La finalidad concreta de Innobasque es la de promover y desarrollar apoyos a la innovación tecnológica en la sociedad vasca y su tejido productivo, promocionando valores y actitudes que ayuden a dinamizar el desarrollo y la innovación en las empresas y organizaciones, además de difundir estos valores en la sociedad y una imagen exterior positiva en referencia a los mismos en el País Vasco.