La estructura que compone la fuerza aérea son: el Grupo Aerotáctico (GAT) con tres escuadrones de caza, el Grupo de Transporte Aéreo, donde se encuentra la Brigada de paracaidistas, (GTA), el Grupo Aéreo de Helicópteros (GAH), que cuenta con un escuadrón SAR, un escuadrón utilitario y un escuadrón de ataque, el Grupo Aéreo de Instrucción (GAI) cuenta con material, el Grupo Aéreo Fotogramétrico (GAF) y Grupo Sección de Mantenimiento Aéreo (SEMAER) que no cuentan con aeronaves asignadas.