Littré se convirtió en su discípulo y defendió el proyecto comteano desde la epistemología, ya que, según él, la filosofía positiva tenía un mérito que no había logrado alcanzar todo el conocimiento humano occidental desde sus orígenes, es decir, hacer una correcta separación de las disciplinas o ciencias, ya que sólo habían formado "una masa confusa en que no se distinguen las relaciones entre la filosofía, ni con la naturaleza, ni con la historia, ni con la enseñanza".