Mientras desempeñaba el cargo de rector de la Universidad Nacional de Trujillo, dicha universidad fue tomada por sus estudiantes quienes exigían la renuncia de Rodríguez a quien acusaban de haber tejido una red de corrupción durante su gestión; la toma duró 103 días, tras los que la Contraloría General de la República y el Congreso encontraron indicios de malos manejos por parte de Rodríguez Nomura, solicitando a la ANR que acepte su renuncia.