En las elecciones presidenciales del 4 de noviembre de 2001 el CCN participó coaligado junto con los partidos Resistencia Nicaragüense (PRN), Liberal Independiente (PLI) y otros pequeños partidos de la antigua Unión Nacional Opositora (UNO) al Partido Liberal Constitucionalista (PLC) llevando al poder al Ingeniero Enrique Bolaños Geyer con el 56.1% de los votos (1,216,863), el FSLN perdió con (915,417) y el Partido Conservador (PC) quedó en tercer lugar con 29,933 votos.