El Barranquilla Futbol Club fue constituido en la temporada 2005 al tomar la ficha dejada por el Johann Fútbol Club con el objetivo de competir en el Campeonato de ascenso de la División Mayor del Futbol Colombiano, DIMAYOR, abriendo un espacio en el fútbol profesional a los jóvenes de la región Caribe para el desarrollo de un proyecto de vida a través de la práctica de este deporte.