Desde la asunción de Néstor Kirchner como Presidente de la Nación en 2003, el Partido Socialista mantuvo una posición de independencia respecto del Gobierno (aunque se verificó un acercamiento al concepto de transversalidad por parte de dirigentes santafesinos), respaldando medidas que consideró positivas (como la política de derechos humanos, los cambios en la Corte Suprema, etc.) y cuestionando con alternativas otras medidas por entenderlas regresivas.