Matt entonces es capturado junto a Ted por la compañía y aprisionados, pero Matt ve la oportunidad de escapar de nuevo, bajo la guía de Noah, (después de que este se entrega voluntariamente ala compañía para proteger a Claire), Matt sin más remedio acepta y sigue las órdenes de Bennet consiguiendo escapar y liberar a Ted y a Noah, más tarde en Texas Noah les revela que destruyendo el sistema de rastreo Walker, serán libres de la compañía, y Matt a duras cuestas acepta, viajando hacia New York, en donde se encuentran con Claire por segunda vez, posteriormente Matt junto a Noah continúan en su búsqueda por el sistema de rastreo, viéndose en la obligación de confrontar a Thompson en un tiroteo que acaba en la muerte de Thompson, Matt y Noah ahora sin obstáculos se dirigen a destruir el sistema, enterándose que se trata de la misma Molly Walker, sin embargo todos entran en un acuerdo de dejar vivir a Molly con el propósito de darles el paradero de Sylar, una vez que Matt sabe la localización de Sylar decide matarlo, aun en contra de los deseos de Noah, pero Matt al llegar al refugio de Sylar se entera rápidamente que Sylar ha ido ala plaza Kirby, y Matt se dirige ala plaza consiguiendo enfrentarse a Matt, pero es reducido fácilmente por Sylar insertándole 5 balas en el pecho.