Una versión EW del Intruder, inicialmente designada A2F-1H (en lugar de "A2F-1Q" ya que la "Q" se había dividido para pasar a ser la "Q" indicativo de la guerra electrónica pasiva y la "H" de la activa) y posteriormente redesignada como EA-6A, voló por primera vez el 26 de abril de 1963.