Después de varias temporadas rindiendo a buen nivel en la Primera Regional, el CF Nules asciende a 3ª División, en la cual milita la temporada 43/44 quedando en quinta posición, aunque una reestructuración de la categoría para la temporada siguiente llevó al club a categoría regional, categoría en la que arrastró graves problemas económicos de su paso en tercera y les llevó a la desaparición en 1946.