El nombre hace referencia a San Francisco porque solían encomendar a un santo la ciudad que fundaban, Peleusí porque en aquel entonces existían grandes campos de flores amarillas llamadas pileus y Azogues por la existencia de minas de azogue, antiguo nombre del mercurio, mineral abundante que existió en la zona; no obstante estas minas han sido abandonadas y la presencia de esta planta ahora es imperceptible.