A inicios del siglo XXI y más precísamente en los otoños de los años 2012 y 2014, Luján ha sufrido importantes inundaciones debido a, copiosas lluvias debidas al parecer al Ciclo Húmedo (1870-1920, 1970-2020) "crecidas" o aumentos de nivel del río Luján curso de agua que alcanzó en la ciudad un nivel de casi 4,5 m en la primera semana de febrero de 2014, entre los factores antrópicos o debidos a algunos humanos (muchos de ellos empresarios sojeros absentistas ) se encuentran dos principales: al realizarse cultivos de soja en la cuenca alta del citado río Luján, se realizaron canales no declarados para desecar los terrenos por los cuales las aguas escurren más velozmente y casi al mismo tiempo los humedales de la cuenca baja del río Luján en su confluencia con el río Paraná han sido rellenados o endicados para construir lujosos "barrios privados", de tal modo que mientras en la cuenca alta las aguas escurren muy velozmente en la cuenca baja se taponan o "endican" provocando las extraordinarias inundaciones.