Javier Torres Maldonado ha recibido muchos de los más importantes premios y distinciones en materia de composición musical, entre los que se cuentan "Da Capo" (Bienal de Brandenburgo y Orquesta Sinfónica de Brandemburgo, 2012), la Commande d'Etat (Comisión del Estado Francés por tres veces consecutivas: 2007, 2009 y 2011) otorgada por el Ministerio de la Cultura y Comunicación de Francia, el premio internacional de composición para ensemble y sistema electro-acústico del GRAME (Centre National de Création Musicale) de Lyon, Francia (2006), “Reine Elisabeth” de Bruselas, Bélgica (2004), “Alfredo Casella” de Siena, Italia (2002), “Reine María José" de Ginebra, Suiza (2000), “Ad Referendum II” de Montréal (1998), "Città di Barletta" (Italia), “Prix des Musiciens” (1998), otorgado por el Nouvel Ensemble Moderne, la “Medalla Mozart” otorgada por el gobierno mexicano y la embajada de Austria en México, y ha sido galardonado por dos veces consecutivas con el segundo lugar en el premio internacional de composición “Mozart” de Salzburgo, Austria (1999 y 2001).