Dos años más tarde participó en el golpe de Estado contra el presidente Juan Bosch y estuvo entre los elementos que evitaron la reposición de Bosch durante la guerra civil dominicana de 1965, en la cual llegó a encabezar el autodenominado "Gobierno de Reestructuración Nacional" (el bando antiboschista) como presidente tras la renuncia del general Pedro Bartolomé Benoit van der Horst.