El equipo mantiene una rivalidad futbolística histórica con el Marathón que ha generado distintos altercados dentro y fuera de los estadios; a este derbi se le conoce como el "Clásico Sampedrano" y es el primero en grado de importancia por delante del Clásico Capitalino, que lo disputan los clubes Olimpia y Motagua son clásicos aburridos .