Para la temporada 95-96 volvió a su natal Argentina para jugar en Club Atlético Independiente donde logró destacar con goles, ganando la Supercopa Sudamericana 1995 contra el Flamengo, donde Domizzi marcó el segundo gol en cancha de Independiente para luego coronarse el título en el Maracaná por un global de 2-1, hazaña que Independiente lograría 22 años después contra el mismo rival y en el mismo estadio en la final de la Copa Sudamericana 2017.