Quilmes no pudo mantener regularidad y poco a poco fue decreciendo en cuanto a calidad de sus planteles, la crisis del dólar hizo que el presupuesto se redujera, por lo que los planteles año a año perdieron calidad llegando así a la temporada 2008-09 donde Esteban de la Fuente se hizo cargo de la dirección técnica y logró salvar al equipo del descenso recién en la última fecha, hecho que no se pudo repetir al año siguiente y Quilmes volvió a caer a la segunda división luego de perder por 3 a 2 su serie de permanencia contra Ciclista Olímpico de La Banda.