La trucha de Seván ("Salmo ischchan") era una especie endémica del lago, constituyendo hasta el treinta por ciento de los peces en el lago, pero fue puesta en peligro debido a que se introdujeron algunos competidores, como el pescado blanco común ("Coregonus lavaretus") proveniente del lago Ladoga, la carpa dorada ("Carassius auratus"), y el cangrejo del Danubio ("Astacus leptodactylus").