Tras llegarle las bulas confirmatorias de su elección para el obispado de Arequipa (2 de agosto de 1632), fue consagrado por el arzobispo de Lima Fernando Arias de Ugarte, pero no tomó posesión de su sede sino hasta el 25 de julio de 1635, porque tuvo que dar pleno cumplimiento a la visita que se le había encomendado.