Hasta hace poco tiempo, la economía de Manaure resultó bastante afectada por la acción en sus inmediaciones de grupos armados ilegales que han provocado considerables migraciones, con todo y esto Manaure es quizá el municipio cesarense con mayores perspectivas en cuanto al desarrollo turístico y si se adelantan planes de manejo y aprovechamiento sostenible de los recursos naturales su potencial agrícola es bastante amplio, ya que este municipio posee suelos en los pisos térmicos frío, medio y cálido con precipitación abundante.