Sin embargo, al celebrarse las primarias como estaba pautado, el 18 de noviembre, el rival de Fillon y en ese momento secretario general del partido (segundo cargo en importancia de la UMP), Jean-François Copé, se proclamó ganador y Fillon hizo lo mismo; pero el escrutinio oficial dio la razón a Copé al asignarle la victoria por un estrecho margen de apenas 98 votos más que Fillon.Pero Fillon se negó a aceptar su derrota e impugnó los resultados alegando las numerosas irregularidades que rodearon al proceso; pero una comisión interna del partido habilitada para resolver recursos contra los resultados no solo confirmó la victoria de Copé sino que amplió el margen de votos a favor de este a 952 al anular los sufragios de dos federaciones regionales favorables a Fillon.