Los contenidos agregados al juego original son un traje alternativo para Meryl, para complementar el esmoquin de Solid Snake y el nuevo traje rojo del cyborg ninja, un nivel de dificultad «Muy fácil», donde el jugador comienza su misión con un subfusil MP5 con munición infinita, nuevas frecuencias en el códec con comentarios del personal y con música oculta, un modo de vista en primera persona, una opción para nuevas rutas alternativas de las patrullas enemigas, y un minijuego descargable para PocketStation.