En 2008 se hizo pública la intención del Gobierno, a través del ministro César Antonio Molina, de desmantelar del Museo ya que se crearía el Museo Nacional de Etnografía en Teruel, con sus fondos etnográficos heredados del Museo del Pueblo Español, y el complejo Matadero Madrid acogería, a partir de 2011, el Centro Nacional de la Moda, con los fondos del Museo no expuestos al público.