Desde su nacimiento, en el Portillo de Lunada, hasta su desembocadura en la Bahía de Santander el LIC ocupa una superficie de más de 395 ha, a través del río Miera, incluyendo territorio de los términos municipales de San Roque de Riomiera, Miera, Liérganes, Riotuerto, Ruesga, Soba, Entrambasaguas, Medio Cudeyo, Marina de Cudeyo, Solórzano y Ribamontán al Monte.