El punto preciso en el cual se localizaba Karakórum fue objeto de debate durante largo tiempo; aunque existían indicios de que Karakórum se localizaba en Erdene Zuu tan temprano como el siglo XVIII, hasta el siglo XX existieron hipótesis alternativas de que las ruinas de Karabalgasun o "Ordu-Baliq" eran en realidad las de Karakórum.