La Universidad de San Marcos ha tenido una influencia muy significativa en el desarrollo de materias de ciencias, medicina, ingenierías, derecho, política, sociales, letras, humanidades y artes, a lo largo de la historia del Perú, logrando destacar los alumnos y catedráticos en épocas decisivas para la realidad nacional como: a lo largo del Virreinato —siglo XVI, siglo XVII y siglo XVIII—; durante el proceso de la Independencia —siglo XVIII y siglo XIX—; y en la actual época republicana —siglo XIX, siglo XX y siglo XXI.