Durante este período se publica el Inventario Actualizado del Museo de Geología de la Universidad de Sevilla (2002) (Foto 19), reproyecta el Museo Virtual de Geología, y se exponen ejemplares del museo en dos exposiciones: "Patrimonio Científico de la Universidad de Sevilla", en 2005 y "Antonio Machado y Núñez y los darwinistas sevillanos", en 2009.