En cuanto al sindicato y su personal, aparte del problema de los llamados "vagoneros", entre sus autoridades y técnicos existen diversas denuncias de todo tipo por cuestiones de refacciones y mantenimiento, corrupción, condicionamiento de plazas laborales y desvío de recursos, amenazas de paros del sindicato etc, derivados de la corrupción dentro del organismo, que se dice, pueden generar accidentes mayores, que han sido negadas por autoridades.así como la presunción del fin de la vida útil de muchas estaciones construidas desde los años 60's.