El topónimo de San Román de la Cuba parece proceder de la unión de, por un lado, el hagiotopónimo de San Román, cristiano martirizado a principios del siglo IV en Siria, y por otro de la palabra de origen árabe "Qubba", en referencia a su posible origen como estructura defensiva, por lo que su significado sería San Román de la Atalaya o de la Torre.