Las principales fuentes de contaminación del HCB en el agua las constituyen la lixiviación del suelo, el arrastre del viento, el agua de lluvia y las descargas de fábricas donde se sintetizan o manipulan clorofenoles, en el que el HCB contenido en los mismos puede quedar adherido a la superficie del agua, absorbido o en suspensión en partículas.