Su propia jerarquía está encabezada por el archieparca mayor Trivandrum (desde el 10 de febrero de 2007 es Baselios Cleemis (Isaac) Thottunkal), quien utiliza los títulos de "sucesor de la sede apostólica de Santo Tomás en la India", "metropolitano malankara" y "archieparca mayor-catolicós de la Iglesia católica siro-malankara".