Los daimyos también fueron controlados estrictamente, ya que el shogunato les impuso la política del "sankin kōtai" desde 1635 hasta 1862, en el que la familia del "daimyō" debía vivir de manera obligada en la ciudad de Edo, mientras que el "daimyō" debía alternar su residencia anualmente entre Edo y su feudo, lo que ocasionaba gastos añadidos al tener que mantener dos residencias y sufragar cuantiosas procesiones, limitaba su poder económico y militar y evitaba así cualquier intento de rebelión en contra del shogunato.