Cuenta con las sedes de la Universidad del Valle, que ofrece programas de Pregrado y tecnológicos; la Universidad del Cauca, que ofrece programas tecnológicos y de pregrado; la Fundación Universitaria de Popayán que ofertan programas de Pregrado y tecnológicos, y Unicomfacauca ofreciendo programas de pregrado y tecnológico para abarcar toda la necesidad educativa de la ciudad.