Finalmente el Hombre Molécula, tras una lucha consigo mismo en la que evoluciona como persona, toma parte en el bando de los superhéroes de la Tierra en su lucha final contra el Beyonder enfrentándose a él, y aunque no consigue vencerle gana tiempo, y evita que un rayo de increíbles proporciones destinado a matar a los Superhéroes y lanzado por el Beyonder, cumpla su fin.