La hidrografía pertenece mitad oeste del territorio a la "Cuenca del río Casas Grandes" y la mitad este a la "Cuenca del río Santa María", ambas pertenecientes de la "Región hidrológica Cuencas Cerradas del Norte", destacan las corrientes del Río Casas Grandes y el Río Santa María, que desembocan en la Laguna de Guzmán y la Laguna de Santa María respectivamente, aunque solo en épocas de fuertes lluvias, la mayor parte del tiempo estos ríos se encuentran completamente secos y sus lagunas se convierte en valles salinos, estos ríos son dos de los únicos cinco importantes que pertenecen a una vertiente interior en México.