Estando ya como general de brigada dirigió casi todas las acciones en la campaña de la Guerra Civil en el norte de Chile (Pisagua, Huara, Pozo Almonte, etc.) En Pisagua una parte de su ejército fue capturado por una estratagema de los militares pro-balmacedistas, las cuales después recuperó con un contragolpe, como asimismo las batallas decisivas para la causa congresista de Concón y Placilla.