Las principales corrientes del municipio son el río de la Barranca y el río Platanar que desembocan en el Golfo de México, y los ríos Capitán, La Peña y El Limón que son afluentes del río Actopan, existe además en el sureste del territorio y casi en la costa del Goldo de México, la Laguna Verde, junto a la que está construida la central nuclear del mismo nombre; hidrológicamente el municipio se encuentra dividido en dos mitades, la mitad norte forma parte de la "Región hidrológica Tuxpan-Nautla" y a la "Cuenca del río Nautla y otros" y la mitad sur a la "Región hidrológica Papaloapan" y a la "Cuenca del río Jamapa y otros".