Dos loci situados en cromosomas distintos segregan habitualmente de forma independiente, esto es, no hay ligamiento y la frecuencia de recombinación es de 0,5; en cambio, dos loci situados en la misma hebra de ADN se transfieren de forma no estocástica, por lo que la probabilidad de que se produzca recombinación entre ambos es siempre menor de dicha frecuencia de 0,5.