Instalado desde sus inicios de manera provisional en la planta baja de la Academia de Bellas Artes de Santa Cecilia, se quiso montar definitivamente en el Palacio de Valdivieso, si bien el destino definitivo de la colección será el Hospital de la Divina Providencia, popularmente conocido en la ciudad como "el Hospitalito", un edificio neoclásico de 1753 en el Barrio Alto.