Como responsables del atentado son señalados Pablo Escobar, Gonzalo Rodríguez Gacha y Jorge Luis Ochoa Vázquez , jefes del Cartel de Medellín; también son señalados los lugartenientes de Escobar John Jairo Arias alias "Pinina", Mario Alberto Castaño alias "Chopo", Jhon Jairo Velásquez Vásquez alias "Popeye", Carlos Mario Alzate Urquijo alias "Arete", y los hermanos Brances Alexander Muñoz Mosquera, alias "Tyson", y Dandenys Muñoz Mosquera, alias "La Quica", este último sentenciado a cadena perpetua en los Estados Unidos como autor material del hecho dado que dos de las personas a bordo del avión eran ciudadanos de dicho país.