Tras la formación del Gran Ducado de Lituania, la Samogitia devino un territorio vasallo aunque el influjo del gran duque lituano fue muy limitado, al punto que durante el reinado del primer jefe de Estado lituano Mindaugas los samogitios prosiguieron con su política independiente luchando contra los caballeros portaespadas aun cuando Mindaugas había firmado con tal orden un tratado de paz.