Desde la cátedra y desde el Centro de Estudios Históricos, institución vinculada al krausismo de la Institución Libre de Enseñanza, del que fue nombrado director en 1910, impulsó la Institución para convertirla en precursora de lo que sería el Consejo Superior de Investigaciones Científicas, fundado en 1939, nada más acabar la guerra, para impulsar las tareas científicas desde el propio Estado.