Aunque Boumaarafi fue juzgado y sentenciado a muerte en junio de 1995, la motivación del asesinato es objeto de controversias, entre la hipótesis de una acción aislada cometida por un militar con simpatías islamistas y la de un complot más vasto que implicaría a generales del Ejército, siendo esta última la sostenida por su viuda, Fatiha Boudiaf.