En el año 1950 el Patronato de la Fundación Goyeneche acordó una escisión de la misma constituyendo la "Fundación Goyeneche de San Sebastián" para poder instalar en aquella ciudad un establecimiento asistencial que se pudo construir gracias a las donaciones de terrenos efectuadas en los años veinte por el Conde de Guaqui y su hermana la Duquesa de Goyeneche.