La Gobernación Distrital de San Martín de Porres es dirigida por la Gobernadora Distrital Natty Yolanda Fernández Yanqui quien es responsable del control de los Tenientes Gobernadores del Distrito de San Martín de Porres; así como de ejecutar y coordinar las acciones de competencia de la Oficina Nacional de Gobierno Interior (ONAGI), en lo que corresponda.