En marzo de 1959, la situación diplomática empeoró cuando Ydígoras-Fuentes acusó al Gobierno mexicano de albergar a José Gregorio Díaz y Rogelio Cruz Wer, exfuncionarios guatemaltecos, y de planear una invasión a Guatemala desde México; aunque este cargo fue rechazado y desmentido, otros cargos fueron expuestos por Ydígoras-Fuentes, incluyendo una alianza militar secreta entre Belice y México para invadir a Guatemala.