recibido críticas desde la posición de la arquitectura posterior, como las de Alfredo Morales, que le cuestiona que en la restauración ensayara según su entender, cosas que faltasen (según palabras del propio Lampérez) en contraposición a las teorías desarrolladas en la actualidad en torno a la Teoría de la restauración, o de González de Valcárcel.