También custodia el Archivo valiosos códices, como la "Biblia de Cardeña" (hacia 910-914), el "Homiliario" de Paulo Diácono y las "Colletiones" del abad Smaragdo (siglo ), el "Moralis Tractatus" de Guillermo de Perault (siglo ), la "Biblia Miniada" (finales del siglo -principios del , con notas marginales atribuidas a Pablo de Santa María) y la "Regla de Nuestra Señora de la Creación" (1494).