En su camino en busca de Emma, Raiden se enfrentó a Solidus Snake en un combate donde Solidus se enfrentó con Raiden en los mandos de un avión de despegue vertical Harrier, quien perdió su ojo izquierdo durante el combate y donde Iroquois se reveló como Solid Snake demostrándose que Snake sobrevivió al incidente del Barco de dos años atrás.