Smith pretende destruir a Neo una vez más, Neo se ve forzado a enfrentar a decenas de réplicas de Smith, los poderes de Neo se han hecho superiores a los de su enemigo, consiguiendo así liberarse de ellos y escapar, aunque más tarde tendrá que enfrentarse a ellos nuevamente en el portal que conduce la fuente de Matrix, aunque una vez más, sin conseguir derrotarlos.