El informe en minoría emitido por la Comisión de Investigación sobre el conflicto en Bagua en 2016 sugiere que Mercedez Araoz (1) emitió "declaraciones inoportunas que contribuyeron a la confusión de la opinión pública", y (2) que fue responsable política por el "incumplimiento de la obligación constitucional de someter los decretos legislativos que afectaban directamente a los pueblos indígenas a la consulta previa que señala el convenio 169 de la OIT".