Saúl Flores Prieto ha sido electo Diputado Federal en dos ocasiones, por distritos electorales federales con sede en Ciudad Juárez, por el VIII Distrito Electoral Federal de Chihuahua a la LIV Legislatura de 1988 a 1991 y por el III Distrito Electoral Federal de Chihuahua a la LVII Legislatura de 1997 a 2000.