En Comayagua, los tributarios del río Sulaco que también forma parte del departamento de Yoro son: El Netapa, Funes, Rancho Colorado, Plátano, Canquigue y Yunque que le llegan al Humuya por la margen derecha; El Tepanguare, El Selguapa, Guare, Maragua, le afluyen por la izquierda.