Explorando el proceso de crecimiento y madurez de Fred, Daphne, Vilma, Shaggy y Scooby mientras definen y descubren su lugar en el mundo, los chicos deben luchar para mantenerse unidos y resolver extraños y terroríficos enigmas, mientras una figura sombría conocida como "el Señor E" los va llevando al descubrimiento de secretos escondidos en la ciudad en que viven y a un misterio que cambiará sus vidas.